GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1776 - 1800 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism
  • ATA1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLNS
  • GLT1
  • GLUL
  • NAT2
  • SAT1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC38A1
  • SNAT1
Homo sapiens (human)
Inhibition of replication initiation of damaged DNA by RB1/E2F1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R3B
  • PPP2R3L
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • RB1
  • RBBP3
  • TFDP1
  • TFDP2
Homo sapiens (human)
Defective MAOA causes BRUNS
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Defective RIPK1-mediated regulated necrosis
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
Homo sapiens (human)
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production
  • CBP
  • CREBBP
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • EP300
  • GCF2
  • IRF3
  • LRRFIP1
  • P300
  • TRIP
Homo sapiens (human)
Defective SLC17A8 causes autosomal dominant deafness 25 (DFNA25)
  • SLC17A8
  • VGLUT3
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of lauroyl-CoA to decanoyl-CoA-CoA
  • ACADL
  • ECHS1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADHA
  • HADHB
  • HADHSC
  • SCHAD
Homo sapiens (human)
ER-Phagosome pathway
  • ABCB2
  • ABCB3
  • ADRM1
  • AGMX1
  • ATK
  • B2M
  • BPK
  • BTK
  • C7orf76
  • CAGA
  • CAGB
  • CALR
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • CHUK
  • CRTC
  • DSS1
  • ERP57
  • ERP60
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FIP3
  • GP110
  • GP3B
  • GP4
  • GRP58
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HMG1
  • HMGB1
  • HSPC
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0012
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • LY96
  • MAL
  • MB1
  • MD2
  • MIP224
  • MOV34L
  • MRP14
  • MRP8
  • MSS1
  • MYD88
  • NEMO
  • NGS17
  • NU
  • PDIA3
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSF1
  • PSF2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RING11
  • RING4
  • RPS27A
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • SEC22B
  • SEC22L1
  • SEC61A
  • SEC61A1
  • SEC61A2
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SNAP23
  • STX4
  • STX4A
  • SUG1
  • SUG2
  • SYB3
  • TAP1
  • TAP2
  • TAPA
  • TAPBP
  • TBP1
  • TBP7
  • TCF16
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VAMP3
  • VAMP8
  • X
  • Y
  • Y1
  • Y3
  • Z
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
Ovarian tumor domain proteases
  • ABIN2
  • ABIN3
  • APC
  • ARH12
  • ARHA
  • C14orf137
  • C15orf16
  • CAP-1
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CEZANNE2
  • CRAF1
  • DDX58
  • DP2.5
  • DUBA8
  • EFP
  • ESR
  • ESR1
  • FIP3
  • FLIP1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HIN7
  • IFIH1
  • IKBKG
  • IPS1
  • KIAA0113
  • KIAA0459
  • KIAA1271
  • KIAA1850
  • LIND
  • MAVS
  • MDA5
  • MMAC1
  • NAF1
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • NR3A1
  • OTB1
  • OTB2
  • OTU1
  • OTU2
  • OTUB1
  • OTUB2
  • OTUD2
  • OTUD3
  • OTUD5
  • OTUD7
  • OTUD7A
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • P34CDC2
  • P53
  • PTEN
  • RH116
  • RHO12
  • RHOA
  • RICK
  • RIGI
  • RIP
  • RIP1
  • RIP2
  • RIPK1
  • RIPK2
  • RNF128
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • RPS27A
  • SFT
  • TEP1
  • TNFAIP3
  • TNIP1
  • TNIP2
  • TNIP3
  • TP53
  • TRABID
  • TRAF3
  • TRAF6
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • TRIM4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBE2D1
  • VCIP135
  • VCP
  • VCPIP1
  • VISA
  • YOD1
  • ZA20D1
  • ZNF147
  • ZRANB1
Homo sapiens (human)
NTF3 activates NTRK3 signaling
  • NTF3
  • NTRK3
  • TRKC
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of butanoyl-CoA to acetyl-CoA
  • ACADS
  • ACSM3
  • ACSM6
  • C10orf129
  • ECHS1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADHSC
  • SAH
  • SCHAD
Homo sapiens (human)
Defective GALNT3 causes HFTC
  • C6orf205
  • CA125
  • DRCC1
  • GALNT3
  • KIAA1359
  • MG2
  • MUC1
  • MUC11
  • MUC12
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC16
  • MUC17
  • MUC19
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC21
  • MUC3
  • MUC3A
  • MUC3B
  • MUC4
  • MUC5
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
  • MUC7
  • MUCL1
  • PUM
  • RECC
  • SBEM
  • SMUC
Homo sapiens (human)
Signal attenuation
  • ERK1
  • ERK2
  • GRB10
  • GRBIR
  • INS
  • INSR
  • IRS1
  • IRS2
  • KIAA0207
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Activated NTRK2 signals through FYN
  • BDNF
  • GRIN2B
  • NMDAR2B
  • NTRK2
  • SRC
  • SRC1
  • TRKB
Homo sapiens (human)
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription
  • BCL8B
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BHLHE39
  • BHLHE78
  • CBP
  • CCNC
  • CDK8
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CTG26
  • CUL1
  • CXorf6
  • EMC19
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRG4
  • GRL
  • HDAC1
  • HDAC10
  • HDAC11
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC4
  • HDAC5
  • HDAC6
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HDAC7B
  • HDAC8
  • HDAC9
  • HDACL1
  • HDRP
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HIF1A
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • IRA1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA0288
  • KIAA0600
  • KIAA0744
  • KIAA0901
  • KIAA1047
  • KIAA1261
  • KIAA1544
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • LYST2
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MITR
  • MOP1
  • MYC
  • NBEA
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOTCH1
  • OCP2
  • P300
  • PASD8
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SKIIP
  • SKIP
  • SKP1
  • SKP1A
  • SNW1
  • TAN1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TCEB1L
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 fusions
  • BEK
  • FGFR2
  • KGFR
  • KSAM
Homo sapiens (human)
IRAK2 mediated activation of TAK1 complex
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • RNF85
  • RPS27A
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Translation initiation complex formation
  • CCG2
  • D6S218E
  • DDX2A
  • DDX2B
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4B
  • EIF4C
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EIF4H
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0038
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PCID1
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • TRIP1
  • UBA80
  • UBCEP1
  • WBSCR1
  • WSCR1
Homo sapiens (human)
Defective APRT disrupts adenine salvage
  • APRT
Homo sapiens (human)
Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP)
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • APRF
  • BAT8
  • BMK1
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C6orf30
  • C9orf17
  • CAP20
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CDK2
  • CDK4
  • CDK6
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CDKN2B
  • CDKN2C
  • CDKN2D
  • CDKN6
  • CEBPB
  • CENP-27
  • CIP1
  • CXCL8
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • EHMT1
  • EHMT2
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK5
  • EUHMTASE1
  • FOS
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • G0S7
  • G9A
  • GLP
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • HPX42B
  • IFNB2
  • IGFBP7
  • IL1A
  • IL1F1
  • IL6
  • IL8
  • ISPK1
  • JUN
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • KIAA1876
  • KIP1
  • KMT1C
  • KMT1D
  • MAC25
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • MDA6
  • MTS1
  • MTS2
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NG36
  • PIC1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM7
  • PSF
  • RELA
  • RPS27A
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
  • SDI1
  • SFT
  • STAT3
  • TCF5
  • TSG24
  • TSH2B
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • VENTX
  • VENTX2
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
2-LTR circle formation
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • G22P1
  • G22P2
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • LIG4
  • PSIP1
  • PSIP2
  • XRCC4
  • XRCC5
  • XRCC6
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Cleavage of the damaged purine
  • AAG
  • ACD
  • ANPG
  • DRIP5
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
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Homo sapiens (human)
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Homo sapiens (human)
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Last updated: December 9, 2024