GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Integration of energy metabolism
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
Homo sapiens (human)
Laminin interactions
  • CD49B
  • COL18A1
  • FNRB
  • HSPG2
  • ITGA1
  • ITGA2
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGA7
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB4
  • KIAA0533
  • KIAA1907
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMA2
  • LAMA3
  • LAMA4
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC1
  • LAMC2
  • LAMC3
  • LAMM
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • LAMS
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK18
  • MSK8
  • NID
  • NID1
  • NID2
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Orexin and neuropeptides FF and QRFP bind to their respective receptors
  • GPR103
  • GPR147
  • GPR74
  • HCRT
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • NPFF
  • NPFF1
  • NPFF2
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • NPGPR
  • OX
  • PPORX
  • PPOX
  • QRFP
  • QRFPR
Homo sapiens (human)
N-Glycan antennae elongation
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CGS23
  • GGNT5
  • GGTB2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • NANTA3
  • SIAT1
  • SIAT4C
  • SIAT8B
  • SIAT8C
  • SIAT8F
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA6
  • STX
  • STZ
Homo sapiens (human)
Transport to the Golgi and subsequent modification
  • ERGIC53
  • F5F8D
  • LMAN1
  • MCFD2
  • SDNSF
Homo sapiens (human)
Intracellular metabolism of fatty acids regulates insulin secretion
  • ACS3
  • ACS4
  • ACSL3
  • ACSL4
  • CD36
  • FACL3
  • FACL4
  • GP3B
  • GP4
  • LACS3
  • LACS4
Homo sapiens (human)
Synthesis of pyrophosphates in the cytosol
  • APS1
  • APS2
  • C9orf12
  • DIPP
  • DIPP1
  • DIPP2
  • DIPP3A
  • DIPP3B
  • HISPPD1
  • HISPPD2A
  • IHPK1
  • IHPK3
  • IP6K
  • IP6K1
  • IP6K3
  • IPPK
  • IPS1
  • ITPK1
  • KIAA0263
  • KIAA0377
  • KIAA0433
  • KIAA0487
  • NUDT10
  • NUDT11
  • NUDT3
  • NUDT4
  • PPIP5K1
  • PPIP5K2
  • VIP1
  • VIP2
Homo sapiens (human)
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF)
  • ASF1A
  • CABIN1
  • CAGH32
  • DGCR1
  • EP400
  • H1-0
  • H1-1
  • H1-2
  • H1-3
  • H1-4
  • H1-5
  • H1F0
  • H1F1
  • H1F2
  • H1F3
  • H1F4
  • H1F5
  • H1FV
  • HIR
  • HIRA
  • HIST1H1A
  • HIST1H1B
  • HIST1H1C
  • HIST1H1D
  • HIST1H1E
  • HMGA1
  • HMGA2
  • HMGIC
  • HMGIY
  • KIAA0330
  • KIAA1498
  • KIAA1818
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • P53
  • RB1
  • TNRC12
  • TP53
  • TUPLE1
  • UBN1
Homo sapiens (human)
ISG15 antiviral mechanism
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARI
  • ARIH1
  • BECN1
  • BLU
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CEB1
  • CEBP1
  • CG1
  • D3S1231E
  • DAP5
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DDX48
  • DDX58
  • EFP
  • EIF2AK2
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4A3
  • EIF4E
  • EIF4E2
  • EIF4E3
  • EIF4EL1
  • EIF4EL3
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4G2
  • EIF4G3
  • EIF4GI
  • ERK1
  • FLN1L
  • FLN3
  • FLNB
  • G10P1
  • G1P2
  • GT197
  • HERC5
  • IFI56
  • IFIT1
  • IFNAI1
  • IRF3
  • ISG15
  • ISG43
  • ISG56
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • KIAA0023
  • KIAA0093
  • KIAA0095
  • KIAA0111
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • KPNA2
  • KPNA3
  • KPNA4
  • KPNA5
  • KPNA7
  • KPNB1
  • MAPK3
  • MOP6
  • MP44
  • MRNP41
  • MX1
  • MX2
  • NDC1
  • NEDD4
  • NEDD4-1
  • NPAP60L
  • NS
  • NTF97
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • PIN1
  • PKR
  • PLC1
  • PLCG1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • PP2CB
  • PPM1B
  • PRKM3
  • PRKR
  • QIP1
  • QIP2
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH1
  • RCH2
  • RIGI
  • RNF147
  • RPF1
  • RPS27A
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SRP1
  • STAT1
  • TABP
  • TAP
  • TMEM48
  • TPR
  • TRIM25
  • UBA52
  • UBA7
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH6
  • UBCH7BP
  • UBCH8
  • UBE1L
  • UBE2
  • UBE2E1
  • UBE2L6
  • UBE2N
  • UCRP
  • USP18
  • ZNF147
  • gag
Homo sapiens (human)
FASTK family proteins regulate processing and stability of mitochondrial RNAs
  • CPR2
  • FASTKD2
  • FASTKD4
  • FASTKD5
  • KIAA0948
  • KIAA0971
  • KIAA1792
  • TBRG4
Homo sapiens (human)
Clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ADHR
  • ADRB2
  • ADRB2R
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AF1P
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AGTR1A
  • AGTR1B
  • AMPH
  • AMPH1
  • AMPHL
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • ARB2
  • ARC16
  • ARC20
  • ARC21
  • ARC34
  • AREG
  • AREGB
  • ARF1GAP
  • ARF6
  • ARFGAP1
  • ARH
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • ARVP
  • AT2R1
  • AT2R1B
  • AVP
  • AVPR2
  • B2AR
  • BIN1
  • BTC
  • C1orf39
  • CALM
  • CBL
  • CBL2
  • CD36L2
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CIN85
  • CIP4
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLH22
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL
  • CLTCL1
  • CLTCL2
  • CLTD
  • CNSA1
  • CNSA2
  • CNSA3
  • CTTN
  • DAB2
  • DIR
  • DIR3
  • DNAJC26
  • DNAJC6
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DOC2
  • DTR
  • DTS
  • DVL2
  • DYN2
  • EGF
  • EGFR
  • EMS1
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EPS15R
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • FBP17
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FZD4
  • GAK
  • GAPEX5
  • GAPVD1
  • GLUT8
  • GLUTX1
  • HBEGF
  • HBP
  • HEGFL
  • HER1
  • HGS
  • HIP1
  • HIP12
  • HIP1R
  • HIP9
  • HRB
  • HRS
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • HYPJ
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0034
  • KIAA0080
  • KIAA0109
  • KIAA0290
  • KIAA0319
  • KIAA0348
  • KIAA0473
  • KIAA0554
  • KIAA0589
  • KIAA0655
  • KIAA0656
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • KIAA0910
  • KIAA1048
  • KIAA1065
  • KIAA1256
  • KIAA1379
  • KIAA1521
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIMP2
  • LIMPII
  • LRP2
  • M6PR
  • MPR46
  • MPRD
  • MPRI
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NK1R
  • OCRL
  • OCRL1
  • PACSIN1
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • POB1
  • RAB
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RABL
  • RAP6
  • REPS1
  • REPS2
  • RIP
  • RNF55
  • RPS27A
  • SALF
  • SBLF
  • SCARB2
  • SDGF
  • SGIP1
  • SH3D1A
  • SH3D1B
  • SH3D2A
  • SH3D2B
  • SH3D2C
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SH3PX1
  • SH3PXD3A
  • SH3PXD3B
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • SNX18
  • SNX9
  • SOP2L
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • STN1
  • STN2
  • STNB
  • STON1
  • STON2
  • STOT
  • STP
  • SVP65
  • SWAP
  • SYB2
  • SYB3
  • SYBL1
  • SYNJ1
  • SYNJ2
  • SYT
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • SYT9
  • T3D
  • T3G
  • TAC1R
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TGN46
  • TGN51
  • TGOLN2
  • TOCA1
  • TRIP10
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • V2R
  • VACHT
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • VP
  • WASL
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Type II Na+/Pi cotransporters
  • NPT2
  • NPT2C
  • NPTIIC
  • SLC17A2
  • SLC34A1
  • SLC34A2
  • SLC34A3
Homo sapiens (human)
RHO GTPases Activate NADPH Oxidases
  • CAGA
  • CAGB
  • CFAG
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CYBA
  • CYBB
  • ERK1
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPK3
  • MOX1
  • MOX2
  • MRP14
  • MRP8
  • MXI2
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOH1
  • NOX1
  • NOX2
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXA2
  • NOXO1
  • NOXO2
  • P41NOX
  • P51NOX
  • P67PHOX
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIN1
  • PKC2
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCD
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCD
  • PRKCZ
  • PRKM1
  • PRKM11
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RAC1
  • RAC2
  • S100A8
  • S100A9
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SH3PXD1A
  • SH3PXD4
  • SH3PXD5
  • TC25
  • VPS15
  • VPS34
Homo sapiens (human)
Interleukin-2 family signaling
  • HAVCR2
  • LGALS9
  • TIM3
  • TIMD3
Homo sapiens (human)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ADHR
  • ADRB2
  • ADRB2R
  • ADRBK1
  • ADRBK2
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AF1P
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AGTR1A
  • AGTR1B
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • ARB2
  • AREG
  • AREGB
  • ARH
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • ARVP
  • AT2R1
  • AT2R1B
  • AVP
  • AVPR2
  • B2AR
  • BARK
  • BARK1
  • BARK2
  • BTC
  • CALM
  • CBL
  • CBL2
  • CD36L2
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CIN85
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLH22
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL
  • CLTCL1
  • CLTCL2
  • CLTD
  • CNSA1
  • CNSA2
  • CNSA3
  • COPS1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSN1
  • CSN2
  • CSN3
  • CSN4
  • CSN5
  • CSN6
  • CSN7A
  • CSN7B
  • CSN8
  • DA41
  • DAB2
  • DERP10
  • DIR
  • DIR3
  • DOC2
  • DQ1
  • DQ2
  • DTR
  • DTS
  • DVL2
  • DYT1
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EPS15R
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FZD4
  • GLUT8
  • GLUTX1
  • GPS1
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HBP
  • HEGFL
  • HER1
  • HGS
  • HIP9
  • HRB
  • HRS
  • HVIP
  • HYPJ
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN
  • ITSN1
  • ITSN2
  • JAB1
  • KIAA0034
  • KIAA0080
  • KIAA0109
  • KIAA0290
  • KIAA0319
  • KIAA0656
  • KIAA0899
  • KIAA1048
  • KIAA1065
  • KIAA1256
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIMP2
  • LIMPII
  • LRP2
  • M6PR
  • MPR46
  • MPRD
  • MPRI
  • N4BP4
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • NK1R
  • PICALM
  • PLIC1
  • PLIC2
  • POB1
  • RAB
  • REPS1
  • REPS2
  • RIP
  • RNF55
  • RPS27A
  • SALF
  • SBLF
  • SCARB2
  • SDGF
  • SGIP1
  • SH3D1A
  • SH3D1B
  • SH3D2A
  • SH3D2B
  • SH3D2C
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • STN1
  • STN2
  • STNB
  • STON1
  • STON2
  • SVP65
  • SWAP
  • SYB2
  • SYB3
  • SYBL1
  • SYT
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • SYT9
  • T3D
  • T3G
  • TA
  • TAC1R
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TGN46
  • TGN51
  • TGOLN2
  • TOR1A
  • TOR1B
  • TORA
  • TRIP15
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBQLN1
  • UBQLN2
  • V2R
  • VACHT
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • VP
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Displacement of DNA glycosylase by APEX1
  • AAG
  • ANPG
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • MBD4
  • MED1
  • MID1
  • MMH
  • MPG
  • MUTM
  • NTH1
  • NTHL1
  • OCTS3
  • OGG1
  • OGH1
  • REF1
  • SMUG1
  • TDG
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through the activation of Adenylate Cyclase
  • ADCY1
  • ADCY8
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PKX1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PRKX
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Transport of glycerol from adipocytes to the liver by Aquaporins
  • AQP7
  • AQP7L
  • AQP9
  • SSC1
Homo sapiens (human)
Somitogenesis
  • ADRM1
  • BHLHB37
  • BHLHC6
  • C6orf159
  • C7orf76
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DLL1
  • DLL3
  • DSS1
  • EPHA4
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEK8
  • HES7
  • HSPC
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KIAA0107
  • LEF1
  • LFNG
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MESP2
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSGN1
  • MSS1
  • NOTCH1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RIPPLY2
  • SCDO2
  • SEK
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TAN1
  • TBP1
  • TBP7
  • TBX6
  • TRAP2
  • TYRO1
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence
  • ACD
  • ATM
  • CAGH32
  • CAP20
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
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  • TRF1
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  • p27
Homo sapiens (human)
Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs)
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  • TR
Homo sapiens (human)
Sorafenib-resistant PDGFR mutants
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)
snRNP Assembly
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
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Homo sapiens (human)
MTF1 activates gene expression
  • CSRP
  • CSRP1
  • CYRP
  • MTF1
  • SNCB
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II Transcription Elongation
  • AF5Q31
  • AF9
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  • BTF2
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  • C19orf17
  • C1orf28
  • C6orf175
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  • CCNK
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Last updated: December 9, 2024