GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1651 - 1675 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
ROBO receptors bind AKAP5
  • AKAP5
  • AKAP79
  • CALNA2
  • CALNB
  • CNA2
  • KIAA1568
  • PKACA
  • PKCA
  • PKR2
  • PPP3CB
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKCA
  • ROBO2
Homo sapiens (human)
Defective HLCS causes multiple carboxylase deficiency
  • ACAC
  • ACACA
  • ACC1
  • ACCA
  • HLCS
  • MCCA
  • MCCB
  • MCCC1
  • MCCC2
  • PC
  • PCCA
  • PCCB
Homo sapiens (human)
Defective SLC24A4 causes hypomineralized amelogenesis imperfecta (AI)
  • NCKX4
  • SLC24A4
Homo sapiens (human)
Processing of Intronless Pre-mRNAs
  • CBP20
  • CBP80
  • CFIM25
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • FIP1
  • FIP1L1
  • HEAB
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA1367
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PCF11
  • RHE
  • SPK
  • SYMPK
  • WDC146
  • WDR33
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation of testis differentiation
  • AD4BP
  • AMH
  • DHH
  • DMRT1
  • DMT1
  • FGF9
  • FOG2
  • FTZF1
  • GATA4
  • MIF
  • NR5A1
  • PDS
  • PTGDS
  • SF1
  • SOX9
  • SRY
  • TDF
  • WT1
  • ZFPM2
  • ZNF89B
Homo sapiens (human)
Cytochrome P450 - arranged by substrate type
  • CYPOR
  • POR
Homo sapiens (human)
Synthesis of 12-eicosatetraenoic acid derivatives
  • 12LO
  • ALOX12
  • ALOX12B
  • ALOX15
  • ALOXE3
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG12
  • LOG15
Homo sapiens (human)
RUNX2 regulates chondrocyte maturation
  • CBFB
  • GLI2
  • HDAC4
  • IHH
  • KIAA0288
  • THP
Homo sapiens (human)
Signaling by MAPK mutants
  • C11orf81
  • DUSP10
  • DUSP16
  • DUSP6
  • DUSP7
  • DUSP8
  • DUSP9
  • ERK2
  • KIAA1700
  • MAPK1
  • MKP3
  • MKP4
  • MKP5
  • MKP7
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PYST1
  • PYST2
  • VH5
Homo sapiens (human)
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • ACHRA
  • CHNRA
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
  • NACHRA3
  • NACHRA5
  • NACRA4
Homo sapiens (human)
Defective SLC34A3 causes Hereditary hypophosphatemic rickets with hypercalciuria (HHRH)
  • NPT2C
  • NPTIIC
  • SLC34A3
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II HIV Promoter Escape
  • BA2R
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCG1
  • CCGS
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CIF150
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2B
  • GTF2D1
  • GTF2E1
  • GTF2E2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RBP56
  • RNF66
  • RPB7
  • STK1
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF15
  • TAF1L
  • TAF2
  • TAF2A
  • TAF2B
  • TAF2C
  • TAF2C1
  • TAF2C2
  • TAF2D
  • TAF2E
  • TAF2F
  • TAF2G
  • TAF2H
  • TAF2I
  • TAF2J
  • TAF2K
  • TAF2N
  • TAF2Q
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4A
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TAF9L
  • TAFII105
  • TAFII130
  • TAFII135
  • TAFII18
  • TAFII20
  • TAFII30
  • TAFII31
  • TAFII55
  • TAFII70
  • TBP
  • TF2A1
  • TF2A2
  • TF2B
  • TF2D
  • TF2E1
  • TF2E2
  • TFIIB
  • TFIID
  • TTDA
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Regulation of RAS by GAPs
  • ADRM1
  • AF9Q34
  • AIP1
  • C7orf76
  • CAPRI
  • CUL3
  • DAB2IP
  • DSS1
  • EVE-3
  • GAP
  • GAP1M
  • GAPL
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HRAS
  • HRAS1
  • HSPC
  • KBTBD7
  • KIAA0107
  • KIAA0538
  • KIAA0617
  • KIAA1743
  • KIAA1938
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NF1
  • NGAP
  • NRAS
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RASA
  • RASA1
  • RASA2
  • RASA3
  • RASA4
  • RASAL
  • RASAL1
  • RASAL2
  • RASAL3
  • RASGAP
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SPRED1
  • SPRED2
  • SPRED3
  • SUG1
  • SUG2
  • SYNGAP1
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Signaling by VEGF
  • AAMP
  • VEGF
  • VEGFA
Homo sapiens (human)
Bloch pathway
  • D7SR
  • DHCR24
  • DHCR7
  • EBP
  • KIAA0018
  • SC5D
  • SC5DL
Homo sapiens (human)
Defective DHDDS causes RP59
  • C6orf68
  • DHDDS
  • HDS
  • NGBR
  • NUS1
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression
  • AIB3
  • ARC205
  • ARNTL
  • ARNTL2
  • ARVP
  • AVP
  • BAF60C
  • BHLHB2
  • BHLHB3
  • BHLHE40
  • BHLHE41
  • BHLHE5
  • BHLHE6
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BHLHE8
  • BHLHE9
  • BMAL1
  • BMAL2
  • CARM1
  • CBP
  • CCR4
  • CCRN4L
  • CHD9
  • CLIF
  • CLOCK
  • CREBBP
  • CRSP1
  • CRSP200
  • DBP
  • DEC1
  • DEC2
  • DRIP205
  • DRIP230
  • F7
  • HCA137
  • HELZ2
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA0334
  • KIAA1769
  • KISH2
  • KKLF
  • KLF15
  • MED1
  • MOP3
  • MOP4
  • MOP9
  • NAMPT
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NOC
  • NOCT
  • NPAS2
  • NR1C1
  • NR2B1
  • PAI1
  • PASD3
  • PASD4
  • PASD9
  • PBEF
  • PBEF1
  • PBP
  • PIMT
  • PLANH1
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAP250
  • RB18A
  • RXRA
  • SERPINE1
  • SHARP1
  • SHARP2
  • SMARCD3
  • SRC1
  • SRC2
  • STRA13
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • TIF2
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
  • VP
Homo sapiens (human)
EPH-ephrin mediated repulsion of cells
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APH1A
  • APH1B
  • BSK
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLG4A
  • CLG4B
  • CLH17
  • CLH22
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL
  • CLTCL1
  • CLTCL2
  • CLTD
  • DNM
  • DNM1
  • DRT
  • ECK
  • EEK
  • EFL2
  • EFL3
  • EFNA1
  • EFNA2
  • EFNA3
  • EFNA4
  • EFNA5
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • EHK1
  • EHK2
  • EHK3
  • ELK
  • EPH
  • EPHA1
  • EPHA10
  • EPHA2
  • EPHA3
  • EPHA4
  • EPHA5
  • EPHA6
  • EPHA7
  • EPHA8
  • EPHB1
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
  • EPHT
  • EPHT1
  • EPHT2
  • EPHT3
  • EPLG1
  • EPLG2
  • EPLG3
  • EPLG4
  • EPLG5
  • EPLG6
  • EPLG7
  • EPLG8
  • EPTH3
  • ERK
  • ETK
  • ETK1
  • ETK2
  • FYN
  • HEK
  • HEK11
  • HEK12
  • HEK2
  • HEK3
  • HEK5
  • HEK6
  • HEK7
  • HEK8
  • HIP9
  • HTK
  • HTKL
  • HYPJ
  • JTK8
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0253
  • KIAA0899
  • KIAA1459
  • KUZ
  • LERK1
  • LERK2
  • LERK3
  • LERK4
  • LERK5
  • LERK6
  • LERK7
  • LERK8
  • LYN
  • MADM
  • MMP2
  • MMP9
  • MYK1
  • NCSTN
  • NET
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RAC1
  • SEK
  • STM2
  • TC25
  • TIAM1
  • TNFAIP4
  • TYRO1
  • TYRO11
  • TYRO4
  • TYRO5
  • TYRO6
  • VAV2
  • VAV3
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Defective POMT1 causes MDDGA1, MDDGB1 and MDDGC1
  • DAG1
  • POMT1
  • POMT2
Homo sapiens (human)
Z-decay: degradation of maternal mRNAs by zygotically expressed factors
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DDX48
  • DIS3L2
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4A3
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • FAM6A
  • HS2
  • KIAA0111
  • KIAA0191
  • KIAA1711
  • PAB1
  • PAB2
  • PABP
  • PABP1
  • PABP2
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PABPN1
  • PAIP1
  • TUT4
  • TUT7
  • ZCCHC11
  • ZCCHC6
Homo sapiens (human)
Synthesis of PIPs at the ER membrane
  • KIAA0851
  • KIAA1073
  • MTMR2
  • MTMR5
  • PI4K2B
  • PI4KA
  • PIK4
  • PIK4CA
  • SAC1
  • SACM1L
  • SBF1
Homo sapiens (human)
G2/M Checkpoints
  • ADRM1
  • C7orf76
  • DSS1
  • GP110
  • GTSE1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • P53
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Defective MMAB causes MMA, cblB type
  • MMAB
Homo sapiens (human)
GSD 0 (muscle)
  • GYG
  • GYG1
  • GYS
  • GYS1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: December 9, 2024