GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1901 - 1925 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Potassium transport channels
  • KCNJ1
  • KCNJ10
  • KCNJ16
  • ROMK1
Homo sapiens (human)
GAB1 signalosome
  • AREG
  • AREGB
  • BTC
  • CBP
  • CSK
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • GAB1
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • PAG
  • PAG1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PXN
  • SDGF
  • SHPTP2
  • SRC
  • SRC1
  • TGFA
Homo sapiens (human)
Mitochondrial Uncoupling
  • AAC1
  • ANT1
  • SLC25A4
  • SLC25A7
  • UCP
  • UCP1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of SUMOylation proteins
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • LUN
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • PIAS4
  • PIASG
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • TMEM48
  • TOPORS
  • TP53BPL
  • TPR
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
RAF activation
  • ARAF
  • ARAF1
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CTAK1
  • EMK2
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • KIAA0044
  • KIAA0862
  • KIAA0968
  • KSR
  • KSR1
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • MRAS
  • NRAS
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RNF52
  • RRAS3
  • SHOC2
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Integration of provirus
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KPNA1
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RCH2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) during gastrulation
  • BFGFR
  • CEK
  • EOMES
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SNAH
  • SNAI1
  • T
  • TBR2
  • TBXT
Homo sapiens (human)
Signaling by PDGFRA extracellular domain mutants
  • APRF
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHEPDGFRA
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A9 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)
Signaling by ALK
  • ALK
  • ALKAL1
  • ALKAL2
  • APRF
  • BHLHE37
  • BHLHE39
  • FAM150A
  • FAM150B
  • FRS2
  • GRB1
  • HBNF1
  • HCP
  • IRS1
  • JAK3
  • MDK
  • MK1
  • MYC
  • MYCN
  • NEGF1
  • NEGF2
  • NMYC
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLC1
  • PLCG1
  • PTN
  • PTP1C
  • PTPN6
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Maturation of protein 3a
  • 3a
  • CGS23
  • GALNT1
  • NANTA3
  • SIAT1
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIATL1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • STHM
  • STZ
Homo sapiens (human)
Chylomicron remodeling
  • APC2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOA5
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • GPIHBP1
  • HBP1
  • LIPD
  • LPL
  • RAP3
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A3 causes Parkinsonism-dystonia infantile (PKDYS)
  • DAT1
  • SLC6A3
Homo sapiens (human)
Regulation of RUNX1 Expression and Activity
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AML1
  • BCL1
  • CAGH26
  • CBFA2
  • CBFB
  • CCND1
  • CCND2
  • CCND3
  • CDK6
  • CDKN6
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MOV10
  • MYL
  • PML
  • PP8675
  • PRAD1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF71
  • RUNX1
  • SHPTP2
  • SRC
  • SRC1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TRIM19
Homo sapiens (human)
Regulation of glycolysis by fructose 2,6-bisphosphate metabolism
  • F6PK
  • PFKFB1
  • PFKFB2
  • PFKFB3
  • PFKFB4
  • PFRX
  • PKACA
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
Homo sapiens (human)
Variant SLC6A20 contributes towards hyperglycinuria (HG) and iminoglycinuria (IG)
  • SIT1
  • SLC6A20
  • XT3
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Serotonin and melatonin biosynthesis
  • AADC
  • AANAT
  • ASMT
  • DDC
  • NTPH
  • SNAT
  • TPH
  • TPH1
  • TPH2
  • TPRH
  • TRPH
Homo sapiens (human)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • ACHRA
  • CHNRA
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNA7
  • CHRNA9
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
  • NACHRA3
  • NACHRA5
  • NACHRA7
  • NACHRA9
  • NACRA4
Homo sapiens (human)
GRB7 events in ERBB2 signaling
  • ERBB2
  • GGF
  • GRB7
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRG1
  • NRG2
  • NTAK
  • SMDF
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells
  • AD4BP
  • APRF
  • BHLHE17
  • BHLHE73
  • CSDD1
  • DPC4
  • EPAS1
  • EZF
  • FTZF1
  • GKLF
  • HIF2A
  • HIF3A
  • KLF4
  • LIN28
  • LIN28A
  • MADH2
  • MADH4
  • MADR2
  • MOP2
  • MOP7
  • NANOG
  • NR5A1
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • PASD2
  • PASD7
  • PBX1
  • POU5F1
  • PRDM14
  • PRL
  • SALL4
  • SF1
  • SMAD2
  • SMAD4
  • SOX2
  • STAT3
  • ZCCHC1
  • ZIC3
  • ZNF203
  • ZNF206
  • ZNF797
  • ZSCAN10
Homo sapiens (human)
ESR-mediated signaling
  • AIG6
  • CYP40
  • CYPD
  • ERK1
  • ERK2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FKBP4
  • FKBP5
  • FKBP51
  • FKBP52
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • MAPK1
  • MAPK3
  • NR3A1
  • NR3A2
  • P23
  • PPID
  • PPP5
  • PPP5C
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTGES3
  • TEBP
Homo sapiens (human)
Transcriptional and post-translational regulation of MITF-M expression and activity
  • AIMP1
  • AIMP2
  • AIMP3
  • AKT3
  • ALX3
  • BHLHB24
  • BHLHE32
  • BHLHE33
  • BHLHE34
  • BHLHE35
  • BRN2
  • CBP
  • CDH1
  • CDHE
  • CREBBP
  • CRM1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DARS
  • DARS1
  • EDN1
  • EDN3
  • EDNRB
  • EEF1E1
  • EMAP2
  • EPRS
  • EPRS1
  • ERK1
  • ERK2
  • ETRB
  • FOXD3
  • GLNS
  • GSK3B
  • HDAC1
  • HFH2
  • HINT
  • HINT1
  • HUP2
  • IARS
  • IARS1
  • ID
  • ID1
  • JTV1
  • KARS
  • KARS1
  • KIAA0070
  • KIAA1352
  • KIT
  • LARS
  • LARS1
  • LEF1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKAPK1A
  • MARS
  • MARS1
  • MC1R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MITF
  • MSHR
  • OCT7
  • OTF7
  • P18
  • PARS
  • PAX3
  • PKBG
  • PKCI1
  • POMC
  • POU3F2
  • PRKCNH1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • QARS
  • QARS1
  • QPRS
  • RARS
  • RARS1
  • RPD3L1
  • RPS6KA1
  • RSK1
  • SCFR
  • SCYE1
  • SIR2L1
  • SIRT1
  • SLUG
  • SLUGH
  • SNAI2
  • SOX10
  • SOX2
  • SOX9
  • TBX3
  • TCFEC
  • TFE3
  • TFEB
  • TFEC
  • TFECL
  • UVO
  • WNT3A
  • XPO1
  • ZIC
  • ZIC1
  • ZNF201
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA methylation proteins
  • AIM
  • BAP1
  • BMI1
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX8
  • CXXC9
  • DING
  • DNMT
  • DNMT1
  • DNMT3A
  • DNMT3B
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • HIPI3
  • MEL18
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • RC1
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RNF1
  • RNF110
  • RNF2
  • RNF51
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • ZNF144
Homo sapiens (human)
TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in Cytochrome C Release
  • 15E1.1
  • AIFM2
  • AMID
  • ASPP1
  • ASPP2
  • ATM
  • BAX
  • BBC3
  • BBP
  • BCL2L4
  • BID
  • BNIP3A
  • BNIP3H
  • BNIP3L
  • C18orf43
  • CBP
  • CREBBP
  • KET
  • KIAA0771
  • NIX
  • NOXA
  • P53
  • P53DINP1
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PMAIP1
  • PPP1R13B
  • PRELI
  • PRELID1
  • PRELID3A
  • PRG3
  • PUMA
  • SIP
  • SLMO1
  • STEAP3
  • TP53
  • TP53AIP1
  • TP53BP2
  • TP53INP1
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • TRIAP1
  • TSAP6
  • ZNF420
Homo sapiens (human)
Glutathione synthesis and recycling
  • BOTCH
  • C7orf24
  • CHAC1
  • CHAC2
  • CN2
  • CNDP2
  • CPGL
  • CRF21
  • GCLC
  • GCLM
  • GGCT
  • GGT
  • GGT1
  • GGT3
  • GGT3P
  • GGT5
  • GGT6
  • GGT7
  • GGTL3
  • GGTL5
  • GGTLA1
  • GLCL
  • GLCLC
  • GLCLR
  • GSS
  • HEL-S-13
  • OPLAH
  • PEPA
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024