GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1626 - 1650 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
FGFR1c and Klotho ligand binding and activation
  • FGF23
  • HYPF
Homo sapiens (human)
Activation of the phototransduction cascade
  • CNCG
  • CNCG1
  • CNCG2
  • CNCG3L
  • CNCG4
  • CNGA1
  • CNGB1
  • GNAT1
  • GNATR
  • GNB1
  • GNGT1
  • KIAA0702
  • NCKX1
  • OPN2
  • PDE6A
  • PDE6B
  • PDE6G
  • PDEA
  • PDEB
  • PDEG
  • RCNC2
  • RHO
  • SAG
  • SLC24A1
Homo sapiens (human)
Interferon gamma signaling
  • ATDC
  • B2M
  • BERP
  • C6orf13
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CD44
  • CES1
  • CIITA
  • CIS3
  • EFP
  • ERK1
  • ERK2
  • FCG1
  • FCGR1
  • FCGR1A
  • FCGR1B
  • FCGR1BP
  • FXY
  • GBP1
  • GBP2
  • GBP3
  • GBP4
  • GBP4L
  • GBP5
  • GBP6
  • GBP7
  • GC109
  • GERP
  • GILT
  • HCP
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HLASB
  • HLS5
  • ICAM1
  • ICSBP1
  • IFI30
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • IFNGT1
  • IFP1
  • IGFR1
  • IGFRB
  • IP30
  • IRF1
  • IRF2
  • IRF3
  • IRF4
  • IRF5
  • IRF6
  • IRF7
  • IRF8
  • IRF9
  • ISGF3G
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • KIAA0129
  • KIAA0517
  • KIAA0968
  • KIAA1098
  • LHR
  • MADH7
  • MADH8
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDU2
  • MDU3
  • MHC2TA
  • MIC4
  • MID1
  • MT2
  • MT2A
  • MUM1
  • MYL
  • NCAM
  • NCAM1
  • NSEP1
  • OAS1
  • OAS2
  • OAS3
  • OASL
  • OIAS
  • PAFR
  • PKCD
  • PML
  • PP8675
  • PRKCD
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTAFR
  • PTP1C
  • PTPN6
  • RBCC
  • RFB30
  • RNF
  • RNF101
  • RNF137
  • RNF147
  • RNF15
  • RNF16
  • RNF21
  • RNF22
  • RNF27
  • RNF59
  • RNF71
  • RNF81
  • RNF86
  • RNF88
  • RNF89
  • RNF9
  • RNF94
  • RNF95
  • RNF97
  • RNF99
  • RO52
  • RORET
  • SMAD7
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SP100
  • SS56
  • SSA1
  • SSI1
  • SSI3
  • STAF50
  • TERF
  • TIP3
  • TRIFIC
  • TRIM10
  • TRIM14
  • TRIM17
  • TRIM18
  • TRIM19
  • TRIM2
  • TRIM21
  • TRIM22
  • TRIM25
  • TRIM26
  • TRIM29
  • TRIM3
  • TRIM31
  • TRIM34
  • TRIM35
  • TRIM38
  • TRIM45
  • TRIM46
  • TRIM48
  • TRIM5
  • TRIM6
  • TRIM62
  • TRIM68
  • TRIM8
  • TRIP14
  • VCAM1
  • XPRF
  • YB1
  • YBX1
  • ZNF147
  • ZNF173
Homo sapiens (human)
Regulation of PTEN mRNA translation
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • CAGH26
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MMAC1
  • MOV10
  • PTEN
  • TEP1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
O-linked glycosylation
  • AGO61
  • B3GALNT2
  • B3GNT1
  • B3GNT6
  • B4GAT1
  • C3orf39
  • DAG1
  • EOGTL
  • GTDC2
  • GYLTL1B
  • KIAA0609
  • LARGE
  • LARGE1
  • LARGE2
  • MGAT1.2
  • POMGNT1
  • POMGNT2
  • POMK
  • POMT1
  • POMT2
  • SGK196
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type F (botF)
  • KIAA0735
  • KIAA0736
  • KIAA1054
  • SV2A
  • SV2B
  • SV2C
  • SYB1
  • SYB2
  • VAMP1
  • VAMP2
  • botF
Homo sapiens (human)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of Cyclin B
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC16
  • CDC2
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • KIAA1406
  • P34CDC2
  • RPS27A
  • SFT
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
High laminar flow shear stress activates signaling by PIEZO1 and PECAM1:CDH5:KDR in endothelial cells
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADM
  • AKT1
  • AM
  • CALCRL
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CANPL2
  • CAPN2
  • CAPN4
  • CAPNS
  • CAPNS1
  • CAPNS2
  • CDH5
  • CGRPR
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • FAM38A
  • FLK1
  • FLT4
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • FYN
  • GA11
  • GAQ
  • GBL
  • GNA11
  • GNAQ
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • KDR
  • KIAA0037
  • KIAA0233
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1027
  • KIAA1060
  • KIAA1999
  • LST8
  • MAPKAP1
  • MIP1
  • MLST8
  • MMP14
  • MRS1
  • MTOR
  • NOS3
  • P2RU1
  • P2RY2
  • PANX1
  • PDK1
  • PDPK1
  • PECAM1
  • PIEZO1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R2
  • PKACA
  • PKB
  • PKN2
  • PKR1
  • PKR2
  • PRK2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PRKCL2
  • PROTOR1
  • PRR5
  • RAC
  • RAFT1
  • RAMP2
  • RAPT1
  • RICTOR
  • SIN1
  • TLN
  • TLN1
  • TRPV4
  • TSE1
  • VCL
  • VEGFR2
  • VEGFR3
  • VRL2
  • VROAC
Homo sapiens (human)
MET interacts with TNS proteins
  • CTEN
  • FNRB
  • HGF
  • HPTA
  • ITGB1
  • MDF2
  • MET
  • MSK12
  • TEM6
  • TENS1
  • TNS3
  • TNS4
  • TPP
Homo sapiens (human)
Formation of the Early Elongation Complex
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • STK1
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
G beta:gamma signalling through PLC beta
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • KIAA0581
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
Homo sapiens (human)
PD-1 signaling
  • B7DC
  • B7H1
  • CD273
  • CD274
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • HCP
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLASB
  • LCK
  • PD1
  • PDCD1
  • PDCD1L1
  • PDCD1L2
  • PDCD1LG1
  • PDCD1LG2
  • PDL1
  • PDL2
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHPTP2
  • T3D
  • T3E
  • T3G
  • TCRA
  • TCRBV12S3
  • TCRBV8S1
  • TRAC
  • TRAV19
  • TRAV29DV5
  • TRAV8-4
  • TRBC1
  • TRBV12-3
  • TRBV7-9
Homo sapiens (human)
Influenza Virus Induced Apoptosis
  • AAC3
  • ANT3
  • NA
  • PB1
  • SLC25A6
  • TGFB
  • TGFB1
Homo sapiens (human)
Defective B4GALT1 causes CDG-2d
  • B4GALT1
  • GGTB2
Homo sapiens (human)
Molecules associated with elastic fibres
  • BMP10
  • BMP14
  • BMP2
  • BMP2A
  • BMP2B
  • BMP4
  • BMP7
  • C14orf141
  • CDMP1
  • DANCE
  • DVR4
  • EFEMP1
  • EFEMP2
  • FBLN1
  • FBLN2
  • FBLN3
  • FBLN4
  • FBLN5
  • FBNL
  • FNRB
  • GDF5
  • GP3A
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP2
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MAGP1
  • MAGP2
  • MDF2
  • MFAP2
  • MFAP3
  • MFAP4
  • MFAP5
  • MSK12
  • MSK8
  • OP1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • VNRA
  • VTN
  • VTNR
Homo sapiens (human)
p53-Dependent G1 DNA Damage Response
  • CAP20
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
  • CIP1
  • KIP1
  • MDA6
  • PIC1
  • SDI1
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
Variant SLC6A20 contributes towards hyperglycinuria (HG) and iminoglycinuria (IG)
  • SIT1
  • SLC6A20
  • XT3
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Metallothioneins bind metals
  • CES1
  • MT1A
  • MT1B
  • MT1E
  • MT1F
  • MT1G
  • MT1H
  • MT1K
  • MT1M
  • MT1Q
  • MT1S
  • MT1X
  • MT2
  • MT2A
  • MT3
  • MT4
Homo sapiens (human)
NTF4 activates NTRK2 (TRKB) signaling
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • TRKB
Homo sapiens (human)
Resistance of ERBB2 KD mutants to neratinib
  • CDC37
  • CDC37A
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • HER2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MLN19
  • NEU
  • NGL
Homo sapiens (human)
Beta-oxidation of very long chain fatty acids
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT4
  • ACOT8
  • ACSVL1
  • ACTEIII
  • ALD
  • DECR2
  • ECHD
  • EDH17B4
  • EHHADH
  • FACVL1
  • FATP2
  • HSD17B4
  • PDCR
  • PTE1
  • PTE2B
  • PTEIB
  • PTHIO
  • SDR17C1
  • SDR8C1
  • SLC27A2
  • VLACS
Homo sapiens (human)
Apoptotic execution phase
  • BAP31
  • BCAP31
  • CASP8
  • DLP1
  • DNM1L
  • DRP1
  • DXS1357E
  • MCH5
  • MST3
  • STK24
  • STK3
Homo sapiens (human)
Cellular hexose transport
  • FGF21
  • GLUT1
  • GLUT10
  • GLUT11
  • GLUT12
  • GLUT14
  • GLUT2
  • GLUT3
  • GLUT4
  • GLUT6
  • GLUT7
  • GLUT8
  • GLUT9
  • GLUTX1
  • KIAA1919
  • MFSD4B
  • NAGLT1
  • NAGT
  • PCANAP6
  • PRST
  • RAG1AP1
  • SAAT1
  • SCP
  • SGLT1
  • SGLT2
  • SGLT3
  • SGLT4
  • SGLT5
  • SLC2A1
  • SLC2A10
  • SLC2A11
  • SLC2A12
  • SLC2A14
  • SLC2A2
  • SLC2A3
  • SLC2A4
  • SLC2A6
  • SLC2A7
  • SLC2A8
  • SLC2A9
  • SLC45A3
  • SLC50A1
  • SLC5A1
  • SLC5A10
  • SLC5A2
  • SLC5A4
  • SLC5A9
Homo sapiens (human)
Nilotinib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Gamma-carboxylation of protein precursors
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GAS6
  • GC
  • GGCX
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024