GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 2001 - 2025 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Defective SLC20A2 causes idiopathic basal ganglia calcification 1 (IBGC1)
  • GLVR2
  • PIT2
  • SLC20A2
Homo sapiens (human)
NTF3 activates NTRK2 (TRKB) signaling
  • NTF3
  • NTRK2
  • TRKB
Homo sapiens (human)
TRP channels
  • ANKTM1
  • C20orf188
  • CHAK1
  • CHAK2
  • ECAC1
  • ECAC2
  • EREG1
  • KIAA1616
  • KNP3
  • LTRPC1
  • LTRPC2
  • LTRPC3
  • LTRPC4
  • LTRPC5
  • LTRPC6
  • LTRPC7
  • MCOLN1
  • MCOLN2
  • MCOLN3
  • ML4
  • MLSN
  • MLSN1
  • MTR1
  • TRP1
  • TRP3
  • TRP5
  • TRP6
  • TRP7
  • TRPA1
  • TRPC1
  • TRPC3
  • TRPC4
  • TRPC4AP
  • TRPC5
  • TRPC6
  • TRPC7
  • TRPM1
  • TRPM2
  • TRPM3
  • TRPM4
  • TRPM5
  • TRPM6
  • TRPM7
  • TRPM8
  • TRPML1
  • TRPP8
  • TRPV1
  • TRPV2
  • TRPV3
  • TRPV4
  • TRPV5
  • TRPV6
  • TRRP4AP
  • VR1
  • VRL
  • VRL2
  • VROAC
Homo sapiens (human)
RHOBTB3 ATPase cycle
  • CCNE
  • CCNE1
  • CUL3
  • HGS
  • HRS
  • KIAA0617
  • KIAA0878
  • LRRC41
  • M6PRBP1
  • MUF1
  • PLIN3
  • RAB9
  • RAB9A
  • RAB9B
  • RAB9L
  • RHOBTB3
  • TIP47
  • VHL
Homo sapiens (human)
Coenzyme A biosynthesis
  • C20orf48
  • COAB
  • COAC
  • COASY
  • DCAKD
  • PANK
  • PANK1
  • PANK2
  • PANK3
  • PPCDC
  • PPCS
Homo sapiens (human)
Defective SLCO1B3 causes hyperbilirubinemia, Rotor type (HBLRR)
  • LST2
  • OATP1B3
  • OATP8
  • SLC21A8
  • SLCO1B3
Homo sapiens (human)
Histamine receptors
  • GPCR105
  • GPCR97
  • HRH1
  • HRH2
  • HRH3
  • HRH4
Homo sapiens (human)
Signaling by Erythropoietin
  • EPO
  • EPOR
  • IRS2
  • JAK2
  • JTK8
  • LYN
Homo sapiens (human)
Resolution of D-loop Structures through Holliday Junction Intermediates
  • APOLO1
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • BTBD12
  • C16orf75
  • C1orf112
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EME1
  • EME2
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • FIGNL1
  • FIRRM
  • GEN1
  • GIYD1
  • GIYD2
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0146
  • KIAA1784
  • KIAA1987
  • MMS4
  • MRE11
  • MRE11A
  • MUS81
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SLX1
  • SLX1A
  • SLX1B
  • SLX4
  • SPIDR
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
  • XRCC3
Homo sapiens (human)
AXIN missense mutants destabilize the destruction complex
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
Transport of nucleotide sugars
  • C6orf196
  • FUCT1
  • HFRC
  • KIAA0260
  • PAPST1
  • PAPST2
  • SLC35A1
  • SLC35A2
  • SLC35A3
  • SLC35B2
  • SLC35B3
  • SLC35B4
  • SLC35C1
  • SLC35D1
  • SLC35D2
  • UGALT
  • UGT
  • UGTL
  • UGTREL7
  • UGTREL8
  • YEA4
Homo sapiens (human)
Ethanol oxidation
  • ACAS2
  • ACAS2L
  • ACSS1
  • ACSS2
  • ADH1
  • ADH1A
  • ADH1B
  • ADH1C
  • ADH2
  • ADH3
  • ADH4
  • ADH5
  • ADH6
  • ADH7
  • ADHX
  • ALDC
  • ALDH1
  • ALDH1A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • ALDH5
  • ALDHX
  • ALDM
  • FDH
  • KIAA1846
  • PUMB1
Homo sapiens (human)
CD22 mediated BCR regulation
  • B29
  • CD22
  • CD79A
  • CD79B
  • HCP
  • IGA
  • IGB
  • IGHD
  • IGHM
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • JTK8
  • LYN
  • MB1
  • PTP1C
  • PTPN6
  • SIGLEC2
Homo sapiens (human)
PI3K/AKT Signaling
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • AREG
  • AREGB
  • ARHG
  • BCAP
  • BDNF
  • BTC
  • C20orf97
  • C9orf26
  • CD135
  • CD19
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • CTMP
  • DER4
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • FRS2
  • FYN
  • GAB1
  • GAB2
  • GBL
  • GGF
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGF
  • HGL
  • HPTA
  • HRGA
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • IL1F11
  • IL1RL1
  • IL33
  • INT2
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • JTK2
  • KGF
  • KIAA0571
  • KIAA1999
  • KIT
  • KLB
  • KS3
  • LAB7
  • LCK
  • LST8
  • M
  • MAPKAP1
  • MET
  • MIP1
  • MLN19
  • MLST8
  • MTOR
  • MYD88
  • N
  • NDF
  • NEU
  • NFHEV
  • NGL
  • NIPK
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • NTF3
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • NTRK3
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PDGFR
  • PDGFR1
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDK1
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKB
  • PKBG
  • PROTOR1
  • PRR5
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAC
  • RAC1
  • RAC2
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RHEPDGFRA
  • RHOG
  • RICTOR
  • RNF85
  • SCFR
  • SDGF
  • SGK
  • SGK1
  • SHPTP2
  • SIN1
  • SIS
  • SKIP3
  • SMDF
  • SRC
  • SRC1
  • ST2
  • STK1
  • STRN
  • T1
  • TC25
  • TCRIM
  • TGFA
  • THEM4
  • TKF
  • TRAF6
  • TRAT1
  • TRB3
  • TRIB3
  • TRKB
  • TRKC
  • VAV
  • VAV1
Homo sapiens (human)
Inhibition of the proteolytic activity of APC/C required for the onset of anaphase by mitotic spindle checkpoint components
  • CDC20
  • MAD2
  • MAD2L1
Homo sapiens (human)
RHOJ GTPase cycle
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGEF7
  • ARHJ
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • ASCT2
  • BND7
  • BORG5
  • BT
  • C11orf59
  • C1orf39
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42GAP
  • CEP1
  • COOL1
  • CPNE8
  • CRIB1
  • CTNNG
  • DEPDC1B
  • DIAP3
  • DIAPH3
  • DOCK8
  • DP3
  • EPB72
  • FBP17
  • FHOD3
  • FMNL3
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FRL2
  • GBAS
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GJAL
  • GRAF
  • GRB1
  • GRF1
  • GRIT
  • GRLF1
  • IMD2
  • IQGAP3
  • JUP
  • KIAA0142
  • KIAA0147
  • KIAA0148
  • KIAA0451
  • KIAA0554
  • KIAA0621
  • KIAA0712
  • KIAA1124
  • KIAA1142
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1722
  • KIAA2014
  • LAMTOR1
  • LAP2
  • LAP4
  • M7V1
  • MPP7
  • MSE55
  • NBC2
  • NBC2B
  • NBC3
  • NBCn1
  • NIPSNAP2
  • OCRL
  • OCRL1
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • OPHN3
  • P190A
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PAK3BP
  • PAK4
  • PDRO
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIXB
  • PREX1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RASL7B
  • RDR
  • RDRC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RHOI
  • RHOJ
  • RICS
  • SBC2
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SLC1A5
  • SLC4A6
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • STB2
  • STEAP3
  • STOM
  • SYB3
  • SYDE1
  • TCL
  • TFRC
  • TMPO
  • TOCA1
  • TRIO
  • TSAP6
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VARTUL
  • WAS
  • WASL
  • WBP3
  • WICH
  • WIPF2
  • WIRE
  • WWP2
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • BZRAP1
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIP1
  • MAOA
  • OCT1
  • OCT2
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVMT
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VMAT2
Homo sapiens (human)
Voltage gated Potassium channels
  • C1orf30
  • EAG
  • EAG1
  • EAG2
  • ERG
  • ERG1
  • ERG2
  • ERG3
  • HERG
  • HGK5
  • KCNA1
  • KCNA10
  • KCNA1B
  • KCNA2
  • KCNA2B
  • KCNA3
  • KCNA3B
  • KCNA4
  • KCNA4L
  • KCNA5
  • KCNA6
  • KCNA7
  • KCNA8
  • KCNA9
  • KCNAB1
  • KCNAB2
  • KCNAB3
  • KCNB1
  • KCNB2
  • KCNC1
  • KCNC2
  • KCNC3
  • KCNC4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNF1
  • KCNF2
  • KCNG1
  • KCNG2
  • KCNG3
  • KCNG4
  • KCNH1
  • KCNH2
  • KCNH3
  • KCNH4
  • KCNH5
  • KCNH6
  • KCNH7
  • KCNH8
  • KCNK2
  • KCNQ1
  • KCNQ2
  • KCNQ3
  • KCNQ4
  • KCNQ5
  • KCNS1
  • KCNS2
  • KCNS3
  • KCNV1
  • KCNV2
  • KIAA1044
  • KIAA1144
  • KIAA1282
  • KVLQT1
Homo sapiens (human)
Translocation of SLC2A4 (GLUT4) to the plasma membrane
  • AKT1
  • AKT2
  • AMPK
  • AMPK2
  • AMPKG3
  • ARHQ
  • AS160
  • ASPL
  • ASPSCR1
  • C20orf74
  • C2CD5
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CDP138
  • EXO70
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC4
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GLUT4
  • HME1
  • KIAA0359
  • KIAA0528
  • KIAA0603
  • KIAA1067
  • KIAA1108
  • KIAA1219
  • KIAA1272
  • KIAA1699
  • KIF3
  • KIF3A
  • KIF3AP
  • KIF3B
  • KIFAP3
  • LNPEP
  • MEL
  • MYH12
  • MYH9
  • MYO1C
  • MYO5A
  • OTASE
  • PKB
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RAB10
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB13
  • RAB14
  • RAB4
  • RAB4A
  • RAB8
  • RAB8A
  • RAC
  • RAC1
  • RAL
  • RALA
  • RALGAPA2
  • RALGAPB
  • RASL7A
  • RCC17
  • RHOQ
  • SEC10
  • SEC10L1
  • SEC15A
  • SEC15L
  • SEC15L1
  • SEC3
  • SEC3L1
  • SEC5
  • SEC5L1
  • SEC6
  • SEC6L1
  • SEC8
  • SEC8L1
  • SFN
  • SLC2A4
  • SMAP
  • SNAP23
  • STX4
  • STX4A
  • STXBP3
  • SYB2
  • TBC1D1
  • TBC1D4
  • TC10
  • TC25
  • TUG
  • UBXD9
  • UBXN9
  • VAMP2
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Transcriptional Regulation by MECP2
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • C22orf12
  • CAGH26
  • DGCR8
  • DGCRK6
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • GAMT
  • IRAK
  • IRAK1
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MMAC1
  • MOBP
  • MOV10
  • PTEN
  • PVALB
  • SGK
  • SGK1
  • SOX2
  • TEP1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
Tandem of pore domain in a weak inwardly rectifying K+ channels (TWIK)
  • HOHO1
  • KCNK1
  • KCNK6
  • KCNK7
  • KCNO1
  • TOSS
  • TWIK1
  • TWIK2
Homo sapiens (human)
FGFR1b ligand binding and activation
  • C19orf3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF3
  • FGFA
  • FGFB
  • GIPC
  • GIPC1
  • INT2
  • RGS19IP1
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
PI3K Cascade
  • CD135
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • IRS1
  • IRS2
  • JTK2
  • KGF
  • KIAA0571
  • KLB
  • KS3
  • PIK3C1
  • PIK3C3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R4
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • STK1
  • TKF
  • TLR9
  • VPS15
  • VPS34
Homo sapiens (human)
Nectin/Necl trans heterodimerization
  • CADM1
  • CADM3
  • HVEB
  • HVEC
  • IGSF4
  • IGSF4A
  • IGSF4B
  • LNIR
  • NECL1
  • NECL2
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
  • PRR1
  • PRR2
  • PRR3
  • PRR4
  • PVR
  • PVRL1
  • PVRL2
  • PVRL3
  • PVRL4
  • PVS
  • SYNCAM
  • SYNCAM3
  • TSLC1
  • TSLL1
Homo sapiens (human)
Ubiquinol biosynthesis
  • ADCK3
  • ADCK4
  • C16orf49
  • C6orf210
  • CABC1
  • CL640
  • COQ2
  • COQ3
  • COQ4
  • COQ5
  • COQ6
  • COQ7
  • COQ8A
  • COQ8B
  • COQ9
  • DLP1
  • DPS1
  • GLOXD1
  • GTT1
  • HPDL
  • PDSS1
  • PDSS2
  • STARD7
  • TPRT
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024