GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 551 - 575 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Minus-strand DNA synthesis
  • CYPA
  • PPIA
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Uncoating of the Influenza Virion
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Formation of the active cofactor, UDP-glucuronate
  • HFRC
  • KIAA0260
  • SLC35D1
  • SLC35D2
  • UGDH
  • UGP1
  • UGP2
  • UGTREL7
  • UGTREL8
  • UXS1
Homo sapiens (human)
MPS IIIA - Sanfilippo syndrome A
  • HSS
  • SGSH
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ADMLX
  • ANOS1
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KAL
  • KAL1
  • KALIG1
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Viral mRNA Translation
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DNAJC3
  • DXS648E
  • EC45
  • FAU
  • FTE1
  • GRSF1
  • HA
  • LAMBR
  • LAMR1
  • M
  • MFTL
  • MPS1
  • NA
  • NEDD6
  • NP
  • NS
  • P58IPK
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PRKRI
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Spry regulation of FGF signaling
  • BRAF
  • BRAF1
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MKNK1
  • MNK1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAFB1
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • SPRY2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Late Phase of HIV Life Cycle
  • NMT
  • NMT1
  • nef
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-2 targets PDZ proteins in cell-cell junction
  • CIPP
  • CRB3
  • E
  • GJA1
  • GJAL
  • INADL
  • MPP5
  • PALS1
  • PATJ
  • TJP1
  • ZO1
Homo sapiens (human)
Cell-extracellular matrix interactions
  • ABPL
  • FBLIM1
  • FBLP1
  • FERMT2
  • FLN
  • FLN1
  • FLN2
  • FLNA
  • FLNC
  • ILK
  • ILK1
  • ILK2
  • KIND2
  • LIMS1
  • LIMS2
  • MIG2
  • MXRA2
  • PARVA
  • PARVB
  • PINCH
  • PINCH1
  • PINCH2
  • PLEKHC1
  • VASP
Homo sapiens (human)
Signaling by FLT3 ITD and TKD mutants
  • ASH
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • GAB2
  • GRB1
  • GRB2
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0571
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • SOS1
  • STK1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of transcription cofactors
  • BAP1
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BING2
  • BMI1
  • CASP8AP2
  • CBP
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX8
  • CREBBP
  • CTBP
  • CTBP1
  • CTG26
  • CXXC3
  • DAP6
  • DAXX
  • DDX17
  • DDX5
  • DDXBP1
  • DING
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • EP300
  • FLASH
  • G17P1
  • HAP
  • HELR
  • HET
  • HIPI3
  • HIPK2
  • HLR1
  • ING1L
  • ING2
  • KAP1
  • KIAA1315
  • KIAA1438
  • LEM6
  • LUN
  • MAL
  • MBD1
  • MEL18
  • MKL1
  • MRTFA
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOR2
  • NIRF
  • NPM
  • NPM1
  • NRIP1
  • P300
  • PARK7
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PCM1
  • PGC1
  • PGC1A
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • RC1
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RIP25
  • RNF1
  • RNF107
  • RNF110
  • RNF2
  • RNF51
  • RNF96
  • SAFB
  • SAFB1
  • SIN3A
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SRC1
  • SRC2
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TIF1B
  • TIF2
  • TOPORS
  • TP53BPL
  • TRIM28
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • UHRF2
  • ZBRK1
  • ZNF131
  • ZNF144
  • ZNF350
Homo sapiens (human)
VLDL clearance
  • APOB
  • APOB48R
  • APOBR
  • APOC1
  • APOC4
  • ILDR3
  • LISCH
  • LSR
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
Catecholamine biosynthesis
  • AADC
  • DBH
  • DDC
  • PENT
  • PNMT
  • TH
  • TYH
Homo sapiens (human)
MyD88 deficiency (TLR2/4)
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
Defective SLC34A1 causes hypophosphatemic nephrolithiasis/osteoporosis 1 (NPHLOP1)
  • NPT2
  • SLC17A2
  • SLC34A1
Homo sapiens (human)
GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome
  • ADRM1
  • BTRC
  • BTRCP
  • C7orf76
  • CSNK1A1
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GLI3
  • GP110
  • GSK3B
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • PKACA
  • POH1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUFU
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Defective LARGE causes MDDGA6 and MDDGB6
  • B3GNT1
  • B3GNT6
  • B4GAT1
  • KIAA0609
  • LARGE
  • LARGE1
Homo sapiens (human)
Clearance of seratonin
  • HTT
  • SERT
  • SLC6A4
Homo sapiens (human)
Netrin mediated repulsion signals
  • DCC
  • IGDCC1
  • KIAA1777
  • KIAA1976
  • NTN1
  • NTN1L
  • P53RDL1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • SRC
  • SRC1
  • UNC5A
  • UNC5B
  • UNC5C
  • UNC5D
  • UNC5H1
  • UNC5H2
  • UNC5H3
  • UNC5H4
Homo sapiens (human)
MDK and PTN in ALK signaling
  • ALK
  • HBNF1
  • HTPZP2
  • MDK
  • MK1
  • NEGF1
  • NEGF2
  • PTN
  • PTPRZ
  • PTPRZ1
  • PTPRZ2
  • PTPZ
Homo sapiens (human)
Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome
  • ACTR1A
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • ALMS1
  • AZI1
  • BBS14
  • BITE
  • C14orf94
  • C15orf25
  • C18orf9
  • C4orf15
  • C9orf81
  • CALT
  • CCCAP
  • CCDC5
  • CCP110
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK5RAP2
  • CDKN1
  • CEN2
  • CENPJ
  • CEP1
  • CEP110
  • CEP131
  • CEP135
  • CEP152
  • CEP164
  • CEP192
  • CEP2
  • CEP215
  • CEP250
  • CEP27
  • CEP290
  • CEP4
  • CEP41
  • CEP43
  • CEP57
  • CEP63
  • CEP70
  • CEP72
  • CEP76
  • CEP78
  • CETN2
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CNAP1
  • CNTRL
  • CP110
  • CPAP
  • CSNK1D
  • CSNK1E
  • CTRN1
  • CXorf5
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN50
  • DGT6
  • DHC1
  • DLC1
  • DNCH1
  • DNCI2
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I2
  • DYNLL1
  • FAM29A
  • FGFR1OP
  • FOP
  • HAUS1
  • HAUS2
  • HAUS3
  • HAUS4
  • HAUS5
  • HAUS6
  • HAUS7
  • HAUS8
  • HCKID
  • HDLC1
  • HEIC
  • HICE1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA0092
  • KIAA0097
  • KIAA0325
  • KIAA0328
  • KIAA0373
  • KIAA0402
  • KIAA0419
  • KIAA0542
  • KIAA0622
  • KIAA0635
  • KIAA0803
  • KIAA0841
  • KIAA0912
  • KIAA0980
  • KIAA1052
  • KIAA1118
  • KIAA1519
  • KIAA1569
  • KIAA1574
  • KIAA1633
  • LAP
  • LIP1
  • LIS1
  • MAPRE1
  • MAST1
  • MDCR
  • MDS
  • NA14
  • NDE1
  • NEDD1
  • NEK2
  • NEK2A
  • NINL
  • NLK1
  • NLP
  • NPHP10
  • NPHP15
  • NPHP6
  • NUDE
  • ODF2
  • OFD1
  • P34CDC2
  • PAFAH1B1
  • PAFAHA
  • PCM1
  • PCNT
  • PCNT2
  • PKACA
  • PLK
  • PLK1
  • PLK4
  • PPP2R1A
  • PRKACA
  • PRKAR2B
  • SAK
  • SDCCAG8
  • SFI1
  • SSNA1
  • STK18
  • TSGA14
  • TSP57
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA3
  • TUBA4A
  • TUBB
  • TUBB2C
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBG
  • TUBG1
  • UCHL5IP
  • UIP1
  • YWHAE
  • YWHAG
Homo sapiens (human)
Insulin receptor signalling cascade
  • GRB10
  • GRBIR
  • HRAS
  • HRAS1
  • INS
  • INSR
  • KIAA0207
  • NRAS
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • ACIN1
  • ACINUS
  • APC
  • API1
  • BAP31
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • CPP32
  • DP2.5
  • DXS1357E
  • FAK
  • FAK1
  • FNTA
  • KIAA0670
  • MASK
  • MCH2
  • MCH3
  • MCH5
  • MIHB
  • MST3
  • MST4
  • PKCD
  • PRKCD
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PTK2
  • RNF48
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
  • STK26
  • STK3
Homo sapiens (human)
Transport of HA trimer, NA tetramer and M2 tetramer from the endoplasmic reticulum to the Golgi Apparatus
  • HA
  • M
  • NA
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024