GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 776 - 800 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Scavenging by Class H Receptors
  • APOB
  • FEEL1
  • FEEL2
  • FELL
  • FEX2
  • HARE
  • KIAA0246
  • ON
  • SPARC
  • STAB1
  • STAB2
Homo sapiens (human)
Mitochondrial translation termination
  • AIP
  • AKIP
  • AURKAIP1
  • BMRP
  • BRIP1
  • C10orf34
  • C11orf4
  • C15orf4
  • C20orf193
  • C21orf101
  • C21orf92
  • C2orf1
  • C3orf5
  • C6orf14
  • CHCHD1
  • DAP3
  • DS1
  • EFG2
  • ERAL1
  • GADD45GIP1
  • GFM2
  • HERA
  • ICT1
  • IMOGN38
  • KGD4
  • KIAA0104
  • KIAA0264
  • L23MRP
  • LIECG2
  • LIP2
  • MAAT1
  • MRL3
  • MRP63
  • MRP64
  • MRPL1
  • MRPL10
  • MRPL11
  • MRPL12
  • MRPL13
  • MRPL14
  • MRPL15
  • MRPL16
  • MRPL17
  • MRPL18
  • MRPL19
  • MRPL2
  • MRPL20
  • MRPL21
  • MRPL22
  • MRPL23
  • MRPL24
  • MRPL25
  • MRPL27
  • MRPL28
  • MRPL3
  • MRPL30
  • MRPL31
  • MRPL32
  • MRPL33
  • MRPL34
  • MRPL35
  • MRPL36
  • MRPL37
  • MRPL38
  • MRPL39
  • MRPL4
  • MRPL40
  • MRPL41
  • MRPL42
  • MRPL43
  • MRPL44
  • MRPL45
  • MRPL46
  • MRPL47
  • MRPL48
  • MRPL49
  • MRPL5
  • MRPL50
  • MRPL51
  • MRPL52
  • MRPL53
  • MRPL54
  • MRPL55
  • MRPL57
  • MRPL58
  • MRPL59
  • MRPL7
  • MRPL8
  • MRPL9
  • MRPS10
  • MRPS11
  • MRPS12
  • MRPS14
  • MRPS15
  • MRPS16
  • MRPS17
  • MRPS18A
  • MRPS18B
  • MRPS18C
  • MRPS2
  • MRPS21
  • MRPS22
  • MRPS23
  • MRPS24
  • MRPS25
  • MRPS26
  • MRPS27
  • MRPS28
  • MRPS29
  • MRPS30
  • MRPS31
  • MRPS32
  • MRPS33
  • MRPS34
  • MRPS35
  • MRPS36
  • MRPS37
  • MRPS38
  • MRPS39
  • MRPS5
  • MRPS6
  • MRPS7
  • MRPS9
  • MRRF
  • MTRF1A
  • MTRF1L
  • NCM1
  • NLVCF
  • NOF1
  • OXA1L
  • PDCD9
  • PLINP1
  • PRG6
  • PTCD3
  • RPL23L
  • RPML12
  • RPML2
  • RPML25
  • RPML27
  • RPML28
  • RPML3
  • RPML31
  • RPML32
  • RPML5
  • RPML8
  • RPMS11
  • RPMS12
  • RPMS13
  • RPMS15
  • RPMS16
  • RPMS17
  • RPMS21
  • RPMS22
  • RPMS25
  • RPMS6
  • RPMS9
  • RPSM12
  • URIM
Homo sapiens (human)
G beta:gamma signalling through BTK
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
Homo sapiens (human)
Signaling by juxtamembrane domain KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Ribavirin ADME
  • ADA
  • ADA1
  • ADK
  • C20orf37
  • CNT2
  • CNT3
  • ENT1
  • ENT3
  • ITPA
  • NDPKA
  • NM23
  • NM23B
  • NME1
  • NME2
  • NP
  • NT5B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • PNP
  • PNT5
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A3
Homo sapiens (human)
Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D
  • ADRM1
  • BCL1
  • C7orf76
  • CCND1
  • CDK4
  • DSS1
  • GP110
  • GSK3B
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PRAD1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG repress genes related to differentiation
  • NANOG
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • POU5F1
  • SOX2
Homo sapiens (human)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR11
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB1
  • ADTB2
  • ADTG
  • AP17
  • AP19
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ARP10
  • ARP11
  • BAM22
  • CANX
  • CAPAA3
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CATL2
  • CD74
  • CENPE
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPB2
  • CLAPG1
  • CLAPM1
  • CLAPS1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CLTNM
  • CNSA2
  • CPPI
  • CPSB
  • CPSD
  • CTRN1
  • CTRN2
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSE
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO1
  • CTSO2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • D3S1231E
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN50
  • DCTN6
  • DHC1
  • DHLAG
  • DLC1
  • DLC2
  • DMA
  • DMB
  • DNCH1
  • DNCI1
  • DNCI2
  • DNCIC1
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNCLI1
  • DNCLI2
  • DNECL
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYHC
  • DYN2
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • EG5
  • FDC
  • GILT
  • GSG3
  • HDLC1
  • HIP9
  • HLA-DMA
  • HLA-DMB
  • HLA-DNA
  • HLA-DOA
  • HLA-DOB
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLA-DZA
  • HLASB
  • HYPJ
  • IFI30
  • IP30
  • KIAA0034
  • KIAA0079
  • KIAA0109
  • KIAA0302
  • KIAA0325
  • KIAA0359
  • KIAA0755
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • KIAA0905
  • KIAA1236
  • KIAA1478
  • KID
  • KIF11
  • KIF15
  • KIF18A
  • KIF2
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3
  • KIF3A
  • KIF3AP
  • KIF3B
  • KIF3C
  • KIF4
  • KIF4A
  • KIF4B
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIF5C
  • KIFAP3
  • KLC
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC2L
  • KLC3
  • KLC4
  • KLP2
  • KNS
  • KNS1
  • KNS2
  • KNSL1
  • KNSL4
  • KNSL5
  • KNSL6
  • KNSL7
  • KNSL8
  • LAG3
  • LGMN
  • LIC2
  • MGCRACGAP
  • MKLP1
  • MKLP2
  • NKHC1
  • ORP1
  • OSBP8
  • OSBPL1
  • OSBPL1A
  • OSBPL1B
  • PPGB
  • PRSC1
  • RAB6KIFL
  • RAB7
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • RING6
  • RING7
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SCA5
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • SMAP
  • SPTBN2
  • TRIP5
  • WS3
Homo sapiens (human)
Loss-of-function mutations in DBT cause MSUD2
  • BCATE2
  • BCKDHA
  • BCKDHB
  • BCKDHE2
  • DBT
  • DLD
  • GCSL
  • LAD
  • PHE3
Homo sapiens (human)
Inhibition of Host mRNA Processing and RNA Silencing
  • CPSF30
  • CPSF4
  • NAR
  • NEB1
  • NS
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
Homo sapiens (human)
Complex III assembly
  • BCS1
  • BCS1L
  • BR
  • BRAWNIN
  • BZFB
  • C11orf83
  • C12orf73
  • C20orf44
  • C3orf78
  • C5orf31
  • C6orf125
  • C6orf149
  • COB
  • CYC1
  • CYTB
  • DNAJC20
  • FRDA
  • FXN
  • GRP75
  • HSC20
  • HSCB
  • HSPA9
  • HSPA9B
  • ISD11
  • LETM1
  • LYRM4
  • LYRM7
  • MNF1
  • MT-CYB
  • MTCYB
  • MZM1L
  • SMIM4
  • TTC19
  • UCRC
  • UQBP
  • UQCC
  • UQCC1
  • UQCC2
  • UQCC3
  • UQCC5
  • UQCC6
  • UQCR
  • UQCR10
  • UQCR11
  • UQCRB
  • UQCRC1
  • UQCRC2
  • UQCRFS1
  • UQCRH
  • UQCRQ
  • X25
  • mt-HSP70
Homo sapiens (human)
CaMK IV-mediated phosphorylation of CREB
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KIAA0968
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucose-dependent Insulinotropic Polypeptide (GIP)
  • ADCP2
  • AN2
  • CD26
  • DPP4
  • FFAR1
  • GATA4
  • GIP
  • GPR119
  • GPR40
  • ISL1
  • KIAA0102
  • NEC1
  • PAX6
  • PCSK1
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
Homo sapiens (human)
TICAM1-dependent activation of IRF3/IRF7
  • CAP-1
  • CRAF1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
ATF6B (ATF6-beta) activates chaperones
  • ATF6B
  • CREBL1
  • G13
  • GRP78
  • HSPA5
  • KIAA0091
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • S1P
  • S2P
  • SKI1
Homo sapiens (human)
RHOT1 GTPase cycle
  • ALS2CR3
  • ARHT1
  • KIAA0549
  • KIAA1042
  • MYO19
  • MYOHD1
  • OIP106
  • RAP1GDS1
  • RHOT1
  • SMGGDS
  • TRAK1
  • TRAK2
Homo sapiens (human)
Defective ABCC2 causes DJS
  • ABCC2
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • MRP2
Homo sapiens (human)
NOTCH3 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERIC1
  • HER1
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KIAA1323
  • KUZ
  • MADM
  • MIB1
  • MIB2
  • NCSTN
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH3
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RNF67
  • RPS27A
  • SKD
  • STM2
  • TACC3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
TWIK-releated acid-sensitive K+ channel (TASK)
  • KCNK3
  • KCNK9
  • TASK
  • TASK1
  • TASK3
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by POLK
  • DINB1
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLK
  • POLZ
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Maturation of protein 3a
  • 3a
  • CGS23
  • GALNT1
  • NANTA3
  • SIAT1
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIATL1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • STHM
  • STZ
Homo sapiens (human)
NOTCH4 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • DLL4
  • INT3
  • JAG1
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KUZ
  • MADM
  • NCSTN
  • NOTCH4
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • STM2
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K)
  • EPO
  • EPOR
  • GAB1
  • GRB1
  • IRS2
  • JAK2
  • JTK8
  • LYN
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3CG
  • PIK3R1
  • PIK3R5
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PI
  • BB1
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS3
  • HREV107
  • LENG4
  • MBOAT7
  • OACT7
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT3
  • PLBD1
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
Homo sapiens (human)
Regorafenib-resistant PDGFR mutants
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024