GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Regulation by c-FLIP
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
GSK3B and BTRC:CUL1-mediated-degradation of NFE2L2
  • ADRM1
  • BTRC
  • BTRCP
  • C7orf76
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GP110
  • GSK3B
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NFE2L2
  • NRF2
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Synthesis of Hepoxilins (HX) and Trioxilins (TrX)
  • 12LO
  • ALOX12
  • LOG12
Homo sapiens (human)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
  • ABCA4
  • ABCR
  • ARSDR1
  • CRALBP
  • CRBP1
  • CYP4V2
  • DHRS9
  • E17KSR
  • EDH17B1
  • EDH17B2
  • EDHB17
  • HSD17B1
  • HSD17B6
  • HSD17B9
  • LRAT
  • MYO7A
  • OPN2
  • PALB
  • PRRDH
  • PSDR1
  • RBP1
  • RBP3
  • RBP4
  • RDH1
  • RDH10
  • RDH11
  • RDH12
  • RDH15
  • RDH16
  • RDH5
  • RDH8
  • RDHS
  • RHO
  • RLBP1
  • RODH
  • RODH4
  • RPE65
  • SDR16C4
  • SDR28C1
  • SDR28C2
  • SDR7C1
  • SDR7C2
  • SDR9C4
  • SDR9C5
  • SDR9C6
  • SDR9C7
  • SDR9C8
  • SDRO
  • STRA6
  • TTR
  • USH1B
Homo sapiens (human)
Defective ABCG5 causes sitosterolemia
  • ABCG5
  • ABCG8
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • AKR1C3
  • AKR1C4
  • AKR1D1
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CHDR
  • CYP12
  • CYP27
  • CYP27A1
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • CYP8B1
  • DDH
  • DDH1
  • DDH2
  • FXR
  • HRR1
  • HSD17B5
  • HSD3B7
  • KIAA0119
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • PGFS
  • RIP14
  • RXRA
  • SRC1
  • SRC2
  • SRD5B1
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1
  • ADRM1
  • ATM
  • C7orf76
  • COP1
  • DSS1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • P53
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RFWD2
  • RNF200
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
CASP8 activity is inhibited
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Nef mediated downregulation of MHC class I complex cell surface expression
  • ADTB1
  • ADTG
  • AP19
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • B2M
  • BAM22
  • CLAPB2
  • CLAPG1
  • CLAPS1
  • CLTNM
  • HLA-A
  • HLAA
  • KIAA1175
  • PACS1
  • nef
Homo sapiens (human)
G2/M DNA damage checkpoint
  • ABRA1
  • ABRAXAS1
  • AGS1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • BABAM1
  • BABAM2
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BLU
  • BRCA1
  • BRCC3
  • BRCC36
  • BRCC45
  • BRE
  • BRIP1
  • C12orf32
  • C16orf75
  • C19orf62
  • C6.1A
  • C9orf76
  • CCDC98
  • CDS1
  • CHEK1
  • CHEK2
  • CHK1
  • CHK2
  • CTIP
  • CXorf53
  • DNA2
  • DNA2L
  • EXO1
  • EXOI
  • FAM175A
  • FANCJ
  • FRP1
  • H2AFX
  • H2AX
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-4
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HERC2
  • HEX1
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2BE
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • HNGS1
  • HTATIP
  • HUS1
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0170
  • KIAA0259
  • KIAA0646
  • KIAA1090
  • MDC1
  • MERIT40
  • MMS2
  • MMSET
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBA1
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • NFBD1
  • NSD2
  • P53
  • P95
  • PIAS4
  • PIASG
  • R24L
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD53
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RAP80
  • RBBP8
  • REC1
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RHINO
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF168
  • RNF53
  • RNF8
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RXRIP110
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • TP53
  • TP53BP1
  • TRX5
  • TSH2B
  • UBE2N
  • UBE2V2
  • UEV2
  • UIMC1
  • WHSC1
  • WRN
Homo sapiens (human)
Interconversion of 2-oxoglutarate and 2-hydroxyglutarate
  • ADHFE1
  • C14orf160
  • D2HGD
  • D2HGDH
  • L2HGDH
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid transport
  • ARF1
  • BTS
  • CLN3
  • CPTP
  • ESYT1
  • ESYT2
  • ESYT3
  • FAM62A
  • FAM62B
  • FAM62C
  • FAPP2
  • GLTP
  • GLTPD1
  • KIAA0747
  • KIAA1228
  • MBC2
  • PLEKHA8
Homo sapiens (human)
Signaling by EGFR
  • AAMP
  • ADAM10
  • ADAM12
  • ADAM17
  • AREG
  • AREGB
  • BTC
  • C20orf129
  • C6orf143
  • CSVP
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • FAM83A
  • FAM83B
  • FAM83D
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • KUZ
  • LIG1
  • LRIG1
  • MADM
  • MLTN
  • SDGF
  • TACE
  • TGFA
  • TSGP
Homo sapiens (human)
NADPH regeneration
  • ACO1
  • IDH1
  • IREB1
  • PICD
Homo sapiens (human)
Defective ABCC9 causes CMD10, ATFB12 and Cantu syndrome
  • ABCC9
  • KCNJ11
  • SUR2
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1
  • ADRM1
  • AIK
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK1
  • AIRK2
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • ARK1
  • ARK2
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BTAK
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C7orf76
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • DSS1
  • E2EPF
  • EAP1
  • FBXL1
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IAK1
  • KIAA0107
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • PLK
  • PLK1
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PTTG
  • PTTG1
  • RB1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP2
  • STK1
  • STK12
  • STK15
  • STK5
  • STK6
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSG24
  • TUTR1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
RPIA deficiency: failed conversion of R5P to RU5P
  • RPI
  • RPIA
Homo sapiens (human)
Calnexin/calreticulin cycle
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • ERP57
  • ERP60
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GRP58
  • KIAA0088
  • PDIA3
  • PRKCSH
Homo sapiens (human)
GABA synthesis, release, reuptake and degradation
  • CLN4
  • CPLX1
  • DNAJC5
  • GAD
  • GAD1
  • GAD2
  • GAD65
  • GAD67
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • KIAA0340
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RIM1
  • RIMS1
  • SLC32A1
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • VAMP2
  • VGAT
  • VIAAT
Homo sapiens (human)
MECP2 regulates transcription factors
  • A2BP
  • A2BP1
  • FOX1
  • HRNBP1
  • MEF2C
  • NR1C3
  • PPARG
  • RBFOX1
Homo sapiens (human)
PTK6 Activates STAT3
  • APRF
  • BKS
  • BRK
  • CIS3
  • PTK6
  • SOCS3
  • SSI3
  • STAP2
  • STAT3
Homo sapiens (human)
IRAK2 mediated activation of TAK1 complex upon TLR7/8 or 9 stimulation
  • CD14
  • ESOP1
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • LY96
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MD2
  • PRVTIRB
  • RNF85
  • RPS27A
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF6
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Mitochondrial translation elongation
  • AIP
  • AKIP
  • AURKAIP1
  • BMRP
  • BRIP1
  • C10orf34
  • C11orf4
  • C15orf4
  • C20orf193
  • C21orf101
  • C21orf92
  • C2orf1
  • C3orf5
  • C6orf14
  • CHCHD1
  • DAP3
  • DS1
  • EFG
  • EFG1
  • ERAL1
  • GADD45GIP1
  • GFM
  • GFM1
  • HERA
  • ICT1
  • IMOGN38
  • KGD4
  • KIAA0104
  • KIAA0264
  • L23MRP
  • LIECG2
  • LIP2
  • MAAT1
  • MRL3
  • MRP63
  • MRP64
  • MRPL1
  • MRPL10
  • MRPL11
  • MRPL12
  • MRPL13
  • MRPL14
  • MRPL15
  • MRPL16
  • MRPL17
  • MRPL18
  • MRPL19
  • MRPL2
  • MRPL20
  • MRPL21
  • MRPL22
  • MRPL23
  • MRPL24
  • MRPL25
  • MRPL27
  • MRPL28
  • MRPL3
  • MRPL30
  • MRPL31
  • MRPL32
  • MRPL33
  • MRPL34
  • MRPL35
  • MRPL36
  • MRPL37
  • MRPL38
  • MRPL39
  • MRPL4
  • MRPL40
  • MRPL41
  • MRPL42
  • MRPL43
  • MRPL44
  • MRPL45
  • MRPL46
  • MRPL47
  • MRPL48
  • MRPL49
  • MRPL5
  • MRPL50
  • MRPL51
  • MRPL52
  • MRPL53
  • MRPL54
  • MRPL55
  • MRPL57
  • MRPL58
  • MRPL59
  • MRPL7
  • MRPL8
  • MRPL9
  • MRPS10
  • MRPS11
  • MRPS12
  • MRPS14
  • MRPS15
  • MRPS16
  • MRPS17
  • MRPS18A
  • MRPS18B
  • MRPS18C
  • MRPS2
  • MRPS21
  • MRPS22
  • MRPS23
  • MRPS24
  • MRPS25
  • MRPS26
  • MRPS27
  • MRPS28
  • MRPS29
  • MRPS30
  • MRPS31
  • MRPS32
  • MRPS33
  • MRPS34
  • MRPS35
  • MRPS36
  • MRPS37
  • MRPS38
  • MRPS39
  • MRPS5
  • MRPS6
  • MRPS7
  • MRPS9
  • NCM1
  • NLVCF
  • NOF1
  • OXA1L
  • PDCD9
  • PLINP1
  • PRG6
  • PTCD3
  • RPL23L
  • RPML12
  • RPML2
  • RPML25
  • RPML27
  • RPML28
  • RPML3
  • RPML31
  • RPML32
  • RPML5
  • RPML8
  • RPMS11
  • RPMS12
  • RPMS13
  • RPMS15
  • RPMS16
  • RPMS17
  • RPMS21
  • RPMS22
  • RPMS25
  • RPMS6
  • RPMS9
  • RPSM12
  • TSFM
  • TUFM
  • URIM
Homo sapiens (human)
Signaling by ALK fusions and activated point mutants
  • ALK
  • ALO17
  • APRF
  • ASH
  • ATIC
  • BCL11A
  • BCL2L3
  • BIRC6
  • C17orf27
  • C2orf2
  • C2orf44
  • CAP20
  • CARS
  • CARS1
  • CDKN1
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  • CLTC
  • CLTCL2
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  • EF1G
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  • FN
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  • NPM1
  • NUP358
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  • RANBP2L4
  • RNF213
  • RPS27A
  • RRBP1
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  • SAPK1A
  • SAPK1C
  • SDI1
  • SEC31A
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  • STAT3
  • STRN
  • TFG
  • TP53
  • TPM3
  • TPM4
  • TPR
  • TSE1
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCL
  • WAF1
  • WDCP
  • ZCYTO18
  • ZNF856
Homo sapiens (human)
Defective ABCA3 causes SMDP3
  • ABC3
  • ABCA3
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024