GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 776 - 800 of 2074 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • 9804
  • ALPG
  • ALPI
  • ALPL
  • ALPPL
  • ALPPL2
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • C11orf34
  • C4.4A
  • C6orf23
  • C6orf24
  • CD109
  • CD16B
  • CD52
  • CDW52
  • CEA
  • CEACAM5
  • CEACAM7
  • CGM2
  • CNTN3
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CO16
  • CPAMD7
  • CPM
  • DO
  • DOK1
  • DPL
  • E48
  • ESP1
  • FCG3
  • FCGR3
  • FCGR3B
  • FOLR2
  • FOLR4
  • G6C
  • G6D
  • GP2
  • GPIHBP1
  • GPLD1
  • HBP1
  • HE5
  • IGFR3
  • IGLON1
  • IGLON2
  • IGLON3
  • IGLON4
  • IZUMO1R
  • JUNO
  • KIAA0976
  • KIAA1496
  • KIAA1857
  • LAMP
  • LMNT1
  • LMNT2
  • LSAMP
  • LY6D
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6G6D
  • LY6H
  • LY6K
  • LYPD1
  • LYPD2
  • LYPD3
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD6B
  • LYPD8
  • LYPDC1
  • LYPDC2
  • Lynx2
  • MAMDC1
  • MAMDC3
  • MAP97
  • MDGA1
  • MDGA2
  • MEGT1
  • MELTF
  • MFI2
  • MPF
  • MSLN
  • N2DL2
  • NEGR1
  • NG24
  • NG25
  • NGRH1
  • NGRH2
  • NGRL2
  • NGRL3
  • NRN
  • NRN1
  • NRN1L
  • NT
  • NTM
  • NTNG1
  • NTNG2
  • OBCAM
  • OPCML
  • OTOA
  • PANG
  • PIGPLD1
  • PLET1
  • PRND
  • PRSS21
  • PRSS41
  • PSCA
  • RAET1G
  • RAET1H
  • RAET1L
  • RECK
  • RIGE
  • RTN4RL1
  • RTN4RL2
  • SAMP14
  • SCA2
  • SGRG
  • SHO
  • SPACA4
  • SPRN
  • ST15
  • TECTA
  • TECTB
  • TESSP1
  • TEST1
  • TEX101
  • THY1
  • TMART
  • TSA1
  • ULBP2
  • ULBP5
  • ULBP6
  • VNN1
  • VNN2
  • XPNPEP2
Homo sapiens (human)
Post-transcriptional silencing by small RNAs
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • CAGH26
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
Post-chaperonin tubulin folding pathway
  • ARL2
  • CG22
  • CKAP1
  • KIAA0988
  • SSD1
  • TBCA
  • TBCB
  • TBCC
  • TBCD
  • TBCE
  • TFCD
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA4
  • TUBA4A
  • TUBA4B
  • TUBA6
  • TUBA8
  • TUBAL2
  • TUBAL3
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
Homo sapiens (human)
Polymerase switching on the C-strand of the telomere
  • ACD
  • C16orf41
  • C17orf106
  • C17orf68
  • CHTF18
  • CHTF8
  • CTC1
  • CTF18
  • CTF8
  • DCC1
  • DRIP5
  • DSCC1
  • KIAA0039
  • OBFC1
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • PTOP
  • RAP1
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • STN1
  • TEN1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
Homo sapiens (human)
Polymerase switching
  • KIAA0039
  • PCNA
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
Homo sapiens (human)
Polo-like kinase mediated events
  • BARA
  • BMYB
  • C14orf46
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC25A
  • CDC25C
  • CENPF
  • CXCDC1
  • EP300
  • FKHL16
  • FOXM1
  • HFH11
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MPP2
  • MYBL2
  • MYT1
  • P300
  • PKMYT1
  • PLK
  • PLK1
  • RBAP48
  • RBBP4
  • TGS
  • WEE1
  • WIN
Homo sapiens (human)
Plus-strand DNA synthesis
  • CYPA
  • PPIA
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Platelet sensitization by LDL
  • APOB
  • APOER2
  • CPLA2
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FGR
  • HCP
  • KIAA0044
  • LRP8
  • MAPK14
  • MXI2
  • PECAM1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SAPK2A
  • SHPTP2
  • SRC2
Homo sapiens (human)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • P2RXL1
  • P2X1
  • P2X2
  • P2X5
  • P2X5FL
  • P2X6
  • PAFAH2
Homo sapiens (human)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • A2M
  • A4
  • AACT
  • AAP
  • AAT
  • ABCC4
  • ACTBL3
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AD1
  • AGP1
  • AGP2
  • AHSG
  • ALB
  • ALDA
  • ALDOA
  • ANX5
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • APOH
  • APOJ
  • APOOL
  • APP
  • APPL2
  • ARMET
  • ARP
  • AXLLG
  • B2G1
  • BCG1
  • BDK
  • BHPCDH
  • BRPF3
  • C1IN
  • C1NH
  • C6orf21
  • C6orf56
  • C9orf167
  • CALM
  • CALM1
  • CALU
  • CAM
  • CAM1
  • CAP
  • CAP1
  • CD109
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37B
  • CDC37L1
  • CFD
  • CFL
  • CFL1
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLGI
  • CLI
  • CLU
  • CPAMD5
  • CPAMD7
  • CTAP3
  • CTSW
  • CXCL4
  • CXCL7
  • CXorf33
  • CYB5R1
  • CYPA
  • CYRI
  • CYRIB
  • DF
  • EBAF
  • ECM
  • ECM1
  • EGF
  • EMILIN4
  • ENDOD1
  • ENX2
  • F13A
  • F13A1
  • F5
  • F8
  • F8C
  • F8VWF
  • FAM121A
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FERMT3
  • FETUA
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FIGF
  • FLN
  • FLN1
  • FLNA
  • FN
  • FN1
  • G6F
  • GAS6
  • GLBA
  • GMRP
  • GP2B
  • GP3A
  • GP3B
  • GP4
  • GPIA*
  • GRMP
  • GRP78
  • GTPBP2
  • GTPBP9
  • HABP4
  • HARC
  • HGF
  • HPTA
  • HRG
  • HSPA5
  • IBP1
  • IGF1
  • IGF2
  • IHRP
  • ILEI
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • ITIH3
  • ITIH4
  • ITIHL1
  • KIAA0120
  • KIAA0206
  • KIAA0680
  • KIAA0830
  • KIAA1027
  • KIAA1286
  • KIAA1830
  • KIND3
  • KNG
  • KNG1
  • KST
  • KUB1
  • LAMP2
  • LEFTA
  • LEFTY2
  • LEFTYA
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LY6G6D
  • LY6G6F
  • M2BP
  • MAGED2
  • MANF
  • MIC27
  • MIC3
  • MIG2B
  • MLA1
  • MMRN
  • MMRN1
  • MOATB
  • MRP4
  • NG32
  • NHLRC2
  • NQO3A2
  • OLA1
  • ON
  • ORM1
  • ORM2
  • P47
  • PAI1
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PF4
  • PFD
  • PFN1
  • PHACTR2
  • PI
  • PI4
  • PK120
  • PLANH1
  • PLEK
  • PLG
  • PLI
  • POTEKP
  • PP4
  • PPBP
  • PPIA
  • PRG
  • PRG1
  • PROS
  • PROS1
  • PSAP
  • QSCN6
  • QSOX1
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SAP1
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SCYB4
  • SCYB7
  • SELENOP
  • SELP
  • SEPP1
  • SERPINA1
  • SERPINA3
  • SERPINA4
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SIS
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SPP24
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TB4X
  • TEX264
  • TF
  • TGB1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TGFB4
  • THBGB1
  • THBS1
  • THYB4
  • TIG2
  • TIMP
  • TIMP1
  • TIMP3
  • TLN
  • TLN1
  • TMSB4
  • TMSB4X
  • TMX3
  • TNA
  • TOR4A
  • TSP
  • TSP1
  • TSPAN29
  • TSPAN30
  • TTN
  • TUBA1
  • TUBA4A
  • TXNDC10
  • UNC18B
  • URP2
  • VCL
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
  • VTI1
  • VTI1B
  • VTI1L
  • VTI1L1
  • VTI2
  • VWF
  • WDR1
  • ZSIG11
Homo sapiens (human)
Platelet Aggregation (Plug Formation)
  • F2
  • F8VWF
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • MGDF
  • MPL
  • THPO
  • TPOR
  • VWF
Homo sapiens (human)
Platelet Adhesion to exposed collagen
  • ADAMTS13
  • C9orf8
  • CD49B
  • F8VWF
  • FCER1G
  • FNRB
  • FYN
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP6
  • GP9
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA2
  • ITGB1
  • JTK8
  • LYN
  • MDF2
  • MSK12
  • VWF
Homo sapiens (human)
Plasmalogen biosynthesis
  • AGPS
  • DAPAT
  • DHAPAT
  • DHRS7B
  • GNPAT
  • SDR32C1
Homo sapiens (human)
Physiological factors
  • ANP
  • ANPRA
  • ANPRB
  • CES1
  • CES2
  • CNP2
  • CORIN
  • CRN
  • CSX
  • EPN
  • GATA4
  • HIPK1
  • HIPK2
  • KAT2B
  • KIAA0630
  • MME
  • MYAK
  • NBAK2
  • NKX2-5
  • NKX2.5
  • NKX2E
  • NPPA
  • NPPC
  • NPR1
  • NPR2
  • PCAF
  • PND
  • SES1
  • TAZ
  • TBX5
  • TMPRSS10
  • WWTR1
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of the APC/C
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC16
  • CDC2
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • KIAA1406
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
  • SFT
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of proteins involved in G1/S transition by active Cyclin E:Cdk2 complexes
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN2
  • RB1
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of Emi1
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC20
  • CDC28A
  • CDH1
  • CDK1
  • CDKN1
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • KIAA1242
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • CBP
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CD45
  • CSK
  • DEP1
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLASB
  • LCK
  • PAG
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPN8
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • T3D
  • T3E
  • T3G
  • TCRA
  • TCRBV12S3
  • TCRBV8S1
  • TRAC
  • TRAV19
  • TRAV29DV5
  • TRAV8-4
  • TRBC1
  • TRBV12-3
  • TRBV7-9
Homo sapiens (human)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • JTK2
  • KLB
  • KS3
  • PLC1
  • PLCG1
  • TKF
Homo sapiens (human)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • KS3
  • PLC1
  • PLCG1
Homo sapiens (human)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KS3
  • PLC1
  • PLCG1
Homo sapiens (human)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • PLC1
  • PLCG1
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins
  • CD39
  • CD39L1
  • CD39L2
  • CD39L3
  • CD39L4
  • ENTPD1
  • ENTPD2
  • ENTPD3
  • ENTPD4
  • ENTPD5
  • ENTPD6
  • ENTPD7
  • ENTPD8
  • IL6ST2
  • KIAA0392
  • LALP1
  • LALP70
  • LYSAL1
  • PCPH
Homo sapiens (human)
Phenylalanine metabolism
  • ALP
  • ASRGL1
  • CCBL1
  • CRASH
  • DCOH
  • DHPR
  • FIG1
  • IL4I1
  • KYAT1
  • PAH
  • PCBD
  • PCBD1
  • QDPR
  • SDR33C1
Homo sapiens (human)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP
  • ABP1
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES2
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5M
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • DAC
  • DAO
  • DIA1
  • EPHX
  • EPHX1
  • EPOX
  • ICE
  • KIAA0307
  • KIAA1234
  • MARC1
  • MARC2
  • MCNAA
  • MOSC1
  • MOSC2
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NMOR2
  • NQO2
  • OMB5
  • SDR21C2
  • SES1
  • VAP1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: December 9, 2024