GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R)
  • CILP
  • IBP1
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
Homo sapiens (human)
Defective F8 accelerates dissociation of the A2 domain
  • F8
  • F8C
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 in disease
  • BEK
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR2
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KGFR
  • KS3
  • KSAM
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • SOS1
Homo sapiens (human)
BDNF activates NTRK2 (TRKB) signaling
  • BDNF
  • NTRK2
  • TRKB
Homo sapiens (human)
Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling
  • CSF2
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • GMCSF
  • GRB1
  • HCP
  • IL3
  • IL3R
  • IL3RA
  • IL3RB
  • IL5
  • IL5R
  • IL5RA
  • IL5RB
  • JAK2
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKACA
  • PRKACA
  • PSCTK4
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SHPTP2
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV
  • VAV1
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Organic cation transport
  • AML1
  • BWR1A
  • BWSCR1A
  • CBFA2
  • EMTH
  • ETT
  • FLIPT1
  • HET
  • IMPT1
  • ITM
  • OCT1
  • OCT2
  • OCT3
  • OCT6
  • OCTN1
  • OCTN2
  • ORCTL2
  • RSC1A1
  • RUNX1
  • SLC22A1
  • SLC22A15
  • SLC22A16
  • SLC22A18
  • SLC22A1L
  • SLC22A2
  • SLC22A3
  • SLC22A4
  • SLC22A5
  • TSSC5
  • UT2H
Homo sapiens (human)
GABA B receptor activation
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GPR51
  • GPRC3A
  • GPRC3B
Homo sapiens (human)
Role of phospholipids in phagocytosis
  • AHCYL1
  • C14orf175
  • CD16A
  • CD32
  • CD3G
  • DCAL
  • DPPL1
  • DPPL2
  • FCG1
  • FCG2
  • FCG3
  • FCGR1
  • FCGR1A
  • FCGR2A
  • FCGR2A1
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • GRB1
  • HTPAP
  • IGFR1
  • IGFR2
  • IGFR3
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKCD
  • PKCE
  • PLA2G6
  • PLC1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD3
  • PLD4
  • PLPLA9
  • PLPP4
  • PLPP5
  • PPAPDC1
  • PPAPDC1A
  • PPAPDC1B
  • PRKCD
  • PRKCE
  • SYK
  • T3G
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
ponatinib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • ARL6IP5
  • ATA2
  • BNPI
  • BZRAP1
  • CPLX1
  • DERP11
  • EAAC1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • EAAT3
  • EAAT4
  • EAAT5
  • GA
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLS
  • GLS1
  • GLS2
  • GLT1
  • HEAAC1
  • JWA
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0838
  • KIAA0897
  • KIAA1382
  • LIP1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • PRA2
  • PRAF3
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SAT2
  • SLC17A7
  • SLC1A1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC1A6
  • SLC1A7
  • SLC38A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • SNAT2
  • STX1
  • STX1A
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VGLUT1
Homo sapiens (human)
TRAIL signaling
  • APO2
  • APO2L
  • CASH
  • CASP10
  • CASP8
  • CASP8AP1
  • CFLAR
  • CLARP
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • KILLER
  • MCH4
  • MCH5
  • MORT1
  • MRIT
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10D
  • TNFSF10
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Defective MAN1B1 causes MRT15
  • MAN1B1
Homo sapiens (human)
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4B
  • EIF4C
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EIF4H
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0038
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PCID1
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRIP1
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WBSCR1
  • WSCR1
Homo sapiens (human)
Platelet Aggregation (Plug Formation)
  • F2
  • F8VWF
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • MGDF
  • MPL
  • THPO
  • TPOR
  • VWF
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A18 may confer susceptibility to iminoglycinuria and/or hyperglycinuria
  • B0AT3
  • SLC6A18
  • XTRP2
Homo sapiens (human)
Ketone body catabolism
  • ACAT
  • ACAT1
  • BDH
  • BDH1
  • MAT
  • OXCT
  • OXCT1
  • OXCT2
  • SCOT
  • SDR9C1
Homo sapiens (human)
TGF-beta receptor signaling activates SMADs
  • ALK5
  • C14orf141
  • CBL
  • CBL2
  • DPC4
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • FNRB
  • FUR
  • FURIN
  • GP3A
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP2
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • NEDD8
  • PACE
  • PCSK3
  • RNF55
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TGFBR3
  • UBC12
  • UBE2M
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
PDGFR mutants bind TKIs
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)
Late endosomal microautophagy
  • ABCC7
  • ADFP
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • BC2
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C9orf28
  • CEN1
  • CETN
  • CETN1
  • CFBP
  • CFTR
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HBB
  • HCRP1
  • HDAC6
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • IFT88
  • KIAA0402
  • KIAA0901
  • M6PRBP1
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NEDF
  • PARK7
  • PCNT
  • PCNT2
  • PLIN2
  • PLIN3
  • PML39
  • RIB1
  • RNASE1
  • RNS1
  • RPS27A
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • TG737
  • TIP47
  • TSG101
  • TTC10
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • WBSCR24
Homo sapiens (human)
Regulation of FOXO transcriptional activity by acetylation
  • AFX
  • AFX1
  • CBP
  • CREBBP
  • EP300
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • KAT2B
  • MLLT7
  • P300
  • PCAF
  • SIR2L1
  • SIR2L3
  • SIRT1
  • SIRT3
  • TRDX
  • TRX
  • TRX1
  • TXN
  • TXNIP
  • VDUP1
Homo sapiens (human)
Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors
  • ACTN2
  • APBA1
  • BCL8B
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CASK
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GRIN3A
  • GRIN3B
  • GluN2D
  • KIAA0968
  • KIAA1232
  • KIAA1365
  • KIAA1405
  • KIAA1544
  • KIAA1973
  • KIF17
  • KIF3X
  • LAP1
  • LIN2
  • LIN7A
  • LIN7B
  • LIN7C
  • LRRC7
  • LYST2
  • MALS1
  • MALS2
  • MALS3
  • MINT1
  • NBEA
  • NEFL
  • NF68
  • NFL
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • PSD95
  • VELI1
  • VELI2
  • VELI3
  • X11
Homo sapiens (human)
OADH complex synthesizes glutaryl-CoA from 2-OA
  • DHTKD1
  • DLD
  • DLST
  • DLTS
  • GCSL
  • KIAA1630
  • LAD
  • PHE3
Homo sapiens (human)
linifanib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
HDR through Homologous Recombination (HRR)
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CHRAC17
  • CTIP
  • DINB1
  • DNA2
  • DNA2L
  • DPE2
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0039
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PCNA
  • PIR51
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLH
  • POLK
  • RAD30
  • RAD30A
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WRN
  • XPV
  • XRCC2
  • XRCC3
Homo sapiens (human)
PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • CHRAC17
  • DPE2
  • FEN1
  • HAP1
  • KIAA0039
  • LIG1
  • PCNA
  • POLB
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • RAD2
  • REF1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: December 9, 2024