GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 976 - 1000 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
TWIK-related alkaline pH activated K+ channel (TALK)
  • KCNK16
  • KCNK17
  • TALK1
  • TALK2
  • TASK4
Homo sapiens (human)
Pausing and recovery of HIV elongation
  • C19orf17
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDK9
  • COBRA1
  • CPR4
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • WHSC2
Homo sapiens (human)
Defective ST3GAL3 causes MCT12 and EIEE15
  • ACAN
  • AGC1
  • CSPG1
  • FM
  • FMOD
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • MSK16
  • OGN
  • OIF
  • OMD
  • PRELP
  • SIAT6
  • SLRR2A
  • SLRR2B
  • SLRR2C
  • SLRR2D
  • SLRR2E
  • SLRR3A
  • ST3GAL3
Homo sapiens (human)
FGFR2c ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KS3
Homo sapiens (human)
Succinyl-CoA Biosynthesis
  • DLD
  • DLST
  • DLTS
  • GCSL
  • KGD4
  • LAD
  • MRPS36
  • OGDH
  • PHE3
Homo sapiens (human)
Resistance of ERBB2 KD mutants to AEE788
  • CDC37
  • CDC37A
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • HER2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MLN19
  • NEU
  • NGL
Homo sapiens (human)
Ca2+ pathway
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • C2orf31
  • CAGH26
  • CALM
  • CALM1
  • CALNA
  • CALNA2
  • CALNB
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK2A
  • CAMKA
  • CNA
  • CNA2
  • CNB
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • FZD2
  • FZD3
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • GNAO1
  • GNAT2
  • GNATC
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • INSP3R1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KIAA0581
  • KIAA0968
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • LAK1
  • LEF1
  • MAP3K7
  • MOV10
  • NFAT2
  • NFATC
  • NFATC1
  • NLK
  • PDE6A
  • PDE6B
  • PDE6G
  • PDEA
  • PDEB
  • PDEG
  • PKCA
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PPP3CA
  • PPP3CB
  • PPP3R1
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKG1
  • PRKG1B
  • PRKG2
  • PRKGR1A
  • PRKGR1B
  • PRKGR2
  • TAK1
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • WNT11
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Defective DPM3 causes CDG-1o
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
Resolution of Abasic Sites (AP sites)
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • REF1
Homo sapiens (human)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • 8
  • ABCB2
  • ABCB3
  • APPILS
  • ARTS1
  • ATG14
  • ATG14L
  • B2M
  • BECN1
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • D3S1231E
  • ERAP1
  • ERAP2
  • ERP57
  • ERP60
  • GRP58
  • GRP78
  • GT197
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HSPA5
  • KIAA0079
  • KIAA0525
  • KIAA0755
  • KIAA0831
  • KIAA0905
  • LRAP
  • NGS17
  • PDIA3
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PSF1
  • PSF2
  • RING11
  • RING4
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • TAP1
  • TAP2
  • TAPA
  • TAPBP
  • VPS15
  • VPS34
  • Y1
  • Y3
Homo sapiens (human)
RPIA deficiency: failed conversion of RU5P to R5P
  • RPI
  • RPIA
Homo sapiens (human)
InlB-mediated entry of Listeria monocytogenes into host cell
  • AF1P
  • CBL
  • CBL2
  • CIN85
  • CNSA1
  • CNSA2
  • CNSA3
  • EPS15
  • HBP
  • HGS
  • HRS
  • MET
  • RNF55
  • RPS27A
  • SH3D2A
  • SH3D2B
  • SH3D2C
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • inlB
Homo sapiens (human)
Acetylcholine inhibits contraction of outer hair cells
  • CHRNA10
  • CHRNA9
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNN2
  • NACHRA10
  • NACHRA9
  • SLO
Homo sapiens (human)
Telomere C-strand synthesis initiation
  • ACD
  • C17orf106
  • C17orf68
  • CTC1
  • DRIP5
  • OBFC1
  • PIN2
  • PIP1
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POT1
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • PTOP
  • RAP1
  • STN1
  • TEN1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • BPI
  • CD11B
  • CD14
  • CD18
  • CD180
  • CR3A
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • ESOP1
  • ITGAM
  • ITGB2
  • KIAA0820
  • LBP
  • LY64
  • LY86
  • LY96
  • MD1
  • MD2
  • MFI7
  • PLCG2
  • PTPN4
  • RP105
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
Homo sapiens (human)
VLDL assembly
  • APOB
  • APOC1
  • APOC4
  • ERBA2L
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
Homo sapiens (human)
SMAC, XIAP-regulated apoptotic response
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CPP32
  • DIABLO
  • IAP3
  • MCH3
  • SMAC
  • XIAP
Homo sapiens (human)
Defective GGT1 in aflatoxin detoxification causes GLUTH
  • GGT
  • GGT1
Homo sapiens (human)
Sodium/Proton exchangers
  • APNH1
  • KIAA0267
  • KIAA0939
  • NHE1
  • NHE2
  • NHE3
  • NHE4
  • NHE5
  • NHE6
  • NHE7
  • NHE8
  • NHE9
  • SLC9A1
  • SLC9A2
  • SLC9A3
  • SLC9A4
  • SLC9A5
  • SLC9A6
  • SLC9A7
  • SLC9A8
  • SLC9A9
Homo sapiens (human)
GRB2 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRAS
  • HRAS1
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • SMDF
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • DICER
  • DICER1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • HERNA
  • KIAA0928
  • KIAA1567
  • PACT
  • PRKRA
  • RAX
  • TARBP2
  • TRAX
  • TRBP
  • TSN
  • TSNAX
Homo sapiens (human)
tRNA modification in the nucleus and cytosol
  • ABH8
  • ADAT1
  • ADAT2
  • ADAT3
  • ALKBH8
  • ATPBD3
  • C12orf1
  • C14orf172
  • C16orf84
  • C20orf64
  • C4orf23
  • C6orf75
  • C8orf79
  • C9orf74
  • CCDC76
  • CDKAL1
  • CTU1
  • CTU2
  • DEADC1
  • DNMT2
  • DUS2
  • DUS2L
  • DXS9879E
  • EPRS
  • EPRS1
  • ESO3
  • FTSJ1
  • GCPL1
  • GITA
  • GLNS
  • ICF45
  • IPT
  • ITBA2
  • KIAA1153
  • KIAA1456
  • KIAA1767
  • KIAA1897
  • LAGE3
  • METTL1
  • METTL19
  • MOD5
  • NCS2
  • NCS6
  • NOPD1
  • NSUN2
  • NSUN6
  • OSGEP
  • PARS
  • PRPK
  • PUS3
  • PUS7
  • QARS
  • QPRS
  • QTRT1
  • QTRT2
  • QTRTD1
  • RG9MTD2
  • SAKI
  • TAD3
  • TGT
  • TGUT
  • THADA
  • THG1L
  • TP53RK
  • TPRKB
  • TRDMT1
  • TRIT1
  • TRM4
  • TRM6
  • TRM61
  • TRM9L
  • TRMT1
  • TRMT10A
  • TRMT11
  • TRMT112
  • TRMT13
  • TRMT44
  • TRMT6
  • TRMT61A
  • TRMT9B
  • URM1
  • WDR4
Homo sapiens (human)
Defective B4GALT1 causes B4GALT1-CDG (CDG-2d)
  • ACAN
  • AGC1
  • B4GALT1
  • CSPG1
  • FM
  • FMOD
  • GGTB2
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • MSK16
  • OGN
  • OIF
  • OMD
  • PRELP
  • SLRR2A
  • SLRR2B
  • SLRR2C
  • SLRR2D
  • SLRR2E
  • SLRR3A
Homo sapiens (human)
RHOV GTPase cycle
  • ARHGAP12
  • ARHGEF7
  • ARHV
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • CCP110
  • CDC42
  • CEP110
  • CEP97
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • COOL1
  • CP110
  • DEPDC1B
  • DFFRX
  • DLG5
  • DMH
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EPHA2
  • FAM
  • GIT1
  • GIT2
  • GRB1
  • GRB4
  • IQGAP1
  • KIAA0034
  • KIAA0051
  • KIAA0142
  • KIAA0148
  • KIAA0419
  • KIAA0583
  • KIAA0728
  • KIAA1142
  • KIAA1196
  • KIAA1494
  • KIAA2002
  • LRRIQ2
  • MAP3K11
  • MLK3
  • MYO9A
  • MYR7
  • NCK
  • NCK1
  • NCK2
  • NEAS
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3BP
  • PAK4
  • PAK5
  • PAK6
  • PAR6A
  • PAR6B
  • PARD6A
  • PARD6B
  • PDLG
  • PEAK1
  • PIK3R1
  • PIXB
  • POSH
  • POSH1
  • PTK1
  • RHOV
  • RNF142
  • SH3MD2
  • SH3RF1
  • SPRK
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • STB2
  • TPM3
  • TPM4
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • USP9
  • USP9X
  • VANGL1
  • WASL
  • WDR6
  • WRCH2
  • XTP8
  • ZNF512B
Homo sapiens (human)
Viral Messenger RNA Synthesis
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NP
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PCNT1
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RAP30
  • RAP74
  • RPB7
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024