GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 601 - 625 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • ADTB1
  • ADTG
  • AP19
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • AP4S1
  • APP
  • ARF1
  • ARR1
  • ARRB1
  • BAM22
  • BC2
  • BLOC1S1
  • BLOS1
  • C6orf212
  • C6orf213
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CLAPB2
  • CLAPG1
  • CLAPS1
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CLTNM
  • CLVS1
  • CLVS2
  • CNSA2
  • CRALBPL
  • CTSZ
  • DNAJC6
  • DNASE2
  • DNASE2A
  • DNL2
  • DNM2
  • DYN2
  • GCN5L1
  • GNS
  • HGS
  • HRS
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • KIAA0034
  • KIAA0473
  • M6PR
  • MPR46
  • MPRD
  • MUARP2
  • RLBP1L1
  • RLBP1L2
  • RT14
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • SYB2
  • SYBL1
  • TLP46
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP7
  • VAMP8
Homo sapiens (human)
Purine catabolism
  • AIRP
  • C20orf37
  • C6orf108
  • DNPH1
  • DNT1
  • GDA
  • ITPA
  • KIAA1258
  • NP
  • NT5
  • NT5B
  • NT5C
  • NT5C1A
  • NT5C1B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • NT5E
  • NTE
  • PNP
  • PNT5
  • RCL
  • UMPH2
  • XDH
  • XDHA
Homo sapiens (human)
TP53 regulates transcription of several additional cell death genes whose specific roles in p53-dependent apoptosis remain uncertain
  • API4
  • ASPP1
  • ASPP2
  • BBP
  • BCL2L14
  • BCL5
  • BCL6
  • BCLG
  • BIRC5
  • CAP43
  • CHM
  • DRG1
  • GGTB
  • IAP4
  • KCP1
  • KET
  • KIAA0771
  • KRTCAP1
  • LAZ3
  • NDRG1
  • P53
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PERP
  • PIG3
  • PIGPC1
  • PPP1R13B
  • RABGGTA
  • RABGGTB
  • REP1
  • RTP
  • TCD
  • THW
  • TP53
  • TP53BP2
  • TP53I3
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • ZBTB27
  • ZNF51
Homo sapiens (human)
Abacavir transmembrane transport
  • ABCB1
  • ABCG2
  • ABCP
  • BCRP
  • BCRP1
  • EMTH
  • MDR1
  • MXR
  • OCT1
  • OCT2
  • OCT3
  • PGY1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC22A3
Homo sapiens (human)
Metal sequestration by antimicrobial proteins
  • CAGA
  • CAGB
  • CFAG
  • GIG12
  • HNL
  • LCN2
  • LF
  • LTF
  • MRP14
  • MRP8
  • NGAL
  • PSOR1
  • S100A15
  • S100A7
  • S100A7A
  • S100A7C
  • S100A7L1
  • S100A8
  • S100A9
Homo sapiens (human)
PKA activation in glucagon signalling
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • GNAS
  • GNAS1
  • GSP
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Inactivation of CDC42 and RAC1
  • ARHGAP13
  • ARHGAP14
  • ARHGAP34
  • ARHGAP39
  • CDC42
  • DUTT1
  • FNBP2
  • KIAA0411
  • KIAA0456
  • KIAA1156
  • KIAA1304
  • KIAA1688
  • MEGAP
  • RAC1
  • ROBO1
  • SLIL3
  • SLIT2
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP2A
  • SRGAP3
  • TC25
Homo sapiens (human)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • COMT
  • COMT2
  • LRTOMT
  • MAOA
  • TOMT
Homo sapiens (human)
Packaging of Eight RNA Segments
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Activation of NIMA Kinases NEK9, NEK6, NEK7
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • KIAA1995
  • NEK6
  • NEK7
  • NEK8
  • NEK9
  • NERCC
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
Homo sapiens (human)
RIPK1-mediated regulated necrosis
  • AIP1
  • ALIX
  • API1
  • API2
  • API3
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • CASP8
  • CD95L
  • CHIP
  • DR4
  • DR5
  • ESA1
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • FLOT1
  • FLOT2
  • IAP3
  • ICP6
  • KIAA1375
  • KILLER
  • M17S1
  • MCH5
  • MDA9
  • MIHB
  • MIHC
  • MLKL
  • MORT1
  • NS
  • OGT
  • PDCD6IP
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RIR1
  • RNF48
  • RNF49
  • SDCBP
  • STUB1
  • SYCL
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • XIAP
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Degradation of cysteine and homocysteine
  • ADO
  • C10orf22
  • CDO1
  • CSAD
  • CSD
  • CTH
  • FMO1
  • GADL1
  • GOT2
  • KYAT4
  • MPST
  • TRX2
  • TST
  • TST2
  • TXN2
Homo sapiens (human)
Nitric oxide stimulates guanylate cyclase
  • GUC1A2
  • GUC1A3
  • GUC1B3
  • GUCSA2
  • GUCSA3
  • GUCSB3
  • GUCY1A1
  • GUCY1A2
  • GUCY1A3
  • GUCY1B1
  • GUCY1B2
  • GUCY1B3
  • NOS1
  • NOS2
  • NOS2A
  • NOS3
Homo sapiens (human)
Regulation of TNFR1 signaling
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CASP8
  • CHIP
  • CHUK
  • CLIP3
  • CLIPR59
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • EBI6
  • FADD
  • FAM105B
  • FIP2
  • FIP3
  • GLC1E
  • GNB2L1
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IKKE
  • IKKI
  • IMP3
  • IMP4
  • KIAA0151
  • KIAA0722
  • KIAA0757
  • KIAA0849
  • KIAA1532
  • MAPKAPK2
  • MCH5
  • MIB2
  • MIHB
  • MIHC
  • MORT1
  • NAK
  • NEMO
  • NRP
  • OPG199
  • OPTN
  • OTDC1
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • OTULIN
  • PD1
  • PSL1
  • PSL2
  • PUBC1
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF54
  • RPS27A
  • SFT
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SKD
  • SPATA2
  • SPI-2
  • SPPL2A
  • SPPL2B
  • STUB1
  • T6BP
  • TAX1BP1
  • TBK1
  • TCF16
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCE7
  • UBCE7IP3
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBCH7
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2L3
  • UBP41
  • UL36
  • ULK1
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
  • ZZANK1
Homo sapiens (human)
HSP90 chaperone cycle for SHRs
  • ACTR10
  • ACTR11
  • ACTR1A
  • AIG6
  • AR
  • ARP10
  • ARP11
  • CAPAA3
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CPR3
  • CTRN1
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN50
  • DCTN6
  • DHC1
  • DHTR
  • DLC1
  • DLC2
  • DNAJ1
  • DNAJ2
  • DNAJA1
  • DNAJA2
  • DNAJA4
  • DNAJB1
  • DNCH1
  • DNCI1
  • DNCI2
  • DNCIC1
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNCLI1
  • DNCLI2
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • FKBP4
  • FKBP5
  • FKBP51
  • FKBP52
  • GRL
  • GSG3
  • HDJ1
  • HDJ2
  • HDLC1
  • HIRIP4
  • HSC70
  • HSJ2
  • HSP72
  • HSP73
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPA1
  • HSPA10
  • HSPA1A
  • HSPA1B
  • HSPA1L
  • HSPA2
  • HSPA8
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • HSPF1
  • HSPF4
  • HSX70
  • KIAA0325
  • LIC2
  • MCR
  • MLR
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR3C3
  • NR3C4
  • P23
  • PGR
  • PTGES3
  • STIP1
  • TEBP
  • WS3
Homo sapiens (human)
Gamma carboxylation, hypusinylation, hydroxylation, and arylsulfatase activation
  • F8
  • F8C
  • FN3K
  • FN3KRP
  • ICMT
  • PCCMT
  • TPST1
  • TPST2
Homo sapiens (human)
CD209 (DC-SIGN) signaling
  • CBP
  • CD209
  • CLEC4L
  • CREBBP
  • EP300
  • FYN
  • HRAS
  • HRAS1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • JTK8
  • LYN
  • MSK1
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NRAS
  • OPHN3
  • P300
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • RAF
  • RAF1
  • RELA
  • RELB
  • RPS6KA5
Homo sapiens (human)
Imatinib-resistant PDGFR mutants
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant
  • ADAM10
  • ADAM17
  • CSVP
  • DLL1
  • DLL4
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KUZ
  • MADM
  • NOTCH1
  • TACE
  • TAN1
Homo sapiens (human)
Synthesis of (16-20)-hydroxyeicosatetraenoic acids (HETE)
  • CYP1A1
  • CYP1A2
  • CYP1B1
  • CYP2C10
  • CYP2C19
  • CYP2C8
  • CYP2C9
  • CYP2U1
  • CYP4A11
  • CYP4A2
  • CYP4F2
Homo sapiens (human)
Pentose phosphate pathway
  • CARKL
  • DERA
  • G6PD
  • PGD
  • PGDH
  • PGLS
  • PGM2
  • RBKS
  • RBSK
  • RPE
  • RPEL1
  • RPI
  • RPIA
  • SHPK
  • TAL
  • TALDO
  • TALDO1
  • TALDOR
  • TKT
Homo sapiens (human)
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • ASF
  • AUF1
  • C1orf199
  • CBP20
  • CBP80
  • CFIM25
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • DXS8237E
  • FIP1
  • FIP1L1
  • FTP3
  • FUS
  • FUSIP1
  • FUSIP2
  • GPATC9
  • GPATCH9
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • HEAB
  • HNRNPA1
  • HNRNPA2B1
  • HNRNPA3
  • HNRNPC
  • HNRNPD
  • HNRNPF
  • HNRNPH1
  • HNRNPH2
  • HNRNPK
  • HNRNPL
  • HNRNPM
  • HNRNPR
  • HNRNPU
  • HNRPA1
  • HNRPA2B1
  • HNRPA3
  • HNRPC
  • HNRPD
  • HNRPF
  • HNRPG
  • HNRPH
  • HNRPH1
  • HNRPH2
  • HNRPK
  • HNRPL
  • HNRPM
  • HNRPR
  • HNRPU
  • HRS
  • KIAA0105
  • KIAA0122
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA1367
  • KIAA1627
  • METTL14
  • METTL3
  • MTA70
  • NAGR1
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NSEP1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PCBP1
  • PCBP2
  • PCF11
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PTB
  • PTBP1
  • RAP30
  • RAP74
  • RBM10
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RHE
  • RPB7
  • SAFA
  • SF2
  • SF2P33
  • SFRS1
  • SFRS10
  • SFRS11
  • SFRS13A
  • SFRS13B
  • SFRS19
  • SFRS2
  • SFRS2B
  • SFRS3
  • SFRS4
  • SFRS5
  • SFRS6
  • SFRS7
  • SFRS9
  • SPK
  • SRP20
  • SRP30C
  • SRP40
  • SRP46
  • SRP55
  • SRP75
  • SRRP35
  • SRSF1
  • SRSF10
  • SRSF11
  • SRSF12
  • SRSF2
  • SRSF3
  • SRSF4
  • SRSF5
  • SRSF6
  • SRSF7
  • SRSF8
  • SRSF9
  • SYMPK
  • TASR
  • TLS
  • TRA2B
  • U21.1
  • WDC146
  • WDR33
  • WTAP
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
Signaling by LTK
  • ACK1
  • ALKAL1
  • ALKAL2
  • ASH
  • FAM150A
  • FAM150B
  • GRB1
  • GRB2
  • IRS1
  • LTK
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SOS1
  • TNK2
  • TYK1
Homo sapiens (human)
Pyrophosphate hydrolysis
  • IOPPP
  • LHPP
  • PP
  • PPA1
  • PPA2
Homo sapiens (human)
SUMOylation of transcription factors
  • BHLHE32
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • DDXBP1
  • FOXL2
  • HIC1
  • MDM2
  • MITF
  • MLM
  • MTA1
  • P53
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SP3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TFAP2B
  • TFAP2C
  • TP53
  • TP53BP1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • ZBTB29
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024