GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1876 - 1900 of 2074 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation
  • AKT1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • DHFR
  • DYT5
  • GCH
  • GCH1
  • GCHFR
  • GFRP
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • NOS3
  • PKB
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • PTS
  • RAC
  • SPR
Homo sapiens (human)
The NLRP3 inflammasome
  • A4
  • AD1
  • APP
  • ASC
  • C1orf7
  • CARD5
  • CASP1
  • CD2BP1
  • CIAS1
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCB
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • LYT10
  • MEF
  • MEFV
  • MRS1
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX1
  • PSTPIP1
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RELA
  • SUGT1
  • TMS1
  • TRDX
  • TRIM20
  • TRX
  • TRX1
  • TXN
  • TXNIP
  • VDUP1
  • hla
  • hly
Homo sapiens (human)
The activation of arylsulfatases
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSC1
  • ARSD
  • ARSE
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • KIAA1001
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • TSULF
Homo sapiens (human)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
  • ABCA4
  • ABCR
  • ARSDR1
  • CRALBP
  • CRBP1
  • CYP4V2
  • DHRS9
  • E17KSR
  • EDH17B1
  • EDH17B2
  • EDHB17
  • HSD17B1
  • HSD17B6
  • HSD17B9
  • LRAT
  • MYO7A
  • OPN2
  • PALB
  • PRRDH
  • PSDR1
  • RBP1
  • RBP3
  • RBP4
  • RDH1
  • RDH10
  • RDH11
  • RDH12
  • RDH15
  • RDH16
  • RDH5
  • RDH8
  • RDHS
  • RHO
  • RLBP1
  • RODH
  • RODH4
  • RPE65
  • SDR16C4
  • SDR28C1
  • SDR28C2
  • SDR7C1
  • SDR7C2
  • SDR9C4
  • SDR9C5
  • SDR9C6
  • SDR9C7
  • SDR9C8
  • SDRO
  • STRA6
  • TTR
  • USH1B
Homo sapiens (human)
The fatty acid cycling model
  • BMCP1
  • SLC25A14
  • SLC25A27
  • SLC25A7
  • SLC25A8
  • SLC25A9
  • UCP
  • UCP1
  • UCP2
  • UCP3
  • UCP4
  • UCP5
Homo sapiens (human)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • AWAT2
  • BCP
  • CRALBP
  • DC4
  • DGAT2L4
  • DHRS3
  • GCP
  • MFAT
  • OPN1LW
  • OPN1MW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RDH17
  • RLBP1
  • SDR16C1
  • WS
Homo sapiens (human)
The role of GTSE1 in G2/M progression after G2 checkpoint
  • ADRM1
  • C7orf76
  • CAP20
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • DIR1
  • DSS1
  • FKBPL
  • GP110
  • GTSE1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MAPRE1
  • MB1
  • MDA6
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NG7
  • NU
  • P34CDC2
  • P53
  • PFAAP4
  • PIC1
  • PLK
  • PLK1
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SDI1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WAF1
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs)
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • CF2R
  • ERK1
  • ERK2
  • F2
  • F2R
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA12
  • GNA13
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PAR1
  • PAR3
  • PAR4
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • TR
Homo sapiens (human)
Thromboxane signalling through TP receptor
  • AAMP
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA13
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • TBXA2R
Homo sapiens (human)
Thyroxine biosynthesis
  • C6orf71
  • CGA
  • DEHAL1
  • DUOX
  • DUOX1
  • DUOX2
  • IYD
  • LNOX1
  • LNOX2
  • NIS
  • SLC5A5
  • THOX1
  • THOX2
  • TPO
  • TSHB
Homo sapiens (human)
Tie2 Signaling
  • ANG3
  • ANG4
  • ANGPT1
  • ANGPT2
  • ANGPT4
  • DOK2
  • GRB1
  • GRB14
  • GRB7
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0003
  • NRAS
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SHPTP2
  • SOS1
  • TEK
  • TIE2
  • VMCM
  • VMCM1
Homo sapiens (human)
Tight junction interactions
  • AWAL
  • C7orf1
  • CEPTRL2
  • CIPP
  • CLD1
  • CLDN1
  • CLDN10
  • CLDN11
  • CLDN12
  • CLDN14
  • CLDN15
  • CLDN16
  • CLDN17
  • CLDN18
  • CLDN19
  • CLDN2
  • CLDN20
  • CLDN22
  • CLDN23
  • CLDN3
  • CLDN4
  • CLDN5
  • CLDN6
  • CLDN7
  • CLDN8
  • CLDN9
  • CPER
  • CPETR1
  • CPETR2
  • CPETRL2
  • CRB3
  • DXS1179E
  • E
  • F11R
  • INADL
  • JAM1
  • JCAM
  • MPP5
  • OSP
  • OTM
  • PALS1
  • PAR3
  • PAR3A
  • PAR6A
  • PAR6B
  • PAR6G
  • PARD3
  • PARD6A
  • PARD6B
  • PARD6G
  • PATJ
  • PCLN1
  • PRKCI
  • SEMP1
  • TMVCF
  • WBSCR8
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade
  • TLR10
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • BPI
  • CD11B
  • CD14
  • CD18
  • CD180
  • CR3A
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • ESOP1
  • ITGAM
  • ITGB2
  • KIAA0820
  • LBP
  • LY64
  • LY86
  • LY96
  • MD1
  • MD2
  • MFI7
  • PLCG2
  • PTPN4
  • RP105
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade
  • TIL3
  • TLR5
  • flaF
  • fliC
  • hag
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade
  • TLR7
  • TLR8
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade
  • EEA1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • RBSN
  • TLR9
  • VPS15
  • VPS34
  • ZFYVE2
  • ZFYVE20
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade
  • CD14
  • KIAA0012
  • TIL4
  • TLR1
  • TLR2
  • porB
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade
  • CD14
  • CD36
  • GP3B
  • GP4
  • TIL4
  • TLR2
  • TLR6
  • mip
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type A (botA)
  • HA
  • HA-17
  • HA-33
  • KIAA0735
  • KIAA0736
  • KIAA1054
  • SNAP
  • SNAP25
  • SV2A
  • SV2B
  • SV2C
  • atx
  • bonT
  • botA
  • ha17
  • ha34
  • ha70
  • ntnha
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type B (botB)
  • HA
  • HA-17
  • HA-33
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • SYT2
  • VAMP2
  • botB
  • ha17
  • ha34
  • ha70
  • ntnha
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type C (botC)
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • STX1B
  • STX1B1
  • STX1B2
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type D (botD)
  • KIAA0735
  • KIAA0736
  • KIAA1054
  • SV2A
  • SV2B
  • SV2C
  • SYB1
  • SYB2
  • VAMP1
  • VAMP2
  • botD
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type E (botE)
  • KIAA0735
  • KIAA0736
  • SNAP
  • SNAP25
  • SV2A
  • SV2B
  • botE
  • ntnha
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024