GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 451 - 475 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Pexophagy
  • 1A13B
  • ATM
  • BHLHE73
  • EPAS1
  • HIF2A
  • KIAA0049
  • M17S2
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • MOP2
  • NBR1
  • ORCA
  • OSIL
  • PASD2
  • PEX5
  • PXR1
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP30
Homo sapiens (human)
Aberrant regulation of mitotic exit in cancer due to RB1 defects
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • FBXL1
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • RB1
  • SFT
  • SKP2
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
Competing endogenous RNAs (ceRNAs) regulate PTEN translation
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • CAGH26
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MOV10
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • FRS3
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KS3
  • NRAS
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Tandem pore domain halothane-inhibited K+ channel (THIK)
  • KCNK13
Homo sapiens (human)
Activation of BID and translocation to mitochondria
  • BID
  • CASP8
  • CGL1
  • CSPB
  • CTLA1
  • GRB
  • GZMB
  • MCH5
  • NMT
  • NMT1
Homo sapiens (human)
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex
  • CCG2
  • D6S218E
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4C
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • PCID1
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • TRIP1
  • UBA80
  • UBCEP1
Homo sapiens (human)
RHO GTPases regulate CFTR trafficking
  • ABCC7
  • ARHQ
  • CAL
  • CFTR
  • FIG
  • GOPC
  • RASL7A
  • RHOQ
  • TC10
Homo sapiens (human)
Alpha-oxidation of phytanate
  • ACSVL1
  • FACVL1
  • FATP2
  • HACL1
  • HPCL
  • HPCL2
  • PAHX
  • PECR
  • PHYH
  • PHYH2
  • PMP34
  • SDR29C1
  • SLC25A17
  • SLC27A2
  • VLACS
Homo sapiens (human)
Regulation of ornithine decarboxylase (ODC)
  • ADRM1
  • AZIN1
  • C7orf76
  • DIA4
  • DSS1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NMOR1
  • NQO1
  • NU
  • OAZ
  • OAZ1
  • OAZ2
  • OAZ3
  • OAZI
  • OAZIN
  • ODC1
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer
  • ALK5
  • SKR4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
Defective GGT1 causes GLUTH
  • GGT
  • GGT1
Homo sapiens (human)
Defective CHST3 causes SEDCJD
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CHST3
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
Retinoid metabolism and transport
  • A2MR
  • AGRIN
  • AGRN
  • AKR1B10
  • AKR1B11
  • AKR1C1
  • AKR1C3
  • AKR1C4
  • APC2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • APOER2
  • APOM
  • APR
  • ARSDR1
  • BCDO
  • BCDO1
  • BCDO2
  • BCMO1
  • BCO1
  • BCO2
  • CHDR
  • CLPS
  • CRBP1
  • CRBP2
  • DDH
  • DDH1
  • G3A
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GPIHBP1
  • HBP1
  • HSD17B5
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0119
  • KIAA0468
  • LDLR
  • LIPD
  • LPL
  • LRAT
  • LRP1
  • LRP10
  • LRP12
  • LRP2
  • LRP8
  • NG20
  • OCI5
  • PALB
  • PGFS
  • PLB
  • PLB1
  • PNLIP
  • PPSIG
  • PSDR1
  • RBP1
  • RBP2
  • RBP4
  • RDH11
  • RETSAT
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SDR7C1
  • ST7
  • TTR
Homo sapiens (human)
ChREBP activates metabolic gene expression
  • ACAC
  • ACACA
  • ACACB
  • ACC1
  • ACC2
  • ACCA
  • ACCB
  • ACLY
  • AGPAT1
  • BHLHD13
  • BHLHD14
  • FAS
  • FASN
  • G15
  • MIO
  • MLX
  • MLXIPL
  • TCFL4
  • WBSCR14
Homo sapiens (human)
Truncations of AMER1 destabilize the destruction complex
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
CD28 co-stimulation
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • FYN
  • GADS
  • GRAP2
  • GRB2L
  • GRID
  • JTK8
  • LAB7
  • LCK
  • LYN
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
DAP12 interactions
  • B2M
  • CD158G
  • CD158I
  • CD158J
  • CD300B
  • CD300E
  • CD300LB
  • CD300LE
  • CD33L3
  • CD94
  • CLEC5A
  • CLECSF5
  • CLM2
  • CLM7
  • CMRF35A2
  • CMRF35A5
  • D12S2489E
  • DAP12
  • HLA-6.2
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • IREM2
  • IREM3
  • KARAP
  • KIR2DS2
  • KIR2DS4
  • KIR2DS5
  • KIR3DS1
  • KKA3
  • KLRC2
  • KLRD1
  • KLRK1
  • LMIR5
  • LY95
  • MDL1
  • NCR2
  • NKAT10
  • NKAT5
  • NKAT8
  • NKAT9
  • NKG2C
  • NKG2D
  • SIGLEC14
  • SIGLEC15
  • SIGLEC16
  • SIGLECP16
  • SIRPB1
  • TREM1
  • TREM2
  • TREM5
  • TYROBP
Homo sapiens (human)
COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • ARCN1
  • ARF1
  • ARF1GAP
  • ARF2
  • ARF3
  • ARF4
  • ARF5
  • ARFGAP1
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ATSV
  • BNIP1
  • C15orf22
  • C20orf23
  • C2orf20
  • C6orf102
  • CENPE
  • COPA
  • COPB
  • COPB1
  • COPB2
  • COPD
  • COPE
  • COPG
  • COPG1
  • COPG2
  • COPZ
  • COPZ1
  • COPZ2
  • EG5
  • ERD2.1
  • ERD2.2
  • ERD23
  • GAKIN
  • GBF1
  • GP25L2
  • HSET
  • KDELR1
  • KDELR2
  • KDELR3
  • KIAA0248
  • KIAA0359
  • KIAA0449
  • KIAA0591
  • KIAA0639
  • KIAA0706
  • KIAA1236
  • KIAA1448
  • KIAA1478
  • KIAA1590
  • KIAA1708
  • KID
  • KIF11
  • KIF12
  • KIF13B
  • KIF15
  • KIF16B
  • KIF18A
  • KIF18B
  • KIF19
  • KIF1A
  • KIF1B
  • KIF1C
  • KIF2
  • KIF20A
  • KIF20B
  • KIF21A
  • KIF21B
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF25
  • KIF26A
  • KIF26B
  • KIF27
  • KIF28P
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3
  • KIF3A
  • KIF3AP
  • KIF3B
  • KIF3C
  • KIF4
  • KIF4A
  • KIF4B
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIF5C
  • KIF6
  • KIF9
  • KIFAP3
  • KIFC1
  • KIFC2
  • KLC
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC2L
  • KLC3
  • KLC4
  • KLP2
  • KLP6
  • KNS
  • KNS1
  • KNS2
  • KNSL1
  • KNSL2
  • KNSL3
  • KNSL4
  • KNSL5
  • KNSL6
  • KNSL7
  • KNSL8
  • KRMP1
  • MGCRACGAP
  • MKLP1
  • MKLP2
  • MPHOSPH1
  • NAG
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NBAS
  • NIP1
  • NKHC1
  • NSF
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB6KIFL
  • RACGAP1
  • RINT1
  • RNP24
  • SEC20L
  • SEC22B
  • SEC22L1
  • SMAP
  • SNAPA
  • SNAPB
  • SNAPG
  • SNX23
  • STX18
  • SURF-4
  • SURF4
  • TMED10
  • TMED2
  • TMED3
  • TMED7
  • TMED9
  • TMP21
  • TRIP5
  • USE1
  • USE1L
  • ZNF289
  • ZW10
Homo sapiens (human)
Signaling by RAF1 mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • JAK2
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA0968
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • NRAS
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
RAS processing
  • ABHD17A
  • ABHD17B
  • ABHD17C
  • APT1
  • ARL2
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCLX
  • C19orf27
  • C9orf77
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CXorf11
  • DUB3
  • FACE2
  • FAM108A1
  • FAM108B1
  • FAM108C1
  • FNTA
  • FNTB
  • GCP16
  • GOLGA7
  • HRAS
  • HRAS1
  • ICMT
  • KRAS
  • KRAS2
  • LPL1
  • LYPLA1
  • NRAS
  • PCCMT
  • PDE6D
  • PDED
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • RASK2
  • RCE1
  • RCE1A
  • RCE1B
  • USP17
  • USP17H
  • USP17I
  • USP17J
  • USP17K
  • USP17L
  • USP17L2
  • USP17M
  • ZDHHC10
  • ZDHHC9
  • ZNF379
  • ZNF380
Homo sapiens (human)
G alpha (z) signalling events
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRA2L1
  • ADRA2L2
  • ADRA2R
  • ADRA2RL1
  • ADRA2RL2
  • ADRAR
  • GAIP
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAI3IP
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNAT3
  • GNAZ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCD
  • PKCE
  • PKCG
  • PKCL
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PRKCG
  • PRKCH
  • PRKCL
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS19
  • RGS20
  • RGS4
  • RGSL
  • RGSL1
  • RGSL2
  • RGSR
  • RGSZ1
  • RGSZ2
  • ZGAP1
Homo sapiens (human)
Methionine salvage pathway
  • ADI1
  • APIP
  • ENOPH1
  • GOT1
  • MASA
  • MRDI
  • MRI1
  • MSAP
  • MTAP
  • MTCBP1
Homo sapiens (human)
Defective DPM1 causes CDG-1e
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KS3
  • PLC1
  • PLCG1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: December 9, 2024