GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 701 - 725 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Linoleic acid (LA) metabolism
  • ABCD1
  • ACSL1
  • ALD
  • CIG30
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
FGFR3b ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF9
  • FGFA
Homo sapiens (human)
Biogenic amines are oxidatively deaminated to aldehydes by MAOA and MAOB
  • MAOA
  • MAOB
Homo sapiens (human)
Defective ABCD4 causes MAHCJ
  • ABCD4
  • C6orf209
  • LMBRD1
  • NESI
  • PXMP1L
Homo sapiens (human)
KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA
  • AKT1
  • CML28
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSL4
  • CSPB1
  • DAN
  • DCP2
  • DIS3
  • EXOSC1
  • EXOSC2
  • EXOSC3
  • EXOSC4
  • EXOSC5
  • EXOSC6
  • EXOSC7
  • EXOSC8
  • EXOSC9
  • FUBP2
  • KHSRP
  • KIAA0116
  • KIAA1008
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MTR3
  • MXI2
  • NUDT20
  • OIP2
  • PARN
  • PKB
  • PMSCL1
  • PRKM11
  • RAC
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP44
  • RRP46
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKI6
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Sperm Motility And Taxes
  • C14orf161
  • C19orf15
  • CATSPER1
  • CATSPER2
  • CATSPER3
  • CATSPER4
  • CATSPERB
  • CATSPERD
  • CATSPERG
  • HVCN1
  • KCNMA3
  • KCNMC1
  • KCNU1
  • SLO3
  • TMEM146
  • VSOP
Homo sapiens (human)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
  • FGF10
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGFB
  • FGFR5
  • FGFRL1
  • FHFR
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • SPRED1
  • SPRED2
Homo sapiens (human)
Reduction of cytosolic Ca++ levels
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CNC
  • KIAA1087
  • MXRA1
  • NCX1
  • NCX2
  • NCX3
  • PMCA1
  • PMCA2
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
Homo sapiens (human)
Neurotransmitter clearance
  • ACHE
  • BCHE
  • CHE1
  • OCT1
  • OCT2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
Homo sapiens (human)
Association of TriC/CCT with target proteins during biosynthesis
  • 99D8.1
  • AP3M1
  • APRF
  • ARFGEF2
  • ARFGEP2
  • BIG2
  • C21orf112
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CCT1
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT6B
  • CCT7
  • CCT8
  • CCTA
  • CCTB
  • CCTD
  • CCTE
  • CCTG
  • CCTH
  • CCTQ
  • CCTZ
  • DCAF7
  • DDX13
  • FBG2
  • FBL3A
  • FBL4
  • FBL5
  • FBS2
  • FBW2
  • FBW4
  • FBW5
  • FBW7
  • FBW9
  • FBX30
  • FBX4
  • FBX6
  • FBXL3
  • FBXL3A
  • FBXL5
  • FBXO4
  • FBXO6
  • FBXW10
  • FBXW2
  • FBXW4
  • FBXW5
  • FBXW7
  • FBXW9
  • FKBP60
  • FKBP63
  • FKBP9
  • FLR1
  • FWD2
  • GAPD2
  • GAPDH2
  • GAPDHS
  • GAPDS
  • GBA
  • GBA1
  • GC
  • GLUC
  • HAN11
  • HDAC3
  • KIAA0002
  • KIAA0098
  • KIF13A
  • LONP
  • LONP2
  • NIP7-1
  • NOL5A
  • NOP56
  • P53
  • RBKIN
  • SEL10
  • SHFM3
  • SK1
  • SKI2W
  • SKIC2
  • SKIV2
  • SKIV2L
  • SPHK
  • SPHK1
  • SPK
  • SRB
  • STAT3
  • TCAB1
  • TCP1
  • TP53
  • TRIC5
  • UHX1
  • USP11
  • W
  • WDR68
  • WDR79
  • WRAP53
  • XRN2
Homo sapiens (human)
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLASB
  • LCK
  • PTPN22
  • PTPN8
  • SRK
  • T3D
  • T3E
  • T3G
  • TCRA
  • TCRBV12S3
  • TCRBV8S1
  • TRAC
  • TRAV19
  • TRAV29DV5
  • TRAV8-4
  • TRBC1
  • TRBV12-3
  • TRBV7-9
  • ZAP70
Homo sapiens (human)
Specification of primordial germ cells
  • BLIMP1
  • BMP2B
  • BMP4
  • CBFA2T2
  • CXCR4
  • DVR4
  • EHT
  • EOMES
  • GP36
  • KIAA1546
  • MTGR1
  • NANOG
  • NANOS3
  • NOS3
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • PDPN
  • POU5F1
  • PRDM1
  • SOX17
  • TBR2
  • TET2
  • TFAP2C
Homo sapiens (human)
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs
  • CBP20
  • CBP80
  • COD
  • HBP
  • KIAA1141
  • LSM10
  • LSM11
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • PBSCF
  • PBSCG
  • SLBP
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • ZFP100
  • ZNF473
Homo sapiens (human)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGC1
  • AGRIN
  • AGRN
  • ASPN
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • BNSP
  • CD11C
  • CD49B
  • CMP
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • CRTL1
  • CRTM
  • CSPG1
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG7
  • DAG1
  • DCN
  • DMP1
  • DSPP
  • FM
  • FMOD
  • FNRB
  • GP2B
  • GP3A
  • HAPLN1
  • HSPG2
  • HXB
  • HXBL
  • IBSP
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAB
  • ITGAV
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • KIAA0533
  • KIAA0816
  • KIAA1907
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMA2
  • LAMA3
  • LAMA4
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMC1
  • LAMM
  • LAMNA
  • LAMS
  • LDC
  • LRP10
  • LRP4
  • LUM
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • MDF2
  • MEGF7
  • MSK12
  • MSK16
  • MSK8
  • MUSK
  • NCAM
  • NCAM1
  • NCAN
  • NEUR
  • ON
  • PAI1
  • PLANH1
  • PLAP1
  • PTPRS
  • SERPINE1
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • SLRR1C
  • SLRR2D
  • SLRR2E
  • SPARC
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TNC
  • TNN
  • TNR
  • TNW
  • TNX
  • TNXB
  • TNXB1
  • TNXB2
  • VCAN
  • VNRA
  • VTN
  • VTNR
  • XB
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation by RUNX2
  • BAX
  • BCL1
  • BCL2L4
  • BHLHA26
  • BHLHA38
  • BHLHA39
  • BMP2
  • BMP2A
  • CAP20
  • CBFB
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCND1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK4
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • DERMO1
  • DHAND
  • HAND2
  • HDAC6
  • KIAA0901
  • MDA6
  • P34CDC2
  • PIC1
  • PPM1D
  • PRAD1
  • SDI1
  • SOX9
  • TWIST
  • TWIST1
  • TWIST2
  • WAF1
  • WIP1
Homo sapiens (human)
Resistance of ERBB2 KD mutants to lapatinib
  • CDC37
  • CDC37A
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • HER2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MLN19
  • NEU
  • NGL
Homo sapiens (human)
HIV elongation arrest and recovery
  • C19orf17
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDK9
  • COBRA1
  • CPR4
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • WHSC2
Homo sapiens (human)
Synthesis of PI
  • CDIPT
  • CDS
  • CDS1
  • DRES9
  • KIAA1457
  • NIR1
  • NIR2
  • NIR3
  • PIS
  • PIS1
  • PITPNM
  • PITPNM1
  • PITPNM2
  • PITPNM3
Homo sapiens (human)
3-Methylcrotonyl-CoA carboxylase deficiency
  • MCCA
  • MCCB
  • MCCC1
  • MCCC2
Homo sapiens (human)
Other interleukin signaling
  • C16orf77
  • C17orf33
  • CASP3
  • CD4
  • CPP32
  • CRFB4
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • D21S58
  • D21S66
  • FMS
  • GCSF
  • GCSFR
  • HTPZP2
  • IFNL1
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL16
  • IL28RA
  • IL29
  • IL32
  • IL34
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • LICR2
  • MBN
  • NK4
  • PRTN3
  • PTPRZ
  • PTPRZ1
  • PTPRZ2
  • PTPZ
  • SDC
  • SDC1
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • STX3
  • STX3A
  • STX4
  • STX4A
  • STXBP2
  • SYB2
  • TAIF
  • TXLN
  • TXLNA
  • TYK2
  • UNC18B
  • VAMP2
  • ZCYTO21
Homo sapiens (human)
JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • JNK1
  • JNK2
  • JNK3
  • JNK3A
  • JNKK1
  • JNKK2
  • KIAA0733
  • MAP2K4
  • MAP2K7
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK10
  • MAPK8
  • MAPK9
  • MEK4
  • MEK7
  • MKK4
  • MKK7
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM10
  • PRKM8
  • PRKM9
  • PRKMK4
  • PRKMK7
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK1
  • SAPK1A
  • SAPK1B
  • SAPK1C
  • SEK1
  • SERK1
  • SKK1
  • SKK4
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
MAPK1 (ERK2) activation
  • ERK2
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MEK2
  • MKK2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKMK2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
G0 and Early G1
  • BARA
  • C14orf46
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN2
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • DYRK
  • DYRK1A
  • E2F4
  • E2F5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MNB
  • MNBH
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
Homo sapiens (human)
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • ADRM1
  • AJUBA
  • BHLHE17
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • C1orf12
  • C7orf76
  • CUL2
  • DSS1
  • EGLN1
  • EGLN2
  • EGLN3
  • EIT6
  • ELOB
  • ELOC
  • EPAS1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HIF1A
  • HIF2A
  • HIF3A
  • HSPC
  • JUB
  • KIAA0107
  • LIMD1
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOP1
  • MOP2
  • MOP7
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PASD2
  • PASD7
  • PASD8
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PUBC1
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • VHL
  • WTIP
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT1
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • B3GALT5
  • B4GALNT2
  • CGS23
  • ELFT
  • FCT3A
  • FT3B
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT3
  • FUT4
  • FUT5
  • FUT6
  • FUT7
  • FUT9
  • GALGT2
  • GALT4
  • LE
  • NANTA3
  • SEC2
  • SIAT10
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7F
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
  • STZ
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024