GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1326 - 1350 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
MET activates PTPN11
  • GAB1
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
Homo sapiens (human)
Signaling by plasma membrane FGFR1 fusions
  • BAG4
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CEK
  • ERLIN2
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SODD
  • SPFH2
Homo sapiens (human)
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta)
  • COCA2
  • DUC1
  • DUG
  • EXO1
  • EXOI
  • HEX1
  • KIAA0039
  • LIG1
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH3
  • PCNA
  • PMS2
  • PMSL2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in WNT signaling
  • AML1
  • AXIN
  • AXIN1
  • CBFA2
  • CBFB
  • ESR
  • ESR1
  • FOXP3
  • IPEX
  • NR3A1
  • PWTSR
  • RSPO3
  • RUNX1
  • THSD2
Homo sapiens (human)
Chk1/Chk2(Cds1) mediated inactivation of Cyclin B:Cdk1 complex
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC25C
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CDS1
  • CHEK1
  • CHEK2
  • CHK1
  • CHK2
  • HME1
  • P34CDC2
  • RAD53
  • SFN
  • WEE1
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Transcription of the HIV genome
  • BA2R
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCG1
  • CCGS
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CIF150
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2B
  • GTF2D1
  • GTF2E1
  • GTF2E2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RBP56
  • RNF66
  • RPB7
  • STK1
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF15
  • TAF1L
  • TAF2
  • TAF2A
  • TAF2B
  • TAF2C
  • TAF2C1
  • TAF2C2
  • TAF2D
  • TAF2E
  • TAF2F
  • TAF2G
  • TAF2H
  • TAF2I
  • TAF2J
  • TAF2K
  • TAF2N
  • TAF2Q
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4A
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TAF9L
  • TAFII105
  • TAFII130
  • TAFII135
  • TAFII18
  • TAFII20
  • TAFII30
  • TAFII31
  • TAFII55
  • TAFII70
  • TBP
  • TF2A1
  • TF2A2
  • TF2B
  • TF2D
  • TF2E1
  • TF2E2
  • TFIIB
  • TFIID
  • TTDA
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Regorafenib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Regulation of NF-kappa B signaling
  • CASP8
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBIP
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKIP
  • IKKA
  • IKKB
  • ISG43
  • KIAA0014
  • KIAA0615
  • LRRC14
  • MCH5
  • N4BP1
  • NEMO
  • NLRC5
  • NLRX1
  • NOD27
  • NOD4
  • NOD5
  • NOD9
  • P53
  • RNF85
  • RPS27A
  • TCF16
  • TGT
  • TP53
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP14
  • USP18
Homo sapiens (human)
Defective SLC12A1 causes Bartter syndrome 1 (BS1)
  • NKCC2
  • SLC12A1
Homo sapiens (human)
Chylomicron assembly
  • APC2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • ERBA2L
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
Homo sapiens (human)
Enhanced cleavage of VWF variant by ADAMTS13
  • ADAMTS13
  • C9orf8
  • F8VWF
  • VWF
Homo sapiens (human)
EPH-Ephrin signaling
  • BSK
  • DRT
  • ECK
  • EEK
  • EFL2
  • EFL3
  • EFNA1
  • EFNA2
  • EFNA3
  • EFNA4
  • EFNA5
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • EHK1
  • EHK2
  • EHK3
  • ELK
  • EPH
  • EPHA1
  • EPHA10
  • EPHA2
  • EPHA3
  • EPHA4
  • EPHA5
  • EPHA6
  • EPHA7
  • EPHA8
  • EPHB1
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
  • EPHT
  • EPHT1
  • EPHT2
  • EPHT3
  • EPLG1
  • EPLG2
  • EPLG3
  • EPLG4
  • EPLG5
  • EPLG6
  • EPLG7
  • EPLG8
  • EPTH3
  • ERK
  • ETK
  • ETK1
  • ETK2
  • FYN
  • HEK
  • HEK11
  • HEK12
  • HEK2
  • HEK3
  • HEK5
  • HEK6
  • HEK7
  • HEK8
  • HTK
  • HTKL
  • JTK8
  • KIAA1459
  • LERK1
  • LERK2
  • LERK3
  • LERK4
  • LERK5
  • LERK6
  • LERK7
  • LERK8
  • LYN
  • MYK1
  • NET
  • SEK
  • TNFAIP4
  • TYRO1
  • TYRO11
  • TYRO4
  • TYRO5
  • TYRO6
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Drug-mediated inhibition of MET activation
  • HGF
  • HPTA
  • MET
Homo sapiens (human)
Collagen biosynthesis and modifying enzymes
  • ADAMTS14
  • ADAMTS2
  • ADAMTS3
  • BMP1
  • BP180
  • BPAG2
  • C1orf17
  • C3orf7
  • CASP
  • CBP1
  • CBP2
  • COL10A1
  • COL11A1
  • COL11A2
  • COL12A1
  • COL12A1L
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL15A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL1AL
  • COL20A1
  • COL21A1
  • COL22A1
  • COL23A1
  • COL24A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • COL27A1
  • COL28
  • COL28A1
  • COL29A1
  • COL2A1
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL4A6
  • COL5A1
  • COL5A2
  • COL5A3
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL7A1
  • COL8A1
  • COL8A2
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COLGALT1
  • COLGALT2
  • COLL6
  • CRTAP
  • CYPB
  • EMID2
  • EMU2
  • ERBA2L
  • GLT25D1
  • GLT25D2
  • GROS1
  • HSP47
  • KIAA0366
  • KIAA0584
  • KIAA0932
  • KIAA1510
  • KIAA1870
  • LEPRE1
  • LEPREL1
  • LEPREL2
  • LLH
  • MLAT4
  • P3H1
  • P3H2
  • P3H3
  • P4HA
  • P4HA1
  • P4HA2
  • P4HA3
  • P4HB
  • PCINP
  • PCOLC
  • PCOLCE
  • PCOLCE2
  • PCPE1
  • PCPE2
  • PCPNI
  • PDI
  • PDIA1
  • PLOD
  • PLOD1
  • PLOD2
  • PLOD3
  • PO4DB
  • PPIB
  • SERPINH1
  • SERPINH2
  • TLL
  • TLL1
  • TLL2
  • UND
  • VWA4
Homo sapiens (human)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ABCP
  • ACO1
  • BCRP
  • BCRP1
  • BOCT
  • BOIT
  • CAND1
  • CP
  • CUL1
  • CYBRD1
  • DCT1
  • DCYTB
  • DMT1
  • EMC19
  • FBL4
  • FBL5
  • FBXL5
  • FLR1
  • FPN
  • FPN1
  • FRRS3
  • FTH
  • FTH1
  • FTHL6
  • FTL
  • FTMT
  • G21
  • GLRX3
  • HCP1
  • HEPH
  • HMOX1
  • HMOX2
  • HNL
  • HO
  • HO1
  • HO2
  • IREB1
  • IREB2
  • IREG1
  • KIAA0698
  • KIAA0829
  • LCN2
  • MXR
  • NEDD8
  • NGAL
  • NRAMP2
  • OCP2
  • PCFT
  • PICOT
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SLC11A2
  • SLC11A3
  • SLC22A17
  • SLC40A1
  • SLC46A1
  • TCEB1L
  • TF
  • TIP120
  • TIP120A
  • TXNL2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
RUNX2 regulates osteoblast differentiation
  • ABL
  • ABL1
  • AR
  • BGLAP
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB39
  • C10orf49
  • CBFB
  • CHF1
  • CHF2
  • COL1A1
  • DHTR
  • EHZF
  • ERK1
  • ERK2
  • GLI3
  • GRL
  • HDAC3
  • HDAC6
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRY
  • JTK7
  • KIAA0901
  • KIAA1034
  • LIP3
  • MAF
  • MAPK1
  • MAPK3
  • NR3C4
  • OSX
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RB1
  • SATB2
  • SP7
  • SRC
  • SRC1
  • TAZ
  • UCMA
  • WWTR1
  • YAP1
  • YAP65
  • YES
  • YES1
  • ZNF521
Homo sapiens (human)
Formation of axial mesoderm
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • FAST1
  • FAST2
  • FOXA1
  • FOXA2
  • FOXH1
  • HNF3A
  • HNF3B
  • LEF1
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • NOTO
  • RTEF1
  • SHH
  • SMAD2
  • SMAD3
  • T
  • TBXT
  • TCF1
  • TCF13L1
  • TCF3A
  • TCF3B
  • TCF7
  • TEAD2
  • TEAD4
  • TEF3
  • TEF4
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
Calmodulin induced events
  • ADRBK1
  • BARK
  • BARK1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • GRK2
  • PKCA
  • PKCD
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCG
Homo sapiens (human)
Defective visual phototransduction due to OPN1SW loss of function
  • BCP
  • OPN1SW
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of EPA-derived SPMs
  • COX2
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • GCK
  • GCKR
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Sodium-coupled sulphate, di- and tri-carboxylate transporters
  • NACT
  • NADC1
  • NADC3
  • NAS1
  • NASI1
  • SDCT1
  • SDCT2
  • SLC13A1
  • SLC13A2
  • SLC13A3
  • SLC13A4
  • SLC13A5
  • SUT1
Homo sapiens (human)
Loss of Nlp from mitotic centrosomes
  • ACTR1A
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • ALMS1
  • AZI1
  • BBS14
  • BITE
  • C14orf94
  • C15orf25
  • C18orf9
  • C4orf15
  • C9orf81
  • CALT
  • CCCAP
  • CCDC5
  • CCP110
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK5RAP2
  • CDKN1
  • CEN2
  • CENPJ
  • CEP1
  • CEP110
  • CEP131
  • CEP135
  • CEP152
  • CEP164
  • CEP192
  • CEP2
  • CEP215
  • CEP250
  • CEP27
  • CEP290
  • CEP4
  • CEP41
  • CEP43
  • CEP57
  • CEP63
  • CEP70
  • CEP72
  • CEP76
  • CEP78
  • CETN2
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CNAP1
  • CNTRL
  • CP110
  • CPAP
  • CSNK1D
  • CSNK1E
  • CTRN1
  • CXorf5
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN50
  • DGT6
  • DHC1
  • DLC1
  • DNCH1
  • DNCI2
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I2
  • DYNLL1
  • FAM29A
  • FGFR1OP
  • FOP
  • HAUS1
  • HAUS2
  • HAUS3
  • HAUS4
  • HAUS5
  • HAUS6
  • HAUS7
  • HAUS8
  • HCKID
  • HDLC1
  • HEIC
  • HICE1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA0092
  • KIAA0097
  • KIAA0325
  • KIAA0328
  • KIAA0373
  • KIAA0402
  • KIAA0419
  • KIAA0542
  • KIAA0622
  • KIAA0635
  • KIAA0803
  • KIAA0841
  • KIAA0912
  • KIAA0980
  • KIAA1052
  • KIAA1118
  • KIAA1519
  • KIAA1569
  • KIAA1574
  • KIAA1633
  • LAP
  • LIP1
  • LIS1
  • MAPRE1
  • MAST1
  • MDCR
  • MDS
  • NA14
  • NDE1
  • NEDD1
  • NEK2
  • NEK2A
  • NINL
  • NLK1
  • NLP
  • NPHP10
  • NPHP15
  • NPHP6
  • NUDE
  • ODF2
  • OFD1
  • P34CDC2
  • PAFAH1B1
  • PAFAHA
  • PCM1
  • PCNT
  • PCNT2
  • PKACA
  • PLK
  • PLK1
  • PLK4
  • PPP2R1A
  • PRKACA
  • PRKAR2B
  • SAK
  • SDCCAG8
  • SFI1
  • SSNA1
  • STK18
  • TSGA14
  • TSP57
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA3
  • TUBA4A
  • TUBB
  • TUBB2C
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBG
  • TUBG1
  • UCHL5IP
  • UIP1
  • YWHAE
  • YWHAG
Homo sapiens (human)
Defective Mismatch Repair Associated With MSH6
  • GTBP
  • MSH2
  • MSH6
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Expression
  • BLIMP1
  • P53
  • PRDM1
  • TP53
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: December 9, 2024