GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1126 - 1150 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
RHOF GTPase cycle
  • A26C1A
  • ACTB
  • ACTN1
  • ADD3
  • ADDL
  • AKAP12
  • AKAP250
  • ANKRD57
  • ARHF
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP12
  • ARHGAP21
  • ARHGAP32
  • ARHGAP34
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • BAIAP2L1
  • BAIAP2L2
  • BASP1
  • BT
  • C2orf26
  • CAPZB
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42GAP
  • CDEP
  • DEPDC1B
  • DIA
  • DIAP1
  • DIAP3
  • DIAPH1
  • DIAPH2
  • DIAPH3
  • ESYT1
  • FAM169A
  • FAM62A
  • FARP1
  • FNBP2
  • GRB1
  • GRIT
  • IRTKS
  • KIAA0456
  • KIAA0712
  • KIAA0747
  • KIAA0888
  • KIAA1424
  • KIAA1688
  • LAP1
  • LAP2
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • MBC2
  • MCAM
  • MTMR1
  • MUC18
  • MYO9B
  • MYR5
  • NAP22
  • NBC2
  • NBC2B
  • NBC3
  • NBCn1
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLEKHC2
  • POTE2
  • POTEE
  • RAB7
  • RAB7A
  • RHOF
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RICS
  • RIF
  • SBC2
  • SENP1
  • SLC4A6
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SOWAHC
  • SRGAP2
  • SRGAP2A
  • STB2
  • STEAP3
  • SYB3
  • SYDE1
  • TMPO
  • TOR1AIP1
  • TSAP6
  • VAMP3
  • VANGL1
  • XTP8
Homo sapiens (human)
PPARA activates gene expression
  • ABC1
  • ABCA1
  • ABCB4
  • ACADM
  • ACID1
  • ACSL1
  • ACSVL5
  • ADFP
  • AGT
  • AHR
  • AHRR
  • AIB1
  • AIB3
  • ALAS1
  • ALAS3
  • ALASH
  • ANGPTL4
  • ANKRD1
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • ARC100
  • ARC105
  • ARC130
  • ARC150
  • ARC205
  • ARC240
  • ARC250
  • ARC33
  • ARC34
  • ARC36
  • ARC70
  • ARC77
  • ARC92
  • ARNT
  • ARNT2
  • ARNTL
  • ARP4
  • BAF60C
  • BAR
  • BCLAF2
  • BHLHD2
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE42
  • BHLHE5
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • BHLHE8
  • BHLHE9
  • BMAL1
  • C193
  • C20orf97
  • CAGH45
  • CARM1
  • CARP
  • CBP
  • CCNC
  • CCPG
  • CD36
  • CDC2L6
  • CDK11
  • CDK19
  • CDK8
  • CERP
  • CHD9
  • CLOCK
  • CPT1
  • CPT1A
  • CPT2
  • CREBBP
  • CRSP1
  • CRSP2
  • CRSP200
  • CRSP3
  • CRSP34
  • CRSP4
  • CRSP6
  • CRSP7
  • CRSP8
  • CRSP9
  • CTG26
  • CTG7A
  • CXorf4
  • CYP1A1
  • CYP4A11
  • CYP4A2
  • CYP7
  • CYP7A1
  • DR6
  • DRAL
  • DRIP100
  • DRIP130
  • DRIP150
  • DRIP205
  • DRIP230
  • DRIP36
  • DRIP77
  • DRIP80
  • DRIP92
  • EAR1
  • EG1
  • EP300
  • ERR1
  • ESRL1
  • ESRRA
  • EXLM1
  • FABP1
  • FABPL
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADSD5
  • FAM120B
  • FATP1
  • FDFT1
  • FHL2
  • FXR
  • G0S2
  • GLIPR
  • GLIPR1
  • GNT1
  • GP3B
  • GP4
  • GPS2
  • GRHL1
  • GRIM12
  • HA1A2
  • HAP3
  • HCA137
  • HDAC3
  • HELZ2
  • HFARP
  • HMGCS
  • HMGCS1
  • HMGCS2
  • HOPA
  • HREV
  • HRR1
  • HST
  • IRA1
  • IXL
  • KDRF
  • KIAA0130
  • KIAA0181
  • KIAA0192
  • KIAA0307
  • KIAA0308
  • KIAA0334
  • KIAA0593
  • KIAA0959
  • KIAA1025
  • KIAA1028
  • KIAA1047
  • KIAA1216
  • KIAA1234
  • KIAA1769
  • KIAA1838
  • KIAA2016
  • KISH2
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • LBP32
  • LCMR1
  • LEM6
  • LXRA
  • LXRB
  • MDR3
  • ME1
  • MED1
  • MED10
  • MED11
  • MED12
  • MED13
  • MED13L
  • MED14
  • MED15
  • MED16
  • MED17
  • MED18
  • MED19
  • MED20
  • MED21
  • MED22
  • MED23
  • MED24
  • MED25
  • MED26
  • MED27
  • MED28
  • MED29
  • MED30
  • MED31
  • MED4
  • MED6
  • MED7
  • MED8
  • MED9
  • MGR
  • MOP3
  • MOP4
  • MTF1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA3
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NER
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • NIPK
  • NPAS2
  • NR1C1
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1F1
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NR3B1
  • NRF1
  • P300
  • PASD3
  • PASD4
  • PBP
  • PCQAP
  • PERC
  • PEX11
  • PEX11A
  • PGAR
  • PGC1
  • PGC1A
  • PGC1B
  • PGY3
  • PIMT
  • PLIN2
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARG
  • PPARGBP
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • PPARGC1B
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • PROSIT240
  • PTOV2
  • RAC3
  • RAP250
  • RAP3
  • RB18A
  • RGL
  • RGL1
  • RGR1
  • RIP14
  • RORA
  • RTVP1
  • RXRA
  • RXRB
  • RZRA
  • SERPINA8
  • SKIP3
  • SLC27A1
  • SLIM3
  • SMARCD3
  • SOH1
  • SP1
  • SRB7
  • SRC1
  • SRC2
  • SREBF2
  • SREBP2
  • STD
  • STEF
  • SULT2A1
  • SUR2
  • SURB7
  • SURF5
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TFCP2L2
  • TGS1
  • THRAL
  • THRAP1
  • THRAP2
  • THRAP3
  • THRAP4
  • THRAP5
  • THRAP6
  • TIAM2
  • TIF2
  • TIG1
  • TNFRSF21
  • TNRC11
  • TNRC7
  • TRAM1
  • TRAP100
  • TRAP150
  • TRAP170
  • TRAP220
  • TRAP230
  • TRAP240
  • TRAP240L
  • TRAP25
  • TRAP80
  • TRB3
  • TRBP
  • TRFP
  • TRIB3
  • TRIP2
  • TSFP1
  • TXNRD1
  • UGT1
  • UGT1A9
  • UNR
  • VDRIP
Homo sapiens (human)
RUNX3 regulates YAP1-mediated transcription
  • AML2
  • CBFA3
  • CCN2
  • CTGF
  • HCS24
  • IGFBP8
  • PEBP2A3
  • RTEF1
  • RUNX3
  • TAZ
  • TCF13
  • TCF13L1
  • TEAD1
  • TEAD2
  • TEAD3
  • TEAD4
  • TEAD5
  • TEF1
  • TEF3
  • TEF4
  • TEF5
  • WWTR1
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
Cobalamin (Cbl) metabolism
  • C2orf25
  • CL25022
  • MMAA
  • MMAB
  • MMACHC
  • MMADHC
  • MMUT
  • MTR
  • MTRR
  • MUT
Homo sapiens (human)
Removal of the Flap Intermediate from the C-strand
  • ACD
  • DNA2
  • DNA2L
  • DRIP5
  • FEN1
  • KIAA0039
  • KIAA0083
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAD2
  • RAP1
  • RECQ3
  • RECQL2
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • WRN
Homo sapiens (human)
FGFR3c ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • GALNT3
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • KS3
Homo sapiens (human)
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT)
  • BC2
  • C13orf9
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C6orf55
  • C9orf28
  • C9orf83
  • CFBP
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP5
  • CHMP6
  • CHMP7
  • DERP9
  • EAP20
  • EAP30
  • EAP45
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HBP
  • HCRP1
  • HGS
  • HRS
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NEDF
  • PML39
  • RPS27A
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • SKD1
  • SNF7DC2
  • SNF8
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS25
  • VPS28
  • VPS36
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • VPS4
  • VPS42
  • VPS4A
  • VPS4B
  • VTA1
  • WBSCR24
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate CIT
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • CDKN1B
  • CIT
  • CRIK
  • DLG4
  • KIAA0042
  • KIAA0866
  • KIAA0949
  • KIAA2034
  • KIF14
  • KIP1
  • MBS
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • PRC1
  • PSD95
  • RAC1
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • STK21
  • TC25
  • p27
Homo sapiens (human)
Virion Assembly and Release
  • 3a
  • 7a
  • E
  • M
  • N
  • S
  • sM
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF2
  • BRFU
  • CRCP
  • GTF2D1
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • OCT1
  • OTF1
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • POU2F1
  • RPC11
  • RPC8
  • SBF
  • SNAP19
  • SNAP190
  • SNAP43
  • SNAP45
  • SNAP50
  • SNAPC1
  • SNAPC2
  • SNAPC3
  • SNAPC4
  • SNAPC5
  • STAF
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
  • ZNF143
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by AKT1 E17K in Cancer
  • AFX
  • AFX1
  • AKT1
  • AKT1S1
  • AKT2
  • AKT3
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2L8
  • CAP20
  • CASP9
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CHUK
  • CIP1
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • FOXO6
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • GFRP1
  • GSK3A
  • GSK3B
  • HMR
  • IKKA
  • KIAA1999
  • KIP1
  • LST8
  • MAPKAP1
  • MCH6
  • MDA6
  • MDM2
  • MIP1
  • MLLT7
  • MLST8
  • MTOR
  • NAK1
  • NR4A1
  • PDK1
  • PDPK1
  • PIC1
  • PKB
  • PKBG
  • PRAS40
  • PROTOR1
  • PRR5
  • RAC
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RICTOR
  • RPS6KB2
  • SDI1
  • SIN1
  • STK14B
  • TCF16
  • TSC2
  • TSC4
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • C20orf54
  • ENPP1
  • FLAD1
  • GPR172A
  • GPR172B
  • M6S1
  • NPPS
  • PAR1
  • PAR2
  • PC1
  • PDNP1
  • RFK
  • RFT1
  • RFT2
  • RFT3
  • RFVT3
  • SLC52A1
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Homo sapiens (human)
Regulation of KIT signaling
  • APS
  • CBL
  • CBL2
  • CIS4
  • FYN
  • HCP
  • JTK8
  • KIT
  • LCK
  • LNK
  • LYN
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PTP1C
  • PTPN6
  • RNF55
  • SCFR
  • SH2B2
  • SH2B3
  • SOCS1
  • SOCS4
  • SOCS6
  • SOS1
  • SSI1
  • TIP3
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Nephron development
  • BRN1
  • DLL1
  • HNF1B
  • HNF4
  • HNF4A
  • IRX1
  • IRX2
  • IRXA1
  • IRXA2
  • JAG1
  • JAGL1
  • LFNG
  • LHX1
  • LIM-1
  • LIM1
  • NR2A1
  • OTF8
  • POU3F3
  • TCF14
  • TCF2
  • WNT14B
  • WNT15
  • WNT4
  • WNT9B
  • WT1
Homo sapiens (human)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • P2RXL1
  • P2X1
  • P2X2
  • P2X5
  • P2X5FL
  • P2X6
  • PAFAH2
Homo sapiens (human)
Transport of the SLBP independent Mature mRNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • BEF
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBP20
  • CBP80
  • CG1
  • D3S1231E
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TAP
  • THOC4
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Androgen biosynthesis
  • 3BH
  • CGA
  • CYP17
  • CYP17A1
  • EDH17B3
  • HSD17B12
  • HSD17B3
  • HSD3B1
  • HSD3B2
  • HSDB3A
  • HSDB3B
  • LHB
  • POMC
  • S17AH
  • SDR12C1
  • SDR12C2
  • SRD5A1
  • SRD5A2
  • SRD5A2L
  • SRD5A3
Homo sapiens (human)
RA biosynthesis pathway
  • ADH1
  • ADH1A
  • ADH1C
  • ADH2
  • ADH3
  • ADH4
  • AKR1C3
  • ALDC
  • ALDH1
  • ALDH12
  • ALDH1A1
  • ALDH1A2
  • ALDH1A3
  • ALDH6
  • ALDH8A1
  • ARSDR1
  • CRABP1
  • CYP26
  • CYP26A1
  • CYP26A2
  • CYP26B1
  • CYP26C1
  • DDH1
  • DHRS3
  • DHRS4
  • DHRS9
  • HSD17B5
  • HSD17B9
  • KIAA0119
  • P450RAI1
  • P450RAI2
  • PAN2
  • PGFS
  • PSDR1
  • PUMB1
  • RALDH2
  • RBP5
  • RDH1
  • RDH10
  • RDH11
  • RDH13
  • RDH14
  • RDH15
  • RDH16
  • RDH17
  • RDH5
  • RDHE2
  • RODH4
  • SDR16C1
  • SDR16C4
  • SDR16C5
  • SDR25C2
  • SDR7C1
  • SDR7C3
  • SDR7C4
  • SDR9C4
  • SDR9C5
  • SDR9C8
Homo sapiens (human)
Abasic sugar-phosphate removal via the single-nucleotide replacement pathway
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • POLB
  • REF1
Homo sapiens (human)
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10
  • CASP10
  • CASP8
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FADD
  • FIP3
  • IFIH1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MCH4
  • MCH5
  • MDA5
  • MORT1
  • NEMO
  • RH116
  • RIGI
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • TCF16
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
ARL13B-mediated ciliary trafficking of INPP5E
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • INPP5E
  • PDE6D
  • PDED
Homo sapiens (human)
Intestinal infectious diseases
  • GUC2C
  • GUCY2C
  • IKEPP
  • NHERF4
  • PDZD3
  • PDZK2
  • STAR
  • sta1
Homo sapiens (human)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of growth factors and their receptors
  • AP2TF
  • ATAD2
  • CGA
  • CGB
  • CGB3
  • CGB5
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Homo sapiens (human)
Signaling by RAS GAP mutants
  • HRAS
  • HRAS1
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  • KRAS2
  • NRAS
  • RASK2
Homo sapiens (human)
Formation of the cornified envelope
  • C1orf196
  • C1orf44
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  • CAPNS1
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Last updated: December 9, 2024