GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1251 - 1275 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Defective ACTH causes obesity and POMCD
  • ACTHR
  • MC2R
  • POMC
Homo sapiens (human)
Imatinib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Activation of PUMA and translocation to mitochondria
  • ASPP1
  • ASPP2
  • BBC3
  • BBP
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • KET
  • KIAA0771
  • P53
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PPP1R13B
  • PUMA
  • RBBP3
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TP53
  • TP53BP2
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
Homo sapiens (human)
HDR through Single Strand Annealing (SSA)
  • ABL
  • ABL1
  • AGS1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRIP1
  • C12orf32
  • C16orf75
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC4
  • EXO1
  • EXOI
  • FANCJ
  • FRP1
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • HUS1
  • JTK7
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0259
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • R24L
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD52
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • REC1
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RHINO
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • WRN
  • XPF
Homo sapiens (human)
Synthesis of PIPs at the early endosome membrane
  • CG2
  • FIG4
  • INPP4A
  • INPP4B
  • INPP5F
  • KIAA0274
  • KIAA0647
  • KIAA0966
  • KIAA0981
  • KIAA1073
  • KIAA1682
  • MTM1
  • MTMR10
  • MTMR12
  • MTMR2
  • MTMR4
  • PI4K2A
  • PI4K2B
  • PIK3C2A
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIKFYVE
  • PIP3AP
  • PIP5K3
  • SAC2
  • SAC3
  • TAX1BP2
  • TRX
  • VAC14
  • VPS15
  • VPS34
  • ZFYVE11
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated IRF7 activation
  • CBP
  • CREBBP
  • DDX58
  • EFP
  • EP300
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNB
  • IFNB1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • P300
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • SIKE
  • SIKE1
  • TANK
  • TBK1
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
Prefoldin mediated transfer of substrate to CCT/TriC
  • 99D8.1
  • ACTB
  • C21orf112
  • CCT1
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT6B
  • CCT7
  • CCT8
  • CCTA
  • CCTB
  • CCTD
  • CCTE
  • CCTG
  • CCTH
  • CCTQ
  • CCTZ
  • HKE2
  • KIAA0002
  • KIAA0098
  • MM1
  • NIP7-1
  • PFD1
  • PFD2
  • PFD4
  • PFD5
  • PFD6
  • PFDN1
  • PFDN2
  • PFDN3
  • PFDN4
  • PFDN5
  • PFDN6
  • SRB
  • TCP1
  • TRIC5
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA4A
  • TUBA6
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
  • VBP1
Homo sapiens (human)
CREB phosphorylation
  • ATF1
  • ISPK1
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • MAPKAPK2
  • MSK1
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA5
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
Homo sapiens (human)
Creatine metabolism
  • AGAT
  • BGT1
  • CKB
  • CKBB
  • CKM
  • CKMM
  • CKMT
  • CKMT1A
  • CKMT1B
  • CKMT2
  • GABT3
  • GAMT
  • GAT3
  • GATM
  • PROT
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A7
  • SLC6A8
Homo sapiens (human)
Mitochondrial transcription initiation
  • NS5ATP5
  • POLRMT
  • TCF6
  • TCF6L2
  • TFAM
  • TFB2M
Homo sapiens (human)
Glycogen synthesis
  • EPM2A
  • EPM2B
  • GBE1
  • GYG
  • GYG1
  • GYG2
  • GYS
  • GYS1
  • GYS2
  • NHLRC1
  • PGM1
  • PPP1R3C
  • PPP1R5
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UGP1
  • UGP2
Homo sapiens (human)
Defective MPDU1 causes CDG-1f
  • MPDU1
Homo sapiens (human)
AMPK inhibits chREBP transcriptional activation activity
  • ACDC
  • ACRP30
  • ADIPOQ
  • ADIPOR1
  • ADIPOR2
  • AMPK
  • AMPK2
  • APM1
  • BHLHD14
  • GBP28
  • LKB1
  • MIO
  • MLXIPL
  • PAQR1
  • PAQR2
  • PJS
  • PRKAA2
  • PRKAB2
  • PRKAG2
  • STK11
  • TESBP1A
  • WBSCR14
Homo sapiens (human)
DNA replication initiation
  • CHRAC17
  • DPE2
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
Homo sapiens (human)
Digestion
  • ALPI
  • GUC2C
  • GUCA2
  • GUCA2A
  • GUCA2B
  • GUCY2C
  • PIR
  • STAR
Homo sapiens (human)
Tat-mediated elongation of the HIV-1 transcript
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCNH
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • tat
Homo sapiens (human)
Transcriptional Regulation by E2F6
  • APAF1
  • BAP1
  • BAT8
  • BHLHD4
  • BMI1
  • BRCA1
  • C6orf30
  • CBX3
  • CBX5
  • CDC7
  • CDC7L1
  • CHEK1
  • CHET9
  • CHK1
  • CTIP
  • DEDAF
  • DING
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F6
  • EDR1
  • EDR3
  • EED
  • EHMT1
  • EHMT2
  • EPC1
  • EUHMTASE1
  • EZH2
  • G9A
  • GLP
  • HIPI3
  • HP1A
  • JJAZ1
  • KIAA0160
  • KIAA0413
  • KIAA0518
  • KIAA1876
  • KMT1C
  • KMT1D
  • KMT6
  • L3MBTL2
  • MAD5
  • MAX
  • MBLR
  • MEL18
  • MGA
  • NG36
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PCGF6
  • PH1
  • PH3
  • PHC1
  • PHC3
  • RAD51
  • RAD51A
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RBBP8
  • RECA
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RNF1
  • RNF110
  • RNF134
  • RNF2
  • RNF51
  • RNF53
  • RR2
  • RRM2
  • RYBP
  • SUZ12
  • TFDP1
  • TFDP2
  • UXT
  • YAF2
  • YEAF1
  • ZNF144
Homo sapiens (human)
E2F-enabled inhibition of pre-replication complex formation
  • C20orf154
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • LATHEO
  • MCM8
  • ORC1
  • ORC1L
  • ORC2
  • ORC2L
  • ORC3
  • ORC3L
  • ORC4
  • ORC4L
  • ORC5
  • ORC5L
  • ORC6
  • ORC6L
  • P34CDC2
  • PARC1
Homo sapiens (human)
CTLA4 inhibitory signaling
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • CD152
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • CTLA4
  • FYN
  • JTK8
  • KIAA0044
  • LAB7
  • LCK
  • LYN
  • PKB
  • PKBG
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAC
  • SHPTP2
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Assembly and release of respiratory syncytial virus (RSV) virions
  • F
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • L
  • M
  • M2-1
  • N
  • P
Homo sapiens (human)
G-protein activation
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • MOR1
  • OPRM1
  • PDYN
  • POMC
Homo sapiens (human)
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK
  • ALS2CR2
  • AMPK
  • AMPK1
  • AMPK2
  • AMPKG3
  • C11orf59
  • C7orf59
  • CAB39
  • CAB39L
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • HBXIP
  • ILPIP
  • KIAA0243
  • KIAA1303
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LKB1
  • LST8
  • LYK5
  • MAP2K1IP1
  • MAPBPIP
  • MAPKSP1
  • MLST8
  • MO25
  • MTOR
  • PDRO
  • PJS
  • PPM1A
  • PPPM1A
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RHEB
  • RHEB2
  • ROBLD3
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • STK11
  • STRAD
  • STRADA
  • STRADB
  • TSC
  • TSC1
  • TSC2
  • TSC4
  • URLC11
  • XIP
Homo sapiens (human)
RHOBTB1 GTPase cycle
  • 99D8.1
  • BRE1A
  • CCT2
  • CCT7
  • CCTB
  • CCTH
  • COPS1
  • COPS2
  • COPS4
  • CPSF7
  • CSN1
  • CSN2
  • CSN4
  • CUL3
  • D0S117E
  • DBN1
  • GPS1
  • HNRNPC
  • HNRPC
  • HNRPG
  • KIAA0389
  • KIAA0617
  • KIAA0619
  • KIAA0740
  • KIAA0929
  • MINT
  • MYO6
  • NDR1
  • NIP7-1
  • P2PR
  • PACT
  • PDE5
  • PDE5A
  • RBBP6
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RBQ1
  • RHOBTB1
  • RNF20
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SFRS10
  • SHARP
  • SPEN
  • SRM160
  • SRRM1
  • STK38
  • TRA2B
  • TRIP15
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • VIM
Homo sapiens (human)
Defective SLC26A2 causes chondrodysplasias
  • DTD
  • DTDST
  • SLC26A2
Homo sapiens (human)
Defective ALG14 causes ALG14-CMS
  • ALG13
  • ALG14
  • CXorf45
  • GLT28D1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024