GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 976 - 1000 of 2074 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
NF-kB is activated and signals survival
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • MAD3
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • ORCA
  • OSIL
  • RELA
  • RNF85
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • TNFRSF16
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10
  • CASP10
  • CASP8
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FADD
  • FIP3
  • IFIH1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MCH4
  • MCH5
  • MDA5
  • MORT1
  • NEMO
  • RH116
  • RIGI
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • TCF16
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
NEP/NS2 Interacts with the Cellular Export Machinery
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARA24
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • CRM1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • M
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NP
  • NPAP60L
  • NS
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RAN
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
  • XPO1
Homo sapiens (human)
NEIL3-mediated resolution of ICLs
  • NEIL3
Homo sapiens (human)
NCAM1 interactions
  • AGRIN
  • AGRN
  • ALTPRP
  • ARTN
  • AXT
  • CACH1
  • CACH2
  • CACH3
  • CACN1
  • CACN2
  • CACN4
  • CACNA1C
  • CACNA1D
  • CACNA1G
  • CACNA1H
  • CACNA1I
  • CACNA1S
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNB3
  • CACNB4
  • CACNL1A1
  • CACNL1A2
  • CACNL1A3
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CACNLB3
  • CACNLB4
  • CCHL1A1
  • CCHL1A2
  • CNTN2
  • COL29A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • CSPG3
  • EVN
  • GDNF
  • GDNFRA
  • GDNFRB
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA4
  • KIAA1120
  • KIAA1123
  • MYSB
  • NCAM
  • NCAM1
  • NCAN
  • NEUR
  • NRTN
  • PRIP
  • PRNP
  • PRP
  • PSPN
  • PST
  • PST1
  • RETL1
  • RETL2
  • SIAT8B
  • SIAT8D
  • ST8SIA2
  • ST8SIA4
  • STX
  • TAG1
  • TAX1
  • TRNR1
  • TRNR2
  • VWA4
Homo sapiens (human)
NCAM signaling for neurite out-growth
  • BSPECV
  • ERK1
  • ERK2
  • FAK
  • FAK1
  • FYN
  • HRAS
  • HRAS1
  • HUBSPECV
  • HUSPECV
  • KIAA0302
  • KIAA1642
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MSK1
  • NCAM
  • NCAM1
  • NEAS
  • NRAS
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTK2
  • PTPA
  • PTPRA
  • PTPRL2
  • RPS6KA5
  • SCA5
  • SOS1
  • SPTA
  • SPTA1
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTB1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN3
  • SPTBN4
  • SPTBN5
Homo sapiens (human)
NADPH regeneration
  • ACO1
  • IDH1
  • IREB1
  • PICD
Homo sapiens (human)
NADE modulates death signalling
  • BEX3
  • CASP2
  • CASP3
  • CPP32
  • DXS6984E
  • ICH1
  • NADE
  • NEDD2
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • NGFRAP1
  • TNFRSF16
  • YWHAE
Homo sapiens (human)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • DER1
  • DERL1
  • ENGASE
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GCS1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • KIAA0088
  • KIAA0152
  • MLEC
  • MOGS
  • NGLY1
  • PNG1
  • PRKCSH
  • PSMC1
  • RAD23B
  • RNF45
  • RPS27A
  • SAKS1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN1
  • VCP
Homo sapiens (human)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • GGNT1
  • GLCT1
  • GLYT1
  • MANEA
  • MGAT
  • MGAT1
Homo sapiens (human)
N-Glycan antennae elongation
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CGS23
  • GGNT5
  • GGTB2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • NANTA3
  • SIAT1
  • SIAT4C
  • SIAT8B
  • SIAT8C
  • SIAT8F
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA6
  • STX
  • STZ
Homo sapiens (human)
Myogenesis
  • ABL
  • ABL1
  • BHLHB19
  • BHLHB20
  • BHLHB21
  • BHLHC1
  • BHLHC2
  • BHLHC3
  • BHLHC4
  • BNIP2
  • CAPR
  • CDC42
  • CDH14
  • CDH15
  • CDH2
  • CDH3
  • CDH4
  • CDHN
  • CDO
  • CDON
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CTNNA1
  • CTNNA2
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • E2A
  • ERK6
  • HEB
  • HSS
  • HTF4
  • IGDCC2
  • ITF1
  • ITF2
  • JTK7
  • KIAA0516
  • MAP2K6
  • MAPK11
  • MAPK12
  • MAPK14
  • MAPK8IP4
  • MEF2
  • MEF2A
  • MEF2B
  • MEF2C
  • MEF2D
  • MEK6
  • MKK6
  • MRF4
  • MXI2
  • MYF3
  • MYF4
  • MYF5
  • MYF6
  • MYOD
  • MYOD1
  • MYOG
  • NCAD
  • NEO1
  • NGN
  • NIP2
  • NTN2L
  • NTN3
  • PRKM11
  • PRKMK6
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SAPK3
  • SEF2
  • SKK3
  • SPAG9
  • SYD1
  • TCF12
  • TCF3
  • TCF4
  • XMEF2
Homo sapiens (human)
Myoclonic epilepsy of Lafora
  • EPM2A
  • EPM2B
  • GYG
  • GYG1
  • GYS
  • GYS1
  • NHLRC1
  • PPP1R3C
  • PPP1R5
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
MyD88:MAL(TIRAP) cascade initiated on plasma membrane
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ECSIT
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MD2
  • MEKK
  • MEKK1
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • RNF85
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • SIGIRR
  • SOCS1
  • SSI1
  • TIL4
  • TIP3
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TRAF6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
MyD88-independent TLR4 cascade
  • CD14
  • ESOP1
  • LY96
  • MD2
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
  • TRIF
Homo sapiens (human)
MyD88 dependent cascade initiated on endosome
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
MyD88 deficiency (TLR5)
  • MYD88
  • TIL3
  • TLR5
  • flaF
  • fliC
  • hag
Homo sapiens (human)
MyD88 deficiency (TLR2/4)
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
MyD88 cascade initiated on plasma membrane
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TIL3
  • TLR10
  • TLR5
  • TRAF6
  • flaF
  • fliC
  • hag
Homo sapiens (human)
Muscarinic acetylcholine receptors
  • CHRM1
  • CHRM2
  • CHRM3
  • CHRM4
  • CHRM5
Homo sapiens (human)
Multifunctional anion exchangers
  • DRA
  • DTD
  • DTDST
  • PDS
  • SAT1
  • SLC26A1
  • SLC26A11
  • SLC26A2
  • SLC26A3
  • SLC26A4
  • SLC26A6
  • SLC26A7
  • SLC26A9
  • SLC5A12
  • SMCT2
  • SUT2
Homo sapiens (human)
Mtb iron assimilation by chelation
  • GIG12
  • LF
  • LTF
  • Rv2895c
  • bfr
  • bfrA
  • bfrB
  • ftn
  • irtA
  • irtB
Homo sapiens (human)
Molybdenum cofactor biosynthesis
  • GPH
  • GPHN
  • KIAA1385
  • MCBPE
  • MOCO1
  • MOCOS
  • MOCS2
  • MOCS3
  • UBA4
Homo sapiens (human)
Molecules associated with elastic fibres
  • BMP10
  • BMP14
  • BMP2
  • BMP2A
  • BMP2B
  • BMP4
  • BMP7
  • C14orf141
  • CDMP1
  • DANCE
  • DVR4
  • EFEMP1
  • EFEMP2
  • FBLN1
  • FBLN2
  • FBLN3
  • FBLN4
  • FBLN5
  • FBNL
  • FNRB
  • GDF5
  • GP3A
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP2
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MAGP1
  • MAGP2
  • MDF2
  • MFAP2
  • MFAP3
  • MFAP4
  • MFAP5
  • MSK12
  • MSK8
  • OP1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • VNRA
  • VTN
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Modulation by Mtb of host immune system
  • B2M
  • CLEC13D
  • CLEC13DL
  • MRC1
  • MRC1L1
  • RPS27A
  • Rv2779c
  • TIL4
  • TLR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • esaT6
  • esxA
  • mptpA
  • phoS1
  • pstS1
  • ptpA
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024