GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 2074 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
2-LTR circle formation
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • G22P1
  • G22P2
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • LIG4
  • PSIP1
  • PSIP2
  • XRCC4
  • XRCC5
  • XRCC6
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
3-Methylcrotonyl-CoA carboxylase deficiency
  • MCCA
  • MCCB
  • MCCC1
  • MCCC2
Homo sapiens (human)
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • AGRIN
  • AGRN
  • B3GALT6
  • B3GAT1
  • B3GAT2
  • B3GAT3
  • B4GALT7
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • GLCATP
  • GLCATS
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • KIAA1963
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
  • XGALT1
  • XT1
  • XT2
  • XYLT1
  • XYLT2
Homo sapiens (human)
ABC transporters in lipid homeostasis
  • ABC12
  • ABC2
  • ABC3
  • ABC8
  • ABCA10
  • ABCA12
  • ABCA2
  • ABCA3
  • ABCA5
  • ABCA6
  • ABCA7
  • ABCA9
  • ABCD1
  • ABCD2
  • ABCD3
  • ABCG1
  • ABCG4
  • ABCG5
  • ABCG8
  • ALD
  • ALD1
  • ALDL1
  • ALDR
  • ALDRP
  • APOA1
  • HK33
  • KIAA1062
  • KIAA1888
  • PEX19
  • PEX3
  • PMP70
  • PXF
  • PXMP1
  • WHITE2
  • WHT1
Homo sapiens (human)
ABC-family proteins mediated transport
  • ABC50
  • ABCA4
  • ABCA8
  • ABCB1
  • ABCB4
  • ABCB5
  • ABCB9
  • ABCC1
  • ABCC10
  • ABCC11
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCC6
  • ABCC7
  • ABCC9
  • ABCF1
  • ABCR
  • ADRM1
  • ARA
  • C10orf69
  • C22orf14
  • C2orf30
  • C7orf76
  • C8orf2
  • CFTR
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMOAT2
  • CMRP
  • DER1
  • DER2
  • DER3
  • DERL1
  • DERL2
  • DERL3
  • DSS1
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • ERLEC1
  • ERLIN1
  • ERLIN2
  • FLANA
  • G16
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HSPC
  • KCNJ11
  • KE04
  • KEO4
  • KIAA0107
  • KIAA0822
  • KIAA1520
  • LLN2
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MDR1
  • MDR3
  • MIP224
  • MLP2
  • MOATB
  • MOV34L
  • MRP
  • MRP1
  • MRP2
  • MRP3
  • MRP4
  • MRP5
  • MRP6
  • MRP7
  • MRP8
  • MSS1
  • NG2
  • NU
  • OS9
  • PFAAP4
  • PGY1
  • PGY3
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RMA1
  • RNF185
  • RNF5
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SIMRP7
  • SPFH1
  • SPFH2
  • SUG1
  • SUG2
  • SUR2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSA305
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
  • X
  • XTP3TPB
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
ABO blood group biosynthesis
  • ABO
  • FUT1
  • FUT2
  • H
  • HSC
  • SEC2
Homo sapiens (human)
ADORA2B mediated anti-inflammatory cytokines production
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADORA2B
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNAT3
  • GNAZ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • IFNB2
  • IL6
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PKX1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PRKX
  • TSE1
Homo sapiens (human)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 1
  • CPLA2
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • MAPK14
  • MXI2
  • P2RY1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • SAPK2A
Homo sapiens (human)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 12
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • HORK3
  • P2RY12
Homo sapiens (human)
AKT phosphorylates targets in the cytosol
  • AKT1
  • AKT1S1
  • AKT2
  • AKT3
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2L8
  • CAP20
  • CASP9
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CHUK
  • CIP1
  • GSK3A
  • GSK3B
  • IKKA
  • KIP1
  • MCH6
  • MDA6
  • MDM2
  • MKRN1
  • PIC1
  • PKB
  • PKBG
  • PRAS40
  • RAC
  • RNF61
  • SDI1
  • TCF16
  • TSC2
  • TSC4
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
AKT phosphorylates targets in the nucleus
  • AFX
  • AFX1
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • FOXO6
  • GFRP1
  • HMR
  • MLLT7
  • NAK1
  • NR4A1
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • RPS6KB2
  • STK14B
Homo sapiens (human)
AKT-mediated inactivation of FOXO1A
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • FKHR
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
Homo sapiens (human)
ALK mutants bind TKIs
  • ALK
  • BCL11A
  • BIRC6
  • C2orf2
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CTIP1
  • EIF2AK3
  • EMAPL4
  • EML4
  • EVI9
  • FN
  • FN1
  • HIP1
  • KIAA0034
  • KIAA1289
  • KIAA1809
  • NPM
  • NPM1
  • PEK
  • PERK
  • PKR1
  • PP2CB
  • PPM1B
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • STRN
  • TSE1
  • ZNF856
Homo sapiens (human)
ALKBH2 mediated reversal of alkylation damage
  • ABH2
  • ALKBH2
Homo sapiens (human)
ALKBH3 mediated reversal of alkylation damage
  • ABH3
  • ALKBH3
  • ASC1P100
  • ASCC1
  • ASCC2
  • ASCC3
  • DEPC1
  • HELIC1
  • RQT2
  • RQT3
Homo sapiens (human)
ALPK1 signaling pathway
  • ALPK1
  • KIAA0733
  • KIAA1527
  • LAK
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • RNF85
  • RPS27A
  • T2BP
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TIFA
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
AMPK inhibits chREBP transcriptional activation activity
  • ACDC
  • ACRP30
  • ADIPOQ
  • ADIPOR1
  • ADIPOR2
  • AMPK
  • AMPK2
  • APM1
  • BHLHD14
  • GBP28
  • LKB1
  • MIO
  • MLXIPL
  • PAQR1
  • PAQR2
  • PJS
  • PRKAA2
  • PRKAB2
  • PRKAG2
  • STK11
  • TESBP1A
  • WBSCR14
Homo sapiens (human)
APAP ADME
  • AAC1
  • AAC2
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABCP
  • ACY1
  • BCRP
  • BCRP1
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMOAT2
  • CMRP
  • CN2
  • CNDP2
  • CPGL
  • CYP2E
  • CYP2E1
  • FAEES3
  • GGT
  • GGT1
  • GGT3
  • GGT3P
  • GGT5
  • GGT6
  • GGT7
  • GGTL3
  • GGTL5
  • GGTLA1
  • GNT1
  • GST1
  • GST3
  • GSTM1
  • GSTP1
  • GSTT1
  • HEL-S-13
  • HST
  • MLP2
  • MOATB
  • MRP
  • MRP1
  • MRP2
  • MRP3
  • MRP4
  • MRP5
  • MXR
  • NAT1
  • NAT2
  • PEPA
  • STD
  • STE
  • STM
  • STP
  • STP1
  • SULT1A1
  • SULT1A3
  • SULT1A4
  • SULT1C2
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • UGT1
  • UGT1A1
  • UGT1A10
  • UGT1A6
  • UGT1A9
  • UGT2B15
  • UGT2B8
Homo sapiens (human)
APC truncation mutants are not K63 polyubiquitinated
  • APC
  • DP2.5
Homo sapiens (human)
APC truncation mutants have impaired AXIN binding
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
APC-Cdc20 mediated degradation of Nek2A
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • BUB1B
  • BUB3
  • BUBR1
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • KIAA1406
  • MAD2
  • MAD2L1
  • MAD3L
  • NEK2
  • NEK2A
  • NLK1
  • RPS27A
  • SFT
  • SSK1
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of Cyclin B
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC16
  • CDC2
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • KIAA1406
  • P34CDC2
  • RPS27A
  • SFT
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin
  • ADRM1
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C7orf76
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • DSS1
  • E2EPF
  • EAP1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • KIAA1406
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PTTG
  • PTTG1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSG24
  • TUTR1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of mitotic proteins
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • BUB1B
  • BUB3
  • BUBR1
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • KIAA1406
  • MAD2
  • MAD2L1
  • MAD3L
  • SFT
  • SSK1
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1
  • ADRM1
  • AIK
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK1
  • AIRK2
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • ARK1
  • ARK2
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BTAK
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C7orf76
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • DSS1
  • E2EPF
  • EAP1
  • FBXL1
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IAK1
  • KIAA0107
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • PLK
  • PLK1
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PTTG
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Last updated: December 9, 2024