GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1751 - 1775 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
STAT5 Activation
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • GAB2
  • KIAA0571
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STK1
Homo sapiens (human)
Defective DPM2 causes CDG-1u
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
Ligand-dependent caspase activation
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD14
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • ESOP1
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • LY96
  • MC159L
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • ORF71
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAM
  • TRAP3
  • TRICK2
  • TRIF
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
tRNA processing in the nucleus
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARA24
  • ARCH
  • C14orf166
  • C1orf19
  • C22orf28
  • C2orf49
  • C6orf135
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CAT60
  • CG1
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF160
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CSTF2
  • D3S1231E
  • DDX1
  • ELAC2
  • FAM98B
  • HEAB
  • HPC2
  • KIAA0023
  • KIAA0061
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • LENG5
  • MP44
  • MRNP41
  • NAR
  • NDC1
  • NEB1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • POP1
  • POP4
  • POP5
  • POP7
  • RAE1
  • RAN
  • RANBP2
  • RNASEP1
  • RNASEP2
  • RPP14
  • RPP20
  • RPP21
  • RPP25
  • RPP29
  • RPP30
  • RPP38
  • RPP40
  • RTCB
  • RTRAF
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEN15
  • SEN2
  • SEN34
  • SEN54
  • TMEM48
  • TPR
  • TRNT1
  • TSEN15
  • TSEN2
  • TSEN34
  • TSEN54
  • XPOT
  • ZBTB8OS
Homo sapiens (human)
TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CHUK
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • EBI6
  • FIP2
  • FIP3
  • GLC1E
  • GNB2L1
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0733
  • KIAA0757
  • KIAA0849
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • NRP
  • OPTN
  • OTDC1
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • PD1
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF54
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SPATA2
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBCE7IP3
  • UBP41
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
Homo sapiens (human)
RHOBTB2 GTPase cycle
  • 99D8.1
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • BAT1
  • CCT2
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT7
  • CCTB
  • CCTH
  • CCTZ
  • CDC37
  • CDC37A
  • CUL3
  • D0S117E
  • DBC2
  • DBN1
  • DCAF14
  • DDX39B
  • HNRNPC
  • HNRPC
  • HNRPG
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0389
  • KIAA0617
  • KIAA0717
  • MSI2
  • MYO6
  • NDR1
  • NIP7-1
  • PHIP
  • PTK9
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RHOBTB2
  • SFRS10
  • SRM160
  • SRRM1
  • STK38
  • TMOD3
  • TRA2B
  • TRP32
  • TWF1
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UAP56
  • WDR11
Homo sapiens (human)
DAG and IP3 signaling
  • AHCYL1
  • DCAL
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • PKCD
  • PKCE
  • PLC1
  • PLCG1
  • PRKCD
  • PRKCE
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
Fatty Acids bound to GPR40 (FFAR1) regulate insulin secretion
  • FFAR1
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GPR40
  • KIAA0581
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol
  • ABCB11
  • ACOT8
  • ACOX2
  • ACSB
  • ACSVL1
  • ACSVL6
  • ACTEIII
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • AKR1C3
  • AKR1C4
  • AKR1D1
  • AMACR
  • BAAT
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BSEP
  • CHDR
  • CYP12
  • CYP27
  • CYP27A1
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • CYP8B1
  • DDH
  • DDH1
  • DDH2
  • EDH17B4
  • FACVL1
  • FACVL3
  • FATP2
  • FATP5
  • FXR
  • HRR1
  • HSD17B4
  • HSD17B5
  • HSD3B7
  • KIAA0119
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • PGFS
  • PTE1
  • RIP14
  • RXRA
  • SDR8C1
  • SLC27A2
  • SLC27A5
  • SRC1
  • SRC2
  • SRD5B1
  • TIF2
  • VLACS
Homo sapiens (human)
Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation
  • ACAA2
  • ACAD10
  • ACAD11
  • ACBD6
  • ACBD7
  • ACOT1
  • ACOT11
  • ACOT12
  • ACOT13
  • ACOT15
  • ACOT2
  • ACOT7
  • ACOT7L
  • ACOT9
  • ACSF2
  • BACH
  • BACHL
  • BFIT
  • CACH
  • CACH1
  • CTE1
  • CTMP
  • DBI
  • KIAA0707
  • MCAT
  • MT
  • NDUFAB1
  • PCTP
  • PTE2
  • PTE2A
  • STARD15
  • STARD2
  • THEA
  • THEM2
  • THEM4
  • THEM5
Homo sapiens (human)
Uptake and function of diphtheria toxin
  • CD9
  • DTR
  • DTS
  • EEF2
  • EF2
  • GRIM12
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KDRF
  • MIC3
  • TSPAN29
  • TXNRD1
Homo sapiens (human)
Trafficking of AMPA receptors
  • AKAP5
  • AKAP79
  • CACNG2
  • CACNG3
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG8
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • DLG1
  • DLG4
  • EPB41L1
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GLUR3
  • GLUR4
  • GLURC
  • GRIA1
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GluA3
  • GluA4
  • KIAA0338
  • KIAA0389
  • KIAA0968
  • MDM2
  • MYO6
  • PSD95
Homo sapiens (human)
Regulation of TBK1, IKKε-mediated activation of IRF3, IRF7 upon TLR3 ligation
  • CAP-1
  • CRAF1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Defective translocation of RB1 mutants to the nucleus
  • RB1
Homo sapiens (human)
PI3K events in ERBB4 signaling
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EREG
  • GGF
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGL
  • HRGA
  • NDF
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • SMDF
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Synthesis of PIPs at the Golgi membrane
  • ARF1
  • ARF3
  • FIG4
  • INPP5E
  • KIAA0274
  • KIAA0851
  • KIAA0981
  • OCRL
  • OCRL1
  • PI4K2A
  • PI4K2B
  • PI4KA
  • PI4KB
  • PIK3C2A
  • PIK3C2G
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIK4
  • PIK4CA
  • PIK4CB
  • PIKFYVE
  • PIP5K3
  • SAC1
  • SAC3
  • SACM1L
  • TAX1BP2
  • TPIP
  • TPTE
  • TPTE2
  • TRX
  • VAC14
  • VPS15
  • VPS34
Homo sapiens (human)
Membrane binding and targetting of GAG proteins
  • C9orf28
  • CFBP
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HCRP1
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NMT2
  • PML39
  • RPS27A
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • WBSCR24
  • gag
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A7 causes lysinuric protein intolerance (LPI)
  • MDU1
  • SLC3A2
  • SLC7A7
Homo sapiens (human)
PERK regulates gene expression
  • ATF4
  • CREB2
  • EIF2A
  • EIF2AK3
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • GRP78
  • HSPA5
  • PEK
  • PERK
  • TXREB
Homo sapiens (human)
Defective CD320 causes MMATC
  • 8D6A
  • CD320
  • TC2
  • TCN2
Homo sapiens (human)
Retrograde neurotrophin signalling
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CNSA2
  • DNAL4
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A19 causes Hartnup disorder (HND)
  • B0AT1
  • SLC6A19
Homo sapiens (human)
TNFR1-induced proapoptotic signaling
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CASP8
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • FADD
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • KIAA0151
  • KIAA0757
  • KIAA0849
  • MCH5
  • MIB2
  • MIHB
  • MIHC
  • MORT1
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • OTDC1
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • PD1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF54
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SKD
  • SPATA2
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBCE7IP3
  • UBP41
  • UL36
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
  • ZZANK1
Homo sapiens (human)
Regulation of localization of FOXO transcription factors
  • AFX
  • AFX1
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • FOXO6
  • HME1
  • MLLT7
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • SFN
  • YWHAB
  • YWHAG
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024