GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1126 - 1150 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Defective CSF2RB causes SMDP5
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • IL3RB
  • IL5RB
  • PSAP
  • PSPD
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
Homo sapiens (human)
Atorvastatin ADME
  • ABCB1
  • ABCC2
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • GNT1
  • LST1
  • LST2
  • MDR1
  • MRP2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • PGY1
  • PON
  • PON1
  • PON3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • UGT1
  • UGT1A3
Homo sapiens (human)
Defective BTD causes biotidinase deficiency
  • BTD
Homo sapiens (human)
Methylation
  • AHCY
  • AMS1
  • AMS2
  • AS3MT
  • C21orf127
  • COMT
  • CYP1A2
  • CYT19
  • GSTO1
  • GSTTLP28
  • HEMK2
  • KMT9
  • MAT1A
  • MAT2A
  • MAT2B
  • MATA1
  • MATA2
  • MTR
  • MTRR
  • N6AMT1
  • NNMT
  • PRED28
  • SAHH
  • TGR
  • TPMT
  • TRMT112
Homo sapiens (human)
Defective F8 binding to the cell membrane
  • F8
  • F8C
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A14GALT
  • A4GALT
  • A4GALT1
  • B3GALNT1
  • B3GALT3
  • B3GALT4
  • B3GNT5
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • CGT
  • CST
  • FUT1
  • FUT2
  • GAL3ST1
  • GALGT
  • GALT4
  • H
  • HSC
  • KIAA1646
  • SEC2
  • SIAT2
  • SIAT4B
  • SIAT6
  • SIAT7E
  • SIAT7F
  • SIAT8E
  • SIAT9
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT4
  • UGT8
Homo sapiens (human)
Regulation of Apoptosis
  • KIAA0567
  • MPRP1
  • OMA1
  • OPA1
Homo sapiens (human)
Type I hemidesmosome assembly
  • BP180
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • BPAG2
  • CD151
  • COL17A1
  • DMH
  • DST
  • DT
  • ITGA6
  • ITGB4
  • KIAA0728
  • LAMA3
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC2
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • PLEC
  • PLEC1
  • TSPAN24
Homo sapiens (human)
Vpu mediated degradation of CD4
  • ADRM1
  • BTRC
  • BTRCP
  • C7orf76
  • CD4
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
  • vpu
Homo sapiens (human)
Maturation of TCA enzymes and regulation of TCA cycle
  • ACAT
  • ACAT1
  • ACN9
  • ACO2
  • C11orf79
  • C6orf149
  • C6orf57
  • CS
  • CSKMT
  • CYB560
  • FRDA
  • FXN
  • HBLD1
  • HBLD2
  • IDH2
  • ISCA1
  • ISCA2
  • ISD11
  • LYRM4
  • LYRM8
  • MAT
  • METTL12
  • PGL2
  • SDH
  • SDH1
  • SDH2
  • SDH3
  • SDH4
  • SDH5
  • SDHA
  • SDHAF1
  • SDHAF2
  • SDHAF3
  • SDHAF4
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SDHF
  • SIR2L3
  • SIRT3
  • X25
Homo sapiens (human)
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling
  • APG12
  • APG12L
  • APG5L
  • ASP
  • ATG12
  • ATG5
  • CAP-1
  • CEB1
  • CEBP1
  • CRAF1
  • CYLD
  • CYLD1
  • DDX58
  • EFP
  • G1P2
  • HERC5
  • HIP2
  • IFIH1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • ISG15
  • ITCH
  • KIAA0151
  • KIAA0849
  • KIAA1271
  • LIG
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • NLRC5
  • NLRX1
  • NOD27
  • NOD4
  • NOD5
  • NOD9
  • OTUD5
  • OTUD7C
  • PCBP2
  • PIN1
  • PUBC1
  • RH116
  • RIGI
  • RNF125
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF216
  • RNF87
  • RPS27A
  • SFT
  • T6BP
  • TAX1BP1
  • TBK1
  • TNFAIP3
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIAD3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • UBA52
  • UBA7
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCE7IP1
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBCH8
  • UBE1L
  • UBE2
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2K
  • UBE2L6
  • UCRP
  • VISA
  • ZIN
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
RET signaling
  • ARTN
  • BMK1
  • C20orf180
  • CDHF12
  • CDHR16
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK5L
  • DOK6
  • ENIGMA
  • ERK5
  • EVN
  • FRS2
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GDNFRA
  • GDNFRB
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB1
  • GRB10
  • GRB7
  • GRBIR
  • IRS2
  • KIAA0207
  • KIAA0474
  • KIAA0571
  • KIAA1650
  • MAPK7
  • NRTN
  • NSHC
  • PDLIM7
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKACA
  • PKCA
  • PLC1
  • PLCG1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKCA
  • PRKM7
  • PROSAP2
  • PSAP2
  • PSPN
  • PTC
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAP1GA1
  • RAP1GAP
  • RET
  • RETL1
  • RETL2
  • SHANK3
  • SHC
  • SHC1
  • SHC3
  • SHCA
  • SHCC
  • SHPTP2
  • SOS1
  • TRNR1
  • TRNR2
Homo sapiens (human)
PTK6 Regulates Proteins Involved in RNA Processing
  • BRK
  • KHDRBS1
  • KHDRBS2
  • KHDRBS3
  • PSF
  • PTK6
  • SALP
  • SAM68
  • SFPQ
  • SLM1
  • SLM2
Homo sapiens (human)
G2/M DNA replication checkpoint
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • MYT1
  • P34CDC2
  • PKMYT1
  • WEE1
Homo sapiens (human)
RHOC GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARH12
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHC
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP18
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGAP7
  • ARHGDIA
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF17
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF40
  • ARHGEF5
  • BCR
  • BCR1
  • BND7
  • BRX
  • C1QBP
  • CAV
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CCDC187
  • CDC42GAP
  • CIT
  • CRIK
  • CTNNG
  • D22S11
  • DAAM1
  • DBL
  • DEPDC1B
  • DIAP1
  • DIAP3
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DLC2
  • DP3
  • EPB72
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • ERGIC53
  • ESA1
  • F5F8D
  • FHOD2
  • FHOD3
  • FLOT1
  • FLOT2
  • FMNL2
  • FMNL3
  • FRL2
  • GC1QBP
  • GDIA1
  • GEFT
  • GRAF
  • GRB1
  • GRF1
  • GRINCHGEF
  • GRIT
  • GRLF1
  • GT650
  • HABP1
  • HT31
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • JUP
  • KIAA0051
  • KIAA0204
  • KIAA0294
  • KIAA0337
  • KIAA0362
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0619
  • KIAA0621
  • KIAA0666
  • KIAA0712
  • KIAA0949
  • KIAA1225
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1478
  • KIAA1626
  • KIAA1688
  • KIAA1722
  • KIAA1723
  • KIAA1902
  • KIAA1996
  • KIAA1998
  • KIAA2014
  • LAP2
  • LARG
  • LBC
  • LBR
  • LMAN1
  • LOK
  • M17S1
  • MACO1
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MGCRACGAP
  • MUC18
  • MYO9B
  • MYR5
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • OST
  • P190A
  • PAK1
  • PIK3R1
  • PKN
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PKNBETA
  • PMP70
  • PREX1
  • PRK1
  • PRK2
  • PRKCL1
  • PRKCL2
  • PTRF
  • PXMP1
  • RACGAP1
  • RGNEF
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RICS
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • RTKN1
  • SF2P32
  • SLK
  • SOLO
  • STARD12
  • STARD13
  • STB2
  • STK10
  • STK2
  • STK21
  • STOM
  • STX5
  • STX5A
  • SYB3
  • TEM4
  • TFRC
  • TIM
  • TJP2
  • TMEM57
  • TMPO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV2
  • WBP3
  • X104
  • XTP8
  • ZO2
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Defective SLC24A1 causes congenital stationary night blindness 1D (CSNB1D)
  • KIAA0702
  • NCKX1
  • SLC24A1
Homo sapiens (human)
Defective AVP does not bind AVPR1A,B and causes neurohypophyseal diabetes insipidus (NDI)
  • ARVP
  • AVP
  • AVPR1
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • AVPR3
  • VP
  • VPR3
Homo sapiens (human)
SHC-mediated cascade:FGFR3
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • KS3
  • NRAS
  • SOS1
Homo sapiens (human)
MAPK3 (ERK1) activation
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ERK1
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAP2K1
  • MAPK3
  • MEK1
  • P34CDC2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Cytoprotection by HMOX1
  • ABCC1
  • AIB3
  • ALB
  • APRF
  • ARC205
  • BAF60C
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BKS
  • BLVR
  • BLVRA
  • BLVRB
  • BRK
  • BVR
  • C1orf7
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CIAS1
  • COI
  • COII
  • COIII
  • COX2
  • COX4
  • COX4I1
  • COX4I2
  • COX4L2
  • COX5A
  • COX5B
  • COX6A
  • COX6A1
  • COX6A2
  • COX6AH
  • COX6AL
  • COX6B
  • COX6B1
  • COX6B2
  • COX6C
  • COX7A1
  • COX7A2
  • COX7A2L
  • COX7AH
  • COX7AL
  • COX7AR
  • COX7B
  • COX7C
  • COX7RP
  • COX8
  • COX8A
  • COX8C
  • COX8L
  • COXI
  • COXII
  • COXIII
  • CREBBP
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CTG26
  • CYC
  • CYCS
  • DRIP205
  • DRIP230
  • FABP1
  • FABPL
  • FLR
  • HBA1
  • HBA2
  • HBB
  • HCA137
  • HDAC3
  • HELZ2
  • HIGD1C
  • HMOX1
  • HMOX2
  • HO
  • HO1
  • HO2
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA1047
  • KIAA1769
  • KISH2
  • MED1
  • MRP
  • MRP1
  • MT-CO1
  • MT-CO2
  • MT-CO3
  • MTCO1
  • MTCO2
  • MTCO3
  • NALP3
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NDUFA4
  • NLRP3
  • NR1C1
  • NR2B1
  • PBP
  • PIMT
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • PTK6
  • PYPAF1
  • RAP250
  • RB18A
  • RXRA
  • SCAN
  • SIN3A
  • SMARCD3
  • SRC1
  • SRC2
  • STAP2
  • STAT3
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • TIF2
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
  • TXNIP
  • UBIE
  • UBIE2
  • VDUP1
Homo sapiens (human)
Defective DPAGT1 causes CDG-1j, CMSTA2
  • DPAGT1
  • DPAGT2
Homo sapiens (human)
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF)
  • ARA24
  • BHLHD2
  • INSIG1
  • INSIG2
  • KIAA0079
  • KIAA0091
  • KIAA0199
  • KIAA0755
  • KPNB1
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • NTF97
  • RAN
  • S1P
  • S2P
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SCAP
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SKI1
  • SREBF2
  • SREBP2
Homo sapiens (human)
Negative regulation of the PI3K/AKT network
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • C20orf97
  • CTMP
  • KIAA0606
  • KIAA0931
  • MMAC1
  • NIPK
  • PHLPP
  • PHLPP1
  • PHLPP2
  • PHLPPL
  • PKB
  • PKBG
  • PLEKHE1
  • PTEN
  • RAC
  • SCOP
  • SKIP3
  • TEP1
  • THEM4
  • TRB3
  • TRIB3
Homo sapiens (human)
G alpha (12/13) signalling events
  • ABR
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1C
  • ADRA1D
  • AGMX1
  • AKAP13
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • ARHDH9
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF26
  • ARHGEF3
  • ARHGEF33
  • ARHGEF35
  • ARHGEF37
  • ARHGEF38
  • ARHGEF39
  • ARHGEF4
  • ARHGEF40
  • ARHGEF5
  • ARHGEF5L
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF8
  • ARHGEF9
  • ATK
  • BPK
  • BRX
  • BTK
  • C9orf100
  • COOL1
  • COOL2
  • DBL
  • DUET
  • DUO
  • ECT2
  • EPHEXIN4
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FGDY
  • FRABP
  • GNA12
  • GNA13
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GRF2
  • GRINCHGEF
  • HAPIP
  • HT31
  • ITSN
  • ITSN1
  • KALRN
  • KIAA0006
  • KIAA0142
  • KIAA0294
  • KIAA0337
  • KIAA0362
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0407
  • KIAA0424
  • KIAA0521
  • KIAA0619
  • KIAA0651
  • KIAA0720
  • KIAA0915
  • KIAA1112
  • KIAA1415
  • KIAA1556
  • KIAA1626
  • KIAA1639
  • KIAA2016
  • LARG
  • LBC
  • LFP40
  • MCF2
  • MCF2L
  • NBR
  • NET1
  • NGEF
  • OBSCN
  • OST
  • P85SPR
  • PAK3BP
  • PIXA
  • PIXB
  • PLEKHG2
  • PLEKHG5
  • PLXN5
  • PLXNB1
  • PREX1
  • RASGRF2
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SEP
  • SGEF
  • SH3D1A
  • SOLO
  • SOS1
  • SOS2
  • STEF
  • TBXA2R
  • TEM4
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TIM
  • TRAD
  • TRIO
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • ZFYVE3
  • ZFYVE4
  • ZFYVE5
  • ZFYVE6
Homo sapiens (human)
The activation of arylsulfatases
  • ARSA
  • ARSB
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Last updated: December 9, 2024