GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 2001 - 2025 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Regulation of APC/C activators between G1/S and early anaphase
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC16
  • CDC2
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDC28A
  • CDH1
  • CDK1
  • CDK2
  • CDKN1
  • CDKN2
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • P34CDC2
  • SFT
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
H139Hfs13* PPM1K causes a mild variant of MSUD
  • BCATE2
  • BCKDHA
  • BCKDHB
  • BCKDHE2
  • DBT
  • DLD
  • GCSL
  • LAD
  • PHE3
  • PP2CM
  • PPM1K
Homo sapiens (human)
Turbulent (oscillatory, disturbed) flow shear stress activates signaling by PIEZO1 and integrins in endothelial cells
  • ABL
  • ABL1
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANXA2
  • CAL1H
  • CANPL2
  • CAPN2
  • CAPN4
  • CAPNS
  • CAPNS1
  • CAPNS2
  • CHUK
  • FAK
  • FAK1
  • FAM38A
  • FIP3
  • FNRA
  • FNRB
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNAQ
  • GP3A
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IKKE
  • IKKI
  • ITGA5
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • JTK7
  • KIAA0151
  • KIAA0233
  • LPC2D
  • MAD3
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • PIEZO1
  • PPP2CA
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R2A
  • PTK2
  • PTP1B
  • PTPN1
  • RELA
  • STAT1
  • TCF16
  • VCL
  • VNRA
  • VTNR
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
Defective HDR through Homologous Recombination Repair (HRR) due to PALB2 loss of BRCA1 binding function
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
HCN channels
  • BCNG1
  • BCNG2
  • HCN1
  • HCN2
  • HCN3
  • HCN4
  • KIAA1535
Homo sapiens (human)
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • ACTN2
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GLUR2
  • GLUR3
  • GLUR4
  • GLURC
  • GRIA1
  • GRIA2
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GluA2
  • GluA3
  • GluA4
  • GluN2D
  • KIAA0968
  • KIAA1232
  • KIAA1365
  • LAP1
  • LRRC7
  • NEFL
  • NF68
  • NFL
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • PSD95
Homo sapiens (human)
NFE2L2 regulating TCA cycle genes
  • IDH1
  • ME1
  • NFE2L2
  • NRF2
  • PICD
Homo sapiens (human)
Activation of AMPK downstream of NMDARs
  • AMPK
  • AMPK1
  • AMPK2
  • AMPKG3
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMKK2
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
Homo sapiens (human)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • KIAA0935
  • LAMAN
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANA
  • MANA1
  • MANB
  • MANB1
  • MANBA
Homo sapiens (human)
HS-GAG degradation
  • AGRIN
  • AGRN
  • ELNR1
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GUSB
  • HEP
  • HPA
  • HPA1
  • HPA2
  • HPR1
  • HPSE
  • HPSE1
  • HPSE2
  • HSE1
  • HSPG1
  • HSPG2
  • HSS
  • IDS
  • IDUA
  • KIAA0468
  • NAGLU
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SGSH
  • SIDS
  • UFHSD1
Homo sapiens (human)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • DER1
  • DERL1
  • ENGASE
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GCS1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • KIAA0088
  • KIAA0152
  • MLEC
  • MOGS
  • NGLY1
  • PNG1
  • PRKCSH
  • PSMC1
  • RAD23B
  • RNF45
  • RPS27A
  • SAKS1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN1
  • VCP
Homo sapiens (human)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • AGC1
  • CSPG1
  • ELNR1
  • FM
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • MSK16
  • OGN
  • OIF
  • OMD
  • PRELP
  • SLRR2A
  • SLRR2B
  • SLRR2C
  • SLRR2D
  • SLRR2E
  • SLRR3A
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSC1
  • ARSD
  • ARSE
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH
  • ASAH1
  • ASAH2
  • ASM
  • CBG
  • CBGL1
  • CTSA
  • ELNR1
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GC
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GLBA
  • GLUC
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • HNAC1
  • KIAA1001
  • KIAA1418
  • KIAA1605
  • M6PR
  • MPR46
  • MPRD
  • NANH
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • PPGB
  • PSAP
  • SAP1
  • SKNY
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • SPG46
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • TSULF
Homo sapiens (human)
Defective HEXA causes GM2G1
  • HEXA
Homo sapiens (human)
Defective HEXB causes GM2G2
  • HEXB
Homo sapiens (human)
Scavenging by Class A Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • APOE
  • CALR
  • CLP1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COLEC11
  • COLEC12
  • CRARF
  • CRARF1
  • CRTC
  • FTH
  • FTH1
  • FTHL6
  • FTL
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • MARCO
  • MASP1
  • MSR1
  • NSR2
  • PNSP1
  • PRSS5
  • SCARA1
  • SCARA2
  • SCARA4
  • SCARA5
  • SCGB3A2
  • SRCL
  • TRA1
  • UGRP1
Homo sapiens (human)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • HYAL3
  • IDS
  • IDUA
  • LUCA1
  • LUCA3
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • SIDS
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
Pentose phosphate pathway
  • CARKL
  • DERA
  • G6PD
  • PGD
  • PGDH
  • PGLS
  • PGM2
  • RBKS
  • RBSK
  • RPE
  • RPEL1
  • RPI
  • RPIA
  • SHPK
  • TAL
  • TALDO
  • TALDO1
  • TALDOR
  • TKT
Homo sapiens (human)
MPS IX - Natowicz syndrome
  • HYAL1
  • LUCA1
Homo sapiens (human)
MPS VII - Sly syndrome
  • GUSB
Homo sapiens (human)
Hyaluronan uptake and degradation
  • APNH1
  • CD44
  • CHP
  • CHP1
  • CRSBP1
  • FEEL2
  • FELL
  • FEX2
  • GUSB
  • HAR
  • HARE
  • HEXA
  • HEXB
  • HMMR
  • HYAL1
  • HYAL2
  • HYAL3
  • IHABP
  • LHR
  • LUCA1
  • LUCA2
  • LUCA3
  • LYVE1
  • MDU2
  • MDU3
  • MIC4
  • NHE1
  • RHAMM
  • SLC9A1
  • STAB2
  • XLKD1
Homo sapiens (human)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS
  • HAS1
  • HAS2
  • HAS3
  • HYBID
  • KIAA1199
  • MRP5
Homo sapiens (human)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT1
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • B3GALT5
  • B4GALNT2
  • CGS23
  • ELFT
  • FCT3A
  • FT3B
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT3
  • FUT4
  • FUT5
  • FUT6
  • FUT7
  • FUT9
  • GALGT2
  • GALT4
  • LE
  • NANTA3
  • SEC2
  • SIAT10
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7F
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
  • STZ
Homo sapiens (human)
Alkylating DNA damage induced by chemotherapeutic drugs
Homo sapiens (human)
Reversible DNA damage induced by alkylating chemotherapeutic drugs
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024