GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 876 - 900 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Signaling by Retinoic Acid
  • CRABP2
  • DLAT
  • DLD
  • DLTA
  • FABP5
  • GCSL
  • HAP
  • LAD
  • NR1B1
  • NR1B2
  • NR1B3
  • NR1C2
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NR2B3
  • PDHA1
  • PDHA2
  • PDHAL
  • PDHB
  • PDHK1
  • PDHK2
  • PDHK3
  • PDHK4
  • PDHX
  • PDK1
  • PDK2
  • PDK3
  • PDK4
  • PDX1
  • PHE1A
  • PHE1B
  • PHE3
  • PPARB
  • PPARD
  • RARA
  • RARB
  • RARG
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
Homo sapiens (human)
Inhibition of the proteolytic activity of APC/C required for the onset of anaphase by mitotic spindle checkpoint components
  • CDC20
  • MAD2
  • MAD2L1
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of Emi1
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC20
  • CDC28A
  • CDH1
  • CDK1
  • CDKN1
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • KIAA1242
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
Homo sapiens (human)
Transcription of E2F targets under negative control by DREAM complex
  • BARA
  • BHLHD4
  • BHLHE39
  • C14orf46
  • CDC18L
  • CDC25A
  • CDC6
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MAX
  • MYC
  • PCNA
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • TOP2
  • TOP2A
Homo sapiens (human)
CDC6 association with the ORC:origin complex
  • C20orf154
  • CDC18L
  • CDC6
  • LATHEO
  • MCM8
  • ORC1
  • ORC1L
  • ORC2
  • ORC2L
  • ORC3
  • ORC3L
  • ORC4
  • ORC4L
  • ORC5
  • ORC5L
  • ORC6
  • ORC6L
  • PARC1
Homo sapiens (human)
Unwinding of DNA
  • BM28
  • C20orf154
  • CCNL1
  • CDC21
  • CDC45
  • CDC45L
  • CDC45L2
  • CDC46
  • CDC47
  • CDCL1
  • GINS1
  • GINS2
  • GINS3
  • GINS4
  • KIAA0030
  • KIAA0186
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
  • MCM8
  • PSF1
  • PSF2
  • PSF3
  • SLD5
Homo sapiens (human)
G1/S-Specific Transcription
  • BARA
  • C14orf46
  • CCNA1
  • CCNE
  • CCNE1
  • CDC18L
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDC45
  • CDC45L
  • CDC45L2
  • CDC6
  • CDK1
  • CDKN1
  • CDT1
  • CXCDC1
  • DHFR
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • E2F6
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • ORC1
  • ORC1L
  • P34CDC2
  • PARC1
  • PCNA
  • POLA
  • POLA1
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • RR2
  • RRM2
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • TK1
  • TS
  • TYMS
Homo sapiens (human)
Activation of the pre-replicative complex
  • ASK
  • BM28
  • C20orf154
  • CCNL1
  • CDC18L
  • CDC21
  • CDC45
  • CDC45L
  • CDC45L2
  • CDC46
  • CDC47
  • CDC6
  • CDC7
  • CDC7L1
  • CDCL1
  • CDK2
  • CDKN2
  • CDT1
  • CHRAC17
  • DBF4
  • DBF4A
  • DPE2
  • GMNN
  • KIAA0030
  • LATHEO
  • MCM10
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
  • MCM8
  • ORC1
  • ORC1L
  • ORC2
  • ORC2L
  • ORC3
  • ORC3L
  • ORC4
  • ORC4L
  • ORC5
  • ORC5L
  • ORC6
  • ORC6L
  • PARC1
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA4
  • RPA70
  • ZDBF1
Homo sapiens (human)
Inactivation of CDC42 and RAC1
  • ARHGAP13
  • ARHGAP14
  • ARHGAP34
  • ARHGAP39
  • CDC42
  • DUTT1
  • FNBP2
  • KIAA0411
  • KIAA0456
  • KIAA1156
  • KIAA1304
  • KIAA1688
  • MEGAP
  • RAC1
  • ROBO1
  • SLIL3
  • SLIT2
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP2A
  • SRGAP3
  • TC25
Homo sapiens (human)
CD28 dependent Vav1 pathway
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • CDC42
  • FYN
  • LAB7
  • LCK
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • RAC1
  • TC25
  • VAV
  • VAV1
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate KTN1
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHG
  • CDC42
  • CG1
  • KIAA0004
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KLC
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC2L
  • KLC3
  • KLC4
  • KNS
  • KNS1
  • KNS2
  • KNSL8
  • KTN1
  • NKHC1
  • RAC1
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOG
  • TC25
Homo sapiens (human)
G beta:gamma signalling through CDC42
  • ARHGEF6
  • CDC42
  • COOL2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • KIAA0006
  • PAK1
  • PIXA
Homo sapiens (human)
DSCAM interactions
  • DCC
  • DSCAM
  • DSCAM2
  • DSCAML1
  • IGDCC1
  • KIAA1132
  • NTN1
  • NTN1L
Homo sapiens (human)
Nectin/Necl trans heterodimerization
  • CADM1
  • CADM3
  • HVEB
  • HVEC
  • IGSF4
  • IGSF4A
  • IGSF4B
  • LNIR
  • NECL1
  • NECL2
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
  • PRR1
  • PRR2
  • PRR3
  • PRR4
  • PVR
  • PVRL1
  • PVRL2
  • PVRL3
  • PVRL4
  • PVS
  • SYNCAM
  • SYNCAM3
  • TSLC1
  • TSLL1
Homo sapiens (human)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of other transcription factors
  • AP2TF
  • ARP1
  • CITED2
  • MRG1
  • PITX2
  • RGS
  • RIEG
  • RIEG1
  • TFAP2
  • TFAP2A
  • TFAP2C
Homo sapiens (human)
RHOH GTPase cycle
  • ARHGDIA
  • ARHGDIB
  • ARHGDIG
  • ARHH
  • ASCT2
  • BCATE2
  • BCKDHE2
  • BND7
  • BRWD2
  • BT
  • C11orf59
  • C1orf8
  • CAV
  • CAV1
  • CSK
  • CTNNG
  • D0S117E
  • DBN1
  • DBT
  • DP3
  • EPB72
  • FAM91A1
  • GARNL1
  • GBAS
  • GDIA1
  • GDIA2
  • GDID4
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • JUP
  • KIAA0619
  • KIAA0884
  • KIAA1142
  • KIAA1264
  • KIAA1351
  • KIAA1561
  • LAMTOR1
  • LCK
  • M7V1
  • MTR
  • NBC2
  • NBC2B
  • NBC3
  • NBCn1
  • NIPSNAP2
  • NSFL1C
  • ORP11
  • OSBP12
  • OSBPL11
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PAK5
  • PAK6
  • PAK7
  • PDRO
  • RAB7
  • RAB7A
  • RALGAPA1
  • RAP1GN1
  • RDR
  • RDRC
  • RHOH
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SBC2
  • SLC1A5
  • SLC4A6
  • SLC4A7
  • SRK
  • STB2
  • STOM
  • SYB3
  • TFRC
  • TMEM59
  • TTF
  • TUBA1B
  • TULIP1
  • UACA
  • UBXN2C
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VCP
  • WDR11
  • WDR15
  • ZAP70
Homo sapiens (human)
FOXO-mediated transcription of cell cycle genes
  • AFX
  • AFX1
  • BTG1
  • CAP20
  • CAV
  • CAV1
  • CCNG2
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CIP1
  • DDIT1
  • DPC4
  • EZF
  • FKH2
  • FKHL1
  • FKHL2
  • FKHL3
  • FKHL4
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXG1
  • FOXG1A
  • FOXG1B
  • FOXG1C
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • GADD45
  • GADD45A
  • GDF8
  • GKLF
  • KIP1
  • KLF4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MDA6
  • MLLT7
  • MSTN
  • PCBP4
  • PIC1
  • RB2
  • RBL2
  • SDI1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
Sperm Motility And Taxes
  • C14orf161
  • C19orf15
  • CATSPER1
  • CATSPER2
  • CATSPER3
  • CATSPER4
  • CATSPERB
  • CATSPERD
  • CATSPERG
  • HVCN1
  • KCNMA3
  • KCNMC1
  • KCNU1
  • SLO3
  • TMEM146
  • VSOP
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • AML1
  • CATL2
  • CBFA2
  • CBFB
  • CIS3
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO2
  • CTSU
  • CTSV
  • PI13
  • RUNX1
  • SERPINB13
  • SOCS3
  • SOCS4
  • SOCS7
  • SSI3
Homo sapiens (human)
Insulin receptor recycling
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6E1
  • ATP6E2
  • ATP6EL2
  • ATP6F
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6G2
  • ATP6G3
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6J
  • ATP6L
  • ATP6M
  • ATP6N1
  • ATP6N1A
  • ATP6N1B
  • ATP6N1C
  • ATP6N2
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A3
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V0E2L
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1EL2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • ATPL
  • C7orf32
  • CPSD
  • CTSD
  • IDE
  • INS
  • INSR
  • LAR
  • NG38
  • PTP1B
  • PTPN1
  • PTPRF
  • TCIRG1
  • VATB
  • VATC
  • VATD
  • VATF
  • VATPS1
  • VPATPD
  • VPP1
  • VPP2
  • VPP3
  • XAP3
Homo sapiens (human)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • CATL2
  • CNPY3
  • CPSB
  • CTG4A
  • CTSB
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • ERDA5
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • LGMN
  • PRAT4A
  • PRSC1
  • TLR3
  • TLR7
  • TLR8
  • TLR9
  • TNRC5
  • TRA1
  • UNC93
  • UNC93B
  • UNC93B1
Homo sapiens (human)
RUNX3 regulates WNT signaling
  • AML2
  • BCL1
  • BHLHE39
  • CBFA3
  • CCND1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • LEF1
  • MYC
  • PEBP2A3
  • PRAD1
  • RUNX3
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
Homo sapiens (human)
Formation of axial mesoderm
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • FAST1
  • FAST2
  • FOXA1
  • FOXA2
  • FOXH1
  • HNF3A
  • HNF3B
  • LEF1
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • NOTO
  • RTEF1
  • SHH
  • SMAD2
  • SMAD3
  • T
  • TBXT
  • TCF1
  • TCF13L1
  • TCF3A
  • TCF3B
  • TCF7
  • TEAD2
  • TEAD4
  • TEF3
  • TEF4
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
Cardiogenesis
  • AFX
  • AFX1
  • BHLHA26
  • BHLHA27
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHC5
  • BIG3
  • BSP1
  • CHF1
  • CHF2
  • CLIM2
  • CSX
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DHAND
  • DPC4
  • EHAND
  • EOMES
  • FOXO4
  • GATA4
  • GATA6
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HAND1
  • HAND2
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HRT1
  • HRT2
  • HTATIP
  • ISL1
  • KAT2A
  • KAT5
  • LDB1
  • LEF1
  • MADH1
  • MADH4
  • MADR1
  • MEF2C
  • MESP1
  • MLLT7
  • MYCD
  • MYOCD
  • NKX2-5
  • NKX2.5
  • NKX2E
  • SMAD1
  • SMAD4
  • SMYD1
  • SRF
  • T
  • TBR2
  • TBX1
  • TBX20
  • TBX5
  • TBXT
  • TIP60
  • WDR5
Homo sapiens (human)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1)
  • ADCP2
  • AN2
  • CD26
  • CDX2
  • CDX3
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DPP4
  • FFAR1
  • FFAR4
  • GCG
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNG13
  • GPR119
  • GPR120
  • GPR129
  • GPR40
  • GRP
  • KIAA0102
  • LEP
  • NEC1
  • O3FAR1
  • OB
  • OBS
  • PAX6
  • PCSK1
  • PGR4
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
  • TCF4
  • TCF7L2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024