GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 301 - 325 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Signaling by LTK in cancer
  • CLIP1
  • CYLN1
  • ERK1
  • ERK2
  • GRB1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RSN
Homo sapiens (human)
Relaxin receptors
  • GPCR135
  • GPCR142
  • GPR100
  • GPR106
  • GREAT
  • INSL3
  • INSL5
  • INSL7
  • LGR7
  • LGR8
  • RLF
  • RLN2
  • RLN3
  • RLN3R1
  • RLN3R2
  • RLNL
  • RXFP1
  • RXFP2
  • RXFP3
  • RXFP4
  • RXN3
  • SALPR
  • ZINS4
Homo sapiens (human)
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins
  • ADD1
  • ADDA
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CMAP
  • CPP32
  • DBNL
  • GAS2
  • GSN
  • MAPT
  • MAPTL
  • MCH2
  • MCH3
  • MCH5
  • MTBT1
  • NEAS
  • PLEC
  • PLEC1
  • SH3P7
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • TAU
  • VIM
Homo sapiens (human)
HDL assembly
  • A2M
  • ABC1
  • ABCA1
  • APOA1
  • CERP
  • CPAMD5
  • KIAA1292
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • ZDHHC8
  • ZDHHCL1
  • ZNF378
Homo sapiens (human)
Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation
  • AKT1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • DHFR
  • DYT5
  • GCH
  • GCH1
  • GCHFR
  • GFRP
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • NOS3
  • PKB
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • PTS
  • RAC
  • SPR
Homo sapiens (human)
Cellular response to hypoxia
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • EPAS1
  • FIH1
  • HIF1A
  • HIF1AN
  • HIF2A
  • MOP1
  • MOP2
  • PASD2
  • PASD8
Homo sapiens (human)
Transport of RCbl within the body
  • 8D6A
  • ABCC1
  • ABCD4
  • ARH
  • C6orf209
  • CD320
  • LDLRAP1
  • LMBRD1
  • LRP2
  • MRP
  • MRP1
  • NESI
  • PXMP1L
  • TC1
  • TC2
  • TCN1
  • TCN2
Homo sapiens (human)
Sensing of DNA Double Strand Breaks
  • ATM
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KPNA2
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • RAD50
  • RCH1
  • SRP1
  • TIP60
Homo sapiens (human)
Metabolism of ingested SeMet, Sec, MeSec into H2Se
  • AHCY
  • AMS1
  • CBS
  • CTH
  • GNMT
  • HNMT
  • MAT1A
  • MATA1
  • NNMT
  • SAHH
  • SCL
  • SCLY
Homo sapiens (human)
FOXO-mediated transcription of cell death genes
  • AFX
  • AFX1
  • APT1LG1
  • BBC3
  • BCL2L11
  • BCL5
  • BCL6
  • BIM
  • CBP
  • CD95L
  • CHOP
  • CHOP10
  • CITED2
  • CREBBP
  • DDIT3
  • EP300
  • FASL
  • FASLG
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • GADD153
  • HAP3
  • LAZ3
  • LKB1
  • MLLT7
  • MRG1
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • P300
  • PINK1
  • PJS
  • PUMA
  • STK11
  • TNFSF6
  • ZBTB27
  • ZNF51
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodeling of DAG and TAG
  • ADPN
  • AGRP1
  • ATGL
  • AWAT2
  • C22orf20
  • DC3
  • DC4
  • DGAT
  • DGAT1
  • DGAT2
  • DGAT2L4
  • DGAT2L6
  • MFAT
  • MGLL
  • PNPLA2
  • PNPLA3
  • WS
Homo sapiens (human)
Formation of intermediate mesoderm
  • BMP2B
  • BMP4
  • DVR4
  • FGF2
  • FGFB
  • FKHL14
  • FKHL7
  • FOXC1
  • FOXC2
  • FREAC3
  • LHX1
  • LIM-1
  • LIM1
  • MFH1
  • ODD
  • OSR1
  • PAX2
  • PAX8
Homo sapiens (human)
Transport of the SLBP Dependant Mature mRNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • BEF
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBP20
  • CBP80
  • CG1
  • D3S1231E
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • HBP
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SLBP
  • TAP
  • THOC4
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Suppression of apoptosis
  • ALO17
  • C17orf27
  • CTSG
  • ERK1
  • ERK2
  • GSK3A
  • KIAA1554
  • KIAA1618
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYSTR
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PSF
  • RFP
  • RNF213
  • RNF76
  • Rv3364c
  • Rv3654c
  • Rv3655c
  • SFPQ
  • TRIM27
  • lprM
  • mce3E
  • mptpA
  • ptpA
Homo sapiens (human)
Regulation of PTEN gene transcription
  • AOF2
  • ATF2
  • ATN1
  • BAP1
  • BMI1
  • C11orf59
  • C7orf59
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX6
  • CBX8
  • CHD3
  • CHD4
  • CHET9
  • CREB2
  • CREBP1
  • D12S755E
  • DING
  • DRPLA
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • EED
  • EGR1
  • ERK1
  • ERK2
  • EVI1
  • EZH2
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GATAD2A
  • GATAD2B
  • GBL
  • HBXIP
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC5
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HIPI3
  • JJAZ1
  • JUN
  • KDM1
  • KDM1A
  • KIAA0071
  • KIAA0160
  • KIAA0600
  • KIAA0601
  • KIAA1150
  • KIAA1266
  • KIAA1303
  • KMT6
  • KROX24
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LSD1
  • LST8
  • MAF1
  • MAP2K1IP1
  • MAPBPIP
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKSP1
  • MBD3
  • MDS1
  • MECOM
  • MLST8
  • MTA1
  • MTA1L1
  • MTA2
  • MTA3
  • MTOR
  • NR1C3
  • NR2E1
  • NRSF
  • P53
  • PC3
  • PCGF4
  • PDRO
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • PID
  • PPARG
  • PRDM3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RC1
  • RCOR
  • RCOR1
  • REST
  • RHEB
  • RHEB2
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RNF1
  • RNF2
  • RNF51
  • ROBLD3
  • RPD3L1
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SALL4
  • SLC38A9
  • SLUG
  • SLUGH
  • SNAH
  • SNAI1
  • SNAI2
  • SUZ12
  • TLX
  • TP53
  • URLC11
  • XBR
  • XIP
  • ZNF225
  • ZNF797
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression by Hypoxia-inducible Factor
  • ARNT
  • BHLHE2
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • CA9
  • CBP
  • CITED2
  • CREBBP
  • EP300
  • EPAS1
  • EPO
  • G250
  • HIF1A
  • HIF2A
  • HIG1
  • HIGD1A
  • MN
  • MOP1
  • MOP2
  • MRG1
  • P300
  • PASD2
  • PASD8
  • VEGF
  • VEGFA
Homo sapiens (human)
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis
  • ACAS2
  • ACSS2
  • AIB3
  • ALAS1
  • ALAS3
  • ALASH
  • ARC205
  • ATF2
  • ATP5B
  • ATP5F1B
  • ATPMB
  • ATPSB
  • BAF60C
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • C10orf2
  • C1orf170
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK4
  • CAMKIV
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CREB2
  • CREBBP
  • CREBP1
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CRTC1
  • CRTC2
  • CRTC3
  • CYC
  • CYCS
  • DRIP205
  • DRIP230
  • E4TF1A
  • EAR1
  • ERR1
  • ESRL1
  • ESRRA
  • GABPA
  • GLUD
  • GLUD1
  • GLUD2
  • GLUDP1
  • HCA137
  • HCF1
  • HCFC1
  • HDAC3
  • HELZ2
  • HFC1
  • HREV
  • IDH2
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA0595
  • KIAA0616
  • KIAA1047
  • KIAA1769
  • KISH2
  • LEM6
  • MECT1
  • MED1
  • MEF2C
  • MEF2D
  • MTERF
  • MTERF1
  • MTPOLB
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NCOR1
  • NR1C1
  • NR1D1
  • NR2B1
  • NR3B1
  • NRF1
  • NS5ATP5
  • PBP
  • PEO1
  • PERC
  • PERM1
  • PGC1
  • PGC1A
  • PGC1B
  • PIMT
  • POLG2
  • POLRMT
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • PPARGC1B
  • PPRC1
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAP250
  • RB18A
  • RXRA
  • SIR2L3
  • SIR2L4
  • SIR2L5
  • SIRT3
  • SIRT4
  • SIRT5
  • SMARCD3
  • SOD2
  • SRC1
  • SRC2
  • SSBP
  • SSBP1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TCF6
  • TCF6L2
  • TFAM
  • TFB1M
  • TFB2M
  • TGS1
  • THRAL
  • TIF2
  • TORC1
  • TORC2
  • TORC3
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
  • TWNK
  • WAMTP1
Homo sapiens (human)
SHC-mediated cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • JTK2
  • KLB
  • KS3
  • NRAS
  • SOS1
  • TKF
Homo sapiens (human)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • C14orf175
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • INPP5B
  • INPP5D
  • INPP5J
  • INPPL1
  • IP3KC
  • ITPK1
  • ITPKA
  • ITPKB
  • ITPKC
  • KIAA0450
  • KIAA0581
  • KIAA0910
  • KIAA1069
  • KIAA1516
  • KIAA1964
  • MMAC1
  • OCRL
  • OCRL1
  • OCRL2
  • PIB5PA
  • PIPP
  • PLC1
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PLCD1
  • PLCD3
  • PLCD4
  • PLCE
  • PLCE1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLCH1
  • PLCH2
  • PLCL3
  • PLCL4
  • PLCZ1
  • PLD4
  • PPLC
  • PTEN
  • SHIP
  • SHIP1
  • SHIP2
  • SYNJ1
  • TEP1
Homo sapiens (human)
PECAM1 interactions
  • FYN
  • GP3A
  • HCP
  • INPP5D
  • ITGAV
  • ITGB3
  • JTK8
  • LCK
  • LYN
  • MSK8
  • PECAM1
  • PLC1
  • PLCG1
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHIP
  • SHIP1
  • SHPTP2
  • VNRA
  • VTNR
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • AREG
  • AREGB
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • PLC1
  • PLCG1
  • SDGF
  • TGFA
Homo sapiens (human)
Nef mediated downregulation of CD28 cell surface expression
  • AP2M1
  • CD28
  • CLAPM1
  • KIAA0109
  • nef
Homo sapiens (human)
Adenosine P1 receptors
  • ADORA1
  • ADORA2
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADORA3
Homo sapiens (human)
Maturation of hRSV A proteins
  • 1B
  • 1C
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CRM1
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • F
  • FUR
  • FURIN
  • G5A
  • Impnb
  • KIAA0102
  • Kpnb1
  • L
  • M
  • M2-1
  • N
  • NS1
  • NS2
  • P
  • PACE
  • PCSK3
  • PPP1A
  • PPP1CA
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
  • XPO1
Homo sapiens (human)
Ras activation upon Ca2+ influx through NMDA receptor
  • ACTN2
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CDC25
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GNRP
  • GRF1
  • GRF2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • GRIN2D
  • GluN2D
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0968
  • KIAA1232
  • KIAA1365
  • LAP1
  • LRRC7
  • NEFL
  • NF68
  • NFL
  • NMDAR1
  • NMDAR2B
  • NMDAR2D
  • NRAS
  • PSD95
  • RASGRF1
  • RASGRF2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024