GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 726 - 750 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
RND2 GTPase cycle
  • ALDH10
  • ALDH3A2
  • ANKRD26
  • ARHGAP1
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHN
  • ARMS
  • BACURD1
  • BACURD2
  • BLTP3B
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • C6orf143
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42GAP
  • CDHF4
  • CG1
  • CKAP4
  • CRIB1
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DMH
  • DRCC1
  • DSG1
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EDP1
  • EPHA2
  • FALDH
  • FAM83B
  • FBP17
  • FNBP1
  • FRS2
  • FRS3
  • GOLGA3
  • GRB1
  • GRF1
  • GRLF1
  • HNRPG
  • IRAS
  • KCTD13
  • KIAA0004
  • KIAA0042
  • KIAA0147
  • KIAA0554
  • KIAA0583
  • KIAA0620
  • KIAA0701
  • KIAA0728
  • KIAA0975
  • KIAA1074
  • KIAA1215
  • KIAA1250
  • KIAA1722
  • KIDINS220
  • KIF14
  • KTN1
  • LANO
  • LAP4
  • LEMD3
  • LRRC1
  • MAN1
  • MUC13
  • NISCH
  • NUDC
  • P190A
  • PDIP1
  • PDLG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLXND1
  • PNP1
  • POLDIP1
  • PRAG1
  • PTP1E
  • PTPL1
  • PTPN13
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RECC
  • RHO7
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RND2
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SGK223
  • SHIP164
  • SOC
  • STB1
  • STB2
  • TFRC
  • TNFAIP1
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UBXD5
  • UBXN11
  • UHRF1BP1L
  • VANGL1
  • VANGL2
  • VARTUL
  • WDR6
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Metabolism of folate and pterines
  • ALDH1L1
  • ALDH1L2
  • DHFR
  • DHFR2
  • DHFRL1
  • DHFRP4
  • FLOT1
  • FOLR2
  • FTHFD
  • FTHFSDC1
  • G21
  • HCP1
  • MFT
  • MFTC
  • MTHFC
  • MTHFD
  • MTHFD1
  • MTHFD1L
  • MTHFD2
  • MTHFD2L
  • MTHFR
  • MTHFS
  • NMDMC
  • PCFT
  • RFC1
  • SHMT1
  • SHMT2
  • SLC19A1
  • SLC25A32
  • SLC46A1
Homo sapiens (human)
Smooth Muscle Contraction
  • ALDH2
  • ALDM
  • ANX1
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANX6
  • ANXA1
  • ANXA2
  • ANXA6
  • C15orf13
  • CACNA1G
  • CACNA1H
  • CACNA1I
  • CAD
  • CAL1H
  • CALD1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV3
  • CDM
  • DYSF
  • FER1L1
  • GUC1A2
  • GUC1A3
  • GUC1B3
  • GUCSA2
  • GUCSA3
  • GUCSB3
  • GUCY1A1
  • GUCY1A2
  • GUCY1A3
  • GUCY1B1
  • GUCY1B2
  • GUCY1B3
  • HSRLC
  • ITGA1
  • ITGB5
  • KIAA0866
  • KIAA0894
  • KIAA1027
  • KIAA1120
  • KIAA1123
  • KIAA1296
  • LMOD1
  • LPC1
  • LPC2D
  • MG53
  • MLC1SA
  • MLC2
  • MLCB
  • MLCK
  • MLCK1
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MRLC3
  • MYH11
  • MYL10
  • MYL11
  • MYL12A
  • MYL12B
  • MYL2A
  • MYL5
  • MYL6
  • MYL6B
  • MYL7
  • MYL9
  • MYLC2A
  • MYLC2B
  • MYLC2PL
  • MYLK
  • MYLK1
  • MYLPF
  • MYRL2
  • PAK1
  • PAK2
  • PDE5
  • PDE5A
  • PLRLC
  • PXN
  • RLC
  • SCAM1
  • SH3D5
  • SORBS1
  • SORBS3
  • TLN
  • TLN1
  • TMSA
  • TMSB
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • TPM4
  • TRIM72
  • VCL
Homo sapiens (human)
Metabolism of serotonin
  • ALDH2
  • ALDM
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Proline catabolism
  • ALDH4
  • ALDH4A1
  • HSPOX1
  • HYPDH
  • P5CDH
  • PIG6
  • POX2
  • PRODH
  • PRODH2
Homo sapiens (human)
Choline catabolism
  • ALDH7A1
  • ATQ1
  • BHMT
  • CD92
  • CDW92
  • CHDH
  • CTL1
  • DMGDH
  • DMGDHL1
  • SARDH
  • SLC44A1
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG10
  • ALG10A
  • ALG10B
  • ALG11
  • ALG12
  • ALG13
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • CXorf45
  • DIBD1
  • DPAGT1
  • DPAGT2
  • GLT28D1
  • GT8
  • HMAT1
  • HMT1
  • KCR1
  • MPDU1
  • NOT
  • NOT56L
  • RFT1
Homo sapiens (human)
Defective ALG14 causes ALG14-CMS
  • ALG13
  • ALG14
  • CXorf45
  • GLT28D1
Homo sapiens (human)
Defective ALG3 causes CDG-1d
  • ALG3
  • NOT
  • NOT56L
Homo sapiens (human)
Defective ALG6 causes CDG-1c
  • ALG6
Homo sapiens (human)
Defective ALG9 causes CDG-1l
  • ALG9
  • DIBD1
Homo sapiens (human)
Signaling by ALK
  • ALK
  • ALKAL1
  • ALKAL2
  • APRF
  • BHLHE37
  • BHLHE39
  • FAM150A
  • FAM150B
  • FRS2
  • GRB1
  • HBNF1
  • HCP
  • IRS1
  • JAK3
  • MDK
  • MK1
  • MYC
  • MYCN
  • NEGF1
  • NEGF2
  • NMYC
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLC1
  • PLCG1
  • PTN
  • PTP1C
  • PTPN6
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Signaling by ALK fusions and activated point mutants
  • ALK
  • ALO17
  • APRF
  • ASH
  • ATIC
  • BCL11A
  • BCL2L3
  • BIRC6
  • C17orf27
  • C2orf2
  • C2orf44
  • CAP20
  • CARS
  • CARS1
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CTIP1
  • DCTN1
  • EEF1G
  • EF1G
  • EIF2AK3
  • EMAPL4
  • EML4
  • EVI9
  • FBX20
  • FBXO20
  • FN
  • FN1
  • FRS2
  • FRS3
  • GCC2
  • GRB1
  • GRB2
  • HIP1
  • IL10
  • IL22
  • ILTIF
  • IRS1
  • JNK1
  • JNK2
  • JUN
  • KIAA0034
  • KIAA0336
  • KIAA0858
  • KIAA0905
  • KIAA1230
  • KIAA1289
  • KIAA1398
  • KIAA1554
  • KIAA1618
  • KIAA1809
  • KIF5B
  • KLC
  • KLC1
  • KNS
  • KNS1
  • KNS2
  • LMO7
  • MAPK8
  • MAPK9
  • MCL1
  • MDA6
  • MDM2
  • MSN
  • MYH9
  • MYSTR
  • NPM
  • NPM1
  • NUP358
  • ORCA
  • OSIL
  • P53
  • PEK
  • PERK
  • PIC1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKR1
  • PLC1
  • PLCG1
  • PP2CB
  • PPFIBP1
  • PPM1B
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKM8
  • PRKM9
  • PURH
  • RANBP2
  • RANBP2L4
  • RNF213
  • RPS27A
  • RRBP1
  • SAPK1
  • SAPK1A
  • SAPK1C
  • SDI1
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • SQSTM1
  • STAT1
  • STAT3
  • STRN
  • TFG
  • TP53
  • TPM3
  • TPM4
  • TPR
  • TSE1
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCL
  • WAF1
  • WDCP
  • ZCYTO18
  • ZNF856
Homo sapiens (human)
ALK mutants bind TKIs
  • ALK
  • BCL11A
  • BIRC6
  • C2orf2
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CTIP1
  • EIF2AK3
  • EMAPL4
  • EML4
  • EVI9
  • FN
  • FN1
  • HIP1
  • KIAA0034
  • KIAA1289
  • KIAA1809
  • NPM
  • NPM1
  • PEK
  • PERK
  • PKR1
  • PP2CB
  • PPM1B
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • STRN
  • TSE1
  • ZNF856
Homo sapiens (human)
MDK and PTN in ALK signaling
  • ALK
  • HBNF1
  • HTPZP2
  • MDK
  • MK1
  • NEGF1
  • NEGF2
  • PTN
  • PTPRZ
  • PTPRZ1
  • PTPRZ2
  • PTPZ
Homo sapiens (human)
ASP-3026-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
NVP-TAE684-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
brigatinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
lorlatinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
alectinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
ceritinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
crizotinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
TGFBR3 regulates TGF-beta signaling
  • ALK5
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • C19orf3
  • GIPC
  • GIPC1
  • RGS19IP1
  • SKR4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • ALK5
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGEF18
  • CGN
  • F11R
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • JAM1
  • JCAM
  • KIAA0521
  • KIAA1319
  • KIAA1625
  • PAR3
  • PAR3A
  • PAR6A
  • PARD3
  • PARD6A
  • PKC2
  • PRKCZ
  • RHO12
  • RHOA
  • RPS27A
  • SKR4
  • SMURF1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • ALK5
  • BAMBI
  • CHIP
  • CRM1
  • GADD34
  • KIAA0439
  • KIAA0529
  • KIAA0647
  • KIAA1625
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAWD
  • MTMR4
  • NEDD4L
  • NEDL3
  • NMA
  • PMEPA1
  • PPP1A
  • PPP1CA
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • PPP1R15A
  • RPS27A
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SMURF1
  • SMURF2
  • STAG1
  • STRAP
  • STUB1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TMEPAI
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UCH37
  • UCHL5
  • UNRIP
  • USP15
  • XPO1
  • ZFYVE11
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024