GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1076 - 1100 of 2074 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
MGMT-mediated DNA damage reversal
  • MGMT
Homo sapiens (human)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • CRKL
  • GAB1
  • GGA3
  • HGF
  • HPTA
  • KIAA0154
  • MET
  • RAB4
  • RAB4A
  • RAB4B
Homo sapiens (human)
MET interacts with TNS proteins
  • CTEN
  • FNRB
  • HGF
  • HPTA
  • ITGB1
  • MDF2
  • MET
  • MSK12
  • TEM6
  • TENS1
  • TNS3
  • TNS4
  • TPP
Homo sapiens (human)
MET activates STAT3
  • APRF
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • STAT3
Homo sapiens (human)
MET activates RAS signaling
  • HGF
  • HPTA
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA1359
  • KIAA1464
  • MET
  • MUC20
  • NRAS
  • RANBP10
  • RANBP9
  • RANBPM
  • SOS1
Homo sapiens (human)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • CRKL
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRF2
  • HGF
  • HPTA
  • KIAA1771
  • KREV1
  • MET
  • RAC1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF1
  • TC25
Homo sapiens (human)
MET activates PTPN11
  • GAB1
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
Homo sapiens (human)
MET activates PTK2 signaling
  • CD49B
  • FAK
  • FAK1
  • FNRB
  • HGF
  • HPTA
  • ITGA2
  • ITGA3
  • ITGB1
  • KIAA0533
  • KIAA1907
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMA2
  • LAMA3
  • LAMA4
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC1
  • LAMC2
  • LAMC3
  • LAMM
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • LAMS
  • MDF2
  • MET
  • MSK12
  • MSK18
  • PTK2
  • SRC
  • SRC1
Homo sapiens (human)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • GAB1
  • GRB1
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Homo sapiens (human)
MET Receptor Activation
  • HAI1
  • HAI2
  • HGF
  • HGFAC
  • HPN
  • HPTA
  • KOP
  • MET
  • SPINT1
  • SPINT2
  • TMPRSS1
Homo sapiens (human)
MECP2 regulates transcription of neuronal ligands
  • BDNF
  • CRH
  • DLL1
  • HDAC1
  • RPD3L1
  • SIN3A
  • SST
Homo sapiens (human)
MECP2 regulates transcription of genes involved in GABA signaling
  • GAD
  • GAD1
  • GAD2
  • GAD65
  • GAD67
Homo sapiens (human)
MECP2 regulates transcription factors
  • A2BP
  • A2BP1
  • FOX1
  • HRNBP1
  • MEF2C
  • NR1C3
  • PPARG
  • RBFOX1
Homo sapiens (human)
MECP2 regulates neuronal receptors and channels
  • AIG6
  • FKBP5
  • FKBP51
  • GLUR2
  • GLUT3
  • GPRIN1
  • GRIA2
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GluA2
  • HDAC1
  • HDAC2
  • KIAA1893
  • MET
  • MOR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • OPRK
  • OPRK1
  • OPRM1
  • PTP1B
  • PTPN1
  • PTPN4
  • RPD3L1
  • SIN3A
  • SLC2A3
  • TRP3
  • TRPC3
Homo sapiens (human)
MDK and PTN in ALK signaling
  • ALK
  • HBNF1
  • HTPZP2
  • MDK
  • MK1
  • NEGF1
  • NEGF2
  • PTN
  • PTPRZ
  • PTPRZ1
  • PTPRZ2
  • PTPZ
Homo sapiens (human)
MASTL Facilitates Mitotic Progression
  • ARPP19
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ENSA
  • GW
  • GWL
  • KIAA1541
  • MASTL
  • P34CDC2
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R2D
  • THC2
Homo sapiens (human)
MAPK6/MAPK4 signaling
  • ADRM1
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AIB1
  • BHLHE39
  • BHLHE42
  • BORG1
  • BORG2
  • BORG3
  • C7orf76
  • CAGH26
  • CCND3
  • CDC10
  • CDC14A
  • CDC14B
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDC42
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP5
  • CDK1
  • CDKN1
  • CEP2
  • CEP3
  • CEP5
  • CRDBP
  • CRM1
  • DNAJ1
  • DNAJB1
  • DSS1
  • DUET
  • DUO
  • E1AF
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • ERK3
  • ERK4
  • ETV4
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • GP110
  • HAPIP
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HDJ1
  • HSP27
  • HSP28
  • HSPB1
  • HSPC
  • HSPF1
  • IGF2BP1
  • JUN
  • KALRN
  • KIAA0107
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • LMPX
  • LMPY
  • MAPK4
  • MAPK6
  • MAPKAPK5
  • MB1
  • MIP224
  • MOV10
  • MOV34L
  • MSS1
  • MYC
  • NCOA3
  • NU
  • OPHN3
  • P34CDC2
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PEA3
  • PFAAP4
  • PKACA
  • POH1
  • PRAK
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKM4
  • PRKM6
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RAC1
  • RAC3
  • RAG1
  • RAG2
  • RNF74
  • RPS27A
  • SEM1
  • SEPT7
  • SEPTIN7
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TC25
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TRAD
  • TRAM1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VICKZ1
  • X
  • XPO1
  • Y
  • Z
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
MAPK3 (ERK1) activation
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ERK1
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAP2K1
  • MAPK3
  • MEK1
  • P34CDC2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
MAPK1 (ERK2) activation
  • ERK2
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MEK2
  • MKK2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKMK2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
MAP3K8 (TPL2)-dependent MAPK1/3 activation
  • ABIN2
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • CHUK
  • COT
  • CUL1
  • EMC19
  • ESTF
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FIP3
  • FLIP1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • JNKK1
  • KIAA0696
  • MAP2K1
  • MAP2K4
  • MAP3K8
  • MEK1
  • MEK4
  • MKK4
  • NEMO
  • NFKB1
  • OCP2
  • PRKMK1
  • PRKMK4
  • RPS27A
  • SEK1
  • SERK1
  • SKK1
  • SKP1
  • SKP1A
  • TCEB1L
  • TCF16
  • TNIP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
MAP2K and MAPK activation
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IL17RD
  • IL17RLM
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • MAP2K1
  • MAP2K1IP1
  • MAP2K2
  • MAPBPIP
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKSP1
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MORG1
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • ROBLD3
  • SEF
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • WDR83
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
M-decay: degradation of maternal mRNAs by maternally stored factors
  • AGO2
  • BTG4
  • C2orf29
  • CAF1
  • CALIF
  • CCR4
  • CCR4B
  • CCR4a
  • CDC36
  • CDC39
  • CNOT1
  • CNOT10
  • CNOT11
  • CNOT2
  • CNOT3
  • CNOT4
  • CNOT6
  • CNOT6L
  • CNOT7
  • CNOT8
  • CNOT9
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DDX48
  • DICER
  • DICER1
  • EIF2C2
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4A3
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EPABP2
  • ERF2
  • HERNA
  • KIAA0111
  • KIAA0691
  • KIAA0928
  • KIAA1007
  • KIAA1194
  • KIAA1741
  • LENG2
  • NOT1
  • NOT2
  • NOT3
  • NOT4
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PABPN1L
  • PABPNL1
  • PAIP1
  • PC3B
  • POP2
  • RCD1
  • RNF162C
  • RQCD1
  • TAB182
  • TIS11D
  • TNKS1BP1
  • ZFP36L2
Homo sapiens (human)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • C9orf108
  • C9orf47
  • CHEDG1
  • EDG1
  • EDG2
  • EDG3
  • EDG4
  • EDG5
  • EDG6
  • EDG7
  • EDG8
  • GPR92
  • GPR93
  • KIAA0455
  • LPA1
  • LPA2
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • LPPR1
  • LPPR2
  • LPPR3
  • LPPR4
  • LPPR5
  • PAP2D
  • PHP1
  • PHP2
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • PRG1
  • PRG2
  • PRG3
  • PRG4
  • PRG5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
Homo sapiens (human)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • ADTB1
  • ADTG
  • AP19
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • AP4S1
  • APP
  • ARF1
  • ARR1
  • ARRB1
  • BAM22
  • BC2
  • BLOC1S1
  • BLOS1
  • C6orf212
  • C6orf213
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CLAPB2
  • CLAPG1
  • CLAPS1
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CLTNM
  • CLVS1
  • CLVS2
  • CNSA2
  • CRALBPL
  • CTSZ
  • DNAJC6
  • DNASE2
  • DNASE2A
  • DNL2
  • DNM2
  • DYN2
  • GCN5L1
  • GNS
  • HGS
  • HRS
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • KIAA0034
  • KIAA0473
  • M6PR
  • MPR46
  • MPRD
  • MUARP2
  • RLBP1L1
  • RLBP1L2
  • RT14
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • SYB2
  • SYBL1
  • TLP46
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP7
  • VAMP8
Homo sapiens (human)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • KIAA0935
  • LAMAN
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANA
  • MANA1
  • MANB
  • MANB1
  • MANBA
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: December 9, 2024