GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1951 - 1975 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Complex I biogenesis
  • ACAD9
  • ATP5SL
  • BCRM1
  • C14orf127
  • C16orf51
  • C17orf89
  • C20orf7
  • C2orf56
  • C3orf1
  • C3orf60
  • C6orf66
  • C7orf44
  • C8orf38
  • C9orf123
  • CIA30
  • COA1
  • DAP13
  • DMAC1
  • DMAC2
  • DNAJC20
  • ECSIT
  • FOXRED1
  • GRIM19
  • GRP75
  • HRPAP20
  • HSC20
  • HSCB
  • HSPA9
  • HSPA9B
  • LYRM2
  • LYRM3
  • LYRM6
  • MITRAC15
  • MT-ND1
  • MT-ND2
  • MT-ND3
  • MT-ND4
  • MT-ND5
  • MT-ND6
  • MTND1
  • MTND2
  • MTND3
  • MTND4
  • MTND5
  • MTND6
  • NADH1
  • NADH2
  • NADH3
  • NADH4
  • NADH5
  • NADH6
  • NADHB14
  • ND1
  • ND2
  • ND3
  • ND4
  • ND5
  • ND6
  • NDUFA1
  • NDUFA10
  • NDUFA11
  • NDUFA12
  • NDUFA12L
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFA3
  • NDUFA5
  • NDUFA6
  • NDUFA7
  • NDUFA8
  • NDUFA9
  • NDUFAB1
  • NDUFAF1
  • NDUFAF2
  • NDUFAF3
  • NDUFAF4
  • NDUFAF5
  • NDUFAF6
  • NDUFAF7
  • NDUFAF8
  • NDUFAFQ
  • NDUFB1
  • NDUFB10
  • NDUFB11
  • NDUFB2
  • NDUFB3
  • NDUFB4
  • NDUFB5
  • NDUFB6
  • NDUFB7
  • NDUFB8
  • NDUFB9
  • NDUFC1
  • NDUFC2
  • NDUFS1
  • NDUFS2
  • NDUFS2L
  • NDUFS3
  • NDUFS4
  • NDUFS5
  • NDUFS6
  • NDUFS7
  • NDUFS8
  • NDUFV1
  • NDUFV2
  • NDUFV3
  • NUBPL
  • OXA1L
  • PREY
  • PYURF
  • SFXN4
  • TIMMDC1
  • TMEM126A
  • TMEM126B
  • TMEM186
  • TMEM261
  • UQOR1
  • UQOR22
  • mt-HSP70
Homo sapiens (human)
Reactions specific to the hybrid N-glycan synthesis pathway
  • GGNT3
  • MGAT3
Homo sapiens (human)
Release of Hh-Np from the secreting cell
  • ADAM17
  • C15orf36
  • CEGP1
  • CSVP
  • DHH
  • DISP2
  • DISPB
  • GPC5
  • IHH
  • KIAA1742
  • LINC00594
  • NOTUM
  • SCUBE2
  • SHH
  • TACE
Homo sapiens (human)
Tie2 Signaling
  • ANG3
  • ANG4
  • ANGPT1
  • ANGPT2
  • ANGPT4
  • DOK2
  • GRB1
  • GRB14
  • GRB7
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0003
  • NRAS
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SHPTP2
  • SOS1
  • TEK
  • TIE2
  • VMCM
  • VMCM1
Homo sapiens (human)
Ligand-receptor interactions
  • BOC
  • CDO
  • CDON
  • DHH
  • GAS1
  • HHIP
  • HIP
  • IHH
  • PTCH
  • PTCH1
  • SHH
Homo sapiens (human)
Reelin signalling pathway
  • CIN85
  • DAB1
  • FYN
  • RELN
  • SH3KBP1
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
RUNX3 regulates RUNX1-mediated transcription
  • AML2
  • CBFA3
  • CBFB
  • PEBP2A3
  • RUNX3
Homo sapiens (human)
Defective ABCA3 causes SMDP3
  • ABC3
  • ABCA3
Homo sapiens (human)
FOXO-mediated transcription of cell cycle genes
  • AFX
  • AFX1
  • BTG1
  • CAP20
  • CAV
  • CAV1
  • CCNG2
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CIP1
  • DDIT1
  • DPC4
  • EZF
  • FKH2
  • FKHL1
  • FKHL2
  • FKHL3
  • FKHL4
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXG1
  • FOXG1A
  • FOXG1B
  • FOXG1C
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • GADD45
  • GADD45A
  • GDF8
  • GKLF
  • KIP1
  • KLF4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MDA6
  • MLLT7
  • MSTN
  • PCBP4
  • PIC1
  • RB2
  • RBL2
  • SDI1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
ABC transporters in lipid homeostasis
  • ABC12
  • ABC2
  • ABC3
  • ABC8
  • ABCA10
  • ABCA12
  • ABCA2
  • ABCA3
  • ABCA5
  • ABCA6
  • ABCA7
  • ABCA9
  • ABCD1
  • ABCD2
  • ABCD3
  • ABCG1
  • ABCG4
  • ABCG5
  • ABCG8
  • ALD
  • ALD1
  • ALDL1
  • ALDR
  • ALDRP
  • APOA1
  • HK33
  • KIAA1062
  • KIAA1888
  • PEX19
  • PEX3
  • PMP70
  • PXF
  • PXMP1
  • WHITE2
  • WHT1
Homo sapiens (human)
Formation of definitive endoderm
  • CDH1
  • CDHE
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CXCR4
  • DPC4
  • EOMES
  • FOXA2
  • GATA4
  • GATA6
  • GSC
  • HNF3B
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MIXL
  • MIXL1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SOX17
  • T
  • TBR2
  • TBXT
  • TCF3B
  • TCF4
  • TCF7L2
  • UVO
Homo sapiens (human)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • GAB1
  • GRB1
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Homo sapiens (human)
Defective SLC16A1 causes symptomatic deficiency in lactate transport (SDLT)
  • BSG
  • MCT1
  • SLC16A1
Homo sapiens (human)
Cytosolic iron-sulfur cluster assembly
  • ABC7
  • ABCB7
  • BACH1
  • BRIP1
  • C20orf41
  • CIA1
  • CIAB
  • CIAO1
  • CIAO2B
  • CIAO3
  • CIAPIN1
  • ERCC2
  • FAM96B
  • FANCJ
  • KIAA1088
  • MIP18
  • MMS19
  • MMS19L
  • NARFL
  • NBP
  • NBP1
  • NDOR1
  • NHL
  • NR1
  • NUBP1
  • NUBP2
  • POLD
  • POLD1
  • PRN
  • RTEL1
  • WDR39
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT8
  • ACSL1
  • ACTEIII
  • ALD
  • CIG30
  • EDH17B4
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • HSD17B4
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • PTE1
  • PTHIO
  • SCP2
  • SDR8C1
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
RHOH GTPase cycle
  • ARHGDIA
  • ARHGDIB
  • ARHGDIG
  • ARHH
  • ASCT2
  • BCATE2
  • BCKDHE2
  • BND7
  • BRWD2
  • BT
  • C11orf59
  • C1orf8
  • CAV
  • CAV1
  • CSK
  • CTNNG
  • D0S117E
  • DBN1
  • DBT
  • DP3
  • EPB72
  • FAM91A1
  • GARNL1
  • GBAS
  • GDIA1
  • GDIA2
  • GDID4
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • JUP
  • KIAA0619
  • KIAA0884
  • KIAA1142
  • KIAA1264
  • KIAA1351
  • KIAA1561
  • LAMTOR1
  • LCK
  • M7V1
  • MTR
  • NBC2
  • NBC2B
  • NBC3
  • NBCn1
  • NIPSNAP2
  • NSFL1C
  • ORP11
  • OSBP12
  • OSBPL11
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PAK5
  • PAK6
  • PAK7
  • PDRO
  • RAB7
  • RAB7A
  • RALGAPA1
  • RAP1GN1
  • RDR
  • RDRC
  • RHOH
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SBC2
  • SLC1A5
  • SLC4A6
  • SLC4A7
  • SRK
  • STB2
  • STOM
  • SYB3
  • TFRC
  • TMEM59
  • TTF
  • TUBA1B
  • TULIP1
  • UACA
  • UBXN2C
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VCP
  • WDR11
  • WDR15
  • ZAP70
Homo sapiens (human)
Regulation of CDH11 function
  • ADAM19
  • ADAM33
  • ANGPTL4
  • ARP4
  • C20orf153
  • CDH11
  • CTNNA1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • CTNNG
  • DP3
  • HFARP
  • JUP
  • KIAA0384
  • MLTNB
  • PGAR
Homo sapiens (human)
Cellular response to mitochondrial stress
  • BAP
  • DELE
  • DELE1
  • EIF2A
  • EIF2AK1
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • FTSH1
  • HRI
  • KIAA0141
  • KIAA1369
  • MPRP1
  • OMA1
  • PHB2
  • REA
  • SLP2
  • STOML2
  • YME1L
  • YME1L1
Homo sapiens (human)
Inhibition of nitric oxide production
  • KPNA1
  • KPNB1
  • NOS2
  • NOS2A
  • NTF97
  • PPE2
  • RCH2
Homo sapiens (human)
Recycling of eIF2:GDP
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2B1
  • EIF2B2
  • EIF2B3
  • EIF2B4
  • EIF2B5
  • EIF2BA
  • EIF2BB
  • EIF2BD
  • EIF2BE
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
Homo sapiens (human)
TBC/RABGAPs
  • ARF6
  • C20orf140
  • EPI64
  • FIP2
  • FLC3A
  • FLC3B
  • GABARAP
  • GABARAPL2
  • GEF2
  • GGA1
  • GGA2
  • GGA3
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • KIAA0154
  • KIAA0243
  • KIAA0722
  • KIAA1080
  • KIAA1171
  • KIAA1322
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • MEL
  • NRP
  • OATL1
  • OPTN
  • PARIS1
  • PP8997
  • PRC17
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11B
  • RAB1C
  • RAB33A
  • RAB33B
  • RAB35
  • RAB4
  • RAB4A
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RAB5EP
  • RAB6
  • RAB6A
  • RAB6B
  • RAB7
  • RAB7A
  • RAB7B
  • RAB8
  • RAB8A
  • RAB8B
  • RABEP1
  • RABEX5
  • RABGAP1
  • RABGEF1
  • RABL
  • RABPT5
  • RABPT5A
  • RABS10
  • RAY
  • SLP1
  • SYTL1
  • TBC1D10
  • TBC1D10A
  • TBC1D10B
  • TBC1D10C
  • TBC1D13
  • TBC1D14
  • TBC1D15
  • TBC1D16
  • TBC1D17
  • TBC1D2
  • TBC1D20
  • TBC1D24
  • TBC1D25
  • TBC1D2A
  • TBC1D3
  • TBC1D3A
  • TBC1D7
  • TBC7
  • TSC
  • TSC1
  • TSC2
  • TSC4
  • ULK1
  • YPT3
Homo sapiens (human)
CDH11 homotypic and heterotypic interactions
  • CDH11
  • CDH11L
  • CDH24
  • CDH8
  • CTNNA1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • CTNNG
  • DP3
  • JUP
  • KIAA0384
Homo sapiens (human)
Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition
  • ACTR1A
  • AIK
  • AIRK1
  • AJUBA
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • ALMS1
  • ARK1
  • AURA
  • AURKA
  • AYK1
  • AZI1
  • BBS14
  • BITE
  • BORA
  • BTAK
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • C13orf34
  • C14orf94
  • C15orf25
  • C18orf9
  • C4orf15
  • C9orf81
  • CALT
  • CCCAP
  • CCDC5
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CCP110
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK5RAP2
  • CDKN1
  • CEN2
  • CENPJ
  • CEP1
  • CEP110
  • CEP131
  • CEP135
  • CEP152
  • CEP164
  • CEP192
  • CEP2
  • CEP215
  • CEP250
  • CEP27
  • CEP290
  • CEP4
  • CEP41
  • CEP43
  • CEP57
  • CEP63
  • CEP70
  • CEP72
  • CEP76
  • CEP78
  • CETN2
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CNAP1
  • CNTRL
  • CP110
  • CPAP
  • CSNK1D
  • CSNK1E
  • CTRN1
  • CUL1
  • CXorf5
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN50
  • DGT6
  • DHC1
  • DLC1
  • DNCH1
  • DNCI2
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I2
  • DYNLL1
  • EMC19
  • FAM29A
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FGFR1OP
  • FIP2
  • FOP
  • GLC1E
  • HAUS1
  • HAUS2
  • HAUS3
  • HAUS4
  • HAUS5
  • HAUS6
  • HAUS7
  • HAUS8
  • HCKID
  • HDLC1
  • HEIC
  • HICE1
  • HIP7
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • HYPL
  • IAK1
  • JUB
  • KIAA0092
  • KIAA0097
  • KIAA0325
  • KIAA0328
  • KIAA0373
  • KIAA0402
  • KIAA0419
  • KIAA0542
  • KIAA0622
  • KIAA0635
  • KIAA0696
  • KIAA0803
  • KIAA0841
  • KIAA0912
  • KIAA0980
  • KIAA1052
  • KIAA1118
  • KIAA1519
  • KIAA1569
  • KIAA1574
  • KIAA1633
  • LAP
  • LIP1
  • LIS1
  • MAPRE1
  • MAST1
  • MBS
  • MDCR
  • MDS
  • MEL
  • MYPT1
  • NA14
  • NDE1
  • NEDD1
  • NEK2
  • NEK2A
  • NINL
  • NLK1
  • NLP
  • NPHP10
  • NPHP15
  • NPHP6
  • NRP
  • NUDE
  • OCP2
  • ODF2
  • OFD1
  • OPTN
  • P34CDC2
  • PAFAH1B1
  • PAFAHA
  • PCM1
  • PCNT
  • PCNT2
  • PKACA
  • PLK
  • PLK1
  • PLK4
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP2R1A
  • PRKACA
  • PRKAR2B
  • RAB8
  • RAB8A
  • RPS27A
  • SAK
  • SDCCAG8
  • SFI1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SSNA1
  • STK15
  • STK18
  • STK6
  • TCEB1L
  • TSGA14
  • TSP57
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA3
  • TUBA4A
  • TUBB
  • TUBB2C
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBG
  • TUBG1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UCHL5IP
  • UIP1
  • YWHAE
  • YWHAG
Homo sapiens (human)
TGFBR3 regulates activin signaling
  • ACVR2
  • ACVR2A
  • INHA
  • INHBA
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
Regulated proteolysis of p75NTR
  • AD3
  • AD4
  • ADAM17
  • APH1A
  • APH1B
  • CSVP
  • KIAA0253
  • NCSTN
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NGFR
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RELA
  • RNF85
  • STM2
  • TACE
  • TNFRSF16
  • TRAF6
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024