GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1226 - 1250 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Regulation of CDH11 gene transcription
  • BHLHB33
  • BHLHB5
  • BHLHE22
  • DRBF
  • FKHL5
  • FOXF1
  • FREAC1
  • HEYL
  • HOX3A
  • HOXC8
  • HRT3
  • ILF3
  • KIAA0569
  • MPHOSPH4
  • NF90
  • PFM5
  • PRDM8
  • SIP1
  • SNAH
  • SNAI1
  • SP1
  • TNRC20
  • TSFP1
  • ZEB2
  • ZFHX1B
  • ZFX1B
Homo sapiens (human)
NOTCH2 intracellular domain regulates transcription
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • CD23A
  • CG1
  • CGL1
  • CLEC4J
  • CSPB
  • CTLA1
  • CXorf6
  • EP300
  • FCE2
  • FCER2
  • GRB
  • GZMB
  • HES1
  • HES5
  • HL
  • HRY
  • IGEBF
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • NOTCH2
  • P300
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
Homo sapiens (human)
PKA-mediated phosphorylation of key metabolic factors
  • BHLHD14
  • F6PK
  • MIO
  • MLXIPL
  • PFKFB1
  • PFRX
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • WBSCR14
Homo sapiens (human)
PP2A-mediated dephosphorylation of key metabolic factors
  • BHLHD14
  • F6PK
  • MIO
  • MLXIPL
  • PFKFB1
  • PFRX
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • WBSCR14
Homo sapiens (human)
SUMOylation of transcription factors
  • BHLHE32
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • DDXBP1
  • FOXL2
  • HIC1
  • MDM2
  • MITF
  • MLM
  • MTA1
  • P53
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SP3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TFAP2B
  • TFAP2C
  • TP53
  • TP53BP1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • ZBTB29
Homo sapiens (human)
Regulation of NFE2L2 gene expression
  • BHLHE39
  • CBP
  • CREBBP
  • EP300
  • MAFK
  • MYC
  • NFE2L2
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NOTCH1
  • NRF2
  • P300
  • RELA
  • TAN1
Homo sapiens (human)
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription
  • BHLHE39
  • CCNC
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDK8
  • CDK9
  • CDKN2B
  • COL1A2
  • CPR4
  • DP1
  • DP2
  • DPC4
  • E2F4
  • E2F5
  • EP300
  • ERK1
  • ERK2
  • FUR
  • FURIN
  • HDAC1
  • JUNB
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEN1
  • MTS2
  • MYC
  • NSEP1
  • P300
  • PACE
  • PAI1
  • PCSK3
  • PLANH1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RBL1
  • RNF111
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SCG2
  • SERPINE1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SP1
  • TAK
  • TAZ
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGIF
  • TGIF1
  • TGIF2
  • TSFP1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWTR1
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
PTK6 Expression
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • BRK
  • EPAS1
  • GRL
  • HIF1A
  • HIF2A
  • HMX3
  • MNAR
  • MOP1
  • MOP2
  • NR3C1
  • PASD2
  • PASD8
  • PELP1
  • PTK6
Homo sapiens (human)
Cellular response to hypoxia
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • EPAS1
  • FIH1
  • HIF1A
  • HIF1AN
  • HIF2A
  • MOP1
  • MOP2
  • PASD2
  • PASD8
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation of brown and beige adipocyte differentiation by EBF2
  • BHLHE74
  • BMP7
  • BSP1
  • C1orf199
  • CHD3
  • CHD4
  • CIDEA
  • CIG30
  • COE2
  • COX7A1
  • COX7AH
  • DIO2
  • DPC4
  • EBF2
  • ELOVL3
  • GATAD2A
  • GATAD2B
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HNRNPU
  • HNRPU
  • ITDI2
  • KIAA0760
  • KIAA1150
  • KIAA1266
  • KIAA1675
  • LEM6
  • MADH1
  • MADH4
  • MADR1
  • MBD3
  • MEL1
  • MTA1
  • MTA1L1
  • MTA2
  • MTA3
  • NCOA1
  • NPHP14
  • NR1C1
  • NR1C3
  • NR2B1
  • OAZ
  • OP1
  • PERC
  • PFM13
  • PGC1
  • PGC1A
  • PGC1B
  • PID
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARG
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • PPARGC1B
  • PRDM16
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RPD3L1
  • RXRA
  • SAFA
  • SLC25A7
  • SMAD1
  • SMAD4
  • SRC1
  • TXDI2
  • U21.1
  • UCP
  • UCP1
  • ZNF423
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression to control bile acid homeostasis
  • BHLHE74
  • CTG26
  • FABP6
  • GNT1
  • ILBP
  • ILLBP
  • KIAA1047
  • LXRA
  • LXRB
  • NCOA1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • RXRA
  • RXRB
  • SRC1
  • UGT1
  • UGT1A3
  • UNR
Homo sapiens (human)
PTK6 promotes HIF1A stabilization
  • BHLHE78
  • BRK
  • DTR
  • DTS
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • GPNMB
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HGFIN
  • HIF1A
  • LRRK2
  • MOP1
  • NMB
  • PARK8
  • PASD8
  • PTK6
Homo sapiens (human)
Activation of BID and translocation to mitochondria
  • BID
  • CASP8
  • CGL1
  • CSPB
  • CTLA1
  • GRB
  • GZMB
  • MCH5
  • NMT
  • NMT1
Homo sapiens (human)
Zinc influx into cells by the SLC39 gene family
  • BIGM103
  • HKE4
  • IRT1
  • KIAA0062
  • KIAA1265
  • LIV1
  • RING5
  • SLC39A1
  • SLC39A10
  • SLC39A14
  • SLC39A2
  • SLC39A3
  • SLC39A4
  • SLC39A5
  • SLC39A6
  • SLC39A7
  • SLC39A8
  • ZIP1
  • ZIP10
  • ZIP14
  • ZIP2
  • ZIP3
  • ZIP4
  • ZIP5
  • ZIP6
  • ZIP8
  • ZIRTL
Homo sapiens (human)
Signal regulatory protein family interactions
  • BIT
  • CD47
  • DAP12
  • FAK
  • FAK1
  • FAK2
  • FYB
  • FYB1
  • HCP
  • KARAP
  • MER6
  • MFR
  • MYD1
  • PRAP
  • PTK2
  • PTK2B
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • PTPNS1
  • PYK2
  • RA70
  • RAFTK
  • SAPS
  • SCAP2
  • SHPS1
  • SHPTP2
  • SIRP
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SIRPB2
  • SIRPG
  • SKAP2
  • SKAP55R
  • SLAP130
  • TYROBP
Homo sapiens (human)
Intraflagellar transport
  • BITH
  • C11orf2
  • C11orf60
  • C14orf179
  • C1orf41
  • C20orf9
  • CCDC2
  • CDV1
  • CEV14
  • CLUAP1
  • CMG1
  • D2LIC
  • DERP8
  • DHC1B
  • DHC2
  • DLC1
  • DLC2
  • DNCH2
  • DNCL1
  • DNCL2A
  • DNCL2B
  • DNCLC1
  • DNLC2A
  • DNLC2B
  • DYH1B
  • DYNC2H1
  • DYNC2I1
  • DYNC2I2
  • DYNC2LI1
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • DYNLRB1
  • DYNLRB2
  • DYNLT2
  • DYNLT2B
  • DYNLT5
  • ESRRBL1
  • HDLC1
  • HIPPI
  • HSPB11
  • IFT121
  • IFT122
  • IFT139
  • IFT140
  • IFT144
  • IFT172
  • IFT20
  • IFT22
  • IFT25
  • IFT27
  • IFT43
  • IFT46
  • IFT52
  • IFT54
  • IFT56
  • IFT57
  • IFT70A
  • IFT70B
  • IFT74
  • IFT80
  • IFT81
  • IFT88
  • KIAA0359
  • KIAA0590
  • KIAA0643
  • KIAA1179
  • KIAA1336
  • KIAA1374
  • KIAA1405
  • KIAA1638
  • KIAA1992
  • KIAA1997
  • KIF17
  • KIF3
  • KIF3A
  • KIF3AP
  • KIF3B
  • KIF3C
  • KIF3X
  • KIFAP3
  • KPNB2
  • LIC3
  • MIP1
  • MIPT3
  • NGD5
  • RABL4
  • RABL5
  • RAYL
  • ROBLD1
  • ROBLD2
  • SMAP
  • SPG
  • TCTE3
  • TCTEX1D1
  • TCTEX1D2
  • TCTEX1D3
  • TG737
  • TNPO1
  • TRAF3IP1
  • TRIP11
  • TRN
  • TTC10
  • TTC21B
  • TTC26
  • TTC30A
  • TTC30B
  • WDR10
  • WDR140
  • WDR19
  • WDR34
  • WDR35
  • WDR56
  • WDR60
  • WDTC2
Homo sapiens (human)
Specification of primordial germ cells
  • BLIMP1
  • BMP2B
  • BMP4
  • CBFA2T2
  • CXCR4
  • DVR4
  • EHT
  • EOMES
  • GP36
  • KIAA1546
  • MTGR1
  • NANOG
  • NANOS3
  • NOS3
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • PDPN
  • POU5F1
  • PRDM1
  • SOX17
  • TBR2
  • TET2
  • TFAP2C
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Expression
  • BLIMP1
  • P53
  • PRDM1
  • TP53
Homo sapiens (human)
Leukotriene receptors
  • BLT
  • BLT1
  • BLT2R
  • BLTR
  • BLTR2
  • CMKRL1
  • CYSLT1
  • CYSLT2
  • CYSLT2R
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • GPR16
  • GPR17
  • LTB4R
  • LTB4R2
  • P2RY7
Homo sapiens (human)
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • MAP2K3
  • MAP2K6
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • MEK3
  • MEK6
  • MKK3
  • MKK6
  • MXI2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM11
  • PRKMK3
  • PRKMK6
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKK2
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • JNK1
  • JNK2
  • JNK3
  • JNK3A
  • JNKK1
  • JNKK2
  • KIAA0733
  • MAP2K4
  • MAP2K7
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK10
  • MAPK8
  • MAPK9
  • MEK4
  • MEK7
  • MKK4
  • MKK7
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM10
  • PRKM8
  • PRKM9
  • PRKMK4
  • PRKMK7
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK1
  • SAPK1A
  • SAPK1B
  • SAPK1C
  • SEK1
  • SERK1
  • SKK1
  • SKK4
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling
  • BLU
  • CROC1
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRF7
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Golgi Cisternae Pericentriolar Stack Reorganization
  • BLZF1
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ERK2
  • GOLGA2
  • GOLPH5
  • GOLPH6
  • GORASP1
  • GORASP2
  • GRASP65
  • JEM1
  • MAPK1
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB2
  • RAB2A
  • USO1
  • VDP
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: December 9, 2024