GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 451 - 475 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Defective ABCB6 causes MCOPCB7
  • ABCB6
  • MTABC3
  • PRP
  • UMAT
Homo sapiens (human)
APAP ADME
  • AAC1
  • AAC2
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABCP
  • ACY1
  • BCRP
  • BCRP1
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMOAT2
  • CMRP
  • CN2
  • CNDP2
  • CPGL
  • CYP2E
  • CYP2E1
  • FAEES3
  • GGT
  • GGT1
  • GGT3
  • GGT3P
  • GGT5
  • GGT6
  • GGT7
  • GGTL3
  • GGTL5
  • GGTLA1
  • GNT1
  • GST1
  • GST3
  • GSTM1
  • GSTP1
  • GSTT1
  • HEL-S-13
  • HST
  • MLP2
  • MOATB
  • MRP
  • MRP1
  • MRP2
  • MRP3
  • MRP4
  • MRP5
  • MXR
  • NAT1
  • NAT2
  • PEPA
  • STD
  • STE
  • STM
  • STP
  • STP1
  • SULT1A1
  • SULT1A3
  • SULT1A4
  • SULT1C2
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • UGT1
  • UGT1A1
  • UGT1A10
  • UGT1A6
  • UGT1A9
  • UGT2B15
  • UGT2B8
Homo sapiens (human)
Aspirin ADME
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ACGNAT
  • ACSM2
  • ACSM2A
  • ACSM2B
  • ACSM4
  • ACSM5
  • ALB
  • BCHE
  • BSG
  • C6orf140
  • CAT
  • CES1
  • CES2
  • CHE1
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMOAT2
  • CMRP
  • CYP2C10
  • CYP2C19
  • CYP2C8
  • CYP2C9
  • CYP2D6
  • CYP2DL1
  • CYP2E
  • CYP2E1
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • GAT
  • GLYAT
  • GLYATL1
  • GLYATL2
  • GLYATL3
  • GNAT
  • GNT1
  • ICE
  • MACS2
  • MACS3
  • MCT1
  • MLP2
  • MRP2
  • MRP3
  • NLT
  • OAT2
  • SES1
  • SLC16A1
  • SLC22A7
  • UGT1
  • UGT1A1
  • UGT1A3
  • UGT1A4
  • UGT1A5
  • UGT1A6
  • UGT1A7
  • UGT1A8
  • UGT1A9
  • UGT2A1
  • UGT2A2
  • UGT2A3
  • UGT2B10
  • UGT2B11
  • UGT2B15
  • UGT2B17
  • UGT2B28
  • UGT2B4
  • UGT2B7
  • UGT2B8
  • UGT3A1
  • UGT3A2
  • UGTB2B9
Homo sapiens (human)
Atorvastatin ADME
  • ABCB1
  • ABCC2
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • GNT1
  • LST1
  • LST2
  • MDR1
  • MRP2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • PGY1
  • PON
  • PON1
  • PON3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • UGT1
  • UGT1A3
Homo sapiens (human)
Heme degradation
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCG2
  • ABCP
  • ALB
  • BCRP
  • BCRP1
  • BLVR
  • BLVRA
  • BLVRB
  • BVR
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • FABP1
  • FABPL
  • FLR
  • GNT1
  • GSTA1
  • HMOX1
  • HMOX2
  • HO
  • HO1
  • HO2
  • LST1
  • LST2
  • MRP
  • MRP1
  • MRP2
  • MXR
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • SCAN
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • UGT1
  • UGT1A1
  • UGT1A4
Homo sapiens (human)
Defective ABCC2 causes DJS
  • ABCC2
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • MRP2
Homo sapiens (human)
NFE2L2 regulating MDR associated enzymes
  • ABCC1
  • ABCC3
  • ABCF2
  • ABCG2
  • ABCP
  • BCRP
  • BCRP1
  • CBP
  • CMOAT2
  • CREBBP
  • EP300
  • MAFK
  • MLP2
  • MRP
  • MRP1
  • MRP3
  • MXR
  • NFE2L2
  • NRF2
  • P300
Homo sapiens (human)
Recycling of bile acids and salts
  • ABCB11
  • ABCC3
  • ACSB
  • ACSVL6
  • ALB
  • ASBT
  • BAAT
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BSEP
  • CMOAT2
  • FABP6
  • FACVL3
  • FATP5
  • FXR
  • HRR1
  • ILBP
  • ILLBP
  • ISBT
  • LST1
  • LST2
  • MLP2
  • MRP3
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • NTCP
  • NTCP2
  • OATP
  • OATP1
  • OATP1A2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • OSTA
  • OSTB
  • RIP14
  • RXRA
  • SLC10A1
  • SLC10A2
  • SLC21A3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLC27A5
  • SLC51A
  • SLC51B
  • SLCO1A2
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • SRC1
  • SRC2
  • STARD5
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Azathioprine ADME
  • ABCC4
  • ABCC5
  • CNT2
  • CNT3
  • DER12
  • ENT1
  • ENT2
  • GMK
  • GMPK
  • GMPS
  • GST1
  • GST2
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTM1
  • GUK1
  • HNP36
  • HPRT
  • HPRT1
  • IMPD1
  • IMPD2
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • MOATB
  • MRP4
  • MRP5
  • MTH2
  • NDPKA
  • NM23
  • NM23B
  • NME1
  • NME2
  • NUDT15
  • RAC1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • TC25
  • TPMT
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • XDH
  • XDHA
Homo sapiens (human)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • A2M
  • A4
  • AACT
  • AAP
  • AAT
  • ABCC4
  • ACTBL3
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AD1
  • AGP1
  • AGP2
  • AHSG
  • ALB
  • ALDA
  • ALDOA
  • ANX5
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • APOH
  • APOJ
  • APOOL
  • APP
  • APPL2
  • ARMET
  • ARP
  • AXLLG
  • B2G1
  • BCG1
  • BDK
  • BHPCDH
  • BRPF3
  • C1IN
  • C1NH
  • C6orf21
  • C6orf56
  • C9orf167
  • CALM
  • CALM1
  • CALU
  • CAM
  • CAM1
  • CAP
  • CAP1
  • CD109
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37B
  • CDC37L1
  • CFD
  • CFL
  • CFL1
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLGI
  • CLI
  • CLU
  • CPAMD5
  • CPAMD7
  • CTAP3
  • CTSW
  • CXCL4
  • CXCL7
  • CXorf33
  • CYB5R1
  • CYPA
  • CYRI
  • CYRIB
  • DF
  • EBAF
  • ECM
  • ECM1
  • EGF
  • EMILIN4
  • ENDOD1
  • ENX2
  • F13A
  • F13A1
  • F5
  • F8
  • F8C
  • F8VWF
  • FAM121A
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FERMT3
  • FETUA
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FIGF
  • FLN
  • FLN1
  • FLNA
  • FN
  • FN1
  • G6F
  • GAS6
  • GLBA
  • GMRP
  • GP2B
  • GP3A
  • GP3B
  • GP4
  • GPIA*
  • GRMP
  • GRP78
  • GTPBP2
  • GTPBP9
  • HABP4
  • HARC
  • HGF
  • HPTA
  • HRG
  • HSPA5
  • IBP1
  • IGF1
  • IGF2
  • IHRP
  • ILEI
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • ITIH3
  • ITIH4
  • ITIHL1
  • KIAA0120
  • KIAA0206
  • KIAA0680
  • KIAA0830
  • KIAA1027
  • KIAA1286
  • KIAA1830
  • KIND3
  • KNG
  • KNG1
  • KST
  • KUB1
  • LAMP2
  • LEFTA
  • LEFTY2
  • LEFTYA
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LY6G6D
  • LY6G6F
  • M2BP
  • MAGED2
  • MANF
  • MIC27
  • MIC3
  • MIG2B
  • MLA1
  • MMRN
  • MMRN1
  • MOATB
  • MRP4
  • NG32
  • NHLRC2
  • NQO3A2
  • OLA1
  • ON
  • ORM1
  • ORM2
  • P47
  • PAI1
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PF4
  • PFD
  • PFN1
  • PHACTR2
  • PI
  • PI4
  • PK120
  • PLANH1
  • PLEK
  • PLG
  • PLI
  • POTEKP
  • PP4
  • PPBP
  • PPIA
  • PRG
  • PRG1
  • PROS
  • PROS1
  • PSAP
  • QSCN6
  • QSOX1
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SAP1
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SCYB4
  • SCYB7
  • SELENOP
  • SELP
  • SEPP1
  • SERPINA1
  • SERPINA3
  • SERPINA4
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SIS
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SPP24
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TB4X
  • TEX264
  • TF
  • TGB1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TGFB4
  • THBGB1
  • THBS1
  • THYB4
  • TIG2
  • TIMP
  • TIMP1
  • TIMP3
  • TLN
  • TLN1
  • TMSB4
  • TMSB4X
  • TMX3
  • TNA
  • TOR4A
  • TSP
  • TSP1
  • TSPAN29
  • TSPAN30
  • TTN
  • TUBA1
  • TUBA4A
  • TXNDC10
  • UNC18B
  • URP2
  • VCL
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
  • VTI1
  • VTI1B
  • VTI1L
  • VTI1L1
  • VTI2
  • VWF
  • WDR1
  • ZSIG11
Homo sapiens (human)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS
  • HAS1
  • HAS2
  • HAS3
  • HYBID
  • KIAA1199
  • MRP5
Homo sapiens (human)
Defective ABCC6 causes PXE
  • ABCC6
  • ARA
  • MRP6
Homo sapiens (human)
ATP sensitive Potassium channels
  • ABCC8
  • ABCC9
  • HRINS
  • KCNJ11
  • KCNJ8
  • SUR
  • SUR1
  • SUR2
Homo sapiens (human)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • AHCYL1
  • CACH2
  • CACH3
  • CACH4
  • CACH6
  • CACN2
  • CACN3
  • CACN4
  • CACNA1A
  • CACNA1C
  • CACNA1D
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • CACNL1A1
  • CACNL1A2
  • CACNL1A4
  • CACNL1A6
  • CACNLB2
  • CACNLB3
  • CCHL1A1
  • CCHL1A2
  • CGEF1
  • CGEF2
  • DCAL
  • EPAC
  • EPAC1
  • EPAC2
  • GLUT1
  • GLUT2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • HRINS
  • INS
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • KIAA0558
  • MYSB
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • STXBP1
  • SUR
  • SUR1
  • SYB2
  • SYT5
  • UNC18A
  • VAMP2
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
Defective ABCC8 can cause hypo- and hyper-glycemias
  • ABCC8
  • HRINS
  • KCNJ11
  • SUR
  • SUR1
Homo sapiens (human)
Ion homeostasis
  • ABCC9
  • AHCYL1
  • ASPH
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1AL2
  • ATP1B
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP1C
  • ATP1G1
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • BAH
  • C7orf19
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CBCIP2
  • CLIC2
  • CNC
  • CRACM1
  • DCAL
  • DM1PK
  • DMPK
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FKBP1L
  • FKBP9
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD3
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • GOK
  • HBRR
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • KIAA0778
  • KIAA0968
  • KIAA1087
  • MAT8
  • MDPK
  • MXRA1
  • NCX1
  • NCX2
  • NCX3
  • NOS1
  • ORAI1
  • ORAI2
  • OTK4
  • PKACA
  • PLB
  • PLM
  • PLML
  • PLN
  • PMCA1
  • PMCA2
  • PRKACA
  • RYDR
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SLN
  • SRI
  • STIM1
  • SUR2
  • TMEM142A
  • TMEM142B
  • TNNC1
  • TNNI3
  • TRDN
  • TRP1
  • TRPC1
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
Defective ABCC9 causes CMD10, ATFB12 and Cantu syndrome
  • ABCC9
  • KCNJ11
  • SUR2
Homo sapiens (human)
Class I peroxisomal membrane protein import
  • ABCD1
  • ABCD2
  • ABCD3
  • ACBD5
  • ALD
  • ALD1
  • ALDL1
  • ALDR
  • ALDRP
  • ATAD1
  • FIS1
  • GDAP1
  • HK33
  • KIAA1996
  • PAF1
  • PAF3
  • PEX11B
  • PEX12
  • PEX13
  • PEX14
  • PEX16
  • PEX19
  • PEX2
  • PEX26
  • PEX3
  • PMP22
  • PMP24
  • PMP3
  • PMP34
  • PMP35
  • PMP70
  • PXF
  • PXMP1
  • PXMP2
  • PXMP3
  • PXMP4
  • RNF72
  • SLC25A17
  • TTC11
Homo sapiens (human)
Linoleic acid (LA) metabolism
  • ABCD1
  • ACSL1
  • ALD
  • CIG30
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
Defective ABCD1 causes ALD
  • ABCD1
  • ALD
Homo sapiens (human)
HDL remodeling
  • ABC8
  • ABCG1
  • ALB
  • APC2
  • APOA1
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • CETP
  • LCAT
  • LIPG
  • WHT1
Homo sapiens (human)
Defective ABCG5 causes sitosterolemia
  • ABCG5
  • ABCG8
Homo sapiens (human)
Defective ABCG8 causes GBD4 and sitosterolemia
  • ABCG5
  • ABCG8
Homo sapiens (human)
Telomere Extension By Telomerase
  • ACD
  • ANKRD28
  • C11orf23
  • C15orf20
  • C20orf41
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • CDKN2
  • DKC1
  • DRIP5
  • EST2
  • GAR1
  • INO80H
  • INO80J
  • KIAA0379
  • KIAA1088
  • KIAA1558
  • NHL
  • NHP2
  • NMP238
  • NOLA1
  • NOLA2
  • NOLA3
  • NOLA4
  • NOP10
  • PIF1
  • PIN2
  • PIP1
  • POT1
  • PP6R3
  • PPP6
  • PPP6C
  • PPP6R3
  • PTOP
  • RAP1
  • RTEL1
  • RUVBL1
  • RUVBL2
  • SAPL
  • SAPS3
  • SHQ1
  • TCAB1
  • TCS1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TERT
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TIP48
  • TIP49
  • TIP49A
  • TIP49B
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • TRT
  • WDR79
  • WRAP53
Homo sapiens (human)
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production
  • DDX36
  • DDX9
  • DHX36
  • DHX9
  • IRF7
  • KIAA1488
  • LKP
  • LYT10
  • MLEL1
  • MYD88
  • NDH2
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • RELA
  • RHAU
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024