GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 526 - 550 of 2074 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Repression of WNT target genes
  • AES
  • CTBP
  • CTBP1
  • CTBP2
  • GRG
  • GRG4
  • GRG5
  • HDAC1
  • KIAA1261
  • KIAA1547
  • LEF1
  • RPD3L1
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • TLE5
Homo sapiens (human)
Replication of the SARS-CoV-2 genome
  • DDX5
  • G17P1
  • HELR
  • HLR1
  • RB1
  • VHL
  • ZCRB1
  • rep
Homo sapiens (human)
Replication of the SARS-CoV-1 genome
  • 1a
  • DDX5
  • G17P1
  • HELR
  • HLR1
  • RB1
  • VHL
  • ZCRB1
  • rep
Homo sapiens (human)
Replacement of protamines by nucleosomes in the male pronucleus
  • C17orf95
  • DGCR1
  • H1-8
  • H1FOO
  • H1OO
  • H2AFX
  • H2AX
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIR
  • HIRA
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2BE
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • METTL23
  • NPM2
  • OSH1
  • PRM1
  • PRM2
  • SRPK1
  • TSH2B
  • TUPLE1
Homo sapiens (human)
Removal of the Flap Intermediate from the C-strand
  • ACD
  • DNA2
  • DNA2L
  • DRIP5
  • FEN1
  • KIAA0039
  • KIAA0083
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAD2
  • RAP1
  • RECQ3
  • RECQL2
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • WRN
Homo sapiens (human)
Removal of the Flap Intermediate
  • DNA2
  • DNA2L
  • FEN1
  • KIAA0039
  • KIAA0083
  • PCNA
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • RAD2
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
Homo sapiens (human)
Removal of aminoterminal propeptides from gamma-carboxylated proteins
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • FUR
  • FURIN
  • GAS6
  • PACE
  • PCSK3
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
Release of apoptotic factors from the mitochondria
  • BAK
  • BAK1
  • BAX
  • BCL2L4
  • BCL2L7
  • CDN1
  • CYC
  • CYCS
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • DIABLO
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • ICERE1
  • SMAC
Homo sapiens (human)
Release of Hh-Np from the secreting cell
  • ADAM17
  • C15orf36
  • CEGP1
  • CSVP
  • DHH
  • DISP2
  • DISPB
  • GPC5
  • IHH
  • KIAA1742
  • LINC00594
  • NOTUM
  • SCUBE2
  • SHH
  • TACE
Homo sapiens (human)
Release
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Relaxin receptors
  • GPCR135
  • GPCR142
  • GPR100
  • GPR106
  • GREAT
  • INSL3
  • INSL5
  • INSL7
  • LGR7
  • LGR8
  • RLF
  • RLN2
  • RLN3
  • RLN3R1
  • RLN3R2
  • RLNL
  • RXFP1
  • RXFP2
  • RXFP3
  • RXFP4
  • RXN3
  • SALPR
  • ZINS4
Homo sapiens (human)
Regulation of the apoptosome activity
  • APAF1
  • API3
  • APIP
  • AVEN
  • BIRC4
  • CARD8
  • CASP9
  • CYC
  • CYCS
  • DACAR
  • DIABLO
  • ERK1
  • ERK2
  • IAP3
  • KIAA0413
  • KIAA0955
  • KIAA1561
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MCH6
  • NDPP1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • SMAC
  • UACA
  • XIAP
Homo sapiens (human)
Regulation of signaling by NODAL
  • ACVR1B
  • ACVR1C
  • ACVR2
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • ACVRLK4
  • ALK4
  • ALK7
  • CER1
  • CER2
  • CFC1
  • CKTSF1B3
  • CRIPTO
  • CRIPTO-1
  • CRIPTO-3
  • CRIPTO3
  • DAND4
  • DAND5
  • EBAF
  • GREM3
  • LEFTA
  • LEFTB
  • LEFTY1
  • LEFTY2
  • LEFTYA
  • LEFTYB
  • NODAL
  • SP1
  • TDGF1
  • TDGF1P3
  • TDGF2
  • TDGF3
  • TGFB4
Homo sapiens (human)
Regulation of signaling by CBL
  • BASH
  • BLNK
  • CBL
  • CBL2
  • CRK
  • CRKL
  • FYN
  • GRB1
  • GRF2
  • HCK
  • JTK8
  • LYN
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • RAPGEF1
  • RNF55
  • SLP65
  • SYK
  • VAV
  • VAV1
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Regulation of pyruvate metabolism
  • ARMC8
  • C17orf39
  • C20orf11
  • CDW2
  • EMP
  • GID4
  • GID8
  • KIAA1901
  • LDHA
  • MAEA
  • ME1
  • MIP2
  • MKLN1
  • NEK1
  • RANBP9
  • RANBPM
  • RMND5A
  • RMND5B
  • RPS27A
  • TWA1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VID24
  • WDR26
Homo sapiens (human)
Regulation of pyruvate dehydrogenase (PDH) complex
  • DLAT
  • DLD
  • DLTA
  • GCSL
  • GSTZ1
  • KIAA1348
  • KIAA1990
  • LAD
  • MAAI
  • PDHA1
  • PDHA2
  • PDHAL
  • PDHB
  • PDHK1
  • PDHK2
  • PDHK3
  • PDHK4
  • PDHX
  • PDK1
  • PDK2
  • PDK3
  • PDK4
  • PDP
  • PDP1
  • PDP2
  • PDPR
  • PDX1
  • PHE1A
  • PHE1B
  • PHE3
  • PPM2C
  • SIR2L4
  • SIRT4
Homo sapiens (human)
Regulation of ornithine decarboxylase (ODC)
  • ADRM1
  • AZIN1
  • C7orf76
  • DIA4
  • DSS1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NMOR1
  • NQO1
  • NU
  • OAZ
  • OAZ1
  • OAZ2
  • OAZ3
  • OAZI
  • OAZIN
  • ODC1
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Regulation of necroptotic cell death
  • AIP1
  • ALIX
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • CASP8
  • CDC37
  • CDC37A
  • CHIP
  • ESA1
  • FADD
  • FLOT1
  • FLOT2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • IAP3
  • ITCH
  • KIAA1375
  • M17S1
  • MCH5
  • MDA9
  • MIHB
  • MIHC
  • MLKL
  • MORT1
  • OGT
  • PARK2
  • PDCD6IP
  • PELI1
  • PRISM
  • PRKN
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RNF48
  • RNF49
  • RPS27A
  • SDCBP
  • STUB1
  • SYCL
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCE7
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH7
  • UBE2L3
  • XIAP
Homo sapiens (human)
Regulation of localization of FOXO transcription factors
  • AFX
  • AFX1
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • FOXO6
  • HME1
  • MLLT7
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • SFN
  • YWHAB
  • YWHAG
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Regulation of lipid metabolism by PPARalpha
  • AIB3
  • ARC205
  • BAF60C
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CREBBP
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CTG26
  • DRIP205
  • DRIP230
  • FABP1
  • FABPL
  • HCA137
  • HDAC3
  • HELZ2
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA1047
  • KIAA1769
  • KISH2
  • MED1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NR1C1
  • NR2B1
  • PBP
  • PIMT
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAP250
  • RB18A
  • RXRA
  • SIN3A
  • SMARCD3
  • SRC1
  • SRC2
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • TIF2
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
Homo sapiens (human)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • AHCYL1
  • CACH2
  • CACH3
  • CACH4
  • CACH6
  • CACN2
  • CACN3
  • CACN4
  • CACNA1A
  • CACNA1C
  • CACNA1D
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • CACNL1A1
  • CACNL1A2
  • CACNL1A4
  • CACNL1A6
  • CACNLB2
  • CACNLB3
  • CCHL1A1
  • CCHL1A2
  • CGEF1
  • CGEF2
  • DCAL
  • EPAC
  • EPAC1
  • EPAC2
  • GLUT1
  • GLUT2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • HRINS
  • INS
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • KIAA0558
  • MYSB
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • STXBP1
  • SUR
  • SUR1
  • SYB2
  • SYT5
  • UNC18A
  • VAMP2
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA
  • ABS
  • C20orf183
  • DDX41
  • DLM1
  • DTX4
  • ERIS
  • HT2A
  • IRF3
  • KIAA0937
  • MITA
  • NAK
  • NALP4
  • NLRP4
  • PAN2
  • PYPAF4
  • RNF109
  • RNF155
  • RNF81
  • RNH2
  • RO52
  • RPS27A
  • SSA1
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TMEM173
  • TRIM21
  • TRIM32
  • TRIM56
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
Regulation of glycolysis by fructose 2,6-bisphosphate metabolism
  • F6PK
  • PFKFB1
  • PFKFB2
  • PFKFB3
  • PFKFB4
  • PFRX
  • PKACA
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in late stage (branching morphogenesis) pancreatic bud precursor cells
  • ATOH5
  • BHLHA7
  • BHLHB39
  • CBP
  • CG1
  • CREBBP
  • CXorf6
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • HES1
  • HL
  • HNF1B
  • HNF6
  • HNF6A
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • NEUROG3
  • NGN3
  • NOTCH1
  • ONECUT1
  • ONECUT3
  • P300
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • TAN1
  • TCF2
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in early pancreatic precursor cells
  • BHLHA29
  • FGF10
  • HNF1B
  • HNF6
  • HNF6A
  • IPF1
  • NKX6-1
  • NKX6A
  • ONECUT1
  • ONECUT3
  • PDX1
  • PTF1A
  • PTF1P48
  • STF1
  • TCF2
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024