GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 751 - 775 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
TGF-beta receptor signaling activates SMADs
  • ALK5
  • C14orf141
  • CBL
  • CBL2
  • DPC4
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • FNRB
  • FUR
  • FURIN
  • GP3A
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP2
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • NEDD8
  • PACE
  • PCSK3
  • RNF55
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TGFBR3
  • UBC12
  • UBE2M
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer
  • ALK5
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • SKR4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer
  • ALK5
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
TGFBR1 KD Mutants in Cancer
  • ALK5
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer
  • ALK5
  • SKR4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation of granulopoiesis
  • ALL1
  • AML1
  • APRF
  • BHLHA17
  • BHLHE39
  • BTEB2
  • CAP20
  • CBFA2
  • CBFB
  • CDK2
  • CDK4
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN2
  • CEBP
  • CEBPA
  • CEBPB
  • CEBPE
  • CIP1
  • CKLF
  • CSF3R
  • CXXC7
  • DEK
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • EP300
  • FLI1
  • GATA2
  • GCSFR
  • GFI1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • HRX
  • HTRX
  • IKLF
  • IL6R
  • KLF5
  • KMT2A
  • LEF1
  • MDA6
  • MLL
  • MLL1
  • MYB
  • MYC
  • NR1B1
  • NR2B1
  • P300
  • PIC1
  • RARA
  • RBBP3
  • RUNX1
  • RXRA
  • SCL
  • SDI1
  • SPI1
  • STAT3
  • TAL1
  • TCF5
  • TCL5
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TRX1
  • TSH2B
  • WAF1
  • ZNF163
Homo sapiens (human)
Suppression of apoptosis
  • ALO17
  • C17orf27
  • CTSG
  • ERK1
  • ERK2
  • GSK3A
  • KIAA1554
  • KIAA1618
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYSTR
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PSF
  • RFP
  • RNF213
  • RNF76
  • Rv3364c
  • Rv3654c
  • Rv3655c
  • SFPQ
  • TRIM27
  • lprM
  • mce3E
  • mptpA
  • ptpA
Homo sapiens (human)
Synthesis of 15-eicosatetraenoic acid derivatives
  • ALOX15
  • ALOX15B
  • COX2
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG15
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of E-series 18(S)-resolvins
  • ALOX15
  • ALOX5
  • HPGD
  • LOG15
  • LOG5
  • LTA4
  • LTA4H
  • PGDH1
  • SDR36C1
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of E-series 18(R)-resolvins
  • ALOX15
  • ALOX5
  • LOG15
  • LOG5
  • LTA4
  • LTA4H
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of protectins
  • ALOX15
  • CYP1A1
  • CYP1A2
  • LOG15
  • LTA4
  • LTA4H
Homo sapiens (human)
Synthesis of 5-eicosatetraenoic acids
  • ALOX5
  • ALOX5AP
  • FLAP
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG5
  • LTC4S
  • PON
  • PON1
  • PON2
  • PON3
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of electrophilic ω-3 PUFA oxo-derivatives
  • ALOX5
  • COX2
  • LOG5
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of maresins
  • ALOX5
  • EPHX2
  • LOG5
Homo sapiens (human)
Interleukin-18 signaling
  • ALOX5
  • FIL1Z
  • IGIF
  • IL13
  • IL18
  • IL18BP
  • IL18R1
  • IL18RAP
  • IL1F4
  • IL1F7
  • IL1H4
  • IL1R7
  • IL1RP1
  • IL1RRP
  • IL37
  • IL4
  • LOG5
  • NC30
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of D-series resolvins
  • ALOX5
  • HPGD
  • LOG5
  • LTA4
  • LTA4H
  • PGDH1
  • SDR36C1
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of aspirin-triggered D-series resolvins
  • ALOX5
  • LOG5
  • LTA4
  • LTA4H
Homo sapiens (human)
Phenylalanine metabolism
  • ALP
  • ASRGL1
  • CCBL1
  • CRASH
  • DCOH
  • DHPR
  • FIG1
  • IL4I1
  • KYAT1
  • PAH
  • PCBD
  • PCBD1
  • QDPR
  • SDR33C1
Homo sapiens (human)
rRNA modification in the nucleus and cytosol
  • ALP
  • BAP28
  • BING4
  • BMS1
  • BMS1L
  • BUD23
  • BXDC4
  • C14orf111
  • C15orf12
  • C16orf42
  • C17orf40
  • C1orf107
  • C2F
  • C4orf9
  • C6orf11
  • C6orf153
  • CIRH1A
  • CRLZ1
  • DCAF13
  • DDX37
  • DDX47
  • DDX49
  • DDX52
  • DEF
  • DHX37
  • DIEXF
  • DIMT1
  • DIMT1L
  • DKC1
  • DRIM
  • EMG1
  • FBL
  • FCF1
  • FIB1
  • FLRN
  • GAR1
  • HCA66
  • HEATR1
  • HRB2
  • IMP3
  • IMP4
  • KIAA0007
  • KIAA0185
  • KIAA0187
  • KIAA0266
  • KIAA1517
  • KIAA1709
  • KIAA1988
  • KRR1
  • MERM1
  • MHAT
  • MPHOSPH10
  • MPP10
  • MRPS4
  • NAT10
  • NHP2
  • NHP2L1
  • NOC4L
  • NOL1
  • NOL11
  • NOL14
  • NOL5
  • NOL5A
  • NOL6
  • NOLA1
  • NOLA2
  • NOLA3
  • NOLA4
  • NOP10
  • NOP14
  • NOP2
  • NOP5
  • NOP56
  • NOP58
  • NSUN1
  • PDCD11
  • PNO1
  • PWP2
  • PWP2H
  • RCL1
  • RNAC
  • RNU3IP2
  • ROK1
  • RPC2
  • RPCL1
  • RPS14
  • RPS2
  • RPS4
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS9
  • RRP36
  • RRP7A
  • RRP9
  • RTC2
  • SAS10
  • SAZD
  • SDCCAG16
  • SNU13
  • TBL3
  • THUMPD1
  • TRMT112
  • TSR3
  • U355K
  • UND313L
  • UTP10
  • UTP11
  • UTP11L
  • UTP14A
  • UTP14C
  • UTP15
  • UTP17
  • UTP18
  • UTP20
  • UTP25
  • UTP3
  • UTP4
  • UTP5
  • UTP6
  • WBSCR22
  • WDR3
  • WDR36
  • WDR43
  • WDR46
  • WDR50
  • WDR75
  • WDSOF1
  • cPERP-E
Homo sapiens (human)
PIWI-interacting RNA (piRNA) biogenesis
  • ALP1
  • AMYB
  • ANKL1
  • ASZ1
  • C14orf75
  • C1orf59
  • C7orf7
  • DDX4
  • ECAT8
  • FKBP36
  • FKBP6
  • GASZ
  • HENMT1
  • HILI
  • HIWI
  • HIWI2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • MAEL
  • MOV10L1
  • MYBL1
  • PIWI
  • PIWIL1
  • PIWIL2
  • PIWIL4
  • PLD6
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RPB7
  • TDRD1
  • TDRD12
  • TDRD2
  • TDRD6
  • TDRD9
  • TDRKH
  • VASA
Homo sapiens (human)
Digestion
  • ALPI
  • GUC2C
  • GUCA2
  • GUCA2A
  • GUCA2B
  • GUCY2C
  • PIR
  • STAR
Homo sapiens (human)
ALPK1 signaling pathway
  • ALPK1
  • KIAA0733
  • KIAA1527
  • LAK
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • RNF85
  • RPS27A
  • T2BP
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TIFA
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Intra-Golgi traffic
  • ALPP
  • ARF1
  • ARNO
  • ARNO3
  • BET1L
  • CEV14
  • CIP150
  • COG1
  • COG2
  • COG3
  • COG4
  • COG5
  • COG6
  • COG7
  • COG8
  • CUTL1
  • CUX1
  • CYT4
  • CYTH1
  • CYTH2
  • CYTH3
  • CYTH4
  • D17S811E
  • GIMPC
  • GOLGA5
  • GOLIM4
  • GOLPH4
  • GOLTC1
  • GOSR1
  • GOSR2
  • GPP130
  • GRP1
  • GS15
  • GS27
  • GS28
  • GTC90
  • KIAA0258
  • KIAA1134
  • KIAA1381
  • KIAA1432
  • LDLB
  • LDLC
  • MAN1A1
  • MAN1A2
  • MAN1A3
  • MAN1B
  • MAN1C
  • MAN1C1
  • MAN2A1
  • MAN2A2
  • MANA2
  • MANA2X
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PLAP
  • PSCD1
  • PSCD2
  • PSCD2L
  • PSCD3
  • PSCD4
  • RAB30
  • RAB33B
  • RAB36
  • RAB39
  • RAB39A
  • RAB41
  • RETII
  • RFG5
  • RGP1
  • RIC1
  • SEC34
  • SNAP29
  • SNAPA
  • SNAPB
  • SNAPG
  • STX16
  • STX5
  • STX5A
  • STX6
  • TRIP11
  • VPS45
  • VPS45A
  • VPS45B
  • VTI1A
  • YKT6
Homo sapiens (human)
Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex
  • ALR
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BAF190A
  • BCL9
  • BCL9L
  • BRG1
  • C1orf28
  • CBP
  • CDC73
  • CREBBP
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DLNB11
  • EP300
  • EST2
  • GRG4
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3-4
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HDAC1
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • HRPT2
  • HTATIP
  • INO80H
  • KAT5
  • KIAA1261
  • KIAA1547
  • KMT2D
  • LEF1
  • LEO1
  • MEN1
  • MLL2
  • MLL4
  • NMP238
  • P300
  • PAF400
  • PYGO1
  • PYGO2
  • RBBP5
  • RBQ3
  • RDL
  • RPD3L1
  • RUVBL1
  • SCG2
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TCS1
  • TERT
  • TIP49
  • TIP49A
  • TIP60
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • TRRAP
  • TRT
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK
  • ALS2CR2
  • AMPK
  • AMPK1
  • AMPK2
  • AMPKG3
  • C11orf59
  • C7orf59
  • CAB39
  • CAB39L
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • HBXIP
  • ILPIP
  • KIAA0243
  • KIAA1303
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LKB1
  • LST8
  • LYK5
  • MAP2K1IP1
  • MAPBPIP
  • MAPKSP1
  • MLST8
  • MO25
  • MTOR
  • PDRO
  • PJS
  • PPM1A
  • PPPM1A
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RHEB
  • RHEB2
  • ROBLD3
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • STK11
  • STRAD
  • STRADA
  • STRADB
  • TSC
  • TSC1
  • TSC2
  • TSC4
  • URLC11
  • XIP
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024