GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 776 - 800 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
MET Receptor Activation
  • HAI1
  • HAI2
  • HGF
  • HGFAC
  • HPN
  • HPTA
  • KOP
  • MET
  • SPINT1
  • SPINT2
  • TMPRSS1
Homo sapiens (human)
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • AGRIN
  • AGRN
  • CAK
  • DAG1
  • DDR1
  • DDR2
  • DMD
  • EDDR1
  • FGF2
  • FGFB
  • HSPG2
  • KIAA0533
  • KIAA0578
  • KIAA1907
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMA2
  • LAMA3
  • LAMA4
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC1
  • LAMC2
  • LAMC3
  • LAMM
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • LAMS
  • NEP
  • NRXN1
  • NTN4
  • NTRK4
  • NTRKR3
  • PALB
  • PDGF1
  • PDGF2
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PTK3A
  • RTK6
  • SIS
  • TKT
  • TRKE
  • TTR
  • TYRO10
Homo sapiens (human)
VEGFR2 mediated cell proliferation
  • AHCYL1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • DCAL
  • FLK1
  • GAP
  • HRAS
  • HRAS1
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KDR
  • NRAS
  • PDK1
  • PDPK1
  • PKC2
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCD
  • PLC1
  • PLCG1
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCD
  • PRKCZ
  • RASA
  • RASA1
  • SK1
  • SPHK
  • SPHK1
  • SPK
  • VEGFR2
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function
  • AGO1
  • AGO3
  • AGO4
  • ALL1
  • ALR
  • AML1
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BIG3
  • CAGH26
  • CBFA2
  • CBFB
  • CHN
  • CSMF
  • CXCL4
  • CXXC7
  • DPY30
  • EIF2C1
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • EP300
  • ERYF1
  • FOG1
  • GATA1
  • GF1
  • GP1BA
  • GP2B
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HALR
  • HDAC1
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • HMT2
  • HRMT1L2
  • HRMT1L6
  • HRX
  • HRX2
  • HTRX
  • IR1B4
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • KAT2B
  • KIAA0304
  • KIAA0339
  • KIAA0700
  • KIAA1076
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1506
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT2D
  • KMT2F
  • KMT2G
  • MINOR
  • MLC2
  • MLL
  • MLL1
  • MLL2
  • MLL3
  • MLL4
  • MOV10
  • MRLC1
  • MYL9
  • MYRL2
  • NFE2
  • NOR1
  • NR4A3
  • P300
  • PCAF
  • PF4
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PRMT1
  • PRMT6
  • RBBP5
  • RBQ3
  • RPD3L1
  • RUNX1
  • SCYB4
  • SET1
  • SET1A
  • SET1B
  • SETD1A
  • SETD1B
  • SIN3A
  • SIN3B
  • TEC
  • THBS1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TRX1
  • TRX2
  • TSH2B
  • TSP
  • TSP1
  • WBP7
  • WDR5
  • ZFN89A
  • ZFPM1
Homo sapiens (human)
Sema4D mediated inhibition of cell attachment and migration
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGAP35
  • C9orf164
  • CD100
  • GRF1
  • GRLF1
  • KIAA0407
  • KIAA1722
  • MET
  • P190A
  • PLXN5
  • PLXNB1
  • RAC1
  • RHO12
  • RHO6
  • RHOA
  • RND1
  • RRAS
  • SEMA4D
  • SEMAJ
  • SEP
  • TC25
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Defective TPR may confer susceptibility towards thyroid papillary carcinoma (TPC)
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • GCK
  • GCKR
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
TGFBR3 expression
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • BHLHB19
  • BHLHB20
  • BHLHB21
  • BHLHC1
  • BHLHC2
  • BHLHC3
  • BHLHC4
  • BHLHE37
  • BTEB4
  • CAGH26
  • DPC4
  • E2A
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • EP300
  • HEB
  • HELLS
  • HTF4
  • ITF1
  • ITF2
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • KLF16
  • MADH3
  • MADH4
  • MOV10
  • MRF4
  • MYCN
  • MYF3
  • MYF4
  • MYF5
  • MYF6
  • MYOD
  • MYOD1
  • MYOG
  • NMYC
  • NR1B1
  • NR2B1
  • NSLP2
  • P300
  • PASG
  • RARA
  • RXRA
  • SEF2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMARCA6
  • SP1
  • TCF12
  • TCF3
  • TCF4
  • TGFBR3
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TSFP1
Homo sapiens (human)
Triglyceride catabolism
  • ABHD5
  • BLBP
  • CAV
  • CAV1
  • DXS1283E
  • FABP1
  • FABP11
  • FABP12
  • FABP2
  • FABP3
  • FABP4
  • FABP5
  • FABP6
  • FABP7
  • FABP9
  • FABPB
  • FABPI
  • FABPL
  • GPD2
  • GS2
  • GS2L
  • ILBP
  • ILLBP
  • LIPE
  • M6PRBP1
  • MDGI
  • MGLL
  • MRG
  • NCIE2
  • PERI
  • PKACA
  • PLIN
  • PLIN1
  • PLIN3
  • PNPLA4
  • PNPLA5
  • PPP1A
  • PPP1CA
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • TIP47
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-2 modulates host translation machinery
  • CCG2
  • COD
  • D6S218E
  • DDX20
  • DP103
  • FAM51A1
  • FAU
  • FTE1
  • GEMIN2
  • GEMIN3
  • GEMIN4
  • GEMIN5
  • GEMIN6
  • GEMIN7
  • GEMIN8
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • PBSCF
  • PBSCG
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • SIP1
  • SMN
  • SMN1
  • SMN2
  • SMNC
  • SMNT
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD1
  • SNRPD2
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • UBA80
  • UBCEP1
  • rep
Homo sapiens (human)
Defective pro-SFTPB causes SMDP1 and RDS
  • SFTP3
  • SFTPB
Homo sapiens (human)
RND3 GTPase cycle
  • ANKRD26
  • APE
  • ARHE
  • ARHGAP10
  • ARHGAP21
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • BACURD1
  • BACURD2
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • C6orf143
  • CALM
  • CAV
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CDHF4
  • CG1
  • CKAP4
  • CKB
  • CKBB
  • CPD
  • CRIB1
  • DDX4
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DMH
  • DRCC1
  • DSG1
  • DSP
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EDP1
  • EPHA2
  • ESA1
  • FAM83B
  • FLOT2
  • GRB1
  • GRDN
  • GRF1
  • GRLF1
  • HNRPG
  • IRAS
  • KCTD13
  • KIAA0004
  • KIAA0147
  • KIAA0583
  • KIAA0720
  • KIAA0728
  • KIAA0975
  • KIAA1074
  • KIAA1212
  • KIAA1215
  • KIAA1424
  • KIAA1722
  • KTN1
  • LAP4
  • LEMD3
  • M17S1
  • MAN1
  • MUC13
  • NGAP
  • NISCH
  • P190A
  • PDIP1
  • PDLG
  • PICALM
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PNP1
  • POLDIP1
  • PTP1E
  • PTPL1
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RECC
  • RHO8
  • RHOE
  • RHOGAP5
  • RND3
  • ROCK1
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SEMA4F
  • SEMAM
  • SEMAW
  • SOC
  • STB1
  • STB2
  • TMOD3
  • TNFAIP1
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UBXD5
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • VARTUL
  • VASA
  • WDR6
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Negative regulation of TCF-dependent signaling by WNT ligand antagonists
  • DKK1
  • DKK2
  • DKK4
  • FRP
  • FRP1
  • FRP2
  • KREMEN
  • KREMEN1
  • KREMEN2
  • KRM1
  • KRM2
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • SARP1
  • SARP2
  • SFRP1
  • SFRP2
  • SOST
  • WIF1
  • WNT14
  • WNT3A
  • WNT4
  • WNT5A
  • WNT9A
Homo sapiens (human)
Interleukin-37 signaling
  • APRF
  • BDP1
  • CASP1
  • FIL1Z
  • HCP
  • IL18BP
  • IL18R1
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F7
  • IL1H4
  • IL1RP1
  • IL1RRP
  • IL37
  • KIAA1471
  • MADH3
  • NAK
  • PEZ
  • PNP1
  • PTP1C
  • PTP1E
  • PTP2C
  • PTPD2
  • PTPL1
  • PTPN11
  • PTPN12
  • PTPN13
  • PTPN14
  • PTPN18
  • PTPN2
  • PTPN20
  • PTPN20A
  • PTPN20B
  • PTPN23
  • PTPN4
  • PTPN5
  • PTPN6
  • PTPN7
  • PTPN9
  • PTPT
  • SHPTP2
  • SIGIRR
  • SMAD3
  • STAT3
  • TBK1
Homo sapiens (human)
SUMO is transferred from E1 to E2 (UBE2I, UBC9)
  • AOS1
  • RSUME
  • RWDD3
  • SAE1
  • SAE2
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUA1
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • UBA2
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • UBLE1A
  • UBLE1B
Homo sapiens (human)
Proton-coupled neutral amino acid transporters
  • PAT1
  • PAT2
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • TRAMD1
Homo sapiens (human)
Defective B3GAT3 causes JDSSDHD
  • AGRIN
  • AGRN
  • B3GAT3
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
Costimulation by the CD28 family
  • B7H2
  • B7RP1
  • BTLA
  • GRB1
  • HCP
  • HVEA
  • HVEM
  • ICOSL
  • ICOSLG
  • KIAA0653
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHPTP2
  • TNFRSF14
Homo sapiens (human)
lorlatinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • CRKL
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRF2
  • HGF
  • HPTA
  • KIAA1771
  • KREV1
  • MET
  • RAC1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF1
  • TC25
Homo sapiens (human)
Pre-NOTCH Transcription and Translation
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AML1
  • BCL1
  • CAGH26
  • CBFA2
  • CBP
  • CCND1
  • CG1
  • CREBBP
  • CXorf6
  • DP1
  • DP2
  • DXS1179E
  • E2F1
  • E2F3
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • ELF3
  • EP300
  • ERT
  • ESX
  • GCN5
  • GCN5L2
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
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  • H3.3B
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Homo sapiens (human)
FCERI mediated MAPK activation
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Homo sapiens (human)
Interleukin-10 signaling
  • APRF
  • C17orf33
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  • CCR5
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  • CSF2
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  • IGIF
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  • IL10R
  • IL10RA
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  • IL1R2
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  • IL1RB
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  • JAK1A
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  • MIP3B
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  • PTAFR
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  • SCYA22
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  • SCYA5
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  • SCYB2
  • STAT3
  • TIMP
  • TIMP1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAR
  • TNFBR
  • TNFR1
  • TNFR2
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF1B
  • TNFSF2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Phase 2 - plateau phase
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • AMMECR2
  • CACH2
  • CACN2
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
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  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CCHL1A1
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  • KCNA9
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  • KCNE1L
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNQ1
  • KIAA0558
  • KIAA0803
  • KVLQT1
  • MYSB
Homo sapiens (human)
TYSND1 cleaves peroxisomal proteins
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOX
  • ACOX1
  • AGPS
  • EDH17B4
  • HSD17B4
  • PAHX
  • PHYH
  • PTHIO
  • SCP2
  • SDR8C1
  • TYSND1
Homo sapiens (human)
NOD1/2 Signaling Pathway
  • AAMP
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARD9
  • CARDIAK
  • CASP1
  • CASP2
  • CASP4
  • CASP8
  • CASP9
  • CHUK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CYLD
  • CYLD1
  • ERK6
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  • ICH2
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
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  • KIAA0733
  • KIAA0849
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  • MAP3K7
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  • MAP3K7IP2
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  • MAPK11
  • MAPK12
  • MAPK13
  • MAPK14
  • MCH5
  • MCH6
  • MEK6
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  • MIHC
  • MKK6
  • MXI2
  • N
  • NEDD2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • OTUD7C
  • PRKM11
  • PRKM13
  • PRKMK6
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  • RIP2
  • RIPK2
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  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SAPK3
  • SAPK4
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TNFAIP3
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024