GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 676 - 700 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
RND2 GTPase cycle
  • ALDH10
  • ALDH3A2
  • ANKRD26
  • ARHGAP1
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHN
  • ARMS
  • BACURD1
  • BACURD2
  • BLTP3B
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • C6orf143
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42GAP
  • CDHF4
  • CG1
  • CKAP4
  • CRIB1
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DMH
  • DRCC1
  • DSG1
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EDP1
  • EPHA2
  • FALDH
  • FAM83B
  • FBP17
  • FNBP1
  • FRS2
  • FRS3
  • GOLGA3
  • GRB1
  • GRF1
  • GRLF1
  • HNRPG
  • IRAS
  • KCTD13
  • KIAA0004
  • KIAA0042
  • KIAA0147
  • KIAA0554
  • KIAA0583
  • KIAA0620
  • KIAA0701
  • KIAA0728
  • KIAA0975
  • KIAA1074
  • KIAA1215
  • KIAA1250
  • KIAA1722
  • KIDINS220
  • KIF14
  • KTN1
  • LANO
  • LAP4
  • LEMD3
  • LRRC1
  • MAN1
  • MUC13
  • NISCH
  • NUDC
  • P190A
  • PDIP1
  • PDLG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLXND1
  • PNP1
  • POLDIP1
  • PRAG1
  • PTP1E
  • PTPL1
  • PTPN13
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RECC
  • RHO7
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RND2
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SGK223
  • SHIP164
  • SOC
  • STB1
  • STB2
  • TFRC
  • TNFAIP1
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UBXD5
  • UBXN11
  • UHRF1BP1L
  • VANGL1
  • VANGL2
  • VARTUL
  • WDR6
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
RND1 GTPase cycle
  • ALDH10
  • ALDH3A2
  • ANKRD26
  • APE
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARMS
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • C1orf8
  • C6orf143
  • CAV
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DMH
  • DRCC1
  • DSP
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EPHA2
  • EPSTI1
  • ESA1
  • FALDH
  • FAM135A
  • FAM83B
  • FLOT2
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB1
  • GRB7
  • GRDN
  • GRF1
  • GRLF1
  • HNRPG
  • KIAA0042
  • KIAA0583
  • KIAA0720
  • KIAA0728
  • KIAA1074
  • KIAA1212
  • KIAA1215
  • KIAA1250
  • KIAA1411
  • KIAA1722
  • KIDINS220
  • KIF14
  • LEMD3
  • M17S1
  • MAN1
  • MUC13
  • NGAP
  • NOV
  • P190A
  • PDLG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PLXN1
  • PLXNA1
  • PNP1
  • PTP1E
  • PTPL1
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RECC
  • RHO6
  • RHOGAP5
  • RND1
  • RRAS2
  • SCG10
  • SCGN10
  • SOC
  • STB1
  • STB2
  • STIP1
  • STMN2
  • TC21
  • TFRC
  • TMEM59
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UBXD5
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Sphingolipid catabolism
  • ACER1
  • ACER2
  • ACER3
  • ALDH3B1
  • ALDH3B2
  • ALDH7
  • ALDH8
  • APHC
  • ASAH3
  • ASAH3L
  • KIAA1252
  • LPP1
  • LPP2
  • LPP3
  • PHCA
  • PLPP1
  • PLPP2
  • PLPP3
  • PPAP2A
  • PPAP2B
  • PPAP2C
  • SGPL1
  • SGPP1
  • SGPP2
  • SPP1
Homo sapiens (human)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP
  • ABP1
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES2
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5M
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • DAC
  • DAO
  • DIA1
  • EPHX
  • EPHX1
  • EPOX
  • ICE
  • KIAA0307
  • KIAA1234
  • MARC1
  • MARC2
  • MCNAA
  • MOSC1
  • MOSC2
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NMOR2
  • NQO2
  • OMB5
  • SDR21C2
  • SES1
  • VAP1
Homo sapiens (human)
Metabolism of serotonin
  • ALDH2
  • ALDM
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Smooth Muscle Contraction
  • ALDH2
  • ALDM
  • ANX1
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANX6
  • ANXA1
  • ANXA2
  • ANXA6
  • C15orf13
  • CACNA1G
  • CACNA1H
  • CACNA1I
  • CAD
  • CAL1H
  • CALD1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV3
  • CDM
  • DYSF
  • FER1L1
  • GUC1A2
  • GUC1A3
  • GUC1B3
  • GUCSA2
  • GUCSA3
  • GUCSB3
  • GUCY1A1
  • GUCY1A2
  • GUCY1A3
  • GUCY1B1
  • GUCY1B2
  • GUCY1B3
  • HSRLC
  • ITGA1
  • ITGB5
  • KIAA0866
  • KIAA0894
  • KIAA1027
  • KIAA1120
  • KIAA1123
  • KIAA1296
  • LMOD1
  • LPC1
  • LPC2D
  • MG53
  • MLC1SA
  • MLC2
  • MLCB
  • MLCK
  • MLCK1
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MRLC3
  • MYH11
  • MYL10
  • MYL11
  • MYL12A
  • MYL12B
  • MYL2A
  • MYL5
  • MYL6
  • MYL6B
  • MYL7
  • MYL9
  • MYLC2A
  • MYLC2B
  • MYLC2PL
  • MYLK
  • MYLK1
  • MYLPF
  • MYRL2
  • PAK1
  • PAK2
  • PDE5
  • PDE5A
  • PLRLC
  • PXN
  • RLC
  • SCAM1
  • SH3D5
  • SORBS1
  • SORBS3
  • TLN
  • TLN1
  • TMSA
  • TMSB
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • TPM4
  • TRIM72
  • VCL
Homo sapiens (human)
Glutathione conjugation
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • ESD
  • FAEES3
  • GST1
  • GST12
  • GST2
  • GST3
  • GST4
  • GST5
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTA3
  • GSTA4
  • GSTA5
  • GSTK1
  • GSTM1
  • GSTM2
  • GSTM3
  • GSTM4
  • GSTM5
  • GSTO1
  • GSTO2
  • GSTP1
  • GSTS
  • GSTT1
  • GSTT2
  • GSTT2B
  • GSTTLP28
  • GSTZ1
  • HPGDS
  • MAAI
  • MGST
  • MGST1
  • MGST2
  • MGST3
  • PGDS
  • PTGDS2
Homo sapiens (human)
Formation of xylulose-5-phosphate
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • CRY
  • CRYL1
  • DCXR
  • SDR20C1
  • SORD
  • XYLB
Homo sapiens (human)
Fructose biosynthesis
  • AKR1B1
  • ALDR1
  • ALR2
  • SORD
Homo sapiens (human)
tRNA modification in the nucleus and cytosol
  • ABH8
  • ADAT1
  • ADAT2
  • ADAT3
  • ALKBH8
  • ATPBD3
  • C12orf1
  • C14orf172
  • C16orf84
  • C20orf64
  • C4orf23
  • C6orf75
  • C8orf79
  • C9orf74
  • CCDC76
  • CDKAL1
  • CTU1
  • CTU2
  • DEADC1
  • DNMT2
  • DUS2
  • DUS2L
  • DXS9879E
  • EPRS
  • EPRS1
  • ESO3
  • FTSJ1
  • GCPL1
  • GITA
  • GLNS
  • ICF45
  • IPT
  • ITBA2
  • KIAA1153
  • KIAA1456
  • KIAA1767
  • KIAA1897
  • LAGE3
  • METTL1
  • METTL19
  • MOD5
  • NCS2
  • NCS6
  • NOPD1
  • NSUN2
  • NSUN6
  • OSGEP
  • PARS
  • PRPK
  • PUS3
  • PUS7
  • QARS
  • QPRS
  • QTRT1
  • QTRT2
  • QTRTD1
  • RG9MTD2
  • SAKI
  • TAD3
  • TGT
  • TGUT
  • THADA
  • THG1L
  • TP53RK
  • TPRKB
  • TRDMT1
  • TRIT1
  • TRM4
  • TRM6
  • TRM61
  • TRM9L
  • TRMT1
  • TRMT10A
  • TRMT11
  • TRMT112
  • TRMT13
  • TRMT44
  • TRMT6
  • TRMT61A
  • TRMT9B
  • URM1
  • WDR4
Homo sapiens (human)
Plasmalogen biosynthesis
  • AGPS
  • DAPAT
  • DHAPAT
  • DHRS7B
  • GNPAT
  • SDR32C1
Homo sapiens (human)
Maturation of spike protein
  • C20orf31
  • C20orf49
  • CANX
  • CGS23
  • CXorf11
  • DAD1
  • DDOST
  • EDEM2
  • FUT8
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GCP16
  • GCS1
  • GGNT1
  • GGNT5
  • GLCT1
  • GLYT1
  • GOLGA7
  • IAG2
  • ITM1
  • KIAA0088
  • KIAA0115
  • KIAA1292
  • KIAA1748
  • MAGT1
  • MAN1B1
  • MAN2A1
  • MANA2
  • MGAT
  • MGAT1
  • MGAT2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • MOGS
  • N33
  • NANTA3
  • OST48
  • PRKCSH
  • REAM
  • REC
  • RPN1
  • RPN2
  • S
  • SIAT1
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIATL1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • STHM
  • STT3A
  • STZ
  • TMC
  • TUSC3
  • ZDHHC10
  • ZDHHC11
  • ZDHHC2
  • ZDHHC20
  • ZDHHC3
  • ZDHHC5
  • ZDHHC8
  • ZDHHC9
  • ZDHHCL1
  • ZNF372
  • ZNF375
  • ZNF378
  • ZNF379
  • ZNF380
  • ZNF399
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG10
  • ALG10A
  • ALG10B
  • ALG11
  • ALG12
  • ALG13
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • CXorf45
  • DIBD1
  • DPAGT1
  • DPAGT2
  • GLT28D1
  • GT8
  • HMAT1
  • HMT1
  • KCR1
  • MPDU1
  • NOT
  • NOT56L
  • RFT1
Homo sapiens (human)
Defective ALG9 causes CDG-1l
  • ALG9
  • DIBD1
Homo sapiens (human)
Maturation of spike protein
  • CANX
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GCS1
  • GGNT1
  • GLCT1
  • GLYT1
  • KIAA0088
  • MGAT
  • MGAT1
  • MOGS
  • PRKCSH
  • S
Homo sapiens (human)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • GGNT1
  • GLCT1
  • GLYT1
  • MANEA
  • MGAT
  • MGAT1
Homo sapiens (human)
N-Glycan antennae elongation
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CGS23
  • GGNT5
  • GGTB2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • NANTA3
  • SIAT1
  • SIAT4C
  • SIAT8B
  • SIAT8C
  • SIAT8F
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA6
  • STX
  • STZ
Homo sapiens (human)
Defective MGAT2 causes CDG-2a
  • MGAT2
Homo sapiens (human)
COPII-mediated vesicle transport
  • AAT
  • ANKRD28
  • AREG
  • AREGB
  • BET1
  • BET3
  • BET5
  • C11orf23
  • C14orf163
  • C20orf140
  • C5orf8
  • CD59
  • CNIH
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CNIL
  • COL7A1
  • CPPI
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • D3S1231E
  • EHOC1
  • ERGIC53
  • ERGL
  • F5
  • F5F8D
  • F8
  • F8C
  • FOLR
  • FOLR1
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GOLGA2
  • GOLPH5
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRASP65
  • GRIA1
  • GS27
  • HCKID
  • KIAA0079
  • KIAA0310
  • KIAA0379
  • KIAA0755
  • KIAA0905
  • KIAA0917
  • KIAA1115
  • KIAA1558
  • KIAA1882
  • KIAA1928
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LZTR2
  • MCFD2
  • MIC11
  • MIN1
  • MIN2
  • MIN3
  • MSK21
  • MUM2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NIBP
  • NSF
  • PI
  • PP6R1
  • PP6R3
  • PPP6
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RGPR
  • RNP24
  • SAPL
  • SAPS1
  • SAPS3
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SBDN
  • SCFD1
  • SDGF
  • SDNSF
  • SEC12
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC16
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC16L
  • SEC16S
  • SEC22A
  • SEC22B
  • SEC22C
  • SEC22L1
  • SEC22L2
  • SEC22L3
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SEC31B
  • SEC31L1
  • SEC31L2
  • SEDL
  • SERPINA1
  • SNAPA
  • SNAPB
  • SNAPG
  • STX17
  • STX5
  • STX5A
  • STXBP1L2
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TMEM1
  • TMP21
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC5
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • VDP
  • VIPL
  • YKT6
Homo sapiens (human)
Cargo concentration in the ER
  • AAT
  • AREG
  • AREGB
  • C5orf8
  • CD59
  • CNIH
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CNIL
  • COL7A1
  • CPPI
  • CTAGE5
  • CTSC
  • CTSZ
  • ERGIC53
  • ERGL
  • F5
  • F5F8D
  • F8
  • F8C
  • FOLR
  • FOLR1
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • GS27
  • KIAA0079
  • KIAA0268
  • KIAA0755
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • MEA11
  • MEA6
  • MGEA11
  • MGEA6
  • MIA2
  • MIA3
  • MIC11
  • MIN1
  • MIN2
  • MIN3
  • MSK21
  • PI
  • PREB
  • RNP24
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SDGF
  • SDNSF
  • SEC12
  • SEC22B
  • SEC22L1
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • STX5
  • STX5A
  • TANGO
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TMP21
  • VIPL
Homo sapiens (human)
Adrenoceptors
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1C
  • ADRA1D
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRA2L1
  • ADRA2L2
  • ADRA2R
  • ADRA2RL1
  • ADRA2RL2
  • ADRAR
  • ADRB1
  • ADRB1R
  • ADRB2
  • ADRB2R
  • ADRB3
  • ADRB3R
  • B1AR
  • B2AR
  • B3AR
Homo sapiens (human)
Sialic acid metabolism
  • C1orf13
  • C20orf147
  • CGS23
  • CMAS
  • CTSA
  • ELNR1
  • GLB1
  • GLCNE
  • GNE
  • HDHD4
  • IBM2
  • KIAA1877
  • NANH
  • NANP
  • NANS
  • NANTA3
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • NPL
  • PPGB
  • PST
  • PST1
  • SAS
  • SIAT1
  • SIAT10
  • SIAT2
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7A
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIAT7E
  • SIAT7F
  • SIAT8
  • SIAT8A
  • SIAT8B
  • SIAT8C
  • SIAT8D
  • SIAT8E
  • SIAT8F
  • SIAT9
  • SIATL1
  • SLC17A5
  • SLC35A1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL5
  • ST3GAL6
  • ST6GAL1
  • ST6GAL2
  • ST6GALNAC1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA4
  • ST8SIA5
  • ST8SIA6
  • STHM
  • STX
  • STZ
Homo sapiens (human)
Dissolution of Fibrin Clot
  • AAP
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANX2LG
  • ANXA2
  • CAL1H
  • CAL1L
  • CLP11
  • HRG
  • LPC2D
  • MO3
  • PAI1
  • PAI2
  • PI6
  • PI7
  • PI8
  • PLANH1
  • PLANH2
  • PLAT
  • PLAU
  • PLAUR
  • PLG
  • PLI
  • PN1
  • PTI
  • S100A10
  • SERPINB2
  • SERPINB6
  • SERPINB8
  • SERPINE1
  • SERPINE2
  • SERPINF2
  • UPAR
Homo sapiens (human)
Intrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • A2M
  • AT3
  • BDK
  • C1IN
  • C1NH
  • C1QBP
  • CPAMD5
  • F10
  • F11
  • F12
  • F2
  • F8
  • F8C
  • F8VWF
  • F9
  • GC1QBP
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • HABP1
  • HCF2
  • KLK3
  • KLKB1
  • KNG
  • KNG1
  • PCI
  • PCP
  • PI7
  • PLANH3
  • PN1
  • PRCP
  • PROC
  • PROCI
  • PROS
  • PROS1
  • SERPINA5
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • SERPING1
  • SF2P32
  • VWF
Homo sapiens (human)
HDL assembly
  • A2M
  • ABC1
  • ABCA1
  • APOA1
  • CERP
  • CPAMD5
  • KIAA1292
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • ZDHHC8
  • ZDHHCL1
  • ZNF378
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024