GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 801 - 825 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Turbulent (oscillatory, disturbed) flow shear stress activates signaling by PIEZO1 and integrins in endothelial cells
  • ABL
  • ABL1
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANXA2
  • CAL1H
  • CANPL2
  • CAPN2
  • CAPN4
  • CAPNS
  • CAPNS1
  • CAPNS2
  • CHUK
  • FAK
  • FAK1
  • FAM38A
  • FIP3
  • FNRA
  • FNRB
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNAQ
  • GP3A
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IKKE
  • IKKI
  • ITGA5
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • JTK7
  • KIAA0151
  • KIAA0233
  • LPC2D
  • MAD3
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • PIEZO1
  • PPP2CA
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R2A
  • PTK2
  • PTP1B
  • PTPN1
  • RELA
  • STAT1
  • TCF16
  • VCL
  • VNRA
  • VTNR
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ADMLX
  • ANOS1
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KAL
  • KAL1
  • KALIG1
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ADMLX
  • ANOS1
  • C19orf3
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • GIPC
  • GIPC1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KAL
  • KAL1
  • KALIG1
  • KS3
  • RGS19IP1
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • 8
  • ABCB2
  • ABCB3
  • APPILS
  • ARTS1
  • ATG14
  • ATG14L
  • B2M
  • BECN1
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • D3S1231E
  • ERAP1
  • ERAP2
  • ERP57
  • ERP60
  • GRP58
  • GRP78
  • GT197
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HSPA5
  • KIAA0079
  • KIAA0525
  • KIAA0755
  • KIAA0831
  • KIAA0905
  • LRAP
  • NGS17
  • PDIA3
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PSF1
  • PSF2
  • RING11
  • RING4
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • TAP1
  • TAP2
  • TAPA
  • TAPBP
  • VPS15
  • VPS34
  • Y1
  • Y3
Homo sapiens (human)
Common Pathway of Fibrin Clot Formation
  • AT3
  • CD177
  • CF2R
  • CXCL4
  • CXCL4V1
  • EPCR
  • F10
  • F13A
  • F13A1
  • F13B
  • F2
  • F2R
  • F5
  • F8
  • F8C
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • HCF2
  • MBN
  • NB1
  • PAR1
  • PCI
  • PF4
  • PF4V1
  • PI7
  • PLANH3
  • PN1
  • PROC
  • PROCI
  • PROCR
  • PROS
  • PROS1
  • PRTN3
  • PRV1
  • SCYB4
  • SCYB4V1
  • SERPINA5
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • THBD
  • THRM
  • TR
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1 activates/modulates innate immune responses
  • 1a
  • 3a
  • 3b
  • 6
  • 7a
  • 8b
  • 9b
  • AML1
  • ASC
  • BST2
  • C1orf7
  • CAP-1
  • CARD5
  • CASP1
  • CBFA2
  • CIAS1
  • COLEC7
  • CRAF1
  • CYP20
  • CYPA
  • CYPB
  • CYPH
  • DAK
  • DDX58
  • DSCR1L2
  • E
  • EFP
  • ERIS
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • IFIH1
  • IKBA
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IPS1
  • IRAK2
  • IRF3
  • ITCH
  • KIAA0151
  • KIAA0220
  • KIAA0719
  • KIAA1271
  • KPNA2
  • KPNB1
  • M
  • MAD3
  • MAVS
  • MDA5
  • MITA
  • N
  • NAK
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NLRP3
  • NMI
  • NPIPB3
  • NPIPL3
  • NTF97
  • PCBP2
  • PPIA
  • PPIB
  • PPIG
  • PPIH
  • PSPD
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RCAN3
  • RCH1
  • RELA
  • RH116
  • RIGI
  • RIP3
  • RIPK3
  • RNF147
  • RNF85
  • RPS27A
  • RUNX1
  • S
  • SFTP4
  • SFTPD
  • SIKE
  • SIKE1
  • SRP1
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TKFC
  • TLR7
  • TMEM173
  • TMS1
  • TOM70
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • TRAF3
  • TRAF6
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VISA
  • ZNF147
  • rep
  • sM
Homo sapiens (human)
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling
  • APG12
  • APG12L
  • APG5L
  • ASP
  • ATG12
  • ATG5
  • CAP-1
  • CEB1
  • CEBP1
  • CRAF1
  • CYLD
  • CYLD1
  • DDX58
  • EFP
  • G1P2
  • HERC5
  • HIP2
  • IFIH1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • ISG15
  • ITCH
  • KIAA0151
  • KIAA0849
  • KIAA1271
  • LIG
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • NLRC5
  • NLRX1
  • NOD27
  • NOD4
  • NOD5
  • NOD9
  • OTUD5
  • OTUD7C
  • PCBP2
  • PIN1
  • PUBC1
  • RH116
  • RIGI
  • RNF125
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF216
  • RNF87
  • RPS27A
  • SFT
  • T6BP
  • TAX1BP1
  • TBK1
  • TNFAIP3
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIAD3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • UBA52
  • UBA7
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCE7IP1
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBCH8
  • UBE1L
  • UBE2
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2K
  • UBE2L6
  • UCRP
  • VISA
  • ZIN
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
Evasion by RSV of host interferon responses
  • 1B
  • 1C
  • CBP
  • CREBBP
  • CUL5
  • DDX58
  • EFP
  • EIF2AK2
  • ELOB
  • ELOC
  • EP300
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNB
  • IFNB1
  • IPS1
  • IRF3
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MDA5
  • N
  • NS1
  • NS2
  • P300
  • PKR
  • PRKR
  • RBX1
  • RH116
  • RIGI
  • RNF147
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • STAT2
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRIM25
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VACM1
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated IRF7 activation
  • CBP
  • CREBBP
  • DDX58
  • EFP
  • EP300
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNB
  • IFNB1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • P300
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • SIKE
  • SIKE1
  • TANK
  • TBK1
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
TRAF3-dependent IRF activation pathway
  • 1C
  • CAP-1
  • CBP
  • CRAF1
  • CREBBP
  • DDX58
  • EFP
  • EP300
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNB
  • IFNB1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • IRF7
  • KIAA0151
  • KIAA1271
  • M
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • NS1
  • P300
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • SIKE
  • SIKE1
  • TBK1
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10
  • CASP10
  • CASP8
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FADD
  • FIP3
  • IFIH1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MCH4
  • MCH5
  • MDA5
  • MORT1
  • NEMO
  • RH116
  • RIGI
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • TCF16
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
Chylomicron remodeling
  • APC2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOA5
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • GPIHBP1
  • HBP1
  • LIPD
  • LPL
  • RAP3
Homo sapiens (human)
Chylomicron assembly
  • APC2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • ERBA2L
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
Homo sapiens (human)
Scavenging by Class A Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • APOE
  • CALR
  • CLP1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COLEC11
  • COLEC12
  • CRARF
  • CRARF1
  • CRTC
  • FTH
  • FTH1
  • FTHL6
  • FTL
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • MARCO
  • MASP1
  • MSR1
  • NSR2
  • PNSP1
  • PRSS5
  • SCARA1
  • SCARA2
  • SCARA4
  • SCARA5
  • SCGB3A2
  • SRCL
  • TRA1
  • UGRP1
Homo sapiens (human)
Scavenging by Class B Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • CD36
  • GP3B
  • GP4
  • SAA1
  • SSC5D
Homo sapiens (human)
HDL clearance
  • AMN
  • APOA1
  • CUBN
  • HBP
  • HDLBP
  • IFCR
  • VGL
Homo sapiens (human)
Defective ABCA1 causes TGD
  • ABC1
  • ABCA1
  • APOA1
  • CERP
Homo sapiens (human)
VLDL clearance
  • APOB
  • APOB48R
  • APOBR
  • APOC1
  • APOC4
  • ILDR3
  • LISCH
  • LSR
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
VLDL assembly
  • APOB
  • APOC1
  • APOC4
  • ERBA2L
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
Homo sapiens (human)
Chylomicron clearance
  • APOB
  • APOE
  • ARH
  • HTGL
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPC
Homo sapiens (human)
LDL remodeling
  • APOB
  • APOF
  • CETP
  • ERBA2L
  • LPA
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
Homo sapiens (human)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • 2B4
  • A15
  • AMICA1
  • APO2
  • APOB
  • AXLLG
  • B1G1
  • BCM1
  • BGP
  • BGP1
  • BIT
  • BLAST1
  • C21orf43
  • CAR
  • CD11A
  • CD11B
  • CD11C
  • CD177
  • CD18
  • CD2
  • CD244
  • CD43
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD49D
  • CD58
  • CD66D
  • CD74
  • CD84
  • CD99
  • CD99L2
  • CEA
  • CEACAM1
  • CEACAM3
  • CEACAM5
  • CEACAM6
  • CEACAM8
  • CFR1
  • CGM1
  • CGM3
  • CGM4
  • CGM6
  • CLEC8A
  • CR3A
  • CXADR
  • CXCL4
  • CXCL4V1
  • DCR2
  • DHLAG
  • DR4
  • DR5
  • DXS1692E
  • ELAM1
  • EPCAM
  • EPCR
  • ESAM
  • ESL1
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN
  • FN1
  • FNRA
  • FNRB
  • FYN
  • GA733-2
  • GAS6
  • GLG1
  • GLIF
  • GLPC
  • GMRP
  • GP6
  • GPA
  • GPB
  • GPC
  • GPC1
  • GRMP
  • GYPA
  • GYPB
  • GYPC
  • HSPG1
  • IGCJ
  • IGHA1
  • IGHA2
  • IGHM
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGJ
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGL1
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLL1
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM1
  • JAM2
  • JAM3
  • JAML
  • JCAM
  • JCHAIN
  • JTK8
  • KIAA0468
  • KILLER
  • LFA3
  • LHR
  • LNHR
  • LOX1
  • LYAM1
  • LYN
  • M1S2
  • M4S1
  • MDF2
  • MDU2
  • MDU3
  • MER
  • MER6
  • MERTK
  • MFI7
  • MFR
  • MG160
  • MIC18
  • MIC2
  • MIC2L1
  • MIC2X
  • MIC2Y
  • MIC4
  • MIF
  • MMIF
  • MSK12
  • MXS1
  • MYD1
  • NB1
  • NCA
  • OLR1
  • PECAM1
  • PF3D7_1301600
  • PF4
  • PF4V1
  • PICK1
  • PRKCABP
  • PROC
  • PROCR
  • PROS
  • PROS1
  • PRV1
  • PSBG1
  • PSBG2
  • PSG1
  • PSG10
  • PSG11
  • PSG12
  • PSG13
  • PSG14
  • PSG2
  • PSG3
  • PSG4
  • PSG5
  • PSG6
  • PSG7
  • PSG8
  • PSG9
  • PSGGA
  • PSGGB
  • PTPNS1
  • SCYB4
  • SCYB4V1
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SELE
  • SELL
  • SELP
  • SELPLG
  • SHPS1
  • SIRP
  • SIRPA
  • SIRPB2
  • SIRPG
  • SLAMF5
  • SPN
  • SRBC
  • TACSTD1
  • TGFB
  • TGFB1
  • THBD
  • THRM
  • TM4SF2
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10D
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR4
  • TREM1
  • TRICK2
  • TROP1
  • TRUNDD
  • TSPAN7
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • VEJAM
  • VPREB
  • VPREB1
  • VPREB3
  • ZTNFR9
  • ebl-1
  • opaA
  • opaB
  • opaC
  • opaD
  • opaE
  • opaF
  • opaG
  • opaH
  • opaI
  • opaJ
  • opaK
  • piiC
Homo sapiens (human)
Scavenging by Class F Receptors
  • APOB
  • CALR
  • CRTC
  • GRP170
  • HSP105
  • HSP110
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • HSPH1
  • HSPH4
  • HYOU1
  • KIAA0149
  • KIAA0201
  • ORP150
  • SCARF1
  • SREC
  • porB
Homo sapiens (human)
Platelet sensitization by LDL
  • APOB
  • APOER2
  • CPLA2
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FGR
  • HCP
  • KIAA0044
  • LRP8
  • MAPK14
  • MXI2
  • PECAM1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SAPK2A
  • SHPTP2
  • SRC2
Homo sapiens (human)
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • APOB
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • HMG1
  • HMGB1
  • ICERE1
  • KIAA0012
  • LBP
  • LY96
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TLR7
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024