GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 401 - 425 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Regulation of PAK-2p34 activity by PS-GAP/RHG10
  • ARHGAP10
  • GRAF2
  • PAK2
Homo sapiens (human)
Formation of the anterior neural plate
  • AN2
  • EHZF
  • GBX2
  • KIAA0569
  • LIP3
  • NANOG
  • OCT3
  • OCT4
  • OCT6
  • OTF3
  • OTF6
  • OTX2
  • PAX6
  • POU3F1
  • POU5F1
  • SIP1
  • SOX1
  • SOX2
  • ZEB2
  • ZFHX1B
  • ZFX1B
  • ZIC2
  • ZNF521
Homo sapiens (human)
Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • AKAP5
  • AKAP79
  • CGEF1
  • CGEF2
  • EPAC
  • EPAC1
  • EPAC2
  • GCG
  • GLP1R
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • INSP3R1
  • IQGAP1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNB1
  • KCNC2
  • KCNF2
  • KCNG2
  • KCNS3
  • KIAA0051
  • KIAA0422
  • KREV1
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAP1A
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Olfactory Signaling Pathway
  • ADCY3
  • ANO2
  • C12orf3
  • C14orf13
  • CNCA
  • CNCA1
  • CNCG2
  • CNGA2
  • CNGA4
  • GNAL
  • GNB1
  • GNG13
  • GPR164
  • KIAA0511
  • OLF3
  • OLFR1
  • OLFRA03
  • OR10A6
  • OR10G3
  • OR10G4
  • OR10G7
  • OR10H2
  • OR10H5
  • OR10J5
  • OR10S1
  • OR10X1
  • OR10X1P
  • OR11A1
  • OR11A2
  • OR11H4
  • OR11H6
  • OR13C3
  • OR14A2
  • OR14J1
  • OR1A1
  • OR1C1
  • OR1D2
  • OR1D5
  • OR1E1
  • OR1E5
  • OR1E6
  • OR1E9P
  • OR1N2
  • OR2A1
  • OR2A25
  • OR2A25P
  • OR2A27
  • OR2A42
  • OR2A7
  • OR2AT4
  • OR2B11
  • OR2C1
  • OR2C2P
  • OR2F1
  • OR2F3
  • OR2F3P
  • OR2F4
  • OR2F5
  • OR2J1
  • OR2J1P
  • OR2J2
  • OR2J3
  • OR2L13
  • OR2L14
  • OR2M2
  • OR2M7
  • OR2S2
  • OR2T1
  • OR2T4
  • OR2W1
  • OR2W3
  • OR2W3P
  • OR2W8P
  • OR3A1
  • OR4C12
  • OR4D2
  • OR4F11P
  • OR4F17
  • OR4F18
  • OR4F19
  • OR4L1
  • OR4L2P
  • OR4Q3
  • OR4Q4
  • OR51B5
  • OR51D1
  • OR51E1
  • OR51E1P
  • OR51E2
  • OR51L1
  • OR52A3P
  • OR52B6
  • OR56A4
  • OR5AL1
  • OR5AL1P
  • OR5AX1
  • OR5AX1P
  • OR5D14
  • OR5K1
  • OR5P3
  • OR5U1
  • OR6F1
  • OR6P1
  • OR7C1
  • OR7C4
  • OR7D4
  • OR7D4P
  • OR7G2
  • OR8B3
  • OR8D1
  • OR8D3
  • OR8K3
  • OR8U8
  • OR9G1
  • OR9G5
  • POGR
  • PSGR
  • PSGR2
  • TMEM16B
Homo sapiens (human)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACH2
  • CACN2
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CACNL1A1
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CCHL1A1
  • FGF11
  • FGF12
  • FGF12B
  • FGF13
  • FGF14
  • FHF1
  • FHF2
  • FHF3
  • FHF4
  • HBA
  • KIAA0558
  • KIAA0968
  • KIAA1158
  • KIAA1356
  • MED
  • MOG1
  • MYSB
  • NAC1
  • NAC2
  • NAC3
  • NENA
  • RANGNRF
  • RANGRF
  • SCN1
  • SCN10A
  • SCN11A
  • SCN12A
  • SCN1A
  • SCN1B
  • SCN2A
  • SCN2A1
  • SCN2A2
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN3B
  • SCN4A
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SCN6A
  • SCN7A
  • SCN8A
  • SCN9A
  • SNS2
Homo sapiens (human)
Striated Muscle Contraction
  • ACTN2
  • ACTN3
  • C15orf13
  • D9S57E
  • DES
  • DMD
  • MLC1
  • MLC2
  • MYBPC1
  • MYBPC2
  • MYBPC3
  • MYBPCF
  • MYBPCS
  • MYH3
  • MYH6
  • MYH8
  • MYHCA
  • MYL1
  • MYL2
  • MYL3
  • MYL4
  • NEB
  • NTMOD
  • TCAP
  • TMOD
  • TMOD1
  • TMOD2
  • TMOD3
  • TMOD4
  • TMSA
  • TMSB
  • TNNC
  • TNNC1
  • TNNC2
  • TNNI1
  • TNNI2
  • TNNI3
  • TNNT1
  • TNNT2
  • TNNT3
  • TNT
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • TPM4
  • TTN
  • VIM
Homo sapiens (human)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • FIGF
  • FLK1
  • FLT
  • FLT1
  • FLT4
  • FRT
  • KDR
  • PGF
  • PGFL
  • PLGF
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VEGFR1
  • VEGFR2
  • VEGFR3
  • VRF
Homo sapiens (human)
Alternative complement activation
  • BF
  • BFD
  • C3
  • CFB
  • CFD
  • CPAMD1
  • DF
  • GZMM
  • MET1
  • PFD
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1 targets PDZ proteins in cell-cell junction
  • E
  • MPP5
  • PALS1
  • sM
Homo sapiens (human)
Formation of xylulose-5-phosphate
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • CRY
  • CRYL1
  • DCXR
  • SDR20C1
  • SORD
  • XYLB
Homo sapiens (human)
Opioid Signalling
  • MOR1
  • OPRM1
  • PDYN
  • POMC
Homo sapiens (human)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperones
  • ATF6
  • GRP78
  • HSPA5
  • KIAA0091
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • S1P
  • S2P
  • SKI1
Homo sapiens (human)
Regulation of gap junction activity
  • E
  • GJA1
  • GJAL
  • TJP1
  • ZO1
Homo sapiens (human)
RUNX3 regulates NOTCH signaling
  • AML2
  • BHLHB39
  • CBFA3
  • CBP
  • CG1
  • CREBBP
  • CXorf6
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • HES1
  • HL
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • JAG1
  • JAGL1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • NOTCH1
  • P300
  • PCAF
  • PEBP2A3
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RUNX3
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • TAN1
Homo sapiens (human)
Defective NEU1 causes sialidosis
  • CTSA
  • ELNR1
  • GLB1
  • NANH
  • NEU1
  • PPGB
Homo sapiens (human)
TNFs bind their physiological receptors
  • AITR
  • AITRL
  • APO3
  • APRIL
  • BAFF
  • BCM
  • BCMA
  • BLYS
  • CD137
  • CD27
  • CD27L
  • CD27LG
  • CD30
  • CD30L
  • CD30LG
  • CD70
  • D1S166E
  • DCR3
  • DDR3
  • DL
  • DR3
  • ED1
  • EDA
  • EDA2
  • EDA2R
  • EDAR
  • EDARADD
  • FASLG
  • GITR
  • GITRL
  • HVEA
  • HVEM
  • HVEML
  • ILA
  • LIGHT
  • LTA
  • OCIF
  • OPG
  • OPGL
  • RANKL
  • TACI
  • TALL1
  • TALL2
  • TL1
  • TL6
  • TNFAR
  • TNFB
  • TNFBR
  • TNFR1
  • TNFR2
  • TNFRSF11B
  • TNFRSF12
  • TNFRSF13B
  • TNFRSF14
  • TNFRSF17
  • TNFRSF18
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF25
  • TNFRSF27
  • TNFRSF4
  • TNFRSF6B
  • TNFRSF7
  • TNFRSF8
  • TNFRSF9
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF13
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF15
  • TNFSF18
  • TNFSF20
  • TNFSF4
  • TNFSF6
  • TNFSF7
  • TNFSF8
  • TNFSF9
  • TNLG1A
  • TR6
  • TRANCE
  • TXGP1
  • TXGP1L
  • VEGI
  • WSL
  • WSL1
  • XEDAR
  • ZTNF2
  • ZTNF4
Homo sapiens (human)
AURKA Activation by TPX2
  • ACTR1A
  • AIK
  • AIRK1
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • ALMS1
  • ARK1
  • AURA
  • AURKA
  • AYK1
  • AZI1
  • BBS14
  • BITE
  • BTAK
  • C14orf94
  • C15orf25
  • C18orf9
  • C20orf1
  • C20orf2
  • C4orf15
  • C9orf81
  • CALT
  • CCCAP
  • CCDC5
  • CCP110
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK5RAP2
  • CDKN1
  • CEN2
  • CENPJ
  • CEP1
  • CEP110
  • CEP131
  • CEP135
  • CEP152
  • CEP164
  • CEP192
  • CEP2
  • CEP215
  • CEP250
  • CEP27
  • CEP290
  • CEP4
  • CEP41
  • CEP43
  • CEP57
  • CEP63
  • CEP70
  • CEP72
  • CEP76
  • CEP78
  • CETN2
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CNAP1
  • CNTRL
  • CP110
  • CPAP
  • CSNK1D
  • CSNK1E
  • CTRN1
  • CXorf5
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN50
  • DGT6
  • DHC1
  • DIL2
  • DLC1
  • DNCH1
  • DNCI2
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I2
  • DYNLL1
  • FAM29A
  • FGFR1OP
  • FOP
  • HAUS1
  • HAUS2
  • HAUS3
  • HAUS4
  • HAUS5
  • HAUS6
  • HAUS7
  • HAUS8
  • HCA519
  • HCKID
  • HDLC1
  • HEIC
  • HICE1
  • HMMR
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • IAK1
  • IHABP
  • KIAA0092
  • KIAA0097
  • KIAA0325
  • KIAA0328
  • KIAA0373
  • KIAA0402
  • KIAA0419
  • KIAA0542
  • KIAA0622
  • KIAA0635
  • KIAA0803
  • KIAA0841
  • KIAA0912
  • KIAA0980
  • KIAA1052
  • KIAA1118
  • KIAA1519
  • KIAA1569
  • KIAA1574
  • KIAA1633
  • LAP
  • LIP1
  • LIS1
  • MAPRE1
  • MAST1
  • MDCR
  • MDS
  • NA14
  • NDE1
  • NEDD1
  • NEK2
  • NEK2A
  • NINL
  • NLK1
  • NLP
  • NPHP10
  • NPHP15
  • NPHP6
  • NUDE
  • ODF2
  • OFD1
  • P34CDC2
  • PAFAH1B1
  • PAFAHA
  • PCM1
  • PCNT
  • PCNT2
  • PKACA
  • PLK
  • PLK1
  • PLK4
  • PPP2R1A
  • PRKACA
  • PRKAR2B
  • RHAMM
  • SAK
  • SDCCAG8
  • SFI1
  • SSNA1
  • STK15
  • STK18
  • STK6
  • TPX2
  • TSGA14
  • TSP57
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA3
  • TUBA4A
  • TUBB
  • TUBB2C
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBG
  • TUBG1
  • UCHL5IP
  • UIP1
  • YWHAE
  • YWHAG
Homo sapiens (human)
Synthesis of dolichyl-phosphate mannose
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
Glycine degradation
  • AMT
  • DLD
  • DLST
  • DLTS
  • GCSH
  • GCSL
  • GCSP
  • GCST
  • GLDC
  • KGD4
  • LAD
  • MRPS36
  • OGDH
  • PHE3
Homo sapiens (human)
Defective CBLIF causes IFD
  • CBLIF
  • GIF
  • IFMH
Homo sapiens (human)
Eicosanoid ligand-binding receptors
  • GPR170
  • OXER1
  • TG1019
Homo sapiens (human)
Proline catabolism
  • ALDH4
  • ALDH4A1
  • HSPOX1
  • HYPDH
  • P5CDH
  • PIG6
  • POX2
  • PRODH
  • PRODH2
Homo sapiens (human)
InlA-mediated entry of Listeria monocytogenes into host cells
  • CBLL1
  • CDH1
  • CDHE
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HAKAI
  • KIAA0384
  • RNF188
  • RPS27A
  • SRC
  • SRC1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UVO
  • inlA
Homo sapiens (human)
Defective SLC11A2 causes hypochromic microcytic anemia, with iron overload 1 (AHMIO1)
  • DCT1
  • DMT1
  • NRAMP2
  • SLC11A2
Homo sapiens (human)
Sulfide oxidation to sulfate
  • DIC
  • ETHE1
  • HSCO
  • KAT
  • SLC25A10
  • SQOR
  • SQRDL
  • SUOX
  • TST
  • TSTD1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024