GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 2074 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Termination of O-glycan biosynthesis
  • C6orf205
  • CA125
  • CGS23
  • DRCC1
  • KIAA1359
  • MG2
  • MUC1
  • MUC11
  • MUC12
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC16
  • MUC17
  • MUC19
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC21
  • MUC3
  • MUC3A
  • MUC3B
  • MUC4
  • MUC5
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
  • MUC7
  • MUCL1
  • NANTA3
  • PUM
  • RECC
  • SBEM
  • SIAT1
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIATL1
  • SMUC
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • STHM
  • STZ
Homo sapiens (human)
Terminal pathway of complement
  • APOJ
  • C5
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CLI
  • CLU
  • CPAMD4
  • KUB1
Homo sapiens (human)
Telomere Extension By Telomerase
  • ACD
  • ANKRD28
  • C11orf23
  • C15orf20
  • C20orf41
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • CDKN2
  • DKC1
  • DRIP5
  • EST2
  • GAR1
  • INO80H
  • INO80J
  • KIAA0379
  • KIAA1088
  • KIAA1558
  • NHL
  • NHP2
  • NMP238
  • NOLA1
  • NOLA2
  • NOLA3
  • NOLA4
  • NOP10
  • PIF1
  • PIN2
  • PIP1
  • POT1
  • PP6R3
  • PPP6
  • PPP6C
  • PPP6R3
  • PTOP
  • RAP1
  • RTEL1
  • RUVBL1
  • RUVBL2
  • SAPL
  • SAPS3
  • SHQ1
  • TCAB1
  • TCS1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TERT
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TIP48
  • TIP49
  • TIP49A
  • TIP49B
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • TRT
  • WDR79
  • WRAP53
Homo sapiens (human)
Telomere C-strand synthesis initiation
  • ACD
  • C17orf106
  • C17orf68
  • CTC1
  • DRIP5
  • OBFC1
  • PIN2
  • PIP1
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POT1
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • PTOP
  • RAP1
  • STN1
  • TEN1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
Homo sapiens (human)
Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis
  • ACD
  • DRIP5
  • KIAA0039
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAP1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
Homo sapiens (human)
Tat-mediated elongation of the HIV-1 transcript
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCNH
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • tat
Homo sapiens (human)
Tat-mediated HIV elongation arrest and recovery
  • C19orf17
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK9
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • WHSC2
  • tat
Homo sapiens (human)
Tandem pore domain halothane-inhibited K+ channel (THIK)
  • KCNK13
Homo sapiens (human)
Tandem of pore domain in a weak inwardly rectifying K+ channels (TWIK)
  • HOHO1
  • KCNK1
  • KCNK6
  • KCNK7
  • KCNO1
  • TOSS
  • TWIK1
  • TWIK2
Homo sapiens (human)
Tachykinin receptors bind tachykinins
  • NK1R
  • NK2R
  • NK3R
  • NKA
  • NKNA
  • NKNAR
  • NKNB
  • TAC1
  • TAC1R
  • TAC2
  • TAC2R
  • TAC3
  • TAC3R
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
Homo sapiens (human)
TYSND1 cleaves peroxisomal proteins
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOX
  • ACOX1
  • AGPS
  • EDH17B4
  • HSD17B4
  • PAHX
  • PHYH
  • PTHIO
  • SCP2
  • SDR8C1
  • TYSND1
Homo sapiens (human)
TWIK-releated acid-sensitive K+ channel (TASK)
  • KCNK3
  • KCNK9
  • TASK
  • TASK1
  • TASK3
Homo sapiens (human)
TWIK-related spinal cord K+ channel (TRESK)
  • KCNK18
  • TRESK
  • TRIK
Homo sapiens (human)
TWIK-related alkaline pH activated K+ channel (TALK)
  • KCNK16
  • KCNK17
  • TALK1
  • TALK2
  • TASK4
Homo sapiens (human)
TWIK related potassium channel (TREK)
  • KCNK10
  • KCNK2
  • KCNK4
  • TRAAK
  • TREK
  • TREK1
  • TREK2
Homo sapiens (human)
TRP channels
  • ANKTM1
  • C20orf188
  • CHAK1
  • CHAK2
  • ECAC1
  • ECAC2
  • EREG1
  • KIAA1616
  • KNP3
  • LTRPC1
  • LTRPC2
  • LTRPC3
  • LTRPC4
  • LTRPC5
  • LTRPC6
  • LTRPC7
  • MCOLN1
  • MCOLN2
  • MCOLN3
  • ML4
  • MLSN
  • MLSN1
  • MTR1
  • TRP1
  • TRP3
  • TRP5
  • TRP6
  • TRP7
  • TRPA1
  • TRPC1
  • TRPC3
  • TRPC4
  • TRPC4AP
  • TRPC5
  • TRPC6
  • TRPC7
  • TRPM1
  • TRPM2
  • TRPM3
  • TRPM4
  • TRPM5
  • TRPM6
  • TRPM7
  • TRPM8
  • TRPML1
  • TRPP8
  • TRPV1
  • TRPV2
  • TRPV3
  • TRPV4
  • TRPV5
  • TRPV6
  • TRRP4AP
  • VR1
  • VRL
  • VRL2
  • VROAC
Homo sapiens (human)
TRKA activation by NGF
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
TRIF-mediated programmed cell death
  • CASP8
  • CD14
  • ESOP1
  • FADD
  • LY96
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
  • TRIF
Homo sapiens (human)
TRAIL signaling
  • APO2
  • APO2L
  • CASH
  • CASP10
  • CASP8
  • CASP8AP1
  • CFLAR
  • CLARP
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • KILLER
  • MCH4
  • MCH5
  • MORT1
  • MRIT
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10D
  • TNFSF10
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
TRAF6-mediated induction of TAK1 complex within TLR4 complex
  • CD14
  • ESOP1
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • LY96
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MD2
  • PRVTIRB
  • RNF85
  • RPS27A
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF6
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FIP3
  • HMG1
  • HMGB1
  • IFIH1
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KBRAS1
  • KBRAS2
  • KIAA1271
  • LYT10
  • MAD3
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MAVS
  • MDA5
  • MEKK
  • MEKK1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RAGE
  • RELA
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • S100A12
  • S100B
  • SAA1
  • TCF16
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • TRIP9
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling
  • BLU
  • CROC1
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRF7
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated IRF7 activation
  • CBP
  • CREBBP
  • DDX58
  • EFP
  • EP300
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNB
  • IFNB1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • P300
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • SIKE
  • SIKE1
  • TANK
  • TBK1
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
TRAF3-dependent IRF activation pathway
  • 1C
  • CAP-1
  • CBP
  • CRAF1
  • CREBBP
  • DDX58
  • EFP
  • EP300
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNB
  • IFNB1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • IRF7
  • KIAA0151
  • KIAA1271
  • M
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • NS1
  • P300
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • SIKE
  • SIKE1
  • TBK1
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024