GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1376 - 1400 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
NTRK3 as a dependence receptor
  • BAX
  • BCL2L4
  • COBRA1
  • KIAA1182
  • NELFB
  • NTRK3
  • TRKC
Homo sapiens (human)
Signaling by membrane-tethered fusions of PDGFRA or PDGFRB
  • ANKRD15
  • BIN2
  • BRAP1
  • ETV6
  • FLK1
  • GOLGA4
  • KANK
  • KANK1
  • KDR
  • KIAA0172
  • TEL
  • TEL1
  • VEGFR2
Homo sapiens (human)
TNFR2 non-canonical NF-kB pathway
  • ADRM1
  • API1
  • API2
  • APO3L
  • BAFF
  • BAFFR
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLYS
  • BR3
  • C7orf76
  • CAP-1
  • CD40L
  • CD40LG
  • CRAF1
  • D12S370
  • DR3LG
  • DSS1
  • FN14
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • HVEML
  • KIAA0107
  • LIGHT
  • LMPX
  • LMPY
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • MB1
  • MIHB
  • MIHC
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NIK
  • NU
  • OPGL
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RANK
  • RANKL
  • RNF48
  • RNF49
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TALL1
  • TBP1
  • TBP7
  • TNF
  • TNFA
  • TNFB
  • TNFBR
  • TNFC
  • TNFCR
  • TNFR2
  • TNFR3
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF3
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF2
  • TNFSF20
  • TNFSF3
  • TNFSF5
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRANCE
  • TRAP
  • TRAP2
  • TRAP3
  • X
  • Y
  • Z
  • ZTNF4
Homo sapiens (human)
Defective GALK1 causes GALCT2
  • GALK
  • GALK1
Homo sapiens (human)
Crosslinking of collagen fibrils
  • BMP1
  • KIAA0230
  • KIAA0932
  • LOX
  • LOXC
  • LOXL
  • LOXL1
  • LOXL2
  • LOXL3
  • LOXL4
  • MG50
  • PCOLC
  • PCOLCE
  • PCPE1
  • PRG2
  • PXD01
  • PXDN
  • TLL
  • TLL1
  • TLL2
  • VPO
  • VPO1
Homo sapiens (human)
STAT3 nuclear events downstream of ALK signaling
  • AIM
  • APRF
  • B7H1
  • BHLHE78
  • BLIMP1
  • CD274
  • CXXC9
  • DNMT
  • DNMT1
  • EP300
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HIF1A
  • IL2RG
  • MOP1
  • P300
  • PASD8
  • PDCD1L1
  • PDCD1LG1
  • PDL1
  • PRDM1
  • RPD3L1
  • SIN3A
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Stimuli-sensing channels
  • ACCN
  • ACCN1
  • ACCN2
  • ACCN3
  • ACCN4
  • ACCN5
  • ANO1
  • ANO10
  • ANO2
  • ANO3
  • ANO4
  • ANO5
  • ANO6
  • ANO7
  • ANO8
  • ANO9
  • ASIC1
  • ASIC2
  • ASIC3
  • ASIC4
  • ASIC5
  • ASPH
  • BAH
  • BART
  • BEST1
  • BEST2
  • BEST3
  • BEST4
  • BNAC1
  • BNAC2
  • BND7
  • BSND
  • C11orf25
  • C12orf3
  • C17orf29
  • C2orf21
  • CACC1
  • CACC3
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CISK
  • CLC1
  • CLCA1
  • CLCA2
  • CLCA3
  • CLCA3P
  • CLCA4
  • CLCK2
  • CLCN1
  • CLCN2
  • CLCN3
  • CLCN4
  • CLCN5
  • CLCN6
  • CLCN7
  • CLCNKA
  • CLCNKB
  • CLIC2
  • CaCC2
  • DNACH
  • DOG1
  • DSIPI
  • EPB72
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FKBP1L
  • FKBP9
  • GDD1
  • GILZ
  • GL
  • HBRR
  • HINAC
  • HSN2
  • KDP
  • KIAA0046
  • KIAA0344
  • KIAA0439
  • KIAA1169
  • KIAA1409
  • KIAA1566
  • KIAA1623
  • KIAA1691
  • KIAA1760
  • KIAA1843
  • MDEG
  • NALCN
  • NEDD4L
  • NEDL3
  • NGEP
  • NHA1
  • NHA2
  • NHEDC1
  • NHEDC2
  • NPT4
  • ORAOV2
  • OSTM1
  • OTK4
  • PCANAP5
  • PIG5
  • PRKWNK1
  • PRKWNK2
  • PRKWNK3
  • PRKWNK4
  • RAF
  • RAF1
  • RPS27A
  • RYDR
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SCNN1
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
  • SDCCAG43
  • SGK
  • SGK1
  • SGK2
  • SGK3
  • SGKL
  • SLC17A3
  • SLC9A10
  • SLC9A11
  • SLC9B1
  • SLC9B2
  • SLC9C1
  • SLC9C2
  • SLNAC1
  • SRI
  • STOM
  • STOML3
  • TAOS2
  • TMEM16A
  • TMEM16B
  • TMEM16C
  • TMEM16D
  • TMEM16E
  • TMEM16F
  • TMEM16G
  • TMEM16H
  • TMEM16J
  • TMEM16K
  • TNAC1
  • TP53I5
  • TPC1
  • TPC2
  • TPCN1
  • TPCN2
  • TRDN
  • TSC22D3
  • TTYH2
  • TTYH3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UNC79
  • UNC80
  • VGCNL1
  • VMD2
  • VMD2L1
  • VMD2L2
  • VMD2L3
  • WNK1
  • WNK2
  • WNK3
  • WNK4
  • WWP1
Homo sapiens (human)
Endogenous sterols
  • ADX
  • ADXR
  • AHR
  • AHRR
  • ARNT
  • ARNT2
  • ARO1
  • BAR
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • CYAR
  • CYP11A
  • CYP11A1
  • CYP11B1
  • CYP11B2
  • CYP19
  • CYP19A1
  • CYP1B1
  • CYP21
  • CYP21A2
  • CYP21B
  • CYP27
  • CYP27A1
  • CYP39A1
  • CYP46
  • CYP46A1
  • CYP4V2
  • CYP51
  • CYP51A1
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • FDX1
  • FDX1L
  • FDX2
  • FDXR
  • FXR
  • HRR1
  • KIAA0307
  • KIAA1234
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • POMC
  • RIP14
  • RXRA
  • S11BH
  • SRC1
  • SRC2
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Mitochondrial ABC transporters
  • ABC7
  • ABCB10
  • ABCB6
  • ABCB7
  • ABCB8
  • MABC1
  • MITOSUR
  • MTABC3
  • PRP
  • UMAT
Homo sapiens (human)
Masitinib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Defective visual phototransduction due to STRA6 loss of function
  • PALB
  • RBP4
  • STRA6
  • TTR
Homo sapiens (human)
Defective SLCO1B1 causes hyperbilirubinemia, Rotor type (HBLRR)
  • LST1
  • OATP1B1
  • OATP2
  • OATPC
  • SLC21A6
  • SLCO1B1
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of mitotic proteins
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • BUB1B
  • BUB3
  • BUBR1
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • KIAA1406
  • MAD2
  • MAD2L1
  • MAD3L
  • SFT
  • SSK1
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
Variant SLC6A14 may confer susceptibility towards obesity
  • SLC6A14
Homo sapiens (human)
TNFR1-mediated ceramide production
  • FAN
  • GNB2L1
  • NSMAF
  • RACK1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
Homo sapiens (human)
p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins
  • APBB1IP
  • BCAR1
  • CAS
  • CASS1
  • CRK
  • CRKAS
  • F8VWF
  • FAK
  • FAK1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA1027
  • KREV1
  • PREL1
  • PTK2
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VWF
Homo sapiens (human)
SHC1 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRAS
  • HRAS1
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PKCA
  • PKCD
  • PKCE
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PTPN12
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SMDF
  • SOS1
Homo sapiens (human)
IKBKB deficiency causes SCID
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • NEMO
  • TCF16
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type B (botB)
  • HA
  • HA-17
  • HA-33
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • SYT2
  • VAMP2
  • botB
  • ha17
  • ha34
  • ha70
  • ntnha
Homo sapiens (human)
Collagen chain trimerization
  • BP180
  • BPAG2
  • C3orf7
  • COL10A1
  • COL11A1
  • COL11A2
  • COL12A1
  • COL12A1L
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL15A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL1AL
  • COL20A1
  • COL21A1
  • COL22A1
  • COL23A1
  • COL24A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • COL27A1
  • COL28
  • COL28A1
  • COL29A1
  • COL2A1
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL4A6
  • COL5A1
  • COL5A2
  • COL5A3
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL7A1
  • COL8A1
  • COL8A2
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COLL6
  • EMID2
  • EMU2
  • KIAA1510
  • KIAA1870
  • UND
  • VWA4
Homo sapiens (human)
Regulation of RUNX3 expression and activity
  • ADRM1
  • AML2
  • C7orf76
  • CBFA3
  • CBFB
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • DSS1
  • EP300
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • KIAA1625
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MDM2
  • MIP224
  • MLM
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • P300
  • PEBP2A3
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • RUNX3
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SRC
  • SRC1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TGFB
  • TGFB1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Downregulation of ERBB2 signaling
  • BDP1
  • BTC
  • CDC37
  • CDC37A
  • CHIP
  • CTK
  • CUL5
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • EREG
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • HYL
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MATK
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PTPN12
  • PTPN18
  • RPS27A
  • SMDF
  • STUB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VACM1
Homo sapiens (human)
UCH proteinases
  • ACTB
  • ACTL6A
  • ACTR5
  • ACTR8
  • ADRM1
  • ALK5
  • AOF1
  • ARP5
  • ARP8
  • ASXH2
  • ASXL1
  • ASXL2
  • BAF53
  • BAF53A
  • BAP1
  • BARD1
  • C18orf37
  • C6orf193
  • C7orf76
  • CCDC95
  • DEN1
  • DSS1
  • FOXK1
  • FOXK2
  • GP110
  • H2AC1
  • H2AC11
  • H2AC12
  • H2AC13
  • H2AC14
  • H2AC15
  • H2AC16
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFC
  • H2AFD
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFI
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFN
  • H2AFO
  • H2AFP
  • H2AFQ
  • H2AFR
  • H2AW
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HCF1
  • HCFC1
  • HFC1
  • HIST1H2AA
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AG
  • HIST1H2AH
  • HIST1H2AI
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2AK
  • HIST1H2AL
  • HIST1H2AM
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AB
  • HIST2H2AC
  • HIST3H2A
  • HMGA1L4
  • HSPC
  • ILF
  • ILF1
  • INO80
  • INO80A
  • INO80B
  • INO80C
  • INO80D
  • INO80E
  • INO80F
  • INO80G
  • INO80H
  • INO80K
  • INO80N
  • INO80Q
  • INO80S
  • INOC1
  • KDM1B
  • KIAA0107
  • KIAA0272
  • KIAA0529
  • KIAA0978
  • KIAA1259
  • KIAA1461
  • KIAA1685
  • KIAA1887
  • LMPX
  • LMPY
  • LSD2
  • MADH7
  • MADH8
  • MB1
  • MBD5
  • MBD6
  • MCRS1
  • MIP224
  • MNF
  • MOV34L
  • MSP58
  • MSS1
  • NEDD8
  • NEDP1
  • NFRKB
  • NMP238
  • NU
  • OGT
  • PAPA1
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PRSC2
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SEM1
  • SENP8
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKR4
  • SMAD7
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TFPT
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TIP49
  • TIP49A
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UCH37
  • UCHL1
  • UCHL3
  • UCHL5
  • USP15
  • X
  • Y
  • YY1
  • Z
  • ZNHIT4
Homo sapiens (human)
Defective regulation of TLR7 by endogenous ligand
  • TLR7
Homo sapiens (human)
Regulation of pyruvate metabolism
  • ARMC8
  • C17orf39
  • C20orf11
  • CDW2
  • EMP
  • GID4
  • GID8
  • KIAA1901
  • LDHA
  • MAEA
  • ME1
  • MIP2
  • MKLN1
  • NEK1
  • RANBP9
  • RANBPM
  • RMND5A
  • RMND5B
  • RPS27A
  • TWA1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VID24
  • WDR26
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

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Last updated: December 9, 2024