GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
ADORA2B mediated anti-inflammatory cytokines production
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADORA2B
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNAT3
  • GNAZ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • IFNB2
  • IL6
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PKX1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PRKX
  • TSE1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of chromatin organization proteins
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALTE
  • BAP1
  • BMI1
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX5
  • CBX8
  • CG1
  • CHD3
  • CHET9
  • D3S1231E
  • DDXBP1
  • DING
  • DREF
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HDAC4
  • HIPI3
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST4H4
  • HP1A
  • JJAZ1
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0160
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0288
  • KIAA0618
  • KIAA0785
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1034
  • L3MBTL2
  • MEL18
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PCNT1
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • PIAS1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RC1
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RNF1
  • RNF110
  • RNF2
  • RNF51
  • RPD3L1
  • SATB1
  • SATB2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • SUZ12
  • TMEM48
  • TPR
  • TRAMP
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • ZBED1
  • ZNF144
  • hDREF
Homo sapiens (human)
Resolution of D-loop Structures through Synthesis-Dependent Strand Annealing (SDSA)
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C20orf41
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA1088
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • NHL
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RTEL1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
  • XRCC3
Homo sapiens (human)
PI Metabolism
  • TIPE3
  • TNFAIP8
  • TNFAIP8L1
  • TNFAIP8L2
  • TNFAIP8L3
Homo sapiens (human)
Respiratory syncytial virus (RSV) attachment and entry
  • AGRIN
  • AGRN
  • CD14
  • CMKBRL1
  • CX3CR1
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ESOP1
  • F
  • FUR
  • FURIN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GPR13
  • HER1
  • HSPG1
  • HSPG2
  • IGF1R
  • KIAA0468
  • L
  • LY96
  • M
  • M2-1
  • MD2
  • N
  • NCL
  • OCI5
  • P
  • PACE
  • PCSK3
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RABL
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TLR4
Homo sapiens (human)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP
  • ABP1
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES2
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5M
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • DAC
  • DAO
  • DIA1
  • EPHX
  • EPHX1
  • EPOX
  • ICE
  • KIAA0307
  • KIAA1234
  • MARC1
  • MARC2
  • MCNAA
  • MOSC1
  • MOSC2
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NMOR2
  • NQO2
  • OMB5
  • SDR21C2
  • SES1
  • VAP1
Homo sapiens (human)
ASP-3026-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
Regulation of necroptotic cell death
  • AIP1
  • ALIX
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • CASP8
  • CDC37
  • CDC37A
  • CHIP
  • ESA1
  • FADD
  • FLOT1
  • FLOT2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • IAP3
  • ITCH
  • KIAA1375
  • M17S1
  • MCH5
  • MDA9
  • MIHB
  • MIHC
  • MLKL
  • MORT1
  • OGT
  • PARK2
  • PDCD6IP
  • PELI1
  • PRISM
  • PRKN
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RNF48
  • RNF49
  • RPS27A
  • SDCBP
  • STUB1
  • SYCL
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCE7
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH7
  • UBE2L3
  • XIAP
Homo sapiens (human)
Interleukin-21 signaling
  • APRF
  • IL21
  • IL21R
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • NILR
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression linked to gluconeogenesis
  • LXRA
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NRIP1
  • PCK1
  • PEPCK1
  • RXRA
  • RXRB
Homo sapiens (human)
Signaling by RAS GTPase mutants
  • HRAS
  • HRAS1
  • KRAS
  • KRAS2
  • NRAS
  • RASK2
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of myristoyl-CoA to lauroyl-CoA
  • ACADL
  • HADH
  • HADHA
  • HADHB
Homo sapiens (human)
Neurotransmitter release cycle
  • ASAHL
  • NAAA
  • PLT
Homo sapiens (human)
EPHA-mediated growth cone collapse
  • ARH12
  • ARHA
  • FYN
  • JTK8
  • KIAA0619
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LYN
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYRL2
  • NGEF
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
SLC15A4:TASL-dependent IRF5 activation
  • CHUK
  • CXorf21
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRF5
  • NEMO
  • PHT1
  • PTR4
  • SLC15A4
  • TASL
  • TCF16
Homo sapiens (human)
Heme signaling
  • AIB3
  • APOA1
  • APOB
  • ARC205
  • ARNTL
  • ATF2
  • BACH1
  • BAF60C
  • BHLHE5
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BHLHE8
  • BHLHE9
  • BMAL1
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CLEC1B
  • CLEC2
  • CLOCK
  • CREB2
  • CREBBP
  • CREBP1
  • CRM1
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CRTC1
  • CRTC2
  • CRTC3
  • DG6
  • DRIP205
  • DRIP230
  • EAR1
  • EP300
  • ESOP1
  • G21
  • HBA1
  • HBA2
  • HBB
  • HCA137
  • HCP1
  • HDAC3
  • HELZ2
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • HREV
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA0334
  • KIAA0616
  • KIAA1047
  • KIAA1769
  • KIAA1820
  • KISH2
  • LEM6
  • LY96
  • MAFK
  • MD2
  • MECT1
  • MED1
  • MEF2C
  • MEF2D
  • MOP3
  • MOP4
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NCOR1
  • NFE2L2
  • NPAS2
  • NR1C1
  • NR1D1
  • NR1F1
  • NR2B1
  • NRF2
  • NRIP1
  • P300
  • PASD3
  • PASD4
  • PBP
  • PCFT
  • PGC1
  • PGC1A
  • PGRMC2
  • PIMT
  • PMBP
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAI1
  • RAP250
  • RB18A
  • RORA
  • RXRA
  • RZRA
  • SIR2L1
  • SIRT1
  • SLC46A1
  • SMARCD3
  • SRC1
  • SRC2
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • THRAL
  • TIF2
  • TLR4
  • TORC1
  • TORC2
  • TORC3
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
  • WAMTP1
  • XPO1
Homo sapiens (human)
Glyoxylate metabolism and glycine degradation
  • AGT1
  • AGT2
  • AGXT
  • AGXT2
  • ALDH4
  • ALDH4A1
  • C10orf65
  • DAMOX
  • DAO
  • DDO
  • DHDPSL
  • GLXR
  • GNMT
  • GOT2
  • GOX1
  • GRHPR
  • HAO1
  • HOGA1
  • HSPOX1
  • HYPDH
  • KYAT4
  • P5CDH
  • PMP22
  • PRODH2
  • PXMP2
  • SPAT
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR4 in disease
  • FGFR4
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • JTK2
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • SOS1
  • TKF
Homo sapiens (human)
Aryl hydrocarbon receptor signalling
  • AHR
  • AHRR
  • AIP
  • ARNT
  • ARNT2
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCB
  • KIAA0307
  • KIAA1234
  • P23
  • PTGES3
  • TEBP
  • XAP2
Homo sapiens (human)
Kandutsch-Russell pathway
  • D7SR
  • DHCR24
  • DHCR7
  • EBP
  • KIAA0018
  • SC5D
  • SC5DL
Homo sapiens (human)
Replication of the SARS-CoV-2 genome
  • DDX5
  • G17P1
  • HELR
  • HLR1
  • RB1
  • VHL
  • ZCRB1
  • rep
Homo sapiens (human)
Eukaryotic Translation Termination
  • APEH
  • BBC1
  • C21orf127
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D3F15S2
  • D3S48E
  • D6S218E
  • DNF15S2
  • DXS648E
  • EC45
  • ERF1
  • ERF3A
  • ERF3B
  • ETF1
  • FAU
  • FTE1
  • GSPT1
  • GSPT2
  • HEMK2
  • KMT9
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • N6AMT1
  • NEDD6
  • PRED28
  • QM
  • RF1
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SUP45L1
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRMT112
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • AWAT2
  • BCP
  • CRALBP
  • DC4
  • DGAT2L4
  • DHRS3
  • GCP
  • MFAT
  • OPN1LW
  • OPN1MW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RDH17
  • RLBP1
  • SDR16C1
  • WS
Homo sapiens (human)
Surfactant metabolism
  • ABC3
  • ABCA3
  • ADA2
  • ADGF
  • ADGRF5
  • ADORA2
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • ADRA2L2
  • ADRA2R
  • ADRA2RL2
  • ADRAR
  • BR22
  • CCDC59
  • CECR1
  • CKAP4
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CPSB
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • CTSH
  • DMBT1
  • GATA6
  • GP340
  • GPR116
  • IDGFL
  • IL3RB
  • IL5RB
  • KIAA0758
  • LMCD1
  • NAP1
  • NAPA
  • NAPSA
  • NPT2
  • P2RU1
  • P2RY2
  • PGA3
  • PGA4
  • PGA5
  • PSAP
  • PSPD
  • REAM
  • REC
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
  • SLC17A2
  • SLC34A1
  • SLC34A2
  • TAP26
  • TTF1
  • ZDHHC2
  • ZNF372
Homo sapiens (human)
Pyroptosis
  • BAK
  • BAK1
  • BAX
  • BC2
  • BCL2L4
  • BCL2L7
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CASP1
  • CASP3
  • CASP4
  • CASP5
  • CDN1
  • CGI149
  • CGL1
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • CPP32
  • CSPB
  • CTLA1
  • CYC
  • CYCS
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • ELA2
  • ELANE
  • GRB
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • GZMB
  • HMG1
  • HMGB1
  • ICERE1
  • ICH2
  • ICH3
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F1
  • IL1F2
  • IL1F4
  • IRF1
  • IRF2
  • KET
  • NEDF
  • P53
  • P63
  • P73H
  • P73L
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • TP53
  • TP63
  • TP73L
  • VPS20
  • VPS24
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024