GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1726 - 1750 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Z-decay: degradation of maternal mRNAs by zygotically expressed factors
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DDX48
  • DIS3L2
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4A3
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • FAM6A
  • HS2
  • KIAA0111
  • KIAA0191
  • KIAA1711
  • PAB1
  • PAB2
  • PABP
  • PABP1
  • PABP2
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PABPN1
  • PAIP1
  • TUT4
  • TUT7
  • ZCCHC11
  • ZCCHC6
Homo sapiens (human)
Synthesis of PIPs at the ER membrane
  • KIAA0851
  • KIAA1073
  • MTMR2
  • MTMR5
  • PI4K2B
  • PI4KA
  • PIK4
  • PIK4CA
  • SAC1
  • SACM1L
  • SBF1
Homo sapiens (human)
G2/M Checkpoints
  • ADRM1
  • C7orf76
  • DSS1
  • GP110
  • GTSE1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • P53
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Defective MMAB causes MMA, cblB type
  • MMAB
Homo sapiens (human)
GSD 0 (muscle)
  • GYG
  • GYG1
  • GYS
  • GYS1
Homo sapiens (human)
Formation of HIV-1 elongation complex containing HIV-1 Tat
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCNH
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • tat
Homo sapiens (human)
Rev-mediated nuclear export of HIV RNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARA24
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • CHC1
  • CRM1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1835
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RAN
  • RANBP1
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC1
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
  • XPO1
  • rev
Homo sapiens (human)
Neurexins and neuroligins
  • APBA1
  • APBA2
  • APBA3
  • BEGAIN
  • C14orf60
  • C8orf68
  • CASK
  • CMAP
  • CORTBP1
  • DAL1
  • DAP1
  • DAP2
  • DAP3
  • DAP4
  • DBNL
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • DLGAP1
  • DLGAP2
  • DLGAP3
  • DLGAP4
  • E41P
  • E6TP1
  • ENH
  • EPB41
  • EPB41L1
  • EPB41L2
  • EPB41L3
  • EPB41L5
  • ERICH1-AS1
  • GKAP
  • GPRC1A
  • GPRC1E
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GRM1
  • GRM5
  • GluN2D
  • HOMER1
  • HOMER2
  • HOMER3
  • KIAA0338
  • KIAA0416
  • KIAA0440
  • KIAA0578
  • KIAA0743
  • KIAA0921
  • KIAA0951
  • KIAA0964
  • KIAA0987
  • KIAA1022
  • KIAA1070
  • KIAA1232
  • KIAA1260
  • KIAA1366
  • KIAA1446
  • KIAA1480
  • KIAA1548
  • KIAA1650
  • LIN2
  • LIN7A
  • LIN7B
  • LIN7C
  • LRRN2
  • LRRTM1
  • LRRTM2
  • LRRTM3
  • LRRTM4
  • MALS1
  • MALS2
  • MALS3
  • MGLUR1
  • MGLUR5
  • MINT1
  • MINT2
  • MINT3
  • NL3
  • NLGN1
  • NLGN2
  • NLGN3
  • NLGN4
  • NLGN4X
  • NLGN4Y
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • NRXN1
  • NRXN2
  • NRXN3
  • PCANAP7
  • PDLIM5
  • PROSAP1
  • PROSAP2
  • PSAP2
  • PSD95
  • SAPAP4
  • SH3P7
  • SHANK1
  • SHANK2
  • SHANK3
  • SHARPIN
  • SIPA1L1
  • SIPL1
  • STX1
  • STX1A
  • STXBP1
  • SVP65
  • SYN47
  • SYT
  • SYT1
  • SYT10
  • SYT12
  • SYT2
  • SYT7
  • SYT9
  • UNC18A
  • VELI1
  • VELI2
  • VELI3
  • X11
  • X11L
  • X11L2
Homo sapiens (human)
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • API1
  • API2
  • APO3L
  • BAFF
  • BAFFR
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLYS
  • BR3
  • CAP-1
  • CD40L
  • CD40LG
  • CRAF1
  • D12S370
  • DR3LG
  • FN14
  • HVEML
  • LIGHT
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • MIHB
  • MIHC
  • NIK
  • OPGL
  • RANK
  • RANKL
  • RNF48
  • RNF49
  • TALL1
  • TNFB
  • TNFC
  • TNFCR
  • TNFR3
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF3
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF20
  • TNFSF3
  • TNFSF5
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRANCE
  • TRAP
  • TRAP3
  • ZTNF4
Homo sapiens (human)
Transport and synthesis of PAPS
  • ATPSK1
  • ATPSK2
  • C6orf196
  • DTD
  • DTDST
  • PAPSS
  • PAPSS1
  • PAPSS2
  • PAPST1
  • PAPST2
  • SAT1
  • SLC26A1
  • SLC26A2
  • SLC35B2
  • SLC35B3
Homo sapiens (human)
Defective MOGS causes CDG-2b
  • GCS1
  • MOGS
Homo sapiens (human)
Defective SLC5A1 causes congenital glucose/galactose malabsorption (GGM)
  • NAGT
  • SGLT1
  • SLC5A1
Homo sapiens (human)
IL-6-type cytokine receptor ligand interactions
  • BSF3
  • CLC
  • CLCF1
  • CNTF
  • CNTFR
  • CRL3
  • CRLF1
  • CTF1
  • GPL
  • HILDA
  • IL11
  • IL11RA
  • IL31
  • IL31RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • LIF
  • LIFR
  • NNT1
  • OSM
  • OSMR
  • OSMRB
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • ALTPRP
  • APP
  • ARSA
  • ASNA1
  • BAG6
  • BAT3
  • C7orf20
  • CAML
  • CAMLG
  • CEE
  • CHD5
  • DXS254E
  • EDMD
  • EMD
  • FER1L2
  • G3
  • GDX
  • GET1
  • GET2
  • GET3
  • GET4
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • OTOF
  • PRIP
  • PRNP
  • PRP
  • RAMP4
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SERP1
  • SGT
  • SGT1
  • SGTA
  • STA
  • STX1
  • STX1A
  • STX5
  • STX5A
  • SYB2
  • TRC35
  • TRC40
  • UBL4
  • UBL4A
  • VAMP2
  • VAP33
  • VAPA
  • WRB
Homo sapiens (human)
Insulin receptor recycling
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6E1
  • ATP6E2
  • ATP6EL2
  • ATP6F
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6G2
  • ATP6G3
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6J
  • ATP6L
  • ATP6M
  • ATP6N1
  • ATP6N1A
  • ATP6N1B
  • ATP6N1C
  • ATP6N2
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A3
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V0E2L
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1EL2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • ATPL
  • C7orf32
  • CPSD
  • CTSD
  • IDE
  • INS
  • INSR
  • LAR
  • NG38
  • PTP1B
  • PTPN1
  • PTPRF
  • TCIRG1
  • VATB
  • VATC
  • VATD
  • VATF
  • VATPS1
  • VPATPD
  • VPP1
  • VPP2
  • VPP3
  • XAP3
Homo sapiens (human)
STAT5 Activation
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • GAB2
  • KIAA0571
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STK1
Homo sapiens (human)
Defective DPM2 causes CDG-1u
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
Ligand-dependent caspase activation
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD14
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • ESOP1
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • LY96
  • MC159L
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • ORF71
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAM
  • TRAP3
  • TRICK2
  • TRIF
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
tRNA processing in the nucleus
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARA24
  • ARCH
  • C14orf166
  • C1orf19
  • C22orf28
  • C2orf49
  • C6orf135
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CAT60
  • CG1
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF160
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CSTF2
  • D3S1231E
  • DDX1
  • ELAC2
  • FAM98B
  • HEAB
  • HPC2
  • KIAA0023
  • KIAA0061
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • LENG5
  • MP44
  • MRNP41
  • NAR
  • NDC1
  • NEB1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • POP1
  • POP4
  • POP5
  • POP7
  • RAE1
  • RAN
  • RANBP2
  • RNASEP1
  • RNASEP2
  • RPP14
  • RPP20
  • RPP21
  • RPP25
  • RPP29
  • RPP30
  • RPP38
  • RPP40
  • RTCB
  • RTRAF
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEN15
  • SEN2
  • SEN34
  • SEN54
  • TMEM48
  • TPR
  • TRNT1
  • TSEN15
  • TSEN2
  • TSEN34
  • TSEN54
  • XPOT
  • ZBTB8OS
Homo sapiens (human)
TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CHUK
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • EBI6
  • FIP2
  • FIP3
  • GLC1E
  • GNB2L1
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0733
  • KIAA0757
  • KIAA0849
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • NRP
  • OPTN
  • OTDC1
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • PD1
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF54
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SPATA2
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBCE7IP3
  • UBP41
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
Homo sapiens (human)
RHOBTB2 GTPase cycle
  • 99D8.1
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • BAT1
  • CCT2
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT7
  • CCTB
  • CCTH
  • CCTZ
  • CDC37
  • CDC37A
  • CUL3
  • D0S117E
  • DBC2
  • DBN1
  • DCAF14
  • DDX39B
  • HNRNPC
  • HNRPC
  • HNRPG
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0389
  • KIAA0617
  • KIAA0717
  • MSI2
  • MYO6
  • NDR1
  • NIP7-1
  • PHIP
  • PTK9
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RHOBTB2
  • SFRS10
  • SRM160
  • SRRM1
  • STK38
  • TMOD3
  • TRA2B
  • TRP32
  • TWF1
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UAP56
  • WDR11
Homo sapiens (human)
DAG and IP3 signaling
  • AHCYL1
  • DCAL
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • PKCD
  • PKCE
  • PLC1
  • PLCG1
  • PRKCD
  • PRKCE
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
Fatty Acids bound to GPR40 (FFAR1) regulate insulin secretion
  • FFAR1
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GPR40
  • KIAA0581
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol
  • ABCB11
  • ACOT8
  • ACOX2
  • ACSB
  • ACSVL1
  • ACSVL6
  • ACTEIII
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • AKR1C3
  • AKR1C4
  • AKR1D1
  • AMACR
  • BAAT
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BSEP
  • CHDR
  • CYP12
  • CYP27
  • CYP27A1
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • CYP8B1
  • DDH
  • DDH1
  • DDH2
  • EDH17B4
  • FACVL1
  • FACVL3
  • FATP2
  • FATP5
  • FXR
  • HRR1
  • HSD17B4
  • HSD17B5
  • HSD3B7
  • KIAA0119
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • PGFS
  • PTE1
  • RIP14
  • RXRA
  • SDR8C1
  • SLC27A2
  • SLC27A5
  • SRC1
  • SRC2
  • SRD5B1
  • TIF2
  • VLACS
Homo sapiens (human)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • MAN1A1
  • MAN1A2
  • MAN1A3
  • MAN1B
  • MAN1C
  • MAN1C1
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024