GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • APOB
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • HMG1
  • HMGB1
  • ICERE1
  • KIAA0012
  • LBP
  • LY96
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TLR7
Homo sapiens (human)
IRAK4 deficiency (TLR2/4)
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • IRAK4
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
MyD88 deficiency (TLR2/4)
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • BPI
  • CD11B
  • CD14
  • CD18
  • CD180
  • CR3A
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • ESOP1
  • ITGAM
  • ITGB2
  • KIAA0820
  • LBP
  • LY64
  • LY86
  • LY96
  • MD1
  • MD2
  • MFI7
  • PLCG2
  • PTPN4
  • RP105
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
Homo sapiens (human)
Activation of IRF3, IRF7 mediated by TBK1, IKKε (IKBKE)
  • CAP-1
  • CD14
  • CRAF1
  • ESOP1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • LY96
  • MD2
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Regulation of TBK1, IKKε (IKBKE)-mediated activation of IRF3, IRF7
  • CAP-1
  • CD14
  • CRAF1
  • ESOP1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • LY96
  • MD2
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
TRIF-mediated programmed cell death
  • CASP8
  • CD14
  • ESOP1
  • FADD
  • LY96
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
  • TRIF
Homo sapiens (human)
MyD88-independent TLR4 cascade
  • CD14
  • ESOP1
  • LY96
  • MD2
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
  • TRIF
Homo sapiens (human)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS
  • HAS1
  • HAS2
  • HAS3
  • HYBID
  • KIAA1199
  • MRP5
Homo sapiens (human)
RIPK1-mediated regulated necrosis
  • AIP1
  • ALIX
  • API1
  • API2
  • API3
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • CASP8
  • CD95L
  • CHIP
  • DR4
  • DR5
  • ESA1
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • FLOT1
  • FLOT2
  • IAP3
  • ICP6
  • KIAA1375
  • KILLER
  • M17S1
  • MCH5
  • MDA9
  • MIHB
  • MIHC
  • MLKL
  • MORT1
  • NS
  • OGT
  • PDCD6IP
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RIR1
  • RNF48
  • RNF49
  • SDCBP
  • STUB1
  • SYCL
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • XIAP
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
TP53 Regulates Transcription of Death Receptors and Ligands
  • APO2
  • APT1
  • ASPP1
  • ASPP2
  • BBP
  • DCR1
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FAS
  • FAS1
  • IBP3
  • IGFBP3
  • KET
  • KIAA0771
  • KILLER
  • LIT
  • P53
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PPP1R13B
  • TMEM219
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10C
  • TNFRSF10D
  • TNFRSF6
  • TP53
  • TP53BP2
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR3
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRID
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
TRAIL signaling
  • APO2
  • APO2L
  • CASH
  • CASP10
  • CASP8
  • CASP8AP1
  • CFLAR
  • CLARP
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • KILLER
  • MCH4
  • MCH5
  • MORT1
  • MRIT
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10D
  • TNFSF10
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Regulation by c-FLIP
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
CASP8 activity is inhibited
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Dimerization of procaspase-8
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Activation of NF-kappaB in B cells
  • ADRM1
  • BCL10
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • C7orf76
  • CARD11
  • CARMA1
  • CHUK
  • CIPER
  • CLAP
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FIP3
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBE
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0107
  • KIAA0696
  • LMPX
  • LMPY
  • MAD3
  • MALT1
  • MAP3K7
  • MB1
  • MIP224
  • MLT
  • MOV34L
  • MSS1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NFKBIE
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • PKCB
  • POH1
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • REL
  • RELA
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TAK1
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TCF16
  • TRAP2
  • TRIP9
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors)
  • CASR
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GPR51
  • GPR59
  • GPR60
  • GPR70
  • GPR71
  • GPRC1A
  • GPRC1B
  • GPRC1C
  • GPRC1D
  • GPRC1E
  • GPRC1F
  • GPRC1G
  • GPRC1H
  • GPRC2A
  • GPRC3A
  • GPRC3B
  • GPRC6A
  • GRM1
  • GRM2
  • GRM3
  • GRM4
  • GRM5
  • GRM6
  • GRM7
  • GRM8
  • MGLUR1
  • MGLUR2
  • MGLUR3
  • MGLUR4
  • MGLUR5
  • MGLUR6
  • MGLUR7
  • MGLUR8
  • PCAR1
  • PTC
  • T1R1
  • T1R2
  • T1R3
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R10
  • TAS2R13
  • TAS2R14
  • TAS2R16
  • TAS2R19
  • TAS2R20
  • TAS2R23
  • TAS2R3
  • TAS2R30
  • TAS2R31
  • TAS2R38
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R41
  • TAS2R42
  • TAS2R43
  • TAS2R44
  • TAS2R45
  • TAS2R46
  • TAS2R47
  • TAS2R48
  • TAS2R49
  • TAS2R5
  • TAS2R50
  • TAS2R55
  • TAS2R60
  • TAS2R7
  • TAS2R8
  • TAS2R9
  • TR1
  • TR2
  • TR3
Homo sapiens (human)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • ACTHR
  • AGT
  • AGTBP
  • AGTR1
  • AGTR1A
  • AGTR1B
  • AGTR2
  • AGTRL1
  • APEL
  • APJ
  • APLN
  • APLNR
  • AT2R1
  • AT2R1B
  • AXOR12
  • AZ3B
  • BDK
  • BDKRB1
  • BDKRB2
  • BKR2
  • BRADYB1
  • BRS3
  • BV8
  • C3
  • C3AR1
  • C3R1
  • C5
  • C5AR
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • C5R1
  • CCK
  • CCKAR
  • CCKBR
  • CCKRA
  • CCKRB
  • CEPR
  • CF2R
  • CMKRL2
  • CORT
  • CPAMD1
  • CPAMD4
  • CXCL8
  • DARC
  • DRY12
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • ETA
  • ETBRLP2
  • ETRA
  • ETRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FY
  • GAL
  • GAL1
  • GALN
  • GALNR
  • GALNR1
  • GALNR2
  • GALNR3
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GHSR
  • GLBA
  • GLNN
  • GPD
  • GPER
  • GPER1
  • GPR10
  • GPR11
  • GPR14
  • GPR145
  • GPR154
  • GPR24
  • GPR30
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR38
  • GPR54
  • GPR66
  • GPR7
  • GPR73
  • GPR73L1
  • GPR77
  • GPR8
  • GPRA
  • GR3
  • GRP
  • GRPR
  • HNFAG09
  • IL8
  • KEL
  • KIAA0604
  • KIAA1226
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG
  • KNG1
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCH
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MOR1
  • MSHR
  • MTLR
  • MTLR1
  • NLN
  • NMB
  • NMBR
  • NMS
  • NMU
  • NMU2R
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPW
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NPYR
  • NPYR5
  • NPYY1
  • NTRR
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OFQ
  • OOR
  • OPRD
  • OPRD1
  • OPRK
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • ORL1
  • PAR1
  • PAR2
  • PAR3
  • PAR4
  • PDYN
  • PENK
  • PGR14
  • PKR1
  • PKR2
  • PMCH
  • PNOC
  • PNP
  • POMC
  • PPL7
  • PPL8
  • PPNPB
  • PPNPW
  • PPY
  • PPYR1
  • PRH
  • PRLH
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SAP1
  • SERPINA8
  • SLC1
  • SLT
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR4
  • SSTR5
  • TGR1
  • TR
  • TRH
  • TRHR
  • URP
  • UTS2
  • UTS2B
  • UTS2D
  • UTS2R
  • XK
  • XKR1
  • XRG1
Homo sapiens (human)
Regulation of PTEN stability and activity
  • ADRM1
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • API3
  • BIRC4
  • C7orf76
  • CHIP
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • DEPDC2
  • DSS1
  • FRK
  • G5A
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IAP3
  • ISOT3
  • KIAA0093
  • KIAA0107
  • KIAA0459
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MKRN1
  • MMAC1
  • MOV34L
  • MSS1
  • NEDD4
  • NEDD4-1
  • NU
  • OTUD3
  • PARP5A
  • PARP5B
  • PARPL
  • PFAAP4
  • PKB
  • PKBG
  • POH1
  • PREX2
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PTEN
  • PTK5
  • RAC
  • RAK
  • RFP
  • RNF146
  • RNF61
  • RNF76
  • RPF1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • STUB1
  • SUG1
  • SUG2
  • TANK2
  • TBP1
  • TBP7
  • TEP1
  • TIN1
  • TINF1
  • TNKL
  • TNKS
  • TNKS1
  • TNKS2
  • TRAP2
  • TRIM27
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP13
  • WWP2
  • X
  • XIAP
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1
  • ADRM1
  • AIK
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK1
  • AIRK2
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • ARK1
  • ARK2
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BTAK
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C7orf76
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • DSS1
  • E2EPF
  • EAP1
  • FBXL1
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IAK1
  • KIAA0107
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • PLK
  • PLK1
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
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Homo sapiens (human)
Cdc20:Phospho-APC/C mediated degradation of Cyclin A
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Homo sapiens (human)
Assembly of the pre-replicative complex
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Homo sapiens (human)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin
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Homo sapiens (human)
CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6
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Homo sapiens (human)
Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C
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  • LMPY
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  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
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  • PSMC2
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  • PSMD11
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  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
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  • TBP7
  • TRAP2
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
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  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024