GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1701 - 1725 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Synthesis of PIPs at the Golgi membrane
  • ARF1
  • ARF3
  • FIG4
  • INPP5E
  • KIAA0274
  • KIAA0851
  • KIAA0981
  • OCRL
  • OCRL1
  • PI4K2A
  • PI4K2B
  • PI4KA
  • PI4KB
  • PIK3C2A
  • PIK3C2G
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIK4
  • PIK4CA
  • PIK4CB
  • PIKFYVE
  • PIP5K3
  • SAC1
  • SAC3
  • SACM1L
  • TAX1BP2
  • TPIP
  • TPTE
  • TPTE2
  • TRX
  • VAC14
  • VPS15
  • VPS34
Homo sapiens (human)
Membrane binding and targetting of GAG proteins
  • C9orf28
  • CFBP
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HCRP1
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NMT2
  • PML39
  • RPS27A
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • WBSCR24
  • gag
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A7 causes lysinuric protein intolerance (LPI)
  • MDU1
  • SLC3A2
  • SLC7A7
Homo sapiens (human)
PERK regulates gene expression
  • ATF4
  • CREB2
  • EIF2A
  • EIF2AK3
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • GRP78
  • HSPA5
  • PEK
  • PERK
  • TXREB
Homo sapiens (human)
Defective CD320 causes MMATC
  • 8D6A
  • CD320
  • TC2
  • TCN2
Homo sapiens (human)
Retrograde neurotrophin signalling
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CNSA2
  • DNAL4
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A19 causes Hartnup disorder (HND)
  • B0AT1
  • SLC6A19
Homo sapiens (human)
TNFR1-induced proapoptotic signaling
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CASP8
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • FADD
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • KIAA0151
  • KIAA0757
  • KIAA0849
  • MCH5
  • MIB2
  • MIHB
  • MIHC
  • MORT1
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • OTDC1
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • PD1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF54
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SKD
  • SPATA2
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBCE7IP3
  • UBP41
  • UL36
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
  • ZZANK1
Homo sapiens (human)
Regulation of localization of FOXO transcription factors
  • AFX
  • AFX1
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • FOXO6
  • HME1
  • MLLT7
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • SFN
  • YWHAB
  • YWHAG
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ANPEP
  • APN
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CAPER
  • CD13
  • CES1
  • CES2
  • CGL2
  • CMA1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CPSD
  • CTSD
  • CTSG
  • CTSGL2
  • CTSZ
  • CYH
  • CYM
  • DCP
  • DCP1
  • ELDF10
  • ENPEP
  • EPN
  • GZMH
  • MME
  • PCPB
  • PEPN
  • REN
  • SERPINA8
  • SES1
Homo sapiens (human)
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production
  • ABL
  • ABL1
  • AK3
  • AK3L1
  • AK6
  • AKAP1
  • AKAP10
  • AKAP149
  • AKL3L
  • AOF2
  • APS
  • BHC80
  • BRAF35
  • C20orf150
  • CABLES
  • CABLES1
  • CABLES2
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZB
  • CARMIL
  • CARMIL1
  • CBX5
  • CDC42
  • CDK2
  • CDK5
  • CDKN2
  • CDKN5
  • CPRP1
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DOCK5
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • EHD1
  • EHD2
  • EHD3
  • ERYF1
  • FOG1
  • FOG2
  • GATA1
  • GATA2
  • GATA3
  • GATA4
  • GATA5
  • GATA6
  • GF1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • HBB
  • HBD
  • HBE
  • HBE1
  • HBG1
  • HBG2
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HMG20B
  • HMGX2
  • HMGXB2
  • HP1A
  • IFB
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNB
  • IFNB1
  • IRF1
  • IRF2
  • ITPK1
  • JAK2
  • JHDM2C
  • JMJD1C
  • JTK7
  • KDM1
  • KDM1A
  • KIAA0071
  • KIAA0209
  • KIAA0214
  • KIAA0299
  • KIAA0601
  • KIAA0694
  • KIAA0716
  • KIAA1058
  • KIAA1299
  • KIAA1380
  • KIAA1395
  • KIAA1696
  • KIAA1771
  • LNK
  • LRRC16
  • LRRC16A
  • LSD1
  • MAFF
  • MAFG
  • MAFK
  • MFN1
  • MFN2
  • MICAL
  • MICAL1
  • MOCA
  • MYB
  • NFE2
  • NICAL
  • P53
  • PAST
  • PAST1
  • PAST2
  • PAST3
  • PHF21A
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKA1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PSSALRE
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAC1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RBSN
  • RCOR
  • RCOR1
  • REC2
  • RPD3L1
  • SH2B
  • SH2B1
  • SH2B2
  • SH2B3
  • SIN3A
  • SMARCE1R
  • TC25
  • TP53
  • TRIP8
  • TSE1
  • VPS45
  • VPS45A
  • VPS45B
  • WEE1
  • ZFN89A
  • ZFPM1
  • ZFPM2
  • ZFYVE20
  • ZIZ1
  • ZIZ2
  • ZIZ3
  • ZNF89B
Homo sapiens (human)
Defective CHST14 causes EDS, musculocontractural type
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CHST14
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • D4ST1
  • DCN
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • 9804
  • ALPG
  • ALPI
  • ALPL
  • ALPPL
  • ALPPL2
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • C11orf34
  • C4.4A
  • C6orf23
  • C6orf24
  • CD109
  • CD16B
  • CD52
  • CDW52
  • CEA
  • CEACAM5
  • CEACAM7
  • CGM2
  • CNTN3
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CO16
  • CPAMD7
  • CPM
  • DO
  • DOK1
  • DPL
  • E48
  • ESP1
  • FCG3
  • FCGR3
  • FCGR3B
  • FOLR2
  • FOLR4
  • G6C
  • G6D
  • GP2
  • GPIHBP1
  • GPLD1
  • HBP1
  • HE5
  • IGFR3
  • IGLON1
  • IGLON2
  • IGLON3
  • IGLON4
  • IZUMO1R
  • JUNO
  • KIAA0976
  • KIAA1496
  • KIAA1857
  • LAMP
  • LMNT1
  • LMNT2
  • LSAMP
  • LY6D
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6G6D
  • LY6H
  • LY6K
  • LYPD1
  • LYPD2
  • LYPD3
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD6B
  • LYPD8
  • LYPDC1
  • LYPDC2
  • Lynx2
  • MAMDC1
  • MAMDC3
  • MAP97
  • MDGA1
  • MDGA2
  • MEGT1
  • MELTF
  • MFI2
  • MPF
  • MSLN
  • N2DL2
  • NEGR1
  • NG24
  • NG25
  • NGRH1
  • NGRH2
  • NGRL2
  • NGRL3
  • NRN
  • NRN1
  • NRN1L
  • NT
  • NTM
  • NTNG1
  • NTNG2
  • OBCAM
  • OPCML
  • OTOA
  • PANG
  • PIGPLD1
  • PLET1
  • PRND
  • PRSS21
  • PRSS41
  • PSCA
  • RAET1G
  • RAET1H
  • RAET1L
  • RECK
  • RIGE
  • RTN4RL1
  • RTN4RL2
  • SAMP14
  • SCA2
  • SGRG
  • SHO
  • SPACA4
  • SPRN
  • ST15
  • TECTA
  • TECTB
  • TESSP1
  • TEST1
  • TEX101
  • THY1
  • TMART
  • TSA1
  • ULBP2
  • ULBP5
  • ULBP6
  • VNN1
  • VNN2
  • XPNPEP2
Homo sapiens (human)
NCAM1 interactions
  • AGRIN
  • AGRN
  • ALTPRP
  • ARTN
  • AXT
  • CACH1
  • CACH2
  • CACH3
  • CACN1
  • CACN2
  • CACN4
  • CACNA1C
  • CACNA1D
  • CACNA1G
  • CACNA1H
  • CACNA1I
  • CACNA1S
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNB3
  • CACNB4
  • CACNL1A1
  • CACNL1A2
  • CACNL1A3
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CACNLB3
  • CACNLB4
  • CCHL1A1
  • CCHL1A2
  • CNTN2
  • COL29A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • CSPG3
  • EVN
  • GDNF
  • GDNFRA
  • GDNFRB
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA4
  • KIAA1120
  • KIAA1123
  • MYSB
  • NCAM
  • NCAM1
  • NCAN
  • NEUR
  • NRTN
  • PRIP
  • PRNP
  • PRP
  • PSPN
  • PST
  • PST1
  • RETL1
  • RETL2
  • SIAT8B
  • SIAT8D
  • ST8SIA2
  • ST8SIA4
  • STX
  • TAG1
  • TAX1
  • TRNR1
  • TRNR2
  • VWA4
Homo sapiens (human)
Defective GALNT12 causes CRCS1
  • C6orf205
  • CA125
  • DRCC1
  • GALNT12
  • KIAA1359
  • MG2
  • MUC1
  • MUC11
  • MUC12
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC16
  • MUC17
  • MUC19
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC21
  • MUC3
  • MUC3A
  • MUC3B
  • MUC4
  • MUC5
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
  • MUC7
  • MUCL1
  • PUM
  • RECC
  • SBEM
  • SMUC
Homo sapiens (human)
Beta-ketothiolase deficiency
  • ACAT
  • ACAT1
  • MAT
Homo sapiens (human)
Regulation of IFNG signaling
  • CIS3
  • DDXBP1
  • HCP
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • IFNGT1
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • PIAS1
  • PTP1B
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN1
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHPTP2
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SSI1
  • SSI3
  • SUMO1
  • TIP3
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha)
  • COCA2
  • EXO1
  • EXOI
  • GTBP
  • HEX1
  • KIAA0039
  • LIG1
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH6
  • PCNA
  • PMS2
  • PMSL2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
Homo sapiens (human)
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism
  • ATA1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLNS
  • GLT1
  • GLUL
  • NAT2
  • SAT1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC38A1
  • SNAT1
Homo sapiens (human)
Inhibition of replication initiation of damaged DNA by RB1/E2F1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R3B
  • PPP2R3L
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • RB1
  • RBBP3
  • TFDP1
  • TFDP2
Homo sapiens (human)
Defective MAOA causes BRUNS
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Defective RIPK1-mediated regulated necrosis
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
Homo sapiens (human)
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production
  • CBP
  • CREBBP
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • EP300
  • GCF2
  • IRF3
  • LRRFIP1
  • P300
  • TRIP
Homo sapiens (human)
Defective SLC17A8 causes autosomal dominant deafness 25 (DFNA25)
  • SLC17A8
  • VGLUT3
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of lauroyl-CoA to decanoyl-CoA-CoA
  • ACADL
  • ECHS1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADHA
  • HADHB
  • HADHSC
  • SCHAD
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024