GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1751 - 1775 of 2074 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Stimulation of the cell death response by PAK-2p34
  • CASP3
  • CPP32
  • PAK2
Homo sapiens (human)
Stimuli-sensing channels
  • ACCN
  • ACCN1
  • ACCN2
  • ACCN3
  • ACCN4
  • ACCN5
  • ANO1
  • ANO10
  • ANO2
  • ANO3
  • ANO4
  • ANO5
  • ANO6
  • ANO7
  • ANO8
  • ANO9
  • ASIC1
  • ASIC2
  • ASIC3
  • ASIC4
  • ASIC5
  • ASPH
  • BAH
  • BART
  • BEST1
  • BEST2
  • BEST3
  • BEST4
  • BNAC1
  • BNAC2
  • BND7
  • BSND
  • C11orf25
  • C12orf3
  • C17orf29
  • C2orf21
  • CACC1
  • CACC3
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CISK
  • CLC1
  • CLCA1
  • CLCA2
  • CLCA3
  • CLCA3P
  • CLCA4
  • CLCK2
  • CLCN1
  • CLCN2
  • CLCN3
  • CLCN4
  • CLCN5
  • CLCN6
  • CLCN7
  • CLCNKA
  • CLCNKB
  • CLIC2
  • CaCC2
  • DNACH
  • DOG1
  • DSIPI
  • EPB72
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FKBP1L
  • FKBP9
  • GDD1
  • GILZ
  • GL
  • HBRR
  • HINAC
  • HSN2
  • KDP
  • KIAA0046
  • KIAA0344
  • KIAA0439
  • KIAA1169
  • KIAA1409
  • KIAA1566
  • KIAA1623
  • KIAA1691
  • KIAA1760
  • KIAA1843
  • MDEG
  • NALCN
  • NEDD4L
  • NEDL3
  • NGEP
  • NHA1
  • NHA2
  • NHEDC1
  • NHEDC2
  • NPT4
  • ORAOV2
  • OSTM1
  • OTK4
  • PCANAP5
  • PIG5
  • PRKWNK1
  • PRKWNK2
  • PRKWNK3
  • PRKWNK4
  • RAF
  • RAF1
  • RPS27A
  • RYDR
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SCNN1
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
  • SDCCAG43
  • SGK
  • SGK1
  • SGK2
  • SGK3
  • SGKL
  • SLC17A3
  • SLC9A10
  • SLC9A11
  • SLC9B1
  • SLC9B2
  • SLC9C1
  • SLC9C2
  • SLNAC1
  • SRI
  • STOM
  • STOML3
  • TAOS2
  • TMEM16A
  • TMEM16B
  • TMEM16C
  • TMEM16D
  • TMEM16E
  • TMEM16F
  • TMEM16G
  • TMEM16H
  • TMEM16J
  • TMEM16K
  • TNAC1
  • TP53I5
  • TPC1
  • TPC2
  • TPCN1
  • TPCN2
  • TRDN
  • TSC22D3
  • TTYH2
  • TTYH3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UNC79
  • UNC80
  • VGCNL1
  • VMD2
  • VMD2L1
  • VMD2L2
  • VMD2L3
  • WNK1
  • WNK2
  • WNK3
  • WNK4
  • WWP1
Homo sapiens (human)
Striated Muscle Contraction
  • ACTN2
  • ACTN3
  • C15orf13
  • D9S57E
  • DES
  • DMD
  • MLC1
  • MLC2
  • MYBPC1
  • MYBPC2
  • MYBPC3
  • MYBPCF
  • MYBPCS
  • MYH3
  • MYH6
  • MYH8
  • MYHCA
  • MYL1
  • MYL2
  • MYL3
  • MYL4
  • NEB
  • NTMOD
  • TCAP
  • TMOD
  • TMOD1
  • TMOD2
  • TMOD3
  • TMOD4
  • TMSA
  • TMSB
  • TNNC
  • TNNC1
  • TNNC2
  • TNNI1
  • TNNI2
  • TNNI3
  • TNNT1
  • TNNT2
  • TNNT3
  • TNT
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • TPM4
  • TTN
  • VIM
Homo sapiens (human)
Succinyl-CoA Biosynthesis
  • DLD
  • DLST
  • DLTS
  • GCSL
  • KGD4
  • LAD
  • MRPS36
  • OGDH
  • PHE3
Homo sapiens (human)
Sulfide oxidation to sulfate
  • DIC
  • ETHE1
  • HSCO
  • KAT
  • SLC25A10
  • SQOR
  • SQRDL
  • SUOX
  • TST
  • TSTD1
Homo sapiens (human)
Sulfur amino acid metabolism
  • AHCY
  • AMS1
  • BHMT
  • BHMT2
  • MAT1A
  • MATA1
  • MTR
  • MTRR
  • SAHH
Homo sapiens (human)
Sunitinib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Sunitinib-resistant PDGFR mutants
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)
Suppression of apoptosis
  • ALO17
  • C17orf27
  • CTSG
  • ERK1
  • ERK2
  • GSK3A
  • KIAA1554
  • KIAA1618
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYSTR
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PSF
  • RFP
  • RNF213
  • RNF76
  • Rv3364c
  • Rv3654c
  • Rv3655c
  • SFPQ
  • TRIM27
  • lprM
  • mce3E
  • mptpA
  • ptpA
Homo sapiens (human)
Suppression of autophagy
  • DUSP16
  • KIAA1700
  • MKP7
  • RAB7
  • RAB7A
  • eis
  • sapM
Homo sapiens (human)
Surfactant metabolism
  • ABC3
  • ABCA3
  • ADA2
  • ADGF
  • ADGRF5
  • ADORA2
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • ADRA2L2
  • ADRA2R
  • ADRA2RL2
  • ADRAR
  • BR22
  • CCDC59
  • CECR1
  • CKAP4
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CPSB
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • CTSH
  • DMBT1
  • GATA6
  • GP340
  • GPR116
  • IDGFL
  • IL3RB
  • IL5RB
  • KIAA0758
  • LMCD1
  • NAP1
  • NAPA
  • NAPSA
  • NPT2
  • P2RU1
  • P2RY2
  • PGA3
  • PGA4
  • PGA5
  • PSAP
  • PSPD
  • REAM
  • REC
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
  • SLC17A2
  • SLC34A1
  • SLC34A2
  • TAP26
  • TTF1
  • ZDHHC2
  • ZNF372
Homo sapiens (human)
Switching of origins to a post-replicative state
  • BM28
  • CCNL1
  • CDC21
  • CDC46
  • CDC47
  • CDCL1
  • CDT1
  • GMNN
  • KIAA0030
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
Homo sapiens (human)
Synaptic adhesion-like molecules
  • ASYIP
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • ESA1
  • FLOT1
  • FLOT2
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GLUR3
  • GLUR4
  • GLURC
  • GRIA1
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GluA3
  • GluA4
  • GluN2D
  • KIAA1232
  • KIAA1246
  • KIAA1484
  • LAR
  • LRFN1
  • LRFN2
  • LRFN3
  • LRFN4
  • M17S1
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • NSPL2
  • PSD95
  • PTPRD
  • PTPRF
  • PTPRS
  • RTN3
  • SALM1
  • SALM2
  • SALM3
  • SALM4
Homo sapiens (human)
Syndecan interactions
  • ACTN1
  • CASK
  • CD49B
  • FGF2
  • FGFB
  • FNRB
  • GP3A
  • HSPG1
  • HXB
  • ITGA2
  • ITGA6
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB4
  • ITGB5
  • KIAA0468
  • LIN2
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • SBDN
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TGFB
  • TGFB1
  • THBS1
  • TNC
  • TRAPPC4
  • TSP
  • TSP1
  • VNRA
  • VTN
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Synthesis And Processing Of GAG, GAGPOL Polyproteins
  • gag
Homo sapiens (human)
Synthesis and processing of ENV and VPU
  • FUR
  • FURIN
  • PACE
  • PCSK3
  • env
  • vpu
Homo sapiens (human)
Synthesis of (16-20)-hydroxyeicosatetraenoic acids (HETE)
  • CYP1A1
  • CYP1A2
  • CYP1B1
  • CYP2C10
  • CYP2C19
  • CYP2C8
  • CYP2C9
  • CYP2U1
  • CYP4A11
  • CYP4A2
  • CYP4F2
Homo sapiens (human)
Synthesis of 12-eicosatetraenoic acid derivatives
  • 12LO
  • ALOX12
  • ALOX12B
  • ALOX15
  • ALOXE3
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG12
  • LOG15
Homo sapiens (human)
Synthesis of 15-eicosatetraenoic acid derivatives
  • ALOX15
  • ALOX15B
  • COX2
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG15
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Synthesis of 5-eicosatetraenoic acids
  • ALOX5
  • ALOX5AP
  • FLAP
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG5
  • LTC4S
  • PON
  • PON1
  • PON2
  • PON3
Homo sapiens (human)
Synthesis of Dolichyl-phosphate
  • C6orf68
  • DHDDS
  • DOLK
  • DOLPP1
  • HDS
  • KIAA1094
  • LSFR2
  • MPD
  • MVD
  • NGBR
  • NUS1
  • SRD5A2L
  • SRD5A3
  • TMEM15
Homo sapiens (human)
Synthesis of GDP-mannose
  • GMPPA
  • GMPPB
  • HK1
  • MPI
  • PMI1
  • PMM1
  • PMM2
  • PMMH22
Homo sapiens (human)
Synthesis of Hepoxilins (HX) and Trioxilins (TrX)
  • 12LO
  • ALOX12
  • LOG12
Homo sapiens (human)
Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol
  • 5PTASE
  • ALDRL6
  • C8orf9
  • IMP.18P
  • IMPA
  • IMPA1
  • IMPA2
  • INO1
  • INPP1
  • INPP4A
  • INPP4B
  • INPP5A
  • INPP5B
  • INPP5J
  • ISYNA1
  • KIAA0910
  • KSP32
  • MIOX
  • MTMR7
  • MTMR8
  • MTMR9
  • OCRL
  • OCRL1
  • OCRL2
  • PIB5PA
  • PIPP
  • RSOR
  • SYNJ1
Homo sapiens (human)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • C14orf175
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • INPP5B
  • INPP5D
  • INPP5J
  • INPPL1
  • IP3KC
  • ITPK1
  • ITPKA
  • ITPKB
  • ITPKC
  • KIAA0450
  • KIAA0581
  • KIAA0910
  • KIAA1069
  • KIAA1516
  • KIAA1964
  • MMAC1
  • OCRL
  • OCRL1
  • OCRL2
  • PIB5PA
  • PIPP
  • PLC1
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PLCD1
  • PLCD3
  • PLCD4
  • PLCE
  • PLCE1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLCH1
  • PLCH2
  • PLCL3
  • PLCL4
  • PLCZ1
  • PLD4
  • PPLC
  • PTEN
  • SHIP
  • SHIP1
  • SHIP2
  • SYNJ1
  • TEP1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024