GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 376 - 400 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Sphingolipid catabolism
  • ACER1
  • ACER2
  • ACER3
  • ALDH3B1
  • ALDH3B2
  • ALDH7
  • ALDH8
  • APHC
  • ASAH3
  • ASAH3L
  • KIAA1252
  • LPP1
  • LPP2
  • LPP3
  • PHCA
  • PLPP1
  • PLPP2
  • PLPP3
  • PPAP2A
  • PPAP2B
  • PPAP2C
  • SGPL1
  • SGPP1
  • SGPP2
  • SPP1
Homo sapiens (human)
Basigin interactions
  • ASC1
  • ATP1B
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BAT1
  • BSG
  • CAML1
  • CAV
  • CAV1
  • CD43
  • CD98LC
  • CLG
  • CYPA
  • FNRB
  • GMA
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • KIAA0245
  • L1CAM
  • LAT1
  • LAT2
  • MAG
  • MCT1
  • MCT3
  • MCT4
  • MDF2
  • MDU1
  • MIC5
  • MMP1
  • MPE16
  • MSK12
  • MSK18
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A1
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Homo sapiens (human)
HATs acetylate histones
  • ACTB
  • ACTL6A
  • ADA2B
  • ADA3
  • ATF2
  • ATP1
  • ATXN7
  • ATXN7L3
  • BAF53
  • BAF53A
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BHLHE8
  • BIG3
  • BR140
  • BRD1
  • BRD8
  • BRL
  • BRPF1
  • BRPF2
  • BRPF3
  • C11orf19
  • C12orf41
  • C13orf19
  • C17orf81
  • C1orf149
  • C20orf104
  • C20orf20
  • C3orf75
  • CAGH32
  • CBP
  • CCDC101
  • CENP-28
  • CENP-36
  • CLOCK
  • CREB2
  • CREBBP
  • CREBP1
  • CSRP2BP
  • DERP6
  • DMAP1
  • DR1
  • EAF6
  • ELP1
  • ELP2
  • ELP3
  • ELP4
  • ELP5
  • ELP6
  • ENY2
  • EP300
  • EP400
  • EPC1
  • FAM48A
  • GAS41
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GLEA2
  • H2AC1
  • H2AC11
  • H2AC12
  • H2AC13
  • H2AC14
  • H2AC15
  • H2AC16
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFC
  • H2AFD
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFI
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFN
  • H2AFO
  • H2AFP
  • H2AFQ
  • H2AFR
  • H2AW
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC18
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFT
  • H2BU1
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HAT1
  • HBO1
  • HBOa
  • HCA58
  • HCF1
  • HCFC1
  • HFC1
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AA
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AG
  • HIST1H2AH
  • HIST1H2AI
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2AK
  • HIST1H2AL
  • HIST1H2AM
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AB
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H2BF
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2A
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • HTATIP
  • HUP2
  • IKAP
  • IKBKAP
  • ING3
  • ING4
  • ING5
  • INO80H
  • INO80J
  • INO80K
  • INO80Q
  • JADE1
  • JADE2
  • JADE3
  • KANSL1
  • KANSL2
  • KANSL3
  • KAT1
  • KAT14
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KAT5
  • KAT6A
  • KAT6B
  • KAT7
  • KAT8
  • KIAA0026
  • KIAA0215
  • KIAA0239
  • KIAA0334
  • KIAA0383
  • KIAA0764
  • KIAA1063
  • KIAA1197
  • KIAA1267
  • KIAA1286
  • KIAA1310
  • KIAA1425
  • KIAA1498
  • KIAA1585
  • KIAA1807
  • KIAA1818
  • MBIP
  • MCRS1
  • MEAF6
  • MOF
  • MORF
  • MORF4L1
  • MORF4L2
  • MOZ
  • MOZ2
  • MRG15
  • MRGBP
  • MRGX
  • MSL1
  • MSL1L1
  • MSL1V1
  • MSL2
  • MSL2L1
  • MSL3
  • MSL3L1
  • MSP58
  • MYST1
  • MYST2
  • MYST3
  • MYST4
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NMP238
  • NSL1
  • NSL2
  • NSL3
  • NZF
  • OGT
  • P300
  • PAF400
  • PAF65A
  • PAF65B
  • PAX3
  • PAXNEB
  • PCAF
  • PHF15
  • PHF16
  • PHF17
  • PHF20
  • PRTD
  • RBAP46
  • RBBP7
  • RNF184
  • RUNXBP2
  • RUVBL1
  • RUVBL2
  • SAP130
  • SCA7
  • SGF29
  • SI1
  • SMAP
  • SMAP2
  • SPT3
  • SRC1
  • SRC2
  • STATIP1
  • SUPT20H
  • SUPT3H
  • SUPT7L
  • TADA1
  • TADA1L
  • TADA2A
  • TADA2B
  • TADA2L
  • TADA3
  • TADA3L
  • TAF10
  • TAF12
  • TAF15
  • TAF2A
  • TAF2G
  • TAF2H
  • TAF2J
  • TAF5L
  • TAF6L
  • TAF9
  • TAFII20
  • TAFII30
  • TAFII31
  • TCFL1
  • TIF2
  • TIP48
  • TIP49
  • TIP49A
  • TIP49B
  • TIP60
  • TMEM103
  • TNRC12
  • TRRAP
  • TSH2B
  • TZP
  • USP22
  • USP3L
  • VPS72
  • WDR5
  • YEATS2
  • YEATS4
  • YL1
  • ZNF220
  • ZZZ3
Homo sapiens (human)
Synthesis of UDP-N-acetyl-glucosamine
  • AGM1
  • AMDHD2
  • GFAT
  • GFPT
  • GFPT1
  • GFPT2
  • GNA1
  • GNPNAT1
  • NAGK
  • PGM3
  • RENBP
  • SPAG2
  • UAP1
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through NMDA receptor-mediated activation of RAS signaling
  • ISPK1
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA6
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
  • RSK4
Homo sapiens (human)
Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures
  • C3orf7
  • CATL2
  • CD151
  • CLG4B
  • COL10A1
  • COL11A1
  • COL11A2
  • COL15A1
  • COL18A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL24A1
  • COL27A1
  • COL29A1
  • COL2A1
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL5A1
  • COL5A2
  • COL5A3
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL8A1
  • COL8A2
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COLL6
  • CPSB
  • CTSB
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • ITGA6
  • ITGB4
  • KIAA1870
  • LAMA3
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC2
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • MMP13
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • MPSL1
  • PLEC
  • PLEC1
  • PUMP1
  • STMY1
  • TSPAN24
  • VWA4
Homo sapiens (human)
Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S
  • DDX2A
  • DDX2B
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EBP1
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EIF4H
  • KIAA0038
  • WBSCR1
  • WSCR1
Homo sapiens (human)
GABA receptor activation
  • ARHDH9
  • ARHGEF9
  • GABRA1
  • GABRA2
  • GABRA3
  • GABRA4
  • GABRA5
  • GABRA6
  • GABRB1
  • GABRB2
  • GABRB3
  • GABRG2
  • GABRG3
  • GABRQ
  • GABRR1
  • GABRR2
  • GABRR3
  • KIAA0424
  • NPTN
  • SDFR1
  • SDR1
Homo sapiens (human)
CDC6 association with the ORC:origin complex
  • C20orf154
  • CDC18L
  • CDC6
  • LATHEO
  • MCM8
  • ORC1
  • ORC1L
  • ORC2
  • ORC2L
  • ORC3
  • ORC3L
  • ORC4
  • ORC4L
  • ORC5
  • ORC5L
  • ORC6
  • ORC6L
  • PARC1
Homo sapiens (human)
Regulation of PAK-2p34 activity by PS-GAP/RHG10
  • ARHGAP10
  • GRAF2
  • PAK2
Homo sapiens (human)
Formation of the anterior neural plate
  • AN2
  • EHZF
  • GBX2
  • KIAA0569
  • LIP3
  • NANOG
  • OCT3
  • OCT4
  • OCT6
  • OTF3
  • OTF6
  • OTX2
  • PAX6
  • POU3F1
  • POU5F1
  • SIP1
  • SOX1
  • SOX2
  • ZEB2
  • ZFHX1B
  • ZFX1B
  • ZIC2
  • ZNF521
Homo sapiens (human)
Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • AKAP5
  • AKAP79
  • CGEF1
  • CGEF2
  • EPAC
  • EPAC1
  • EPAC2
  • GCG
  • GLP1R
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • INSP3R1
  • IQGAP1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNB1
  • KCNC2
  • KCNF2
  • KCNG2
  • KCNS3
  • KIAA0051
  • KIAA0422
  • KREV1
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAP1A
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Olfactory Signaling Pathway
  • ADCY3
  • ANO2
  • C12orf3
  • C14orf13
  • CNCA
  • CNCA1
  • CNCG2
  • CNGA2
  • CNGA4
  • GNAL
  • GNB1
  • GNG13
  • GPR164
  • KIAA0511
  • OLF3
  • OLFR1
  • OLFRA03
  • OR10A6
  • OR10G3
  • OR10G4
  • OR10G7
  • OR10H2
  • OR10H5
  • OR10J5
  • OR10S1
  • OR10X1
  • OR10X1P
  • OR11A1
  • OR11A2
  • OR11H4
  • OR11H6
  • OR13C3
  • OR14A2
  • OR14J1
  • OR1A1
  • OR1C1
  • OR1D2
  • OR1D5
  • OR1E1
  • OR1E5
  • OR1E6
  • OR1E9P
  • OR1N2
  • OR2A1
  • OR2A25
  • OR2A25P
  • OR2A27
  • OR2A42
  • OR2A7
  • OR2AT4
  • OR2B11
  • OR2C1
  • OR2C2P
  • OR2F1
  • OR2F3
  • OR2F3P
  • OR2F4
  • OR2F5
  • OR2J1
  • OR2J1P
  • OR2J2
  • OR2J3
  • OR2L13
  • OR2L14
  • OR2M2
  • OR2M7
  • OR2S2
  • OR2T1
  • OR2T4
  • OR2W1
  • OR2W3
  • OR2W3P
  • OR2W8P
  • OR3A1
  • OR4C12
  • OR4D2
  • OR4F11P
  • OR4F17
  • OR4F18
  • OR4F19
  • OR4L1
  • OR4L2P
  • OR4Q3
  • OR4Q4
  • OR51B5
  • OR51D1
  • OR51E1
  • OR51E1P
  • OR51E2
  • OR51L1
  • OR52A3P
  • OR52B6
  • OR56A4
  • OR5AL1
  • OR5AL1P
  • OR5AX1
  • OR5AX1P
  • OR5D14
  • OR5K1
  • OR5P3
  • OR5U1
  • OR6F1
  • OR6P1
  • OR7C1
  • OR7C4
  • OR7D4
  • OR7D4P
  • OR7G2
  • OR8B3
  • OR8D1
  • OR8D3
  • OR8K3
  • OR8U8
  • OR9G1
  • OR9G5
  • POGR
  • PSGR
  • PSGR2
  • TMEM16B
Homo sapiens (human)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACH2
  • CACN2
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CACNL1A1
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CCHL1A1
  • FGF11
  • FGF12
  • FGF12B
  • FGF13
  • FGF14
  • FHF1
  • FHF2
  • FHF3
  • FHF4
  • HBA
  • KIAA0558
  • KIAA0968
  • KIAA1158
  • KIAA1356
  • MED
  • MOG1
  • MYSB
  • NAC1
  • NAC2
  • NAC3
  • NENA
  • RANGNRF
  • RANGRF
  • SCN1
  • SCN10A
  • SCN11A
  • SCN12A
  • SCN1A
  • SCN1B
  • SCN2A
  • SCN2A1
  • SCN2A2
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN3B
  • SCN4A
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SCN6A
  • SCN7A
  • SCN8A
  • SCN9A
  • SNS2
Homo sapiens (human)
Striated Muscle Contraction
  • ACTN2
  • ACTN3
  • C15orf13
  • D9S57E
  • DES
  • DMD
  • MLC1
  • MLC2
  • MYBPC1
  • MYBPC2
  • MYBPC3
  • MYBPCF
  • MYBPCS
  • MYH3
  • MYH6
  • MYH8
  • MYHCA
  • MYL1
  • MYL2
  • MYL3
  • MYL4
  • NEB
  • NTMOD
  • TCAP
  • TMOD
  • TMOD1
  • TMOD2
  • TMOD3
  • TMOD4
  • TMSA
  • TMSB
  • TNNC
  • TNNC1
  • TNNC2
  • TNNI1
  • TNNI2
  • TNNI3
  • TNNT1
  • TNNT2
  • TNNT3
  • TNT
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • TPM4
  • TTN
  • VIM
Homo sapiens (human)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • FIGF
  • FLK1
  • FLT
  • FLT1
  • FLT4
  • FRT
  • KDR
  • PGF
  • PGFL
  • PLGF
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VEGFR1
  • VEGFR2
  • VEGFR3
  • VRF
Homo sapiens (human)
Alternative complement activation
  • BF
  • BFD
  • C3
  • CFB
  • CFD
  • CPAMD1
  • DF
  • GZMM
  • MET1
  • PFD
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1 targets PDZ proteins in cell-cell junction
  • E
  • MPP5
  • PALS1
  • sM
Homo sapiens (human)
Formation of xylulose-5-phosphate
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • CRY
  • CRYL1
  • DCXR
  • SDR20C1
  • SORD
  • XYLB
Homo sapiens (human)
Opioid Signalling
  • MOR1
  • OPRM1
  • PDYN
  • POMC
Homo sapiens (human)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperones
  • ATF6
  • GRP78
  • HSPA5
  • KIAA0091
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • S1P
  • S2P
  • SKI1
Homo sapiens (human)
Regulation of gap junction activity
  • E
  • GJA1
  • GJAL
  • TJP1
  • ZO1
Homo sapiens (human)
RUNX3 regulates NOTCH signaling
  • AML2
  • BHLHB39
  • CBFA3
  • CBP
  • CG1
  • CREBBP
  • CXorf6
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • HES1
  • HL
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • JAG1
  • JAGL1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • NOTCH1
  • P300
  • PCAF
  • PEBP2A3
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RUNX3
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • TAN1
Homo sapiens (human)
Defective NEU1 causes sialidosis
  • CTSA
  • ELNR1
  • GLB1
  • NANH
  • NEU1
  • PPGB
Homo sapiens (human)
TNFs bind their physiological receptors
  • AITR
  • AITRL
  • APO3
  • APRIL
  • BAFF
  • BCM
  • BCMA
  • BLYS
  • CD137
  • CD27
  • CD27L
  • CD27LG
  • CD30
  • CD30L
  • CD30LG
  • CD70
  • D1S166E
  • DCR3
  • DDR3
  • DL
  • DR3
  • ED1
  • EDA
  • EDA2
  • EDA2R
  • EDAR
  • EDARADD
  • FASLG
  • GITR
  • GITRL
  • HVEA
  • HVEM
  • HVEML
  • ILA
  • LIGHT
  • LTA
  • OCIF
  • OPG
  • OPGL
  • RANKL
  • TACI
  • TALL1
  • TALL2
  • TL1
  • TL6
  • TNFAR
  • TNFB
  • TNFBR
  • TNFR1
  • TNFR2
  • TNFRSF11B
  • TNFRSF12
  • TNFRSF13B
  • TNFRSF14
  • TNFRSF17
  • TNFRSF18
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF25
  • TNFRSF27
  • TNFRSF4
  • TNFRSF6B
  • TNFRSF7
  • TNFRSF8
  • TNFRSF9
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF13
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF15
  • TNFSF18
  • TNFSF20
  • TNFSF4
  • TNFSF6
  • TNFSF7
  • TNFSF8
  • TNFSF9
  • TNLG1A
  • TR6
  • TRANCE
  • TXGP1
  • TXGP1L
  • VEGI
  • WSL
  • WSL1
  • XEDAR
  • ZTNF2
  • ZTNF4
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024