GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1576 - 1600 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC)
  • ABC2
  • ATX
  • BBC1
  • C17orf31
  • C17orf71
  • C19orf61
  • C1orf16
  • CASC3
  • CBP20
  • CBP80
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DCP1A
  • DDX48
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF4A3
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • ERF1
  • ERF3A
  • ERF3B
  • EST1A
  • EST1B
  • EST1C
  • ETF1
  • FAU
  • FTE1
  • GSPT1
  • GSPT2
  • KIAA0111
  • KIAA0221
  • KIAA0250
  • KIAA0421
  • KIAA0732
  • KIAA1089
  • KIAA1408
  • LAMBR
  • LAMR1
  • LDC2
  • LIP
  • MAGOH
  • MAGOH2
  • MAGOHA
  • MAGOHB
  • MFTL
  • MLN51
  • MPS1
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEDD6
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PNRC2
  • PPP2CA
  • PPP2R1A
  • PPP2R2A
  • QM
  • RBM8
  • RBM8A
  • RENT1
  • RENT2
  • RENT3A
  • RENT3B
  • RF1
  • RIG
  • RNPS1
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SMG1
  • SMG5
  • SMG6
  • SMG7
  • SMG8
  • SMG9
  • SMIF
  • SUP45L1
  • SURF-3
  • SURF3
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UPF1
  • UPF2
  • UPF3
  • UPF3A
  • UPF3B
  • UPF3X
Homo sapiens (human)
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • BBC1
  • CBP20
  • CBP80
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • ERF1
  • ERF3A
  • ERF3B
  • ETF1
  • FAU
  • FTE1
  • GSPT1
  • GSPT2
  • KIAA0221
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEDD6
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • QM
  • RENT1
  • RF1
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SUP45L1
  • SURF-3
  • SURF3
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UPF1
Homo sapiens (human)
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex
  • CCG2
  • D6S218E
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4C
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • PCID1
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • TRIP1
  • UBA80
  • UBCEP1
Homo sapiens (human)
Formation of a pool of free 40S subunits
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4C
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • PCID1
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRIP1
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Recycling of eIF2:GDP
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2B1
  • EIF2B2
  • EIF2B3
  • EIF2B4
  • EIF2B5
  • EIF2BA
  • EIF2BB
  • EIF2BD
  • EIF2BE
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
Homo sapiens (human)
MyD88:MAL(TIRAP) cascade initiated on plasma membrane
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ECSIT
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MD2
  • MEKK
  • MEKK1
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • RNF85
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • SIGIRR
  • SOCS1
  • SSI1
  • TIL4
  • TIP3
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TRAF6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
MyD88 cascade initiated on plasma membrane
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TIL3
  • TLR10
  • TLR5
  • TRAF6
  • flaF
  • fliC
  • hag
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism
  • ATA1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLNS
  • GLT1
  • GLUL
  • NAT2
  • SAT1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC38A1
  • SNAT1
Homo sapiens (human)
Defective SLC1A3 causes episodic ataxia 6 (EA6)
  • EAAT1
  • GLAST
  • GLAST1
  • SLC1A3
Homo sapiens (human)
Defective SLC1A1 is implicated in schizophrenia 18 (SCZD18) and dicarboxylic aminoaciduria (DCBXA)
  • EAAC1
  • EAAT3
  • HEAAC1
  • SLC1A1
Homo sapiens (human)
Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors)
  • CASR
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GPR51
  • GPR59
  • GPR60
  • GPR70
  • GPR71
  • GPRC1A
  • GPRC1B
  • GPRC1C
  • GPRC1D
  • GPRC1E
  • GPRC1F
  • GPRC1G
  • GPRC1H
  • GPRC2A
  • GPRC3A
  • GPRC3B
  • GPRC6A
  • GRM1
  • GRM2
  • GRM3
  • GRM4
  • GRM5
  • GRM6
  • GRM7
  • GRM8
  • MGLUR1
  • MGLUR2
  • MGLUR3
  • MGLUR4
  • MGLUR5
  • MGLUR6
  • MGLUR7
  • MGLUR8
  • PCAR1
  • PTC
  • T1R1
  • T1R2
  • T1R3
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R10
  • TAS2R13
  • TAS2R14
  • TAS2R16
  • TAS2R19
  • TAS2R20
  • TAS2R23
  • TAS2R3
  • TAS2R30
  • TAS2R31
  • TAS2R38
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R41
  • TAS2R42
  • TAS2R43
  • TAS2R44
  • TAS2R45
  • TAS2R46
  • TAS2R47
  • TAS2R48
  • TAS2R49
  • TAS2R5
  • TAS2R50
  • TAS2R55
  • TAS2R60
  • TAS2R7
  • TAS2R8
  • TAS2R9
  • TR1
  • TR2
  • TR3
Homo sapiens (human)
Mitotic Metaphase/Anaphase Transition
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • PLK
  • PLK1
Homo sapiens (human)
Loss of MECP2 binding ability to the NCoR/SMRT complex
  • CTG26
  • GPS2
  • HDAC3
  • IRA1
  • KIAA1047
  • NCOR1
  • NCOR2
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
Homo sapiens (human)
FASTK family proteins regulate processing and stability of mitochondrial RNAs
  • CPR2
  • FASTKD2
  • FASTKD4
  • FASTKD5
  • KIAA0948
  • KIAA0971
  • KIAA1792
  • TBRG4
Homo sapiens (human)
SEMA3A-Plexin repulsion signaling by inhibiting Integrin adhesion
  • FARP2
  • FES
  • FPS
  • FYN
  • KIAA0463
  • KIAA0589
  • KIAA0793
  • KIAA1027
  • KIAA1550
  • NOV
  • NRP
  • NRP1
  • OCT
  • PIP5K1C
  • PLEKHC3
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN4
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA3
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • RAC1
  • RHO6
  • RND1
  • RRAS
  • SEMA3A
  • SEMAD
  • SEX
  • TC25
  • TLN
  • TLN1
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Signal regulatory protein family interactions
  • BIT
  • CD47
  • DAP12
  • FAK
  • FAK1
  • FAK2
  • FYB
  • FYB1
  • HCP
  • KARAP
  • MER6
  • MFR
  • MYD1
  • PRAP
  • PTK2
  • PTK2B
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • PTPNS1
  • PYK2
  • RA70
  • RAFTK
  • SAPS
  • SCAP2
  • SHPS1
  • SHPTP2
  • SIRP
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SIRPB2
  • SIRPG
  • SKAP2
  • SKAP55R
  • SLAP130
  • TYROBP
Homo sapiens (human)
Intracellular metabolism of fatty acids regulates insulin secretion
  • ACS3
  • ACS4
  • ACSL3
  • ACSL4
  • CD36
  • FACL3
  • FACL4
  • GP3B
  • GP4
  • LACS3
  • LACS4
Homo sapiens (human)
Defective SLC40A1 causes hemochromatosis 4 (HFE4) (duodenum)
  • FPN
  • FPN1
  • HEPH
  • IREG1
  • KIAA0698
  • SLC11A3
  • SLC40A1
Homo sapiens (human)
IRAK4 deficiency (TLR2/4)
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • IRAK4
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
MyD88 deficiency (TLR2/4)
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
Signaling by activated point mutants of FGFR1
  • BFGFR
  • CEK
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KS3
Homo sapiens (human)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • FRS3
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • NRAS
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • SOS1
Homo sapiens (human)
PI-3K cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
Homo sapiens (human)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • NRAS
  • SOS1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024