GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1026 - 1050 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • DICER
  • DICER1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • HERNA
  • KIAA0928
  • KIAA1567
  • PACT
  • PRKRA
  • RAX
  • TARBP2
  • TRAX
  • TRBP
  • TSN
  • TSNAX
Homo sapiens (human)
tRNA modification in the nucleus and cytosol
  • ABH8
  • ADAT1
  • ADAT2
  • ADAT3
  • ALKBH8
  • ATPBD3
  • C12orf1
  • C14orf172
  • C16orf84
  • C20orf64
  • C4orf23
  • C6orf75
  • C8orf79
  • C9orf74
  • CCDC76
  • CDKAL1
  • CTU1
  • CTU2
  • DEADC1
  • DNMT2
  • DUS2
  • DUS2L
  • DXS9879E
  • EPRS
  • EPRS1
  • ESO3
  • FTSJ1
  • GCPL1
  • GITA
  • GLNS
  • ICF45
  • IPT
  • ITBA2
  • KIAA1153
  • KIAA1456
  • KIAA1767
  • KIAA1897
  • LAGE3
  • METTL1
  • METTL19
  • MOD5
  • NCS2
  • NCS6
  • NOPD1
  • NSUN2
  • NSUN6
  • OSGEP
  • PARS
  • PRPK
  • PUS3
  • PUS7
  • QARS
  • QPRS
  • QTRT1
  • QTRT2
  • QTRTD1
  • RG9MTD2
  • SAKI
  • TAD3
  • TGT
  • TGUT
  • THADA
  • THG1L
  • TP53RK
  • TPRKB
  • TRDMT1
  • TRIT1
  • TRM4
  • TRM6
  • TRM61
  • TRM9L
  • TRMT1
  • TRMT10A
  • TRMT11
  • TRMT112
  • TRMT13
  • TRMT44
  • TRMT6
  • TRMT61A
  • TRMT9B
  • URM1
  • WDR4
Homo sapiens (human)
Defective B4GALT1 causes B4GALT1-CDG (CDG-2d)
  • ACAN
  • AGC1
  • B4GALT1
  • CSPG1
  • FM
  • FMOD
  • GGTB2
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • MSK16
  • OGN
  • OIF
  • OMD
  • PRELP
  • SLRR2A
  • SLRR2B
  • SLRR2C
  • SLRR2D
  • SLRR2E
  • SLRR3A
Homo sapiens (human)
RHOV GTPase cycle
  • ARHGAP12
  • ARHGEF7
  • ARHV
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • CCP110
  • CDC42
  • CEP110
  • CEP97
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • COOL1
  • CP110
  • DEPDC1B
  • DFFRX
  • DLG5
  • DMH
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EPHA2
  • FAM
  • GIT1
  • GIT2
  • GRB1
  • GRB4
  • IQGAP1
  • KIAA0034
  • KIAA0051
  • KIAA0142
  • KIAA0148
  • KIAA0419
  • KIAA0583
  • KIAA0728
  • KIAA1142
  • KIAA1196
  • KIAA1494
  • KIAA2002
  • LRRIQ2
  • MAP3K11
  • MLK3
  • MYO9A
  • MYR7
  • NCK
  • NCK1
  • NCK2
  • NEAS
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3BP
  • PAK4
  • PAK5
  • PAK6
  • PAR6A
  • PAR6B
  • PARD6A
  • PARD6B
  • PDLG
  • PEAK1
  • PIK3R1
  • PIXB
  • POSH
  • POSH1
  • PTK1
  • RHOV
  • RNF142
  • SH3MD2
  • SH3RF1
  • SPRK
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • STB2
  • TPM3
  • TPM4
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • USP9
  • USP9X
  • VANGL1
  • WASL
  • WDR6
  • WRCH2
  • XTP8
  • ZNF512B
Homo sapiens (human)
Viral Messenger RNA Synthesis
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NP
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PCNT1
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RAP30
  • RAP74
  • RPB7
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 1
  • CPLA2
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • MAPK14
  • MXI2
  • P2RY1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • SAPK2A
Homo sapiens (human)
rRNA modification in the nucleus and cytosol
  • ALP
  • BAP28
  • BING4
  • BMS1
  • BMS1L
  • BUD23
  • BXDC4
  • C14orf111
  • C15orf12
  • C16orf42
  • C17orf40
  • C1orf107
  • C2F
  • C4orf9
  • C6orf11
  • C6orf153
  • CIRH1A
  • CRLZ1
  • DCAF13
  • DDX37
  • DDX47
  • DDX49
  • DDX52
  • DEF
  • DHX37
  • DIEXF
  • DIMT1
  • DIMT1L
  • DKC1
  • DRIM
  • EMG1
  • FBL
  • FCF1
  • FIB1
  • FLRN
  • GAR1
  • HCA66
  • HEATR1
  • HRB2
  • IMP3
  • IMP4
  • KIAA0007
  • KIAA0185
  • KIAA0187
  • KIAA0266
  • KIAA1517
  • KIAA1709
  • KIAA1988
  • KRR1
  • MERM1
  • MHAT
  • MPHOSPH10
  • MPP10
  • MRPS4
  • NAT10
  • NHP2
  • NHP2L1
  • NOC4L
  • NOL1
  • NOL11
  • NOL14
  • NOL5
  • NOL5A
  • NOL6
  • NOLA1
  • NOLA2
  • NOLA3
  • NOLA4
  • NOP10
  • NOP14
  • NOP2
  • NOP5
  • NOP56
  • NOP58
  • NSUN1
  • PDCD11
  • PNO1
  • PWP2
  • PWP2H
  • RCL1
  • RNAC
  • RNU3IP2
  • ROK1
  • RPC2
  • RPCL1
  • RPS14
  • RPS2
  • RPS4
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS9
  • RRP36
  • RRP7A
  • RRP9
  • RTC2
  • SAS10
  • SAZD
  • SDCCAG16
  • SNU13
  • TBL3
  • THUMPD1
  • TRMT112
  • TSR3
  • U355K
  • UND313L
  • UTP10
  • UTP11
  • UTP11L
  • UTP14A
  • UTP14C
  • UTP15
  • UTP17
  • UTP18
  • UTP20
  • UTP25
  • UTP3
  • UTP4
  • UTP5
  • UTP6
  • WBSCR22
  • WDR3
  • WDR36
  • WDR43
  • WDR46
  • WDR50
  • WDR75
  • WDSOF1
  • cPERP-E
Homo sapiens (human)
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GGTB2
  • GLUT1
  • LALBA
  • LYZL7
  • SLC2A1
Homo sapiens (human)
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA
  • AIM2
  • BN51
  • BN51T
  • CRCP
  • G22P1
  • G22P2
  • HNGS1
  • HYRC
  • HYRC1
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • MRE11
  • MRE11A
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • PRKDC
  • RPC11
  • RPC8
  • XRCC5
  • XRCC6
Homo sapiens (human)
Binding of TCF/LEF:CTNNB1 to target gene promoters
  • AML2
  • AXIN2
  • BHLHE39
  • CBFA3
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • LEF1
  • MYC
  • PEBP2A3
  • RUNX3
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
Homo sapiens (human)
Synthesis of IPs in the ER lumen
  • MINPP1
  • MIPP
Homo sapiens (human)
Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen
  • AE1
  • AQP1
  • CA1
  • CA2
  • CA4
  • CHIP28
  • CYB5R1
  • CYB5R2
  • CYB5R4
  • CYB5RL
  • DI
  • EPB3
  • HBA1
  • HBA2
  • HBB
  • NCB5OR
  • NQO3A2
  • RH50
  • RHAG
  • SLC4A1
Homo sapiens (human)
Mitochondrial unfolded protein response (UPRmt)
  • AKT1
  • ATF5
  • ATFX
  • CAT
  • DEF5
  • DEFA5
  • DNAJ2
  • DNAJA1
  • ESR
  • ESR1
  • FKHRL1
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • GRP75
  • HDJ2
  • HSF1
  • HSJ2
  • HSP60
  • HSP72
  • HSPA1
  • HSPA1A
  • HSPA1B
  • HSPA9
  • HSPA9B
  • HSPD1
  • HSPE1
  • HSPF4
  • HSTF1
  • HSX70
  • HTRA2
  • LONP1
  • NR3A1
  • NRF1
  • OMI
  • PKB
  • PRSS15
  • PRSS25
  • RAC
  • SIR2L3
  • SIRT3
  • SOD2
  • mt-HSP70
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation
  • AGS1
  • AIK
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK1
  • AIRK2
  • AMPK
  • AMPK1
  • AMPK2
  • AMPKG3
  • ARK1
  • ARK2
  • ARK5
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BA2R
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRIP1
  • BTAK
  • C12orf32
  • C16orf75
  • C20orf1
  • C20orf2
  • C20orf64
  • C9orf76
  • CCG1
  • CCGS
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN2
  • CDKN5
  • CDS1
  • CHEK1
  • CHEK2
  • CHK1
  • CHK2
  • CIF150
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CNK
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • CSPB1
  • CTIP
  • DIL2
  • DNA2
  • DNA2L
  • DYRK2
  • EXO1
  • EXOI
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FANCJ
  • FNK
  • FRP1
  • G5A
  • GTF2D1
  • HCA519
  • HEX1
  • HIPK1
  • HIPK2
  • HNGS1
  • HTATIP
  • HUS1
  • IAK1
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0259
  • KIAA0537
  • KIAA0630
  • LKB1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK5
  • MDM2
  • MDM4
  • MDMX
  • MRE11
  • MRE11A
  • MXI2
  • MYAK
  • NBAK2
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • NCK5A
  • NIR
  • NOC2L
  • NUAK1
  • OMPHK1
  • P53
  • P53DINP1
  • P95
  • PIN1
  • PJS
  • PLK3
  • PRAK
  • PRK
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • PRKM11
  • PRPK
  • PSSALRE
  • R24L
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD53
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • RBP56
  • REC1
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RHINO
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SIP
  • SSRP1
  • STK1
  • STK11
  • STK12
  • STK15
  • STK5
  • STK6
  • SUPT16H
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF15
  • TAF1L
  • TAF2
  • TAF2A
  • TAF2B
  • TAF2C
  • TAF2C1
  • TAF2C2
  • TAF2D
  • TAF2E
  • TAF2F
  • TAF2G
  • TAF2H
  • TAF2I
  • TAF2J
  • TAF2K
  • TAF2N
  • TAF2Q
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4A
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TAF9L
  • TAFII105
  • TAFII130
  • TAFII135
  • TAFII18
  • TAFII20
  • TAFII30
  • TAFII31
  • TAFII55
  • TAFII70
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • TP53
  • TP53INP1
  • TP53RK
  • TPX2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WRN
Homo sapiens (human)
Insulin effects increased synthesis of Xylulose-5-Phosphate
  • TAL
  • TALDO
  • TALDO1
  • TALDOR
  • TKT
Homo sapiens (human)
Activation of the AP-1 family of transcription factors
  • ATF2
  • CREB2
  • CREBP1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • ERK1
  • ERK2
  • FOS
  • G0S7
  • JNK1
  • JNK2
  • JNK3
  • JNK3A
  • JUN
  • MAPK1
  • MAPK10
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPK3
  • MAPK8
  • MAPK9
  • MXI2
  • PRKM1
  • PRKM10
  • PRKM11
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM8
  • PRKM9
  • SAPK1
  • SAPK1A
  • SAPK1B
  • SAPK1C
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
Homo sapiens (human)
Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide
  • AE1
  • AQP1
  • CA1
  • CA2
  • CA4
  • CHIP28
  • DI
  • EPB3
  • HBA1
  • HBA2
  • HBB
  • RH50
  • RHAG
  • SLC4A1
Homo sapiens (human)
Events associated with phagocytolytic activity of PMN cells
  • LPO
  • MPO
  • SAPX
Homo sapiens (human)
Melanin biosynthesis
  • AIM1
  • CAS2
  • D15S12
  • DCT
  • MATP
  • OCA2
  • P
  • SLC45A2
  • TYR
  • TYRP
  • TYRP1
  • TYRP2
  • TYRRP
Homo sapiens (human)
Defective SLC4A1 causes hereditary spherocytosis type 4 (HSP4), distal renal tubular acidosis (dRTA) and dRTA with hemolytic anemia (dRTA-HA)
  • AE1
  • DI
  • EPB3
  • SLC4A1
Homo sapiens (human)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • 3BH
  • CGA
  • CYP11B2
  • CYP21
  • CYP21A2
  • CYP21B
  • HSD3B1
  • HSD3B2
  • HSDB3A
  • HSDB3B
  • LHB
Homo sapiens (human)
Defective F9 variant does not activate FX
  • F10
  • F8
  • F8C
  • F9
Homo sapiens (human)
Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex
  • ALR
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BAF190A
  • BCL9
  • BCL9L
  • BRG1
  • C1orf28
  • CBP
  • CDC73
  • CREBBP
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DLNB11
  • EP300
  • EST2
  • GRG4
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3-4
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
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Homo sapiens (human)
Synthesis of PIPs at the plasma membrane
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Homo sapiens (human)
Signalling to ERK5
  • BMK1
  • ERK5
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  • MKK5
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Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024