GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Acrosome Reaction and Sperm:Oocyte Membrane Binding
  • ACR
  • ACRS
  • C19orf36
  • C19orf41
  • C9orf134
  • CD9
  • IZUMO1
  • IZUMO2
  • IZUMO3
  • IZUMO4
  • MIC3
  • SCRL
  • TSPAN29
Homo sapiens (human)
Beta defensins
  • BD1
  • BD3
  • BD5
  • BD6
  • C20orf63
  • C20orf73
  • C20orf8
  • C20orf87
  • CCR2
  • CCR6
  • CKRL3
  • CMKBR2
  • CMKBR6
  • DEFB1
  • DEFB10
  • DEFB102
  • DEFB103
  • DEFB103A
  • DEFB103B
  • DEFB104
  • DEFB104A
  • DEFB104B
  • DEFB105
  • DEFB105A
  • DEFB105B
  • DEFB106
  • DEFB106A
  • DEFB106B
  • DEFB107
  • DEFB107A
  • DEFB107B
  • DEFB108
  • DEFB108A
  • DEFB108B
  • DEFB108C
  • DEFB108P1
  • DEFB108P2
  • DEFB109B
  • DEFB109P1B
  • DEFB11
  • DEFB110
  • DEFB111
  • DEFB112
  • DEFB113
  • DEFB114
  • DEFB115
  • DEFB116
  • DEFB117
  • DEFB118
  • DEFB119
  • DEFB12
  • DEFB120
  • DEFB121
  • DEFB123
  • DEFB124
  • DEFB125
  • DEFB126
  • DEFB127
  • DEFB128
  • DEFB129
  • DEFB13
  • DEFB130
  • DEFB130A
  • DEFB130B
  • DEFB131
  • DEFB131A
  • DEFB132
  • DEFB133
  • DEFB134
  • DEFB135
  • DEFB136
  • DEFB14
  • DEFB15
  • DEFB16
  • DEFB18
  • DEFB19
  • DEFB2
  • DEFB20
  • DEFB21
  • DEFB23
  • DEFB24
  • DEFB25
  • DEFB26
  • DEFB27
  • DEFB28
  • DEFB29
  • DEFB3
  • DEFB30
  • DEFB31
  • DEFB32
  • DEFB4
  • DEFB4A
  • DEFB4B
  • DEFB5
  • DEFB6
  • DEFB7
  • DEFB8
  • ESC42
  • GPR29
  • HBD1
  • KIAA0012
  • STRL22
  • TIL4
  • TLR1
  • TLR2
Homo sapiens (human)
Tyrosine catabolism
  • FAH
  • GSTZ1
  • HGD
  • HGO
  • HPD
  • MAAI
  • PPD
  • TAT
Homo sapiens (human)
PINK1-PRKN Mediated Mitophagy
  • APG12
  • APG12L
  • APG5L
  • APG9L1
  • ASP
  • ATG12
  • ATG5
  • ATG9A
  • BLU
  • C19orf1
  • C9orf105
  • CPRP1
  • CROC1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • KIAA0016
  • KIAA0214
  • KIAA0719
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3A
  • MAP1LC3B
  • MFN1
  • MFN2
  • MTERF3
  • MTERFD1
  • NAK
  • NRP
  • OBTP
  • OPTN
  • ORCA
  • OSIL
  • PARK2
  • PEREC1
  • PINK1
  • PRKN
  • PUBC1
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • TBK1
  • TOM22
  • TOM40
  • TOM5
  • TOM6
  • TOM7
  • TOM70
  • TOMM07
  • TOMM20
  • TOMM22
  • TOMM40
  • TOMM5
  • TOMM6
  • TOMM7
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCE7
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBCH7
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2L3
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
  • VDAC
  • VDAC1
  • VDAC2
  • VDAC3
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts via 24-hydroxycholesterol
  • ACSB
  • ACSVL1
  • ACSVL6
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • AKR1C3
  • AKR1C4
  • AKR1D1
  • AMACR
  • CHDR
  • CYP12
  • CYP27
  • CYP27A1
  • CYP39A1
  • CYP46
  • CYP46A1
  • CYP8B1
  • DDH
  • DDH1
  • DDH2
  • FACVL1
  • FACVL3
  • FATP2
  • FATP5
  • HSD17B5
  • HSD3B7
  • KIAA0119
  • PGFS
  • SLC27A2
  • SLC27A5
  • SRD5B1
  • VLACS
Homo sapiens (human)
Attachment and Entry
  • 3a
  • 7a
  • ACE2
  • CTSL
  • CTSL1
  • E
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • M
  • N
  • PRSS10
  • S
  • TMPRSS2
  • VCP
  • sM
Homo sapiens (human)
Estrogen biosynthesis
  • AKR1B15
  • ARO1
  • CYAR
  • CYP19
  • CYP19A1
  • DHRS10
  • DHRS8
  • E17KSR
  • EDH17B1
  • EDH17B2
  • EDHB17
  • HSD17B1
  • HSD17B11
  • HSD17B14
  • HSD17B2
  • PAN1B
  • SDR16C2
  • SDR28C1
  • SDR3
  • SDR47C1
  • SDR9C2
Homo sapiens (human)
Role of ABL in ROBO-SLIT signaling
  • ABL
  • ABL1
  • ABL2
  • ABLL
  • ARG
  • CAP
  • CAP1
  • CAP2
  • CLASP1
  • CLASP2
  • DUTT1
  • JTK7
  • KIAA0622
  • KIAA0627
  • MAST1
  • ROBO1
  • SLIL3
  • SLIT2
Homo sapiens (human)
Reuptake of GABA
  • BGT1
  • GABATR
  • GABT1
  • GABT3
  • GAT1
  • GAT2
  • GAT3
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
Homo sapiens (human)
Multifunctional anion exchangers
  • DRA
  • DTD
  • DTDST
  • PDS
  • SAT1
  • SLC26A1
  • SLC26A11
  • SLC26A2
  • SLC26A3
  • SLC26A4
  • SLC26A6
  • SLC26A7
  • SLC26A9
  • SLC5A12
  • SMCT2
  • SUT2
Homo sapiens (human)
Cation-coupled Chloride cotransporters
  • KCC1
  • KCC2
  • KCC3
  • KCC4
  • KIAA1176
  • NCC
  • NKCC1
  • NKCC2
  • SLC12A1
  • SLC12A2
  • SLC12A3
  • SLC12A4
  • SLC12A5
  • SLC12A6
  • SLC12A7
  • TSC
Homo sapiens (human)
Hormone ligand-binding receptors
  • CGA
  • FSHB
  • FSHR
  • GNRH
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GNRHR2
  • GPA2
  • GPB5
  • GPHA2
  • GPHB5
  • GRH
  • GRHR
  • LCGR
  • LGR1
  • LGR2
  • LGR3
  • LHB
  • LHCGR
  • LHRH
  • LHRHR
  • TSHB
  • TSHR
  • ZLUT1
  • ZSIG51
Homo sapiens (human)
Physiological factors
  • ANP
  • ANPRA
  • ANPRB
  • CES1
  • CES2
  • CNP2
  • CORIN
  • CRN
  • CSX
  • EPN
  • GATA4
  • HIPK1
  • HIPK2
  • KAT2B
  • KIAA0630
  • MME
  • MYAK
  • NBAK2
  • NKX2-5
  • NKX2.5
  • NKX2E
  • NPPA
  • NPPC
  • NPR1
  • NPR2
  • PCAF
  • PND
  • SES1
  • TAZ
  • TBX5
  • TMPRSS10
  • WWTR1
Homo sapiens (human)
RHOG GTPase cycle
  • ANKLE2
  • ARFGAP1
  • ARFGAP3
  • ARHG
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP21
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGDIA
  • ARHGDIB
  • ARHGDIG
  • ARHGEF16
  • ARHGEF26
  • ARHGEF5
  • BORG5
  • C11orf59
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CDC42GAP
  • CDHF5
  • CED12A
  • CEP1
  • CG1
  • CYFIP1
  • DBL
  • DEPDC1B
  • DG6
  • DIAP3
  • DIAPH3
  • DOCK1
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DOCK5
  • DSG2
  • DUET
  • DUO
  • ECK
  • EDMD
  • ELMO2
  • EMD
  • EPHA2
  • EPHEXIN4
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • ERGIC53
  • ESYT1
  • F5F8D
  • FAM62A
  • FNRB
  • GARRE1
  • GDIA1
  • GDIA2
  • GDID4
  • GRB1
  • GRF1
  • GRIT
  • GRLF1
  • HAPIP
  • HSPE1
  • IQGAP2
  • ITGB1
  • ITSN
  • ITSN1
  • KALRN
  • KIAA0004
  • KIAA0068
  • KIAA0209
  • KIAA0299
  • KIAA0355
  • KIAA0362
  • KIAA0599
  • KIAA0692
  • KIAA0712
  • KIAA0716
  • KIAA0747
  • KIAA1142
  • KIAA1225
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1688
  • KIAA1722
  • KIAA1834
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LAP2
  • LBR
  • LEM4
  • LEMD3
  • LETM1
  • LMAN1
  • MAN1
  • MAP3K11
  • MBC2
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MDF2
  • MLK3
  • MOCA
  • MPP7
  • MSE55
  • MSK12
  • MUC18
  • NBR
  • NDUFA5
  • NDUFS3
  • OPHN1
  • OST
  • P190A
  • PAK2
  • PAK4
  • PDRO
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PLD1
  • PLEKHG3
  • PMBP
  • PREX1
  • PTK1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RAP1GN1
  • RHOG
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RICS
  • SGEF
  • SH3D1A
  • SHMT2
  • SPRK
  • STA
  • STB2
  • STBD1
  • STX5
  • STX5A
  • SYB3
  • TFRC
  • TIM
  • TMPO
  • TRAD
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • VRK2
  • XTP8
  • YKT6
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
ERKs are inactivated
  • BMK1
  • DUSP3
  • DUSP4
  • DUSP6
  • DUSP7
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK5
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • MKP2
  • MKP3
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM7
  • PYST1
  • PYST2
  • VH2
  • VHR
  • VRK3
Homo sapiens (human)
ABO blood group biosynthesis
  • ABO
  • FUT1
  • FUT2
  • H
  • HSC
  • SEC2
Homo sapiens (human)
Viral RNP Complexes in the Host Cell Nucleus
  • HSP72
  • HSPA1
  • HSPA1A
  • HSX70
  • M
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Nef Mediated CD8 Down-regulation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ATP6V1H
  • CD8B
  • CD8B1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • nef
Homo sapiens (human)
Impaired BRCA2 binding to PALB2
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Leukotriene receptors
  • BLT
  • BLT1
  • BLT2R
  • BLTR
  • BLTR2
  • CMKRL1
  • CYSLT1
  • CYSLT2
  • CYSLT2R
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • GPR16
  • GPR17
  • LTB4R
  • LTB4R2
  • P2RY7
Homo sapiens (human)
rRNA processing in the mitochondrion
  • ELAC2
  • ERAB
  • HADH2
  • HPC2
  • HSD17B10
  • KIAA0391
  • MRPP1
  • MRPP2
  • MRPP3
  • PRORP
  • RG9MTD1
  • SCHAD
  • SDR5C1
  • TRMT10C
  • XH98G2
Homo sapiens (human)
DCC mediated attractive signaling
  • ABLIM
  • ABLIM1
  • ABLIM2
  • ABLIM3
  • CDC42
  • DCC
  • DOCK1
  • FAK
  • FAK1
  • IGDCC1
  • KIAA0059
  • KIAA0843
  • KIAA1808
  • LIMAB1
  • NCK
  • NCK1
  • NTN1
  • NTN1L
  • PTK2
  • RAC1
  • SRC
  • SRC1
  • TC25
  • TRIO
  • WASL
Homo sapiens (human)
Invadopodia formation
  • ADAM12
  • ADAM15
  • ADAM19
  • FISH
  • KIAA0418
  • MDC15
  • MLTN
  • MLTNB
  • SH3MD1
  • SH3PXD2A
  • TKS5
Homo sapiens (human)
Termination of O-glycan biosynthesis
  • C6orf205
  • CA125
  • CGS23
  • DRCC1
  • KIAA1359
  • MG2
  • MUC1
  • MUC11
  • MUC12
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC16
  • MUC17
  • MUC19
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC21
  • MUC3
  • MUC3A
  • MUC3B
  • MUC4
  • MUC5
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
  • MUC7
  • MUCL1
  • NANTA3
  • PUM
  • RECC
  • SBEM
  • SIAT1
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIATL1
  • SMUC
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • STHM
  • STZ
Homo sapiens (human)
Formation of a pool of free 40S subunits
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4C
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • PCID1
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRIP1
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: December 9, 2024