GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1826 - 1850 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
PLC-gamma1 signalling
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • PLC1
  • PLCG1
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Regulation of endogenous retroelements by the Human Silencing Hub (HUSH) complex
  • ATF7IP
  • BAT8
  • C3orf63
  • C6orf30
  • DOB1
  • EHMT1
  • EHMT2
  • ESET
  • EUHMTASE1
  • FAM208A
  • G9A
  • GLP
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • KIAA0052
  • KIAA0067
  • KIAA0852
  • KIAA1105
  • KIAA1876
  • KMT1C
  • KMT1D
  • KMT1E
  • MCAF
  • MCAF1
  • MORC2
  • MPHOSPH8
  • MPP8
  • MTR4
  • MTREX
  • NG36
  • PPHLN1
  • RBM7
  • SETDB1
  • SKIV2L2
  • TASOR
  • TSH2B
  • ZCCHC8
  • ZCWCC1
Homo sapiens (human)
Mtb iron assimilation by chelation
  • GIG12
  • LF
  • LTF
  • Rv2895c
  • bfr
  • bfrA
  • bfrB
  • ftn
  • irtA
  • irtB
Homo sapiens (human)
Chemokine receptors bind chemokines
  • ACKR2
  • ACKR3
  • ACKR4
  • BCA1
  • BLC
  • BLR1
  • BONZO
  • CCBP2
  • CCL1
  • CCL11
  • CCL13
  • CCL16
  • CCL17
  • CCL19
  • CCL2
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL22
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL28
  • CCL3
  • CCL3L1
  • CCL3L3
  • CCL4
  • CCL5
  • CCL7
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR11
  • CCR2
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR7
  • CCR8
  • CCR9
  • CCRL1
  • CCRL2
  • CCXCR1
  • CKRL1
  • CKRL3
  • CKRX
  • CMK
  • CMKAR1
  • CMKBR1
  • CMKBR2
  • CMKBR3
  • CMKBR4
  • CMKBR5
  • CMKBR6
  • CMKBR7
  • CMKBR8
  • CMKBR9
  • CMKBRL1
  • CMKBRL2
  • CMKOR1
  • CMKR1
  • CRAM
  • CTAP3
  • CX3CL1
  • CX3CR1
  • CXCL1
  • CXCL10
  • CXCL11
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL2
  • CXCL3
  • CXCL4
  • CXCL5
  • CXCL6
  • CXCL7
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR1
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • CXCR7
  • D17S136E
  • D17S1718
  • D6
  • EBI1
  • ELC
  • ENA78
  • EVI1
  • FKN
  • G0S19-1
  • G0S19-2
  • GCP2
  • GPR13
  • GPR159
  • GPR2
  • GPR28
  • GPR29
  • GPR5
  • GPR9
  • GRO
  • GRO1
  • GRO2
  • GRO3
  • GROA
  • GROB
  • GROG
  • HCR
  • IL8
  • IL8RA
  • IL8RB
  • ILC
  • ILINCK
  • INP10
  • ITAC
  • LAG1
  • LARC
  • LTN
  • MCP1
  • MCP3
  • MCP4
  • MDC
  • MDR15
  • MGSA
  • MIG
  • MIP1A
  • MIP1B
  • MIP2A
  • MIP3A
  • MIP3B
  • NCC1
  • NCC4
  • NTT
  • PF4
  • PPBP
  • RDC1
  • SCYA1
  • SCYA11
  • SCYA13
  • SCYA16
  • SCYA17
  • SCYA19
  • SCYA2
  • SCYA20
  • SCYA21
  • SCYA22
  • SCYA25
  • SCYA27
  • SCYA28
  • SCYA3
  • SCYA3L1
  • SCYA4
  • SCYA5
  • SCYA6
  • SCYA7
  • SCYAR1
  • SCYB1
  • SCYB10
  • SCYB11
  • SCYB13
  • SCYB16
  • SCYB2
  • SCYB3
  • SCYB4
  • SCYB5
  • SCYB6
  • SCYB7
  • SCYB9
  • SCYB9B
  • SCYC1
  • SCYC2
  • SCYD1
  • SDF1
  • SDF1A
  • SDF1B
  • SRPSOX
  • STRL22
  • STRL33
  • TARC
  • TECK
  • TGB1
  • THBGB1
  • TYMSTR
  • VSHK1
  • XCL1
  • XCL2
  • XCR1
Homo sapiens (human)
Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • POLB
  • REF1
Homo sapiens (human)
MPS VI - Maroteaux-Lamy syndrome
  • ARSB
Homo sapiens (human)
Defective SLC12A3 causes Gitelman syndrome (GS)
  • NCC
  • SLC12A3
  • TSC
Homo sapiens (human)
Resistance of ERBB2 KD mutants to afatinib
  • CDC37
  • CDC37A
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • HER2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MLN19
  • NEU
  • NGL
Homo sapiens (human)
Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA1 loss of function
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Defective ABCG8 causes GBD4 and sitosterolemia
  • ABCG5
  • ABCG8
Homo sapiens (human)
Influenza Infection
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Defective GFPT1 causes CMSTA1
  • GFAT
  • GFPT
  • GFPT1
Homo sapiens (human)
Dissolution of Fibrin Clot
  • AAP
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANX2LG
  • ANXA2
  • CAL1H
  • CAL1L
  • CLP11
  • HRG
  • LPC2D
  • MO3
  • PAI1
  • PAI2
  • PI6
  • PI7
  • PI8
  • PLANH1
  • PLANH2
  • PLAT
  • PLAU
  • PLAUR
  • PLG
  • PLI
  • PN1
  • PTI
  • S100A10
  • SERPINB2
  • SERPINB6
  • SERPINB8
  • SERPINE1
  • SERPINE2
  • SERPINF2
  • UPAR
Homo sapiens (human)
Signaling by activated point mutants of FGFR1
  • BFGFR
  • CEK
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KS3
Homo sapiens (human)
NGF processing
  • FUR
  • FURIN
  • NGF
  • NGFB
  • PACE
  • PACE4
  • PC5
  • PC6
  • PCSK3
  • PCSK5
  • PCSK6
Homo sapiens (human)
TP53 Regulates Transcription of Death Receptors and Ligands
  • APO2
  • APT1
  • ASPP1
  • ASPP2
  • BBP
  • DCR1
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FAS
  • FAS1
  • IBP3
  • IGFBP3
  • KET
  • KIAA0771
  • KILLER
  • LIT
  • P53
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PPP1R13B
  • TMEM219
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10C
  • TNFRSF10D
  • TNFRSF6
  • TP53
  • TP53BP2
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR3
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRID
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Potassium transport channels
  • KCNJ1
  • KCNJ10
  • KCNJ16
  • ROMK1
Homo sapiens (human)
GAB1 signalosome
  • AREG
  • AREGB
  • BTC
  • CBP
  • CSK
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • GAB1
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • PAG
  • PAG1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PXN
  • SDGF
  • SHPTP2
  • SRC
  • SRC1
  • TGFA
Homo sapiens (human)
Mitochondrial Uncoupling
  • AAC1
  • ANT1
  • SLC25A4
  • SLC25A7
  • UCP
  • UCP1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of SUMOylation proteins
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • LUN
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • PIAS4
  • PIASG
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • TMEM48
  • TOPORS
  • TP53BPL
  • TPR
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
RAF activation
  • ARAF
  • ARAF1
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CTAK1
  • EMK2
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • KIAA0044
  • KIAA0862
  • KIAA0968
  • KSR
  • KSR1
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • MRAS
  • NRAS
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RNF52
  • RRAS3
  • SHOC2
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Integration of provirus
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KPNA1
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RCH2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) during gastrulation
  • BFGFR
  • CEK
  • EOMES
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SNAH
  • SNAI1
  • T
  • TBR2
  • TBXT
Homo sapiens (human)
Signaling by PDGFRA extracellular domain mutants
  • APRF
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHEPDGFRA
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A9 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024