GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1101 - 1125 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • APOB
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • HMG1
  • HMGB1
  • ICERE1
  • KIAA0012
  • LBP
  • LY96
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TLR7
Homo sapiens (human)
XBP1(S) activates chaperone genes
  • 54TM
  • ACADVL
  • ADD1
  • ADDA
  • ARF1GAP
  • ARFGAP1
  • ATP6D
  • ATP6V0D1
  • C19orf10
  • CDA1
  • CFP1
  • CGBP
  • CHL1
  • CHLR1
  • CLN2
  • CTDSP2
  • CUL7
  • CXXC1
  • DCTN1
  • DDX11
  • DENTT
  • DNAJB11
  • DNAJB9
  • DNAJC3
  • EDEM
  • EDEM1
  • EDJ
  • ERD23
  • ERJ3
  • ERP5
  • EXTL
  • EXTL1
  • EXTL1L
  • EXTL2
  • EXTL3
  • EXTR1
  • EXTR2
  • FKBP14
  • FKBP22
  • GFAT
  • GFPT
  • GFPT1
  • GOSR2
  • GRP170
  • GS27
  • GSK3A
  • HDGF
  • HDJ9
  • HMG1L2
  • HRD1
  • HSPH4
  • HYIF1P
  • HYOU1
  • KDELR3
  • KIAA0076
  • KIAA0212
  • KIAA0218
  • KIAA0519
  • KIAA0905
  • KIAA1027
  • KIAA1810
  • KLHDC3
  • KRG2
  • LMN1
  • LMNA
  • MDG1
  • MIZ1
  • MYDGF
  • NIF2
  • ORP150
  • OS4
  • P5
  • P58IPK
  • PCCX1
  • PDIA5
  • PDIA6
  • PDIR
  • PEAS
  • PHF18
  • PLA2G4B
  • PPP2R5B
  • PREB
  • PRKRI
  • RAMP4
  • SCP2
  • SEC12
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • SERP1
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SRPR
  • SRPRA
  • SRPRB
  • SSR1
  • STM
  • SULT1A3
  • SYVN1
  • TATDN2
  • TLN
  • TLN1
  • TPP1
  • TRAPA
  • TSPX
  • TSPYL2
  • TXNDC7
  • VLCAD
  • VPATPD
  • WFS1
  • WIPI1
  • WIPI49
  • YIF1
  • YIF1A
  • ZBTB17
  • ZNF151
  • ZNF60
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1 activates/modulates innate immune responses
  • 1a
  • 3a
  • 3b
  • 6
  • 7a
  • 8b
  • 9b
  • AML1
  • ASC
  • BST2
  • C1orf7
  • CAP-1
  • CARD5
  • CASP1
  • CBFA2
  • CIAS1
  • COLEC7
  • CRAF1
  • CYP20
  • CYPA
  • CYPB
  • CYPH
  • DAK
  • DDX58
  • DSCR1L2
  • E
  • EFP
  • ERIS
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • IFIH1
  • IKBA
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IPS1
  • IRAK2
  • IRF3
  • ITCH
  • KIAA0151
  • KIAA0220
  • KIAA0719
  • KIAA1271
  • KPNA2
  • KPNB1
  • M
  • MAD3
  • MAVS
  • MDA5
  • MITA
  • N
  • NAK
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NLRP3
  • NMI
  • NPIPB3
  • NPIPL3
  • NTF97
  • PCBP2
  • PPIA
  • PPIB
  • PPIG
  • PPIH
  • PSPD
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RCAN3
  • RCH1
  • RELA
  • RH116
  • RIGI
  • RIP3
  • RIPK3
  • RNF147
  • RNF85
  • RPS27A
  • RUNX1
  • S
  • SFTP4
  • SFTPD
  • SIKE
  • SIKE1
  • SRP1
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TKFC
  • TLR7
  • TMEM173
  • TMS1
  • TOM70
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • TRAF3
  • TRAF6
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VISA
  • ZNF147
  • rep
  • sM
Homo sapiens (human)
Free fatty acid receptors
  • FFA2
  • FFAR1
  • FFAR2
  • FFAR3
  • FFAR4
  • GPCR43
  • GPR120
  • GPR129
  • GPR31
  • GPR40
  • GPR41
  • GPR43
  • O3FAR1
  • PGR4
Homo sapiens (human)
GSD IV
  • GBE1
  • GYG2
  • GYS2
Homo sapiens (human)
Translation of Accessory Proteins
  • 6
  • 7a
  • 8
  • 9b
Homo sapiens (human)
Release of apoptotic factors from the mitochondria
  • BAK
  • BAK1
  • BAX
  • BCL2L4
  • BCL2L7
  • CDN1
  • CYC
  • CYCS
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • DIABLO
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • ICERE1
  • SMAC
Homo sapiens (human)
Oxidative demethylation of DNA
  • CXXC6
  • KIAA0401
  • KIAA1546
  • KIAA1676
  • LCX
  • TDG
  • TET1
  • TET2
  • TET3
Homo sapiens (human)
HCMV Late Events
  • AAAS
  • ADRACALA
  • APNG
  • BC2
  • C13orf9
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C7orf14
  • C9orf28
  • CAIN
  • CAN
  • CEBPD
  • CFBP
  • CG1
  • CGI149
  • CHMP1
  • CHMP1A
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • CVC1
  • CVC2
  • D3S1231E
  • DBP
  • DERP9
  • EAP20
  • EAP30
  • EAP45
  • FAM125A
  • FAM125B
  • H2AC1
  • H2AC11
  • H2AC12
  • H2AC13
  • H2AC14
  • H2AC15
  • H2AC16
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFC
  • H2AFD
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFI
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFN
  • H2AFO
  • H2AFP
  • H2AFQ
  • H2AFR
  • H2AW
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC18
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFT
  • H2BU1
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HCRP1
  • HELI
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AA
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AG
  • HIST1H2AH
  • HIST1H2AI
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2AK
  • HIST1H2AL
  • HIST1H2AM
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AB
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H2BF
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2A
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • HNRNPK
  • HNRPK
  • IRS1
  • KIAA0023
  • KIAA0047
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MCP
  • MP44
  • MRNP41
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NDC1
  • NEC1
  • NEC2
  • NEDF
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • PCOLN3
  • PML39
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • PRSM1
  • RAE1
  • RANBP2
  • RIR1
  • RL11
  • RL8A
  • RL9A
  • SCP
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • SNF8
  • TMEM48
  • TPR
  • TRM1
  • TRM2
  • TRM3
  • TRS1
  • TRX1
  • TRX2
  • TSG101
  • TSH2B
  • UBAP1
  • UL102
  • UL103
  • UL104
  • UL111A
  • UL112/UL113
  • UL117
  • UL120
  • UL121
  • UL122
  • UL130
  • UL131A
  • UL132
  • UL14
  • UL144
  • UL146
  • UL147
  • UL147A
  • UL148
  • UL15A
  • UL18
  • UL2
  • UL22A
  • UL23
  • UL24
  • UL25
  • UL26
  • UL29
  • UL31
  • UL32
  • UL35
  • UL36
  • UL38
  • UL41A
  • UL43
  • UL44
  • UL45
  • UL47
  • UL48
  • UL52
  • UL54
  • UL57
  • UL69
  • UL7
  • UL70
  • UL71
  • UL73
  • UL74
  • UL75
  • UL76
  • UL79
  • UL80
  • UL82
  • UL83
  • UL84
  • UL86
  • UL87
  • UL88
  • UL9
  • UL91
  • UL92
  • UL94
  • UL95
  • UL96
  • UL97
  • UL99
  • US22
  • US23
  • US32
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS25
  • VPS28
  • VPS36
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • VPS4
  • VPS4A
  • WBSCR24
  • gB
  • gH
  • gL
  • gM
  • gN
Homo sapiens (human)
Deactivation of the beta-catenin transactivating complex
  • AKT1
  • AKT2
  • ALR
  • APC
  • API3
  • ARB1
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BCL9
  • BCL9L
  • BIRC4
  • BTRC
  • BTRCP
  • C22orf2
  • CBY
  • CBY1
  • CHD8
  • CRM1
  • CTBP
  • CTBP1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNNBIP1
  • DLNB11
  • DP2.5
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GRG4
  • HDAC1
  • HELSNF1
  • IAP3
  • ICAT
  • KIAA1261
  • KIAA1547
  • KIAA1564
  • KMT2D
  • LEF1
  • MEN1
  • MLL2
  • MLL4
  • PGEA1
  • PKB
  • PYGO1
  • PYGO2
  • RAC
  • RBBP5
  • RBQ3
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SCG2
  • SOX13
  • SOX17
  • SOX2
  • SOX3
  • SOX4
  • SOX6
  • SOX7
  • SOX9
  • SRY
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TDF
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XIAP
  • XPO1
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Regulation of MITF-M-dependent genes involved in pigmentation
  • ACTB
  • ACTL6A
  • AKT2
  • AP2TF
  • ARID1A
  • ARID1B
  • BAF155
  • BAF170
  • BAF190A
  • BAF190B
  • BAF250
  • BAF250A
  • BAF250B
  • BAF45B
  • BAF45C
  • BAF45D
  • BAF47
  • BAF53
  • BAF53A
  • BAF57
  • BAF60A
  • BAF60B
  • BAF60C
  • BCL7A
  • BCL7B
  • BCL7C
  • BHLHB11
  • BRG1
  • BRM
  • C1orf4
  • CAS2
  • CERD4
  • CREST
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • D12S53E
  • DAN15
  • DCT
  • DPF1
  • DPF2
  • DPF3
  • GPR143
  • INI1
  • INO80K
  • IRF4
  • KIAA0693
  • KIAA1235
  • KIAA1597
  • LEF1
  • MAPK14
  • MART1
  • MLANA
  • MLPH
  • MUM1
  • MXI2
  • MYH12
  • MYO5A
  • MYRIP
  • NEUD4
  • OA1
  • OSA1
  • OSA2
  • PMEL
  • PMEL17
  • RAB27
  • RAB27A
  • REQ
  • SAPK2A
  • SGA72M
  • SILV
  • SLAC2A
  • SLAC2C
  • SLP2
  • SLP2A
  • SMARCA2
  • SMARCA4
  • SMARCB1
  • SMARCC1
  • SMARCC2
  • SMARCD1
  • SMARCD2
  • SMARCD3
  • SMARCE1
  • SMARCF1
  • SNF2A
  • SNF2B
  • SNF2L2
  • SNF2L4
  • SNF5L1
  • SOX10
  • SS18
  • SS18L1
  • SSXT
  • SYT
  • SYTL2
  • TFAP2
  • TFAP2A
  • TYR
  • TYRP
  • TYRP1
  • TYRP2
  • TYRRP
  • UBID4
  • USF
  • USF1
Homo sapiens (human)
APOBEC3G mediated resistance to HIV-1 infection
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Termination
  • BN51
  • BN51T
  • CRCP
  • KIAA1439
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • NFI
  • NFIA
  • NFIB
  • NFIC
  • NFIX
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • SSB
Homo sapiens (human)
Negative regulation of TCF-dependent signaling by DVL-interacting proteins
  • CCDC88C
  • CXXC4
  • DAPLE
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • IDAX
  • KIAA0208
  • KIAA1509
Homo sapiens (human)
TLR3-mediated TICAM1-dependent programmed cell death
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
XAV939 stabilizes AXIN
  • PARP5A
  • PARP5B
  • PARPL
  • TANK2
  • TIN1
  • TINF1
  • TNKL
  • TNKS
  • TNKS1
  • TNKS2
Homo sapiens (human)
Complex IV assembly
  • C12orf62
  • C14orf112
  • C18orf55
  • C19orf79
  • C20orf24
  • C2orf64
  • C3orf68
  • C4orf52
  • C7orf44
  • CCDC44
  • CCDC56
  • CMC1
  • COA1
  • COA3
  • COA5
  • COI
  • COII
  • COIII
  • COQ10A
  • COQ10B
  • COX11
  • COX14
  • COX15
  • COX16
  • COX17
  • COX18
  • COX19
  • COX2
  • COX20
  • COX4
  • COX4I1
  • COX4I2
  • COX4L2
  • COX5A
  • COX5B
  • COX6A
  • COX6A1
  • COX6A2
  • COX6AH
  • COX6AL
  • COX6B
  • COX6B1
  • COX6B2
  • COX6C
  • COX7A1
  • COX7A2
  • COX7A2L
  • COX7AH
  • COX7AL
  • COX7AR
  • COX7B
  • COX7C
  • COX7RP
  • COX8
  • COX8A
  • COX8C
  • COX8L
  • COXI
  • COXII
  • COXIII
  • FAM36A
  • HIG1
  • HIGD1A
  • HIGD2A
  • MITRAC12
  • MITRAC15
  • MITRAC7
  • MT-CO1
  • MT-CO2
  • MT-CO3
  • MTCO1
  • MTCO2
  • MTCO3
  • NDUFA4
  • OPTI
  • OXA1L2
  • PET100
  • PET117
  • RAB5IF
  • RCAF1
  • SCO1
  • SCO2
  • SCOD1
  • SMIM20
  • SURF-1
  • SURF1
  • TACO1
  • TIM21
  • TIMM21
  • TMEM177
  • TMEM223
Homo sapiens (human)
NEIL3-mediated resolution of ICLs
  • NEIL3
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation of granulopoiesis
  • ALL1
  • AML1
  • APRF
  • BHLHA17
  • BHLHE39
  • BTEB2
  • CAP20
  • CBFA2
  • CBFB
  • CDK2
  • CDK4
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN2
  • CEBP
  • CEBPA
  • CEBPB
  • CEBPE
  • CIP1
  • CKLF
  • CSF3R
  • CXXC7
  • DEK
  • DP1
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  • E2F1
  • EP300
  • FLI1
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  • GFI1
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  • H2AFE
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  • H2AFO
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  • H2AFV
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  • H3.3A
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  • HRX
  • HTRX
  • IKLF
  • IL6R
  • KLF5
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  • LEF1
  • MDA6
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  • MLL1
  • MYB
  • MYC
  • NR1B1
  • NR2B1
  • P300
  • PIC1
  • RARA
  • RBBP3
  • RUNX1
  • RXRA
  • SCL
  • SDI1
  • SPI1
  • STAT3
  • TAL1
  • TCF5
  • TCL5
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TRX1
  • TSH2B
  • WAF1
  • ZNF163
Homo sapiens (human)
Peroxisomal lipid metabolism
  • ACBD4
  • ACBD5
  • HAO2
  • HAOX2
  • KIAA1996
  • NUDT19
  • NUDT7
Homo sapiens (human)
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCG
Homo sapiens (human)
NOSIP mediated eNOS trafficking
  • NOS3
  • NOSIP
Homo sapiens (human)
Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER
  • CHRAC17
  • DINB1
  • DPE2
  • KIAA0039
  • LIG1
  • LIG3
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLK
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XRCC1
Homo sapiens (human)
Defective gamma-carboxylation of F9
  • F9
  • GC
  • GGCX
Homo sapiens (human)
Regulation of cytoskeletal remodeling and cell spreading by IPP complex components
  • ACTN1
  • ARHGEF6
  • COOL2
  • KIAA0006
  • LIMS1
  • MXRA2
  • PARVA
  • PARVB
  • PINCH
  • PINCH1
  • PIXA
  • PXN
  • RSP1
  • RSU1
  • TESK1
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024